MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_021490	AATT	2	8	733376	733383	50 %	50 %	0 %	0 %	512556710
15503	NC_021490	CGG	2	6	733412	733417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556710
15504	NC_021490	TTA	2	6	733480	733485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556710
15505	NC_021490	TTTTC	2	10	733580	733589	0 %	80 %	0 %	20 %	512556710
15506	NC_021490	TTTC	2	8	733608	733615	0 %	75 %	0 %	25 %	512556710
15507	NC_021490	TATTT	2	10	733750	733759	20 %	80 %	0 %	0 %	512556710
15508	NC_021490	AT	3	6	733783	733788	50 %	50 %	0 %	0 %	512556710
15509	NC_021490	AATG	2	8	733794	733801	50 %	25 %	25 %	0 %	512556710
15510	NC_021490	TCC	2	6	733843	733848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556710
15511	NC_021490	GCA	2	6	733912	733917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15512	NC_021490	TTCC	2	8	733922	733929	0 %	50 %	0 %	50 %	512556710
15513	NC_021490	CGT	2	6	734005	734010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15514	NC_021490	CTG	2	6	734186	734191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15515	NC_021490	T	6	6	734301	734306	0 %	100 %	0 %	0 %	512556710
15516	NC_021490	ATC	2	6	734322	734327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
15517	NC_021490	ATC	2	6	734344	734349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
15518	NC_021490	CGC	2	6	734397	734402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556710
15519	NC_021490	TAA	2	6	734426	734431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556710
15520	NC_021490	CGCA	2	8	734460	734467	25 %	0 %	25 %	50 %	512556710
15521	NC_021490	CTT	2	6	734480	734485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
15522	NC_021490	CAAAA	2	10	734495	734504	80 %	0 %	0 %	20 %	512556710
15523	NC_021490	CAA	2	6	734609	734614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556710
15524	NC_021490	CCCCG	2	10	734632	734641	0 %	0 %	20 %	80 %	512556710
15525	NC_021490	TAA	2	6	734675	734680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556710
15526	NC_021490	CAA	2	6	734705	734710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556710
15527	NC_021490	ATCC	2	8	734712	734719	25 %	25 %	0 %	50 %	512556710
15528	NC_021490	TTC	2	6	734760	734765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
15529	NC_021490	ACT	2	6	734770	734775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
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15532	NC_021490	AGA	2	6	734967	734972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556710
15533	NC_021490	TTC	3	9	735025	735033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
15534	NC_021490	CAG	2	6	735045	735050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15535	NC_021490	CGT	2	6	735092	735097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15536	NC_021490	ACC	2	6	735103	735108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556710
15537	NC_021490	TCAA	2	8	735136	735143	50 %	25 %	0 %	25 %	512556710
15538	NC_021490	TCT	2	6	735158	735163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
15539	NC_021490	TCA	2	6	735166	735171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556710
15540	NC_021490	GC	3	6	735231	735236	0 %	0 %	50 %	50 %	512556710
15541	NC_021490	TTC	2	6	735240	735245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556710
15542	NC_021490	CAAGA	2	10	735293	735302	60 %	0 %	20 %	20 %	512556710
15543	NC_021490	GTA	2	6	735363	735368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556710
15544	NC_021490	GGA	2	6	735390	735395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556710
15545	NC_021490	AGCA	2	8	735432	735439	50 %	0 %	25 %	25 %	512556710
15546	NC_021490	CAG	2	6	735542	735547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15547	NC_021490	AAGCGC	2	12	735597	735608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556710
15548	NC_021490	GAA	2	6	735652	735657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556710
15549	NC_021490	TCCA	2	8	735660	735667	25 %	25 %	0 %	50 %	512556710
15550	NC_021490	AAT	2	6	735674	735679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556710
15551	NC_021490	GC	3	6	735711	735716	0 %	0 %	50 %	50 %	512556710
15552	NC_021490	A	6	6	735726	735731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_021490	ACAGC	2	10	735759	735768	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15554	NC_021490	TTG	2	6	735778	735783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_021490	TA	3	6	735790	735795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_021490	AGGG	2	8	735882	735889	25 %	0 %	75 %	0 %	512556711
15557	NC_021490	GTC	2	6	735912	735917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556711
15558	NC_021490	GCA	2	6	735940	735945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556711
15559	NC_021490	CA	3	6	735959	735964	50 %	0 %	0 %	50 %	512556711
15560	NC_021490	GCG	2	6	735991	735996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556711
15561	NC_021490	CG	3	6	735995	736000	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
15562	NC_021490	A	7	7	736155	736161	100 %	0 %	0 %	0 %	512556711
15563	NC_021490	GC	3	6	736201	736206	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
15564	NC_021490	CG	3	6	736267	736272	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
15565	NC_021490	CG	4	8	736387	736394	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
15566	NC_021490	CCA	2	6	736406	736411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556711
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15568	NC_021490	CTGC	2	8	736495	736502	0 %	25 %	25 %	50 %	512556711
15569	NC_021490	CAA	2	6	736553	736558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556711
15570	NC_021490	TGCATA	2	12	736564	736575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556711
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15573	NC_021490	GCA	2	6	736706	736711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556711
15574	NC_021490	AC	3	6	736783	736788	50 %	0 %	0 %	50 %	512556711
15575	NC_021490	ACC	2	6	736821	736826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556711
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15577	NC_021490	ACG	2	6	736935	736940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556711
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15579	NC_021490	GC	3	6	736983	736988	0 %	0 %	50 %	50 %	512556711
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15585	NC_021490	TA	3	6	737326	737331	50 %	50 %	0 %	0 %	512556712
15586	NC_021490	AGAA	2	8	737372	737379	75 %	0 %	25 %	0 %	512556712
15587	NC_021490	A	7	7	737396	737402	100 %	0 %	0 %	0 %	512556712
15588	NC_021490	A	6	6	737445	737450	100 %	0 %	0 %	0 %	512556712
15589	NC_021490	AC	3	6	737452	737457	50 %	0 %	0 %	50 %	512556712
15590	NC_021490	A	7	7	737502	737508	100 %	0 %	0 %	0 %	512556712
15591	NC_021490	GC	3	6	737599	737604	0 %	0 %	50 %	50 %	512556712
15592	NC_021490	A	6	6	737668	737673	100 %	0 %	0 %	0 %	512556712
15593	NC_021490	CAG	2	6	737731	737736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556712
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15595	NC_021490	C	6	6	737885	737890	0 %	0 %	0 %	100 %	512556712
15596	NC_021490	AGC	2	6	737921	737926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556712
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15599	NC_021490	CG	3	6	738106	738111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15600	NC_021490	AG	3	6	738113	738118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_021490	ACA	2	6	738122	738127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15602	NC_021490	GA	3	6	738186	738191	50 %	0 %	50 %	0 %	512556713
15603	NC_021490	ACCGTA	2	12	738224	738235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556713
15604	NC_021490	CGG	2	6	738296	738301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556713
15605	NC_021490	TCG	2	6	738359	738364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556713
15606	NC_021490	CGCAC	2	10	738365	738374	20 %	0 %	20 %	60 %	512556713
15607	NC_021490	T	7	7	738397	738403	0 %	100 %	0 %	0 %	512556713
15608	NC_021490	A	6	6	738413	738418	100 %	0 %	0 %	0 %	512556713
15609	NC_021490	GTG	2	6	738425	738430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556713
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15611	NC_021490	CTT	2	6	738489	738494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556713
15612	NC_021490	CTGT	2	8	738501	738508	0 %	50 %	25 %	25 %	512556713
15613	NC_021490	TTC	2	6	738547	738552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556713
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15616	NC_021490	GCA	2	6	738812	738817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556713
15617	NC_021490	A	6	6	738925	738930	100 %	0 %	0 %	0 %	512556713
15618	NC_021490	T	6	6	738974	738979	0 %	100 %	0 %	0 %	512556713
15619	NC_021490	ACGC	2	8	739165	739172	25 %	0 %	25 %	50 %	512556713
15620	NC_021490	CAC	2	6	739185	739190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556713
15621	NC_021490	ACGGC	2	10	739215	739224	20 %	0 %	40 %	40 %	512556713
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15623	NC_021490	AC	3	6	739252	739257	50 %	0 %	0 %	50 %	512556713
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15856	NC_021490	CG	3	6	749763	749768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15995	NC_021490	TCA	2	6	757497	757502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556729
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