MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14504	NC_021490	T	6	6	683488	683493	0 %	100 %	0 %	0 %	512556670
14505	NC_021490	GACC	2	8	683506	683513	25 %	0 %	25 %	50 %	512556670
14506	NC_021490	C	9	9	683606	683614	0 %	0 %	0 %	100 %	512556670
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14519	NC_021490	TGA	2	6	684284	684289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556671
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14749	NC_021490	CGC	2	6	695304	695309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556678
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14752	NC_021490	A	6	6	695406	695411	100 %	0 %	0 %	0 %	512556678
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14864	NC_021490	ACG	2	6	700581	700586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556682
14865	NC_021490	CG	3	6	700585	700590	0 %	0 %	50 %	50 %	512556682
14866	NC_021490	GAG	2	6	700607	700612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556682
14867	NC_021490	TTGC	2	8	700733	700740	0 %	50 %	25 %	25 %	512556682
14868	NC_021490	GCT	2	6	700760	700765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556682
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14870	NC_021490	CGA	2	6	700804	700809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556682
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14872	NC_021490	GCA	2	6	700900	700905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556682
14873	NC_021490	AGCA	2	8	700919	700926	50 %	0 %	25 %	25 %	512556682
14874	NC_021490	AGA	2	6	700951	700956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556682
14875	NC_021490	CATG	2	8	700981	700988	25 %	25 %	25 %	25 %	512556682
14876	NC_021490	GGA	2	6	700993	700998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556682
14877	NC_021490	CGG	2	6	701068	701073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556682
14878	NC_021490	GAAC	2	8	701119	701126	50 %	0 %	25 %	25 %	512556682
14879	NC_021490	CA	3	6	701130	701135	50 %	0 %	0 %	50 %	512556682
14880	NC_021490	GCC	2	6	701171	701176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556682
14881	NC_021490	TGC	2	6	701342	701347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556683
14882	NC_021490	GC	3	6	701349	701354	0 %	0 %	50 %	50 %	512556683
14883	NC_021490	CGT	2	6	701355	701360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556683
14884	NC_021490	TC	3	6	701389	701394	0 %	50 %	0 %	50 %	512556683
14885	NC_021490	CTT	2	6	701457	701462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556683
14886	NC_021490	CTA	2	6	701502	701507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556683
14887	NC_021490	CCT	2	6	701596	701601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556683
14888	NC_021490	GGT	2	6	701613	701618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556683
14889	NC_021490	GT	3	6	701626	701631	0 %	50 %	50 %	0 %	512556683
14890	NC_021490	CTA	2	6	701679	701684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556683
14891	NC_021490	CAG	2	6	701688	701693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556683
14892	NC_021490	CTT	2	6	701721	701726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556683
14893	NC_021490	CTTT	2	8	701735	701742	0 %	75 %	0 %	25 %	512556683
14894	NC_021490	AC	3	6	701744	701749	50 %	0 %	0 %	50 %	512556683
14895	NC_021490	TAC	2	6	701797	701802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556683
14896	NC_021490	CGT	2	6	701823	701828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556683
14897	NC_021490	GTTT	2	8	701840	701847	0 %	75 %	25 %	0 %	512556683
14898	NC_021490	TTTC	2	8	702138	702145	0 %	75 %	0 %	25 %	512556683
14899	NC_021490	GC	3	6	702208	702213	0 %	0 %	50 %	50 %	512556683
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14902	NC_021490	GCA	2	6	702315	702320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556683
14903	NC_021490	ATCG	2	8	702334	702341	25 %	25 %	25 %	25 %	512556683
14904	NC_021490	GCC	2	6	702385	702390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556683
14905	NC_021490	TCC	2	6	702391	702396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556683
14906	NC_021490	CTG	2	6	702469	702474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556683
14907	NC_021490	CTTG	2	8	702600	702607	0 %	50 %	25 %	25 %	512556683
14908	NC_021490	GTCAG	2	10	702645	702654	20 %	20 %	40 %	20 %	512556683
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14912	NC_021490	CAC	2	6	702816	702821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556683
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14920	NC_021490	GCAG	2	8	703253	703260	25 %	0 %	50 %	25 %	512556684
14921	NC_021490	TCC	2	6	703261	703266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556684
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14927	NC_021490	CTG	2	6	703485	703490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556684
14928	NC_021490	CACC	2	8	703526	703533	25 %	0 %	0 %	75 %	512556684
14929	NC_021490	CACT	2	8	703535	703542	25 %	25 %	0 %	50 %	512556684
14930	NC_021490	ACCGA	2	10	703594	703603	40 %	0 %	20 %	40 %	512556684
14931	NC_021490	CA	3	6	703631	703636	50 %	0 %	0 %	50 %	512556684
14932	NC_021490	GTA	2	6	703647	703652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556684
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14935	NC_021490	ATGT	2	8	703787	703794	25 %	50 %	25 %	0 %	512556684
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14938	NC_021490	AAAG	2	8	703960	703967	75 %	0 %	25 %	0 %	512556684
14939	NC_021490	A	6	6	703975	703980	100 %	0 %	0 %	0 %	512556684
14940	NC_021490	ACA	2	6	704039	704044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556684
14941	NC_021490	CA	3	6	704078	704083	50 %	0 %	0 %	50 %	512556684
14942	NC_021490	CGA	2	6	704096	704101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556684
14943	NC_021490	CAA	2	6	704282	704287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556684
14944	NC_021490	GCA	2	6	704327	704332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556684
14945	NC_021490	CAG	2	6	704480	704485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556684
14946	NC_021490	AGC	2	6	704558	704563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14949	NC_021490	CAG	2	6	704708	704713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556685
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14954	NC_021490	AACA	2	8	704818	704825	75 %	0 %	0 %	25 %	512556685
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14956	NC_021490	GC	3	6	704903	704908	0 %	0 %	50 %	50 %	512556685
14957	NC_021490	GC	3	6	704910	704915	0 %	0 %	50 %	50 %	512556685
14958	NC_021490	CA	3	6	704964	704969	50 %	0 %	0 %	50 %	512556685
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14965	NC_021490	GTC	2	6	705472	705477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556685
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14971	NC_021490	GCAC	2	8	705749	705756	25 %	0 %	25 %	50 %	512556685
14972	NC_021490	GT	3	6	705769	705774	0 %	50 %	50 %	0 %	512556685
14973	NC_021490	GAA	2	6	705860	705865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556685
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14975	NC_021490	CGC	2	6	705916	705921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556685
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14977	NC_021490	GATC	2	8	705973	705980	25 %	25 %	25 %	25 %	512556685
14978	NC_021490	AAT	2	6	706075	706080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556685
14979	NC_021490	GC	3	6	706115	706120	0 %	0 %	50 %	50 %	512556685
14980	NC_021490	AT	4	8	706143	706150	50 %	50 %	0 %	0 %	512556685
14981	NC_021490	CTTT	2	8	706196	706203	0 %	75 %	0 %	25 %	512556685
14982	NC_021490	TGC	2	6	706218	706223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556685
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14984	NC_021490	A	6	6	706278	706283	100 %	0 %	0 %	0 %	512556685
14985	NC_021490	ATC	2	6	706295	706300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556685
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14988	NC_021490	AAC	2	6	706458	706463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556686
14989	NC_021490	AGA	3	9	706476	706484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556686
14990	NC_021490	TAT	2	6	706527	706532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556686
14991	NC_021490	GC	3	6	706534	706539	0 %	0 %	50 %	50 %	512556686
14992	NC_021490	CGA	2	6	706605	706610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556686
14993	NC_021490	TCA	2	6	706664	706669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556686
14994	NC_021490	TCG	2	6	706682	706687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556686
14995	NC_021490	AGT	2	6	706764	706769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556686
14996	NC_021490	TACG	2	8	706773	706780	25 %	25 %	25 %	25 %	512556686
14997	NC_021490	GCA	2	6	706867	706872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556686
14998	NC_021490	CA	3	6	706871	706876	50 %	0 %	0 %	50 %	512556686
14999	NC_021490	CAC	2	6	706930	706935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556686
15000	NC_021490	CAAA	2	8	706938	706945	75 %	0 %	0 %	25 %	512556686

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