MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

< Previous12...2425262728293031323334...4748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021490	CCT	2	6	660553	660558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556652
14002	NC_021490	CAC	2	6	660620	660625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
14003	NC_021490	TCA	2	6	660661	660666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556652
14004	NC_021490	CTG	2	6	660716	660721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556652
14005	NC_021490	CAAAAG	2	12	660739	660750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	512556652
14006	NC_021490	AAG	3	9	660765	660773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556652
14007	NC_021490	GCT	2	6	660775	660780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556652
14008	NC_021490	TCC	2	6	660793	660798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556652
14009	NC_021490	GCACG	2	10	660842	660851	20 %	0 %	40 %	40 %	512556652
14010	NC_021490	CG	3	6	660850	660855	0 %	0 %	50 %	50 %	512556652
14011	NC_021490	CAC	2	6	660879	660884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
14012	NC_021490	AC	3	6	660922	660927	50 %	0 %	0 %	50 %	512556652
14013	NC_021490	CG	3	6	660994	660999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_021490	AGA	2	6	661074	661079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_021490	CTC	2	6	661094	661099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_021490	AG	3	6	661104	661109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_021490	ACG	2	6	661129	661134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_021490	GCG	2	6	661168	661173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_021490	GCT	2	6	661216	661221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_021490	GTGC	2	8	661264	661271	0 %	25 %	50 %	25 %	512556653
14021	NC_021490	C	6	6	661306	661311	0 %	0 %	0 %	100 %	512556653
14022	NC_021490	TCC	2	6	661499	661504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556653
14023	NC_021490	CGCT	2	8	661514	661521	0 %	25 %	25 %	50 %	512556653
14024	NC_021490	TAC	2	6	661539	661544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556653
14025	NC_021490	TCCCC	2	10	661577	661586	0 %	20 %	0 %	80 %	512556653
14026	NC_021490	GC	3	6	661611	661616	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14027	NC_021490	CTG	2	6	661646	661651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556653
14028	NC_021490	AGA	2	6	661667	661672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556653
14029	NC_021490	TGCG	2	8	661694	661701	0 %	25 %	50 %	25 %	512556653
14030	NC_021490	GC	5	10	661713	661722	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14031	NC_021490	CA	3	6	661813	661818	50 %	0 %	0 %	50 %	512556653
14032	NC_021490	ACT	2	6	661870	661875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556653
14033	NC_021490	GC	3	6	661894	661899	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14034	NC_021490	GGCA	2	8	661920	661927	25 %	0 %	50 %	25 %	512556653
14035	NC_021490	GAC	2	6	661951	661956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556653
14036	NC_021490	T	6	6	661957	661962	0 %	100 %	0 %	0 %	512556653
14037	NC_021490	GC	3	6	661972	661977	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14038	NC_021490	GCC	2	6	662078	662083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556653
14039	NC_021490	TGG	2	6	662102	662107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556653
14040	NC_021490	ACTG	2	8	662134	662141	25 %	25 %	25 %	25 %	512556653
14041	NC_021490	GCA	2	6	662182	662187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556653
14042	NC_021490	GC	3	6	662198	662203	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14043	NC_021490	CCTT	2	8	662213	662220	0 %	50 %	0 %	50 %	512556653
14044	NC_021490	GC	3	6	662226	662231	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14045	NC_021490	GCA	2	6	662235	662240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556653
14046	NC_021490	GC	3	6	662249	662254	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14047	NC_021490	AC	3	6	662261	662266	50 %	0 %	0 %	50 %	512556653
14048	NC_021490	CG	3	6	662274	662279	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14049	NC_021490	GC	3	6	662287	662292	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14050	NC_021490	CG	3	6	662347	662352	0 %	0 %	50 %	50 %	512556653
14051	NC_021490	ACT	2	6	662388	662393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556653
14052	NC_021490	T	6	6	662463	662468	0 %	100 %	0 %	0 %	512556653
14053	NC_021490	AGA	2	6	662472	662477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556653
14054	NC_021490	TGC	2	6	662756	662761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556653
14055	NC_021490	CGC	2	6	662813	662818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556653
14056	NC_021490	CGG	2	6	662908	662913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556654
14057	NC_021490	ACGC	2	8	662916	662923	25 %	0 %	25 %	50 %	512556654
14058	NC_021490	CGG	2	6	662936	662941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556654
14059	NC_021490	CTC	2	6	662949	662954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556654
14060	NC_021490	CAG	2	6	662978	662983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556654
14061	NC_021490	GTCAG	2	10	662992	663001	20 %	20 %	40 %	20 %	512556654
14062	NC_021490	CTC	2	6	663016	663021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556654
14063	NC_021490	GTC	2	6	663027	663032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556654
14064	NC_021490	GCA	2	6	663034	663039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556654
14065	NC_021490	TG	3	6	663044	663049	0 %	50 %	50 %	0 %	512556654
14066	NC_021490	CGC	2	6	663080	663085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556654
14067	NC_021490	CCG	2	6	663148	663153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556654
14068	NC_021490	GCC	2	6	663162	663167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556654
14069	NC_021490	CGA	2	6	663186	663191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556654
14070	NC_021490	AGA	2	6	663246	663251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556654
14071	NC_021490	GC	3	6	663268	663273	0 %	0 %	50 %	50 %	512556654
14072	NC_021490	CA	3	6	663306	663311	50 %	0 %	0 %	50 %	512556654
14073	NC_021490	TG	3	6	663314	663319	0 %	50 %	50 %	0 %	512556654
14074	NC_021490	GTT	2	6	663330	663335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556654
14075	NC_021490	GC	3	6	663357	663362	0 %	0 %	50 %	50 %	512556654
14076	NC_021490	AGA	2	6	663465	663470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556654
14077	NC_021490	AGG	2	6	663593	663598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556654
14078	NC_021490	CGG	2	6	663627	663632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556654
14079	NC_021490	CTTT	2	8	663690	663697	0 %	75 %	0 %	25 %	512556654
14080	NC_021490	CTGCTC	2	12	663734	663745	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512556654
14081	NC_021490	GCG	2	6	663757	663762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556654
14082	NC_021490	GACGC	2	10	663799	663808	20 %	0 %	40 %	40 %	512556654
14083	NC_021490	CAGC	2	8	663854	663861	25 %	0 %	25 %	50 %	512556654
14084	NC_021490	GC	4	8	663944	663951	0 %	0 %	50 %	50 %	512556654
14085	NC_021490	CTC	2	6	663962	663967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556654
14086	NC_021490	GGT	2	6	663981	663986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556654
14087	NC_021490	A	6	6	664064	664069	100 %	0 %	0 %	0 %	512556654
14088	NC_021490	AGTT	2	8	664239	664246	25 %	50 %	25 %	0 %	512556654
14089	NC_021490	CTTG	2	8	664254	664261	0 %	50 %	25 %	25 %	512556654
14090	NC_021490	CAA	2	6	664285	664290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556654
14091	NC_021490	GCG	2	6	664349	664354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556654
14092	NC_021490	CA	4	8	664416	664423	50 %	0 %	0 %	50 %	512556654
14093	NC_021490	CGG	3	9	664428	664436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556654
14094	NC_021490	AC	3	6	664474	664479	50 %	0 %	0 %	50 %	512556654
14095	NC_021490	TAC	2	6	664564	664569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556654
14096	NC_021490	TC	3	6	664571	664576	0 %	50 %	0 %	50 %	512556654
14097	NC_021490	GT	3	6	664583	664588	0 %	50 %	50 %	0 %	512556654
14098	NC_021490	GC	3	6	664639	664644	0 %	0 %	50 %	50 %	512556654
14099	NC_021490	CAC	2	6	664701	664706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556654
14100	NC_021490	CT	3	6	664783	664788	0 %	50 %	0 %	50 %	512556654
14101	NC_021490	TTA	2	6	664856	664861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556654
14102	NC_021490	ACAT	2	8	665011	665018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_021490	CTC	2	6	665077	665082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556655
14104	NC_021490	ATTT	2	8	665254	665261	25 %	75 %	0 %	0 %	512556655
14105	NC_021490	ACG	2	6	665279	665284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556655
14106	NC_021490	GC	3	6	665298	665303	0 %	0 %	50 %	50 %	512556655
14107	NC_021490	CGG	2	6	665305	665310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556655
14108	NC_021490	TC	3	6	665319	665324	0 %	50 %	0 %	50 %	512556655
14109	NC_021490	GAG	2	6	665362	665367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556655
14110	NC_021490	CG	3	6	665374	665379	0 %	0 %	50 %	50 %	512556655
14111	NC_021490	TGCG	2	8	665435	665442	0 %	25 %	50 %	25 %	512556655
14112	NC_021490	CG	3	6	665480	665485	0 %	0 %	50 %	50 %	512556655
14113	NC_021490	GA	3	6	665510	665515	50 %	0 %	50 %	0 %	512556655
14114	NC_021490	A	8	8	665515	665522	100 %	0 %	0 %	0 %	512556655
14115	NC_021490	ATC	2	6	665662	665667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556655
14116	NC_021490	GTG	2	6	665707	665712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556655
14117	NC_021490	TCG	2	6	665720	665725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556655
14118	NC_021490	AGG	2	6	665820	665825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556655
14119	NC_021490	AAGT	2	8	665851	665858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_021490	GC	3	6	665874	665879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_021490	CAG	2	6	665891	665896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_021490	ACGT	2	8	665973	665980	25 %	25 %	25 %	25 %	512556656
14123	NC_021490	ACCTAC	2	12	666024	666035	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556656
14124	NC_021490	AGA	2	6	666268	666273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556656
14125	NC_021490	GGT	2	6	666347	666352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556656
14126	NC_021490	AAC	2	6	666379	666384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556656
14127	NC_021490	GTG	2	6	666390	666395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556656
14128	NC_021490	CG	3	6	666441	666446	0 %	0 %	50 %	50 %	512556656
14129	NC_021490	TGC	2	6	666485	666490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556656
14130	NC_021490	TCGT	2	8	666519	666526	0 %	50 %	25 %	25 %	512556656
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14136	NC_021490	CG	3	6	666728	666733	0 %	0 %	50 %	50 %	512556656
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14138	NC_021490	GC	3	6	666791	666796	0 %	0 %	50 %	50 %	512556656
14139	NC_021490	TCGC	2	8	666890	666897	0 %	25 %	25 %	50 %	512556656
14140	NC_021490	CAT	2	6	667139	667144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556656
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14232	NC_021490	AAACG	2	10	671131	671140	60 %	0 %	20 %	20 %	512556661
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14241	NC_021490	GCG	2	6	671566	671571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556662
14242	NC_021490	CCT	2	6	671632	671637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556662
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14244	NC_021490	CG	3	6	671727	671732	0 %	0 %	50 %	50 %	512556662
14245	NC_021490	CACG	2	8	671735	671742	25 %	0 %	25 %	50 %	512556662
14246	NC_021490	CAC	2	6	671762	671767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556662
14247	NC_021490	CTC	2	6	671799	671804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14248	NC_021490	TTC	2	6	671812	671817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14249	NC_021490	TCC	2	6	671830	671835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14250	NC_021490	AAACG	2	10	671919	671928	60 %	0 %	20 %	20 %	512556663
14251	NC_021490	GC	3	6	671954	671959	0 %	0 %	50 %	50 %	512556663
14252	NC_021490	AGT	2	6	671963	671968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556663
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14255	NC_021490	GCT	2	6	672120	672125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556663
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14257	NC_021490	CGC	2	6	672201	672206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556663
14258	NC_021490	TAC	2	6	672221	672226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556663
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14263	NC_021490	GC	3	6	672587	672592	0 %	0 %	50 %	50 %	512556663
14264	NC_021490	ACC	2	6	672663	672668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556664
14265	NC_021490	AGCA	2	8	672743	672750	50 %	0 %	25 %	25 %	512556664
14266	NC_021490	TTCA	2	8	672830	672837	25 %	50 %	0 %	25 %	512556664
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14276	NC_021490	GACT	2	8	673320	673327	25 %	25 %	25 %	25 %	512556664
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14279	NC_021490	TCGT	2	8	673746	673753	0 %	50 %	25 %	25 %	512556664
14280	NC_021490	TGC	2	6	673779	673784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556664
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14284	NC_021490	CCGGAG	2	12	673992	674003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512556664
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14332	NC_021490	GTA	2	6	676605	676610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556665
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14336	NC_021490	C	10	10	676829	676838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14337	NC_021490	TAG	2	6	676848	676853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14339	NC_021490	ACT	2	6	676877	676882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556666
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14351	NC_021490	T	7	7	677482	677488	0 %	100 %	0 %	0 %	512556666
14352	NC_021490	TGC	2	6	677518	677523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556666
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14358	NC_021490	GC	3	6	677931	677936	0 %	0 %	50 %	50 %	512556666
14359	NC_021490	AG	3	6	678006	678011	50 %	0 %	50 %	0 %	512556666
14360	NC_021490	TGC	2	6	678019	678024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556666
14361	NC_021490	GA	3	6	678057	678062	50 %	0 %	50 %	0 %	512556666
14362	NC_021490	GCG	2	6	678065	678070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556666
14363	NC_021490	TGCG	3	12	678073	678084	0 %	25 %	50 %	25 %	512556666
14364	NC_021490	CG	3	6	678083	678088	0 %	0 %	50 %	50 %	512556666
14365	NC_021490	TCA	2	6	678118	678123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556666
14366	NC_021490	T	6	6	678132	678137	0 %	100 %	0 %	0 %	512556666
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14368	NC_021490	GCA	2	6	678307	678312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556666
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14482	NC_021490	AGAC	2	8	682522	682529	50 %	0 %	25 %	25 %	512556669
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14486	NC_021490	CACC	2	8	682588	682595	25 %	0 %	0 %	75 %	512556669
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14493	NC_021490	T	6	6	682792	682797	0 %	100 %	0 %	0 %	512556670
14494	NC_021490	AT	3	6	682832	682837	50 %	50 %	0 %	0 %	512556670
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