MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021490	CTC	2	6	637988	637993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556633
13502	NC_021490	AC	3	6	638215	638220	50 %	0 %	0 %	50 %	512556633
13503	NC_021490	CTG	2	6	638254	638259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556633
13504	NC_021490	TCG	2	6	638289	638294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556633
13505	NC_021490	CTT	2	6	638302	638307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556633
13506	NC_021490	GCAG	2	8	638310	638317	25 %	0 %	50 %	25 %	512556633
13507	NC_021490	TGCA	2	8	638363	638370	25 %	25 %	25 %	25 %	512556633
13508	NC_021490	GCG	2	6	638385	638390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556633
13509	NC_021490	AAG	2	6	638453	638458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556633
13510	NC_021490	A	6	6	638600	638605	100 %	0 %	0 %	0 %	512556634
13511	NC_021490	TG	3	6	638639	638644	0 %	50 %	50 %	0 %	512556634
13512	NC_021490	GCG	2	6	638671	638676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556634
13513	NC_021490	GGT	2	6	638783	638788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556634
13514	NC_021490	CG	3	6	638868	638873	0 %	0 %	50 %	50 %	512556634
13515	NC_021490	CAGA	2	8	638905	638912	50 %	0 %	25 %	25 %	512556634
13516	NC_021490	GAA	2	6	639083	639088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556634
13517	NC_021490	TGC	2	6	639101	639106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13518	NC_021490	GTG	2	6	639135	639140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556634
13519	NC_021490	ATTGG	2	10	639240	639249	20 %	40 %	40 %	0 %	512556634
13520	NC_021490	GCG	2	6	639258	639263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556634
13521	NC_021490	AC	3	6	639416	639421	50 %	0 %	0 %	50 %	512556634
13522	NC_021490	GCA	2	6	639458	639463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13523	NC_021490	A	6	6	639463	639468	100 %	0 %	0 %	0 %	512556634
13524	NC_021490	CAATC	2	10	639535	639544	40 %	20 %	0 %	40 %	512556634
13525	NC_021490	GTG	2	6	639680	639685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556634
13526	NC_021490	GTC	2	6	639770	639775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13527	NC_021490	CG	3	6	639811	639816	0 %	0 %	50 %	50 %	512556634
13528	NC_021490	TTG	2	6	639825	639830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556634
13529	NC_021490	TCCT	2	8	639940	639947	0 %	50 %	0 %	50 %	512556634
13530	NC_021490	CCG	2	6	639999	640004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556634
13531	NC_021490	GC	3	6	640046	640051	0 %	0 %	50 %	50 %	512556634
13532	NC_021490	AAAC	2	8	640101	640108	75 %	0 %	0 %	25 %	512556634
13533	NC_021490	CTG	2	6	640132	640137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13534	NC_021490	GGT	2	6	640229	640234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556634
13535	NC_021490	CGT	2	6	640353	640358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13536	NC_021490	GC	3	6	640380	640385	0 %	0 %	50 %	50 %	512556634
13537	NC_021490	ACG	2	6	640395	640400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13538	NC_021490	GTC	2	6	640496	640501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13539	NC_021490	TGA	2	6	640507	640512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556634
13540	NC_021490	A	6	6	640629	640634	100 %	0 %	0 %	0 %	512556634
13541	NC_021490	GGC	2	6	640657	640662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556634
13542	NC_021490	GCC	2	6	640696	640701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556634
13543	NC_021490	GCAC	2	8	640711	640718	25 %	0 %	25 %	50 %	512556634
13544	NC_021490	GCA	2	6	640731	640736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13545	NC_021490	CGA	2	6	640783	640788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13546	NC_021490	TCAG	2	8	640818	640825	25 %	25 %	25 %	25 %	512556634
13547	NC_021490	ATG	2	6	640826	640831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556634
13548	NC_021490	GGA	2	6	640863	640868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556634
13549	NC_021490	CT	3	6	640910	640915	0 %	50 %	0 %	50 %	512556634
13550	NC_021490	CAC	2	6	640923	640928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556634
13551	NC_021490	AGA	2	6	640936	640941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556634
13552	NC_021490	TG	3	6	640953	640958	0 %	50 %	50 %	0 %	512556634
13553	NC_021490	GCACAC	2	12	640960	640971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556634
13554	NC_021490	TG	3	6	641023	641028	0 %	50 %	50 %	0 %	512556634
13555	NC_021490	GTG	2	6	641036	641041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556634
13556	NC_021490	CCG	2	6	641124	641129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556634
13557	NC_021490	GCA	2	6	641152	641157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556634
13558	NC_021490	TG	3	6	641242	641247	0 %	50 %	50 %	0 %	512556635
13559	NC_021490	GTCT	2	8	641336	641343	0 %	50 %	25 %	25 %	512556635
13560	NC_021490	GC	3	6	641397	641402	0 %	0 %	50 %	50 %	512556635
13561	NC_021490	TCC	2	6	641469	641474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556635
13562	NC_021490	AGC	2	6	641559	641564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556635
13563	NC_021490	TCT	2	6	641634	641639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556635
13564	NC_021490	TG	3	6	641642	641647	0 %	50 %	50 %	0 %	512556635
13565	NC_021490	GCG	2	6	641681	641686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556635
13566	NC_021490	A	8	8	641696	641703	100 %	0 %	0 %	0 %	512556635
13567	NC_021490	GTT	2	6	641741	641746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556635
13568	NC_021490	CCA	2	6	641749	641754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556635
13569	NC_021490	AAG	2	6	641759	641764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556635
13570	NC_021490	CCT	2	6	641776	641781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556635
13571	NC_021490	A	9	9	641804	641812	100 %	0 %	0 %	0 %	512556635
13572	NC_021490	T	6	6	641831	641836	0 %	100 %	0 %	0 %	512556635
13573	NC_021490	AAC	2	6	641844	641849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556635
13574	NC_021490	A	6	6	641854	641859	100 %	0 %	0 %	0 %	512556635
13575	NC_021490	GC	3	6	641943	641948	0 %	0 %	50 %	50 %	512556635
13576	NC_021490	GCC	2	6	641951	641956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556635
13577	NC_021490	CTT	2	6	641996	642001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556635
13578	NC_021490	CG	3	6	642141	642146	0 %	0 %	50 %	50 %	512556635
13579	NC_021490	CCT	2	6	642151	642156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556635
13580	NC_021490	GCA	2	6	642348	642353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556636
13581	NC_021490	CAAC	2	8	642373	642380	50 %	0 %	0 %	50 %	512556636
13582	NC_021490	AGCCAT	2	12	642404	642415	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	512556636
13583	NC_021490	ATA	2	6	642423	642428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556636
13584	NC_021490	TTCC	2	8	642572	642579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13585	NC_021490	T	6	6	642598	642603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_021490	ATC	2	6	642619	642624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556637
13587	NC_021490	ATA	2	6	642631	642636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556637
13588	NC_021490	TGC	2	6	642646	642651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556637
13589	NC_021490	AGC	2	6	642733	642738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556637
13590	NC_021490	GAT	2	6	642748	642753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556637
13591	NC_021490	TTCC	2	8	642761	642768	0 %	50 %	0 %	50 %	512556637
13592	NC_021490	TAG	2	6	642813	642818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556637
13593	NC_021490	GAA	2	6	642857	642862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556637
13594	NC_021490	ACC	2	6	642881	642886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556637
13595	NC_021490	TTTC	2	8	642894	642901	0 %	75 %	0 %	25 %	512556637
13596	NC_021490	TGA	2	6	642942	642947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556637
13597	NC_021490	C	6	6	642993	642998	0 %	0 %	0 %	100 %	512556637
13598	NC_021490	CTA	2	6	643035	643040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556637
13599	NC_021490	CAA	2	6	643050	643055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556637
13600	NC_021490	CCA	2	6	643146	643151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556637
13601	NC_021490	TCG	2	6	643170	643175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556637
13602	NC_021490	GA	3	6	643190	643195	50 %	0 %	50 %	0 %	512556637
13603	NC_021490	AAAG	2	8	643211	643218	75 %	0 %	25 %	0 %	512556637
13604	NC_021490	CTCG	2	8	643219	643226	0 %	25 %	25 %	50 %	512556637
13605	NC_021490	AAG	3	9	643254	643262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556637
13606	NC_021490	CGG	2	6	643288	643293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556637
13607	NC_021490	ACA	2	6	643315	643320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556637
13608	NC_021490	CCG	2	6	643420	643425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556637
13609	NC_021490	A	6	6	643441	643446	100 %	0 %	0 %	0 %	512556637
13610	NC_021490	CT	3	6	643657	643662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13611	NC_021490	AG	3	6	643666	643671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_021490	TACA	2	8	643702	643709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13613	NC_021490	CTG	2	6	643718	643723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_021490	GA	3	6	643765	643770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_021490	GCC	2	6	643774	643779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13616	NC_021490	GTC	2	6	643806	643811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_021490	GC	3	6	643880	643885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13618	NC_021490	ACC	2	6	643898	643903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_021490	CA	3	6	643921	643926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13620	NC_021490	CGCAC	2	10	643937	643946	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13621	NC_021490	GC	3	6	644038	644043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13622	NC_021490	GCG	2	6	644073	644078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_021490	GCC	2	6	644167	644172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13624	NC_021490	A	6	6	644173	644178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13748	NC_021490	GCA	2	6	649421	649426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556642
13749	NC_021490	CGTA	2	8	649427	649434	25 %	25 %	25 %	25 %	512556642
13750	NC_021490	A	7	7	649500	649506	100 %	0 %	0 %	0 %	512556642
13751	NC_021490	AGT	2	6	649538	649543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556642
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13862	NC_021490	CA	3	6	654556	654561	50 %	0 %	0 %	50 %	512556646
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13865	NC_021490	TCT	2	6	654621	654626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556646
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13867	NC_021490	CCT	2	6	654697	654702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556646
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13981	NC_021490	AG	3	6	659704	659709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13982	NC_021490	TC	3	6	659728	659733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13983	NC_021490	CAC	2	6	659737	659742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13984	NC_021490	CA	3	6	659793	659798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13985	NC_021490	GCA	2	6	659869	659874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13987	NC_021490	CAG	2	6	660049	660054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13992	NC_021490	CCA	2	6	660154	660159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
13993	NC_021490	GC	3	6	660162	660167	0 %	0 %	50 %	50 %	512556652
13994	NC_021490	GA	3	6	660221	660226	50 %	0 %	50 %	0 %	512556652
13995	NC_021490	CCG	2	6	660325	660330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556652
13996	NC_021490	CAC	2	6	660335	660340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556652
13997	NC_021490	CA	3	6	660358	660363	50 %	0 %	0 %	50 %	512556652
13998	NC_021490	CAG	2	6	660490	660495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556652
13999	NC_021490	CCT	2	6	660514	660519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556652
14000	NC_021490	TCA	2	6	660525	660530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556652

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