MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021490	T	6	6	569683	569688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_021490	GC	3	6	569783	569788	0 %	0 %	50 %	50 %	512556577
12003	NC_021490	TTG	2	6	569807	569812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556577
12004	NC_021490	TTC	2	6	569858	569863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556577
12005	NC_021490	GGT	2	6	569884	569889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556577
12006	NC_021490	CT	3	6	569926	569931	0 %	50 %	0 %	50 %	512556577
12007	NC_021490	CA	3	6	570007	570012	50 %	0 %	0 %	50 %	512556577
12008	NC_021490	CTC	2	6	570079	570084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556577
12009	NC_021490	CAT	3	9	570096	570104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556577
12010	NC_021490	ATTTT	2	10	570140	570149	20 %	80 %	0 %	0 %	512556577
12011	NC_021490	TCA	2	6	570257	570262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556577
12012	NC_021490	TCC	2	6	570303	570308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556577
12013	NC_021490	GCC	2	6	570346	570351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556577
12014	NC_021490	CTTT	2	8	570492	570499	0 %	75 %	0 %	25 %	512556577
12015	NC_021490	AGA	2	6	570525	570530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556577
12016	NC_021490	CG	3	6	570550	570555	0 %	0 %	50 %	50 %	512556577
12017	NC_021490	GTC	2	6	570574	570579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556577
12018	NC_021490	CATC	2	8	570602	570609	25 %	25 %	0 %	50 %	512556577
12019	NC_021490	GCG	2	6	570729	570734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556577
12020	NC_021490	GCAG	2	8	570742	570749	25 %	0 %	50 %	25 %	512556577
12021	NC_021490	CG	3	6	570782	570787	0 %	0 %	50 %	50 %	512556577
12022	NC_021490	AGC	2	6	570797	570802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556577
12023	NC_021490	GAA	2	6	570820	570825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556577
12024	NC_021490	TCC	2	6	570909	570914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556577
12025	NC_021490	TAT	2	6	570927	570932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556577
12026	NC_021490	AGA	2	6	570939	570944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556577
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12028	NC_021490	ATG	2	6	571003	571008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556577
12029	NC_021490	GAT	2	6	571041	571046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556577
12030	NC_021490	GCG	2	6	571059	571064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556577
12031	NC_021490	GCG	2	6	571099	571104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556577
12032	NC_021490	TCTG	2	8	571107	571114	0 %	50 %	25 %	25 %	512556577
12033	NC_021490	GAA	2	6	571147	571152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556577
12034	NC_021490	A	6	6	571151	571156	100 %	0 %	0 %	0 %	512556577
12035	NC_021490	A	6	6	571158	571163	100 %	0 %	0 %	0 %	512556577
12036	NC_021490	T	6	6	571206	571211	0 %	100 %	0 %	0 %	512556577
12037	NC_021490	CG	3	6	571222	571227	0 %	0 %	50 %	50 %	512556577
12038	NC_021490	AACA	2	8	571243	571250	75 %	0 %	0 %	25 %	512556577
12039	NC_021490	AGC	2	6	571313	571318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556577
12040	NC_021490	CGGG	2	8	571358	571365	0 %	0 %	75 %	25 %	512556577
12041	NC_021490	GAA	2	6	571372	571377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556577
12042	NC_021490	GTGC	2	8	571416	571423	0 %	25 %	50 %	25 %	512556577
12043	NC_021490	TCGC	2	8	571443	571450	0 %	25 %	25 %	50 %	512556577
12044	NC_021490	TG	3	6	571486	571491	0 %	50 %	50 %	0 %	512556577
12045	NC_021490	GTAT	2	8	571544	571551	25 %	50 %	25 %	0 %	512556577
12046	NC_021490	A	7	7	571576	571582	100 %	0 %	0 %	0 %	512556577
12047	NC_021490	GCACG	2	10	571635	571644	20 %	0 %	40 %	40 %	512556577
12048	NC_021490	CG	3	6	571652	571657	0 %	0 %	50 %	50 %	512556577
12049	NC_021490	GAA	2	6	571668	571673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556577
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12051	NC_021490	AAC	2	6	571749	571754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12052	NC_021490	AGC	2	6	571755	571760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12053	NC_021490	GGT	2	6	571791	571796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556578
12054	NC_021490	GC	3	6	571809	571814	0 %	0 %	50 %	50 %	512556578
12055	NC_021490	CTC	2	6	571854	571859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556578
12056	NC_021490	TGCT	2	8	571909	571916	0 %	50 %	25 %	25 %	512556578
12057	NC_021490	TCC	2	6	572023	572028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556578
12058	NC_021490	GCA	2	6	572062	572067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556578
12059	NC_021490	CCT	2	6	572135	572140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556578
12060	NC_021490	GCA	2	6	572179	572184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556578
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12062	NC_021490	AAG	2	6	572205	572210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556578
12063	NC_021490	AGA	2	6	572266	572271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556578
12064	NC_021490	AG	3	6	572285	572290	50 %	0 %	50 %	0 %	512556578
12065	NC_021490	CAAG	2	8	572327	572334	50 %	0 %	25 %	25 %	512556578
12066	NC_021490	TGG	2	6	572390	572395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556578
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12068	NC_021490	CCT	2	6	572535	572540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556579
12069	NC_021490	TCAC	2	8	572561	572568	25 %	25 %	0 %	50 %	512556579
12070	NC_021490	CGATA	2	10	572613	572622	40 %	20 %	20 %	20 %	512556579
12071	NC_021490	CTGA	2	8	572674	572681	25 %	25 %	25 %	25 %	512556579
12072	NC_021490	GGTCA	2	10	572992	573001	20 %	20 %	40 %	20 %	512556579
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12076	NC_021490	GC	3	6	573086	573091	0 %	0 %	50 %	50 %	512556579
12077	NC_021490	GTG	2	6	573161	573166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556579
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12080	NC_021490	ATA	2	6	573281	573286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556579
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12085	NC_021490	ATACCC	2	12	573392	573403	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	512556579
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12088	NC_021490	TGAA	2	8	573563	573570	50 %	25 %	25 %	0 %	512556579
12089	NC_021490	CG	4	8	573585	573592	0 %	0 %	50 %	50 %	512556579
12090	NC_021490	GATAG	2	10	573601	573610	40 %	20 %	40 %	0 %	512556579
12091	NC_021490	AG	3	6	573634	573639	50 %	0 %	50 %	0 %	512556579
12092	NC_021490	AGGC	2	8	573740	573747	25 %	0 %	50 %	25 %	512556579
12093	NC_021490	ACA	2	6	573793	573798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556579
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12095	NC_021490	GGA	2	6	573919	573924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556579
12096	NC_021490	C	7	7	573962	573968	0 %	0 %	0 %	100 %	512556580
12097	NC_021490	TG	3	6	573970	573975	0 %	50 %	50 %	0 %	512556580
12098	NC_021490	CG	3	6	573976	573981	0 %	0 %	50 %	50 %	512556580
12099	NC_021490	GCA	2	6	573982	573987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556580
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12101	NC_021490	CGTA	2	8	574061	574068	25 %	25 %	25 %	25 %	512556580
12102	NC_021490	TACG	2	8	574076	574083	25 %	25 %	25 %	25 %	512556580
12103	NC_021490	GCA	3	9	574136	574144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556580
12104	NC_021490	CTG	2	6	574236	574241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556580
12105	NC_021490	CA	3	6	574265	574270	50 %	0 %	0 %	50 %	512556580
12106	NC_021490	TCT	2	6	574288	574293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556580
12107	NC_021490	GCG	2	6	574369	574374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556580
12108	NC_021490	GC	3	6	574387	574392	0 %	0 %	50 %	50 %	512556580
12109	NC_021490	TACT	2	8	574399	574406	25 %	50 %	0 %	25 %	512556580
12110	NC_021490	CCA	2	6	574407	574412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556580
12111	NC_021490	ACTT	2	8	574416	574423	25 %	50 %	0 %	25 %	512556580
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12113	NC_021490	TG	3	6	574527	574532	0 %	50 %	50 %	0 %	512556580
12114	NC_021490	ATG	2	6	574582	574587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556580
12115	NC_021490	CG	3	6	574601	574606	0 %	0 %	50 %	50 %	512556580
12116	NC_021490	CA	3	6	574608	574613	50 %	0 %	0 %	50 %	512556580
12117	NC_021490	GC	3	6	574630	574635	0 %	0 %	50 %	50 %	512556580
12118	NC_021490	CTC	2	6	574680	574685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556580
12119	NC_021490	TTC	2	6	574695	574700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556580
12120	NC_021490	ATG	2	6	574756	574761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556580
12121	NC_021490	GTA	2	6	574785	574790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556580
12122	NC_021490	AG	3	6	574882	574887	50 %	0 %	50 %	0 %	512556580
12123	NC_021490	AG	3	6	574923	574928	50 %	0 %	50 %	0 %	512556580
12124	NC_021490	ATA	2	6	574975	574980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556580
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12152	NC_021490	GC	3	6	576542	576547	0 %	0 %	50 %	50 %	512556582
12153	NC_021490	G	6	6	576586	576591	0 %	0 %	100 %	0 %	512556582
12154	NC_021490	GC	4	8	576611	576618	0 %	0 %	50 %	50 %	512556582
12155	NC_021490	CCT	2	6	576621	576626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556582
12156	NC_021490	CTA	2	6	576657	576662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556582
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12160	NC_021490	CTCA	2	8	576833	576840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12161	NC_021490	GCC	2	6	576935	576940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12162	NC_021490	GGC	2	6	576954	576959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12164	NC_021490	AC	3	6	576997	577002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12165	NC_021490	TCC	2	6	577036	577041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556583
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12172	NC_021490	A	6	6	577424	577429	100 %	0 %	0 %	0 %	512556583
12173	NC_021490	A	7	7	577523	577529	100 %	0 %	0 %	0 %	512556583
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12194	NC_021490	CTG	2	6	578451	578456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556583
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12203	NC_021490	TCG	2	6	578835	578840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556584
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12227	NC_021490	CA	3	6	579733	579738	50 %	0 %	0 %	50 %	512556584
12228	NC_021490	A	6	6	579745	579750	100 %	0 %	0 %	0 %	512556585
12229	NC_021490	AAGG	2	8	579760	579767	50 %	0 %	50 %	0 %	512556585
12230	NC_021490	TCC	3	9	579785	579793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556585
12231	NC_021490	CTTC	2	8	579906	579913	0 %	50 %	0 %	50 %	512556585
12232	NC_021490	GCC	2	6	579929	579934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556585
12233	NC_021490	TCC	2	6	579998	580003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12234	NC_021490	GGA	2	6	580102	580107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556586
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12236	NC_021490	CCA	2	6	580200	580205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556586
12237	NC_021490	GCTT	2	8	580222	580229	0 %	50 %	25 %	25 %	512556586
12238	NC_021490	CTG	2	6	580230	580235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556586
12239	NC_021490	CGC	2	6	580236	580241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556586
12240	NC_021490	GTC	2	6	580257	580262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556586
12241	NC_021490	CAA	2	6	580275	580280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556586
12242	NC_021490	GAAA	2	8	580286	580293	75 %	0 %	25 %	0 %	512556586
12243	NC_021490	A	6	6	580302	580307	100 %	0 %	0 %	0 %	512556586
12244	NC_021490	CCA	2	6	580393	580398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556586
12245	NC_021490	ACC	2	6	580438	580443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556586
12246	NC_021490	ACC	3	9	580453	580461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556586
12247	NC_021490	A	7	7	580589	580595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12248	NC_021490	CAC	2	6	580620	580625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12249	NC_021490	TAC	2	6	580637	580642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12251	NC_021490	CG	3	6	580740	580745	0 %	0 %	50 %	50 %	512556587
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12255	NC_021490	CA	3	6	580933	580938	50 %	0 %	0 %	50 %	512556587
12256	NC_021490	GC	3	6	580953	580958	0 %	0 %	50 %	50 %	512556587
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12268	NC_021490	CAC	2	6	581534	581539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12320	NC_021490	TTGC	2	8	584146	584153	0 %	50 %	25 %	25 %	512556591
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12351	NC_021490	CA	3	6	585557	585562	50 %	0 %	0 %	50 %	512556592
12352	NC_021490	CTT	2	6	585605	585610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556592
12353	NC_021490	GACA	2	8	585620	585627	50 %	0 %	25 %	25 %	512556592
12354	NC_021490	GC	3	6	585644	585649	0 %	0 %	50 %	50 %	512556592
12355	NC_021490	TAA	2	6	585689	585694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556592
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12357	NC_021490	TCA	2	6	585904	585909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556592
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12362	NC_021490	GTG	2	6	586348	586353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556592
12363	NC_021490	C	6	6	586388	586393	0 %	0 %	0 %	100 %	512556592
12364	NC_021490	GAA	2	6	586394	586399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556592
12365	NC_021490	AG	3	6	586442	586447	50 %	0 %	50 %	0 %	512556592
12366	NC_021490	GAT	2	6	586459	586464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12367	NC_021490	ACCGC	2	10	586493	586502	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12368	NC_021490	ACTC	2	8	586515	586522	25 %	25 %	0 %	50 %	512556593
12369	NC_021490	GCA	2	6	586524	586529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556593
12370	NC_021490	CTT	3	9	586591	586599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556593
12371	NC_021490	CCG	2	6	586654	586659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556593
12372	NC_021490	GCA	2	6	586752	586757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556593
12373	NC_021490	ATC	2	6	586760	586765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556593
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12375	NC_021490	CA	3	6	586903	586908	50 %	0 %	0 %	50 %	512556593
12376	NC_021490	GCA	2	6	587091	587096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556593
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12379	NC_021490	GCT	2	6	587298	587303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556594
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12382	NC_021490	ACAG	2	8	587348	587355	50 %	0 %	25 %	25 %	512556594
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12390	NC_021490	GC	3	6	587761	587766	0 %	0 %	50 %	50 %	512556594
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12392	NC_021490	CGGTA	2	10	587865	587874	20 %	20 %	40 %	20 %	512556594
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12407	NC_021490	CCACG	2	10	588945	588954	20 %	0 %	20 %	60 %	512556594
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12411	NC_021490	CTC	2	6	589117	589122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12493	NC_021490	CCA	2	6	592775	592780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556597
12494	NC_021490	CAC	2	6	592842	592847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556597
12495	NC_021490	TTC	2	6	592863	592868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556597
12496	NC_021490	GCG	2	6	592877	592882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556597
12497	NC_021490	AGAT	2	8	592917	592924	50 %	25 %	25 %	0 %	512556597
12498	NC_021490	CG	4	8	592951	592958	0 %	0 %	50 %	50 %	512556597
12499	NC_021490	GGT	2	6	593018	593023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556597
12500	NC_021490	CGC	2	6	593066	593071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556597

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