MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_021490	TTA	2	6	545113	545118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556560
11503	NC_021490	TGA	2	6	545178	545183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556560
11504	NC_021490	CAG	2	6	545251	545256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556560
11505	NC_021490	AAT	2	6	545268	545273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556560
11506	NC_021490	G	6	6	545304	545309	0 %	0 %	100 %	0 %	512556560
11507	NC_021490	TGG	2	6	545370	545375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556560
11508	NC_021490	CGTT	2	8	545378	545385	0 %	50 %	25 %	25 %	512556560
11509	NC_021490	GT	3	6	545413	545418	0 %	50 %	50 %	0 %	512556560
11510	NC_021490	GAT	2	6	545500	545505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556560
11511	NC_021490	GTCTT	2	10	545663	545672	0 %	60 %	20 %	20 %	512556560
11512	NC_021490	TGA	2	6	545673	545678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556560
11513	NC_021490	CAG	2	6	545701	545706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556560
11514	NC_021490	A	6	6	545717	545722	100 %	0 %	0 %	0 %	512556560
11515	NC_021490	GAA	2	6	545820	545825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556560
11516	NC_021490	TGGTG	2	10	545884	545893	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_021490	ACTTT	2	10	545916	545925	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11518	NC_021490	GTTT	2	8	545931	545938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_021490	G	6	6	546034	546039	0 %	0 %	100 %	0 %	512556561
11520	NC_021490	TG	3	6	546117	546122	0 %	50 %	50 %	0 %	512556561
11521	NC_021490	CG	4	8	546144	546151	0 %	0 %	50 %	50 %	512556561
11522	NC_021490	GACA	2	8	546237	546244	50 %	0 %	25 %	25 %	512556561
11523	NC_021490	GAT	2	6	546267	546272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556561
11524	NC_021490	GTT	2	6	546312	546317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556561
11525	NC_021490	TCAG	2	8	546438	546445	25 %	25 %	25 %	25 %	512556561
11526	NC_021490	GC	3	6	546560	546565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_021490	TGC	2	6	546598	546603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_021490	TG	3	6	546610	546615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_021490	GCA	2	6	546651	546656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_021490	A	6	6	546707	546712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_021490	CCA	2	6	546789	546794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556562
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11533	NC_021490	CG	3	6	546906	546911	0 %	0 %	50 %	50 %	512556562
11534	NC_021490	CCG	2	6	546923	546928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556562
11535	NC_021490	CTG	2	6	546955	546960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556562
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11538	NC_021490	CG	3	6	547246	547251	0 %	0 %	50 %	50 %	512556562
11539	NC_021490	CA	3	6	547374	547379	50 %	0 %	0 %	50 %	512556562
11540	NC_021490	GCT	2	6	547467	547472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556562
11541	NC_021490	ACT	2	6	547475	547480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556562
11542	NC_021490	CGT	2	6	547563	547568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556562
11543	NC_021490	TCA	2	6	547610	547615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556562
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11546	NC_021490	TCT	2	6	547820	547825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556562
11547	NC_021490	GGA	2	6	547982	547987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556562
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11550	NC_021490	ACC	2	6	548222	548227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556562
11551	NC_021490	GCA	2	6	548246	548251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556562
11552	NC_021490	GC	3	6	548255	548260	0 %	0 %	50 %	50 %	512556562
11553	NC_021490	AC	3	6	548347	548352	50 %	0 %	0 %	50 %	512556562
11554	NC_021490	TGT	2	6	548397	548402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556562
11555	NC_021490	TGC	2	6	548417	548422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556562
11556	NC_021490	CG	4	8	548437	548444	0 %	0 %	50 %	50 %	512556562
11557	NC_021490	GC	3	6	548537	548542	0 %	0 %	50 %	50 %	512556562
11558	NC_021490	TAG	2	6	548544	548549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556562
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11561	NC_021490	GTG	2	6	548710	548715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556563
11562	NC_021490	A	6	6	548756	548761	100 %	0 %	0 %	0 %	512556563
11563	NC_021490	GCT	2	6	548778	548783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556563
11564	NC_021490	TAC	2	6	548785	548790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556563
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11566	NC_021490	GC	3	6	548889	548894	0 %	0 %	50 %	50 %	512556563
11567	NC_021490	TCTG	2	8	548904	548911	0 %	50 %	25 %	25 %	512556563
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11569	NC_021490	GCTC	2	8	549011	549018	0 %	25 %	25 %	50 %	512556563
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11575	NC_021490	CCT	2	6	549329	549334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556564
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11582	NC_021490	TGC	2	6	549689	549694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556564
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11586	NC_021490	GGA	2	6	549905	549910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556564
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11590	NC_021490	AAG	2	6	550065	550070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556564
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11593	NC_021490	GC	3	6	550235	550240	0 %	0 %	50 %	50 %	512556564
11594	NC_021490	GGC	2	6	550249	550254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556564
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11598	NC_021490	GCG	2	6	550413	550418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556564
11599	NC_021490	GC	3	6	550484	550489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11600	NC_021490	A	7	7	550499	550505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_021490	CTA	2	6	550513	550518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11604	NC_021490	TTG	2	6	550613	550618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556565
11605	NC_021490	TCA	2	6	550677	550682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556565
11606	NC_021490	TTG	2	6	550736	550741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556565
11607	NC_021490	TG	3	6	550775	550780	0 %	50 %	50 %	0 %	512556565
11608	NC_021490	GCC	2	6	550786	550791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556565
11609	NC_021490	GT	3	6	550852	550857	0 %	50 %	50 %	0 %	512556565
11610	NC_021490	TGCG	2	8	550916	550923	0 %	25 %	50 %	25 %	512556565
11611	NC_021490	CT	3	6	551038	551043	0 %	50 %	0 %	50 %	512556565
11612	NC_021490	CGT	2	6	551050	551055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556565
11613	NC_021490	TTG	2	6	551072	551077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556565
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11615	NC_021490	A	8	8	551220	551227	100 %	0 %	0 %	0 %	512556565
11616	NC_021490	GGTA	2	8	551250	551257	25 %	25 %	50 %	0 %	512556565
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11619	NC_021490	T	6	6	551439	551444	0 %	100 %	0 %	0 %	512556565
11620	NC_021490	ACC	2	6	551482	551487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556565
11621	NC_021490	TAA	2	6	551490	551495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556565
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11623	NC_021490	TAT	2	6	551646	551651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556565
11624	NC_021490	CATA	2	8	551682	551689	50 %	25 %	0 %	25 %	512556565
11625	NC_021490	C	6	6	551741	551746	0 %	0 %	0 %	100 %	512556565
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11690	NC_021490	ATT	3	9	555005	555013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556567
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11734	NC_021490	TGC	2	6	557023	557028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556567
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11737	NC_021490	CT	3	6	557141	557146	0 %	50 %	0 %	50 %	512556567
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11739	NC_021490	TCTT	2	8	557293	557300	0 %	75 %	0 %	25 %	512556567
11740	NC_021490	TCT	2	6	557302	557307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556567
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11869	NC_021490	ATG	2	6	563630	563635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556572
11870	NC_021490	CA	3	6	563660	563665	50 %	0 %	0 %	50 %	512556572
11871	NC_021490	TG	3	6	563750	563755	0 %	50 %	50 %	0 %	512556572
11872	NC_021490	T	6	6	563756	563761	0 %	100 %	0 %	0 %	512556572
11873	NC_021490	TCGG	2	8	563765	563772	0 %	25 %	50 %	25 %	512556572
11874	NC_021490	CTT	2	6	563819	563824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556572
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11879	NC_021490	CTG	2	6	564076	564081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556572
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11882	NC_021490	TCGT	2	8	564238	564245	0 %	50 %	25 %	25 %	512556572
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11887	NC_021490	CG	3	6	564456	564461	0 %	0 %	50 %	50 %	512556572
11888	NC_021490	GCA	2	6	564473	564478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556572
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11901	NC_021490	CAA	2	6	564958	564963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556573
11902	NC_021490	CTG	2	6	564964	564969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556573
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11908	NC_021490	GT	3	6	565149	565154	0 %	50 %	50 %	0 %	512556574
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11910	NC_021490	GCA	2	6	565262	565267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556574
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11956	NC_021490	TCG	2	6	567362	567367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556575
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11958	NC_021490	GC	4	8	567518	567525	0 %	0 %	50 %	50 %	512556575
11959	NC_021490	CGG	2	6	567559	567564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556575
11960	NC_021490	CAG	2	6	567571	567576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556575
11961	NC_021490	GAT	2	6	567577	567582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556575
11962	NC_021490	TCA	2	6	567668	567673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556575
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11964	NC_021490	TCC	2	6	567704	567709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556575
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11969	NC_021490	T	6	6	568030	568035	0 %	100 %	0 %	0 %	512556575
11970	NC_021490	AT	3	6	568037	568042	50 %	50 %	0 %	0 %	512556575
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11973	NC_021490	TGC	2	6	568094	568099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556575
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11975	NC_021490	TCT	2	6	568184	568189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556575
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11978	NC_021490	CAA	2	6	568615	568620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556575
11979	NC_021490	TCA	2	6	568622	568627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556575
11980	NC_021490	ACT	2	6	568634	568639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556575
11981	NC_021490	GC	3	6	568679	568684	0 %	0 %	50 %	50 %	512556575
11982	NC_021490	TGC	2	6	568708	568713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556575
11983	NC_021490	GC	3	6	568766	568771	0 %	0 %	50 %	50 %	512556575
11984	NC_021490	TCC	2	6	568772	568777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556575
11985	NC_021490	CGGC	2	8	568839	568846	0 %	0 %	50 %	50 %	512556575
11986	NC_021490	CGT	2	6	568854	568859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556575
11987	NC_021490	TTC	2	6	568874	568879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556575
11988	NC_021490	A	6	6	568943	568948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11989	NC_021490	AG	3	6	569007	569012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11990	NC_021490	TGC	2	6	569118	569123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556576
11991	NC_021490	GC	3	6	569128	569133	0 %	0 %	50 %	50 %	512556576
11992	NC_021490	CTCA	2	8	569167	569174	25 %	25 %	0 %	50 %	512556576
11993	NC_021490	TCAGTA	2	12	569229	569240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	512556576
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11997	NC_021490	CAAG	2	8	569517	569524	50 %	0 %	25 %	25 %	512556576
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12000	NC_021490	CAC	2	6	569662	569667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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