MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021490	GCA	2	6	497566	497571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556524
10502	NC_021490	GCA	2	6	497608	497613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556524
10503	NC_021490	CACG	2	8	497656	497663	25 %	0 %	25 %	50 %	512556524
10504	NC_021490	A	6	6	497754	497759	100 %	0 %	0 %	0 %	512556524
10505	NC_021490	CGC	2	6	497790	497795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556524
10506	NC_021490	GTT	2	6	497917	497922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556524
10507	NC_021490	GTC	2	6	497925	497930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556524
10508	NC_021490	CTTC	2	8	498002	498009	0 %	50 %	0 %	50 %	512556524
10509	NC_021490	CTG	2	6	498113	498118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556524
10510	NC_021490	AC	3	6	498164	498169	50 %	0 %	0 %	50 %	512556524
10511	NC_021490	CGT	2	6	498190	498195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556524
10512	NC_021490	GTG	2	6	498234	498239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556524
10513	NC_021490	GC	3	6	498265	498270	0 %	0 %	50 %	50 %	512556524
10514	NC_021490	CGGGG	2	10	498349	498358	0 %	0 %	80 %	20 %	512556524
10515	NC_021490	CG	3	6	498367	498372	0 %	0 %	50 %	50 %	512556524
10516	NC_021490	CT	3	6	498405	498410	0 %	50 %	0 %	50 %	512556524
10517	NC_021490	CTC	2	6	498450	498455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556524
10518	NC_021490	TTC	2	6	498477	498482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556524
10519	NC_021490	TCC	2	6	498532	498537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556524
10520	NC_021490	GCA	2	6	498548	498553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556524
10521	NC_021490	CCAG	2	8	498566	498573	25 %	0 %	25 %	50 %	512556524
10522	NC_021490	CTC	3	9	498597	498605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556524
10523	NC_021490	GC	3	6	498640	498645	0 %	0 %	50 %	50 %	512556524
10524	NC_021490	ACC	2	6	498646	498651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556524
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10526	NC_021490	AAG	2	6	498687	498692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556524
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10529	NC_021490	TCC	2	6	498773	498778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10530	NC_021490	CG	3	6	498797	498802	0 %	0 %	50 %	50 %	512556525
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10532	NC_021490	GC	4	8	498825	498832	0 %	0 %	50 %	50 %	512556525
10533	NC_021490	CCT	2	6	498852	498857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
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10539	NC_021490	CCT	2	6	498924	498929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10540	NC_021490	TCC	2	6	498941	498946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10541	NC_021490	CCT	2	6	498948	498953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
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10547	NC_021490	CCT	2	6	499020	499025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
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10553	NC_021490	CCT	2	6	499092	499097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10554	NC_021490	TCC	2	6	499109	499114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10555	NC_021490	CCT	2	6	499116	499121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10556	NC_021490	TCC	2	6	499133	499138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10557	NC_021490	CCT	2	6	499140	499145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10558	NC_021490	TCC	2	6	499157	499162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10559	NC_021490	CCT	2	6	499164	499169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
10560	NC_021490	TCC	2	6	499181	499186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556525
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10571	NC_021490	CTGT	2	8	499590	499597	0 %	50 %	25 %	25 %	512556525
10572	NC_021490	TGC	2	6	499621	499626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556525
10573	NC_021490	TGCTG	2	10	499646	499655	0 %	40 %	40 %	20 %	512556525
10574	NC_021490	CTG	2	6	499678	499683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556525
10575	NC_021490	CTG	2	6	499687	499692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556525
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10578	NC_021490	GGC	2	6	499876	499881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556526
10579	NC_021490	CTG	2	6	499900	499905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556526
10580	NC_021490	GCG	2	6	499909	499914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556526
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10582	NC_021490	TGG	2	6	499985	499990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556526
10583	NC_021490	A	6	6	499991	499996	100 %	0 %	0 %	0 %	512556526
10584	NC_021490	GGAAG	2	10	500106	500115	40 %	0 %	60 %	0 %	512556526
10585	NC_021490	GC	3	6	500139	500144	0 %	0 %	50 %	50 %	512556526
10586	NC_021490	CAG	3	9	500148	500156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556526
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10588	NC_021490	GAG	2	6	500236	500241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556526
10589	NC_021490	CTT	2	6	500260	500265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556526
10590	NC_021490	TGC	2	6	500400	500405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556526
10591	NC_021490	CTT	2	6	500419	500424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556526
10592	NC_021490	CT	3	6	500498	500503	0 %	50 %	0 %	50 %	512556526
10593	NC_021490	GAAA	2	8	500526	500533	75 %	0 %	25 %	0 %	512556526
10594	NC_021490	GCG	2	6	500542	500547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556526
10595	NC_021490	GAG	2	6	500574	500579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556526
10596	NC_021490	TGC	2	6	500585	500590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556526
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10598	NC_021490	TGCGC	2	10	500670	500679	0 %	20 %	40 %	40 %	512556526
10599	NC_021490	CCT	2	6	500732	500737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556526
10600	NC_021490	A	7	7	500744	500750	100 %	0 %	0 %	0 %	512556526
10601	NC_021490	GTT	2	6	501043	501048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556526
10602	NC_021490	T	6	6	501047	501052	0 %	100 %	0 %	0 %	512556526
10603	NC_021490	GC	3	6	501087	501092	0 %	0 %	50 %	50 %	512556526
10604	NC_021490	GTG	3	9	501133	501141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556526
10605	NC_021490	TCT	2	6	501145	501150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556526
10606	NC_021490	CGT	3	9	501236	501244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556526
10607	NC_021490	TTC	2	6	501322	501327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556527
10608	NC_021490	GTT	2	6	501341	501346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556527
10609	NC_021490	GT	3	6	501371	501376	0 %	50 %	50 %	0 %	512556527
10610	NC_021490	GAAC	2	8	501442	501449	50 %	0 %	25 %	25 %	512556527
10611	NC_021490	AGCA	2	8	501457	501464	50 %	0 %	25 %	25 %	512556527
10612	NC_021490	TG	3	6	501468	501473	0 %	50 %	50 %	0 %	512556527
10613	NC_021490	CTTT	2	8	501522	501529	0 %	75 %	0 %	25 %	512556527
10614	NC_021490	GCA	2	6	501588	501593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556527
10615	NC_021490	TGCAG	2	10	501596	501605	20 %	20 %	40 %	20 %	512556527
10616	NC_021490	CGA	2	6	501611	501616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556527
10617	NC_021490	GTG	2	6	501627	501632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556527
10618	NC_021490	GCA	2	6	501722	501727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556527
10619	NC_021490	GT	3	6	501786	501791	0 %	50 %	50 %	0 %	512556527
10620	NC_021490	CGG	2	6	501800	501805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556527
10621	NC_021490	TGA	2	6	502097	502102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556527
10622	NC_021490	GC	3	6	502110	502115	0 %	0 %	50 %	50 %	512556527
10623	NC_021490	GT	3	6	502125	502130	0 %	50 %	50 %	0 %	512556527
10624	NC_021490	TGCAG	2	10	502150	502159	20 %	20 %	40 %	20 %	512556527
10625	NC_021490	CGT	2	6	502161	502166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556527
10626	NC_021490	TGG	2	6	502188	502193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556527
10627	NC_021490	GAA	2	6	502283	502288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556527
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10629	NC_021490	GTATG	2	10	502410	502419	20 %	40 %	40 %	0 %	512556527
10630	NC_021490	AGT	2	6	502425	502430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556527
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10635	NC_021490	ATC	2	6	502639	502644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556527
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10640	NC_021490	GA	3	6	502782	502787	50 %	0 %	50 %	0 %	512556527
10641	NC_021490	TAG	2	6	502826	502831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556527
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10643	NC_021490	GGT	2	6	502858	502863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556527
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10646	NC_021490	T	7	7	503065	503071	0 %	100 %	0 %	0 %	512556527
10647	NC_021490	GT	3	6	503076	503081	0 %	50 %	50 %	0 %	512556527
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10652	NC_021490	AAG	2	6	503187	503192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556527
10653	NC_021490	GA	3	6	503314	503319	50 %	0 %	50 %	0 %	512556527
10654	NC_021490	CCA	2	6	503346	503351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10655	NC_021490	AAG	2	6	503434	503439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556528
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10731	NC_021490	CCTG	2	8	507901	507908	0 %	25 %	25 %	50 %	512556531
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10737	NC_021490	ACG	2	6	508322	508327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556532
10738	NC_021490	GT	3	6	508379	508384	0 %	50 %	50 %	0 %	512556532
10739	NC_021490	GCACG	2	10	508420	508429	20 %	0 %	40 %	40 %	512556532
10740	NC_021490	GCG	2	6	508472	508477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556532
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10743	NC_021490	G	6	6	508591	508596	0 %	0 %	100 %	0 %	512556532
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10987	NC_021490	TTCC	2	8	519871	519878	0 %	50 %	0 %	50 %	512556540
10988	NC_021490	CCA	2	6	519955	519960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556540
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10990	NC_021490	GA	3	6	520089	520094	50 %	0 %	50 %	0 %	512556540
10991	NC_021490	ACC	2	6	520104	520109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556540
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