MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021490	TGC	2	6	430518	430523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556461
9002	NC_021490	GT	3	6	430634	430639	0 %	50 %	50 %	0 %	512556462
9003	NC_021490	AGCGT	2	10	430673	430682	20 %	20 %	40 %	20 %	512556462
9004	NC_021490	A	7	7	430867	430873	100 %	0 %	0 %	0 %	512556462
9005	NC_021490	AC	3	6	430899	430904	50 %	0 %	0 %	50 %	512556462
9006	NC_021490	A	7	7	430924	430930	100 %	0 %	0 %	0 %	512556462
9007	NC_021490	CGA	2	6	430938	430943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556462
9008	NC_021490	TG	3	6	431004	431009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_021490	GC	3	6	431071	431076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9010	NC_021490	GTG	2	6	431101	431106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_021490	GAT	2	6	431176	431181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_021490	AGG	2	6	431236	431241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556463
9013	NC_021490	CGTG	2	8	431266	431273	0 %	25 %	50 %	25 %	512556463
9014	NC_021490	ATT	2	6	431345	431350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556463
9015	NC_021490	GCGT	2	8	431353	431360	0 %	25 %	50 %	25 %	512556463
9016	NC_021490	CAC	2	6	431394	431399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556463
9017	NC_021490	TGTC	2	8	431427	431434	0 %	50 %	25 %	25 %	512556463
9018	NC_021490	TGCG	2	8	431451	431458	0 %	25 %	50 %	25 %	512556463
9019	NC_021490	GTG	2	6	431474	431479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556463
9020	NC_021490	GTG	2	6	431483	431488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556463
9021	NC_021490	GT	4	8	431605	431612	0 %	50 %	50 %	0 %	512556463
9022	NC_021490	TGCG	2	8	431619	431626	0 %	25 %	50 %	25 %	512556463
9023	NC_021490	GC	3	6	431699	431704	0 %	0 %	50 %	50 %	512556463
9024	NC_021490	TGCTCG	2	12	431739	431750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556463
9025	NC_021490	GGT	2	6	431812	431817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556463
9026	NC_021490	CGC	2	6	431887	431892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556463
9027	NC_021490	GC	3	6	431909	431914	0 %	0 %	50 %	50 %	512556463
9028	NC_021490	GCA	2	6	431950	431955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556463
9029	NC_021490	T	6	6	431977	431982	0 %	100 %	0 %	0 %	512556463
9030	NC_021490	GTGC	2	8	432012	432019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9031	NC_021490	TG	4	8	432022	432029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_021490	TG	3	6	432032	432037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_021490	AG	3	6	432051	432056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_021490	TGC	2	6	432074	432079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_021490	GC	3	6	432198	432203	0 %	0 %	50 %	50 %	512556464
9036	NC_021490	TGCG	2	8	432208	432215	0 %	25 %	50 %	25 %	512556464
9037	NC_021490	GTGCG	2	10	432220	432229	0 %	20 %	60 %	20 %	512556464
9038	NC_021490	CGT	2	6	432240	432245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556464
9039	NC_021490	T	9	9	432279	432287	0 %	100 %	0 %	0 %	512556464
9040	NC_021490	CGCGC	2	10	432305	432314	0 %	0 %	40 %	60 %	512556464
9041	NC_021490	AGA	2	6	432329	432334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556464
9042	NC_021490	GGC	2	6	432436	432441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556464
9043	NC_021490	TCC	2	6	432473	432478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556464
9044	NC_021490	G	6	6	432499	432504	0 %	0 %	100 %	0 %	512556464
9045	NC_021490	GC	3	6	432506	432511	0 %	0 %	50 %	50 %	512556464
9046	NC_021490	GAG	2	6	432537	432542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556464
9047	NC_021490	GAA	2	6	432609	432614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556464
9048	NC_021490	GC	3	6	432652	432657	0 %	0 %	50 %	50 %	512556464
9049	NC_021490	GCA	2	6	432660	432665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556464
9050	NC_021490	TG	3	6	432681	432686	0 %	50 %	50 %	0 %	512556464
9051	NC_021490	AGA	2	6	433023	433028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556465
9052	NC_021490	A	7	7	433094	433100	100 %	0 %	0 %	0 %	512556465
9053	NC_021490	GAA	2	6	433126	433131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556465
9054	NC_021490	TAA	2	6	433258	433263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556465
9055	NC_021490	TCT	2	6	433268	433273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556465
9056	NC_021490	TCG	2	6	433275	433280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556465
9057	NC_021490	GCA	2	6	433321	433326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556465
9058	NC_021490	CG	3	6	433365	433370	0 %	0 %	50 %	50 %	512556465
9059	NC_021490	GAA	2	6	433562	433567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556465
9060	NC_021490	AGG	2	6	433620	433625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556465
9061	NC_021490	CCT	2	6	433639	433644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556465
9062	NC_021490	GCA	3	9	433651	433659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556465
9063	NC_021490	GT	3	6	433777	433782	0 %	50 %	50 %	0 %	512556465
9064	NC_021490	TAC	2	6	433816	433821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556465
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9067	NC_021490	AGGA	2	8	433979	433986	50 %	0 %	50 %	0 %	512556465
9068	NC_021490	GATG	2	8	433987	433994	25 %	25 %	50 %	0 %	512556465
9069	NC_021490	AG	3	6	434015	434020	50 %	0 %	50 %	0 %	512556465
9070	NC_021490	ACAGA	2	10	434072	434081	60 %	0 %	20 %	20 %	512556465
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9072	NC_021490	GCA	2	6	434152	434157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556465
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9077	NC_021490	GAGTG	2	10	434321	434330	20 %	20 %	60 %	0 %	512556465
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9079	NC_021490	GAA	2	6	434441	434446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556465
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9082	NC_021490	GA	4	8	434603	434610	50 %	0 %	50 %	0 %	512556465
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9089	NC_021490	AGA	2	6	434901	434906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556465
9090	NC_021490	TGA	2	6	434932	434937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556465
9091	NC_021490	TG	3	6	434949	434954	0 %	50 %	50 %	0 %	512556465
9092	NC_021490	GACAG	2	10	435004	435013	40 %	0 %	40 %	20 %	512556465
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9095	NC_021490	AGGT	2	8	435147	435154	25 %	25 %	50 %	0 %	512556465
9096	NC_021490	TGC	2	6	435198	435203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556465
9097	NC_021490	CTGA	2	8	435302	435309	25 %	25 %	25 %	25 %	512556465
9098	NC_021490	GAG	2	6	435389	435394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556465
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9101	NC_021490	TGC	2	6	435469	435474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556465
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9108	NC_021490	CAAA	2	8	435963	435970	75 %	0 %	0 %	25 %	512556465
9109	NC_021490	GCC	2	6	435988	435993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556465
9110	NC_021490	GAC	2	6	436043	436048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556465
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9112	NC_021490	GC	3	6	436137	436142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9113	NC_021490	CG	4	8	436144	436151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_021490	AGA	2	6	436159	436164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_021490	T	6	6	436186	436191	0 %	100 %	0 %	0 %	512556466
9116	NC_021490	GC	3	6	436206	436211	0 %	0 %	50 %	50 %	512556466
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9118	NC_021490	GC	3	6	436223	436228	0 %	0 %	50 %	50 %	512556466
9119	NC_021490	CGCT	2	8	436299	436306	0 %	25 %	25 %	50 %	512556466
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9124	NC_021490	CGG	2	6	436423	436428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556467
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9499	NC_021490	GGC	2	6	451834	451839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556479
9500	NC_021490	GGTG	2	8	451865	451872	0 %	25 %	75 %	0 %	512556479

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