MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_021490	AAT	2	6	407168	407173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556438
8503	NC_021490	GATG	2	8	407306	407313	25 %	25 %	50 %	0 %	512556438
8504	NC_021490	T	6	6	407329	407334	0 %	100 %	0 %	0 %	512556438
8505	NC_021490	CA	3	6	407335	407340	50 %	0 %	0 %	50 %	512556438
8506	NC_021490	TG	3	6	407481	407486	0 %	50 %	50 %	0 %	512556438
8507	NC_021490	CGA	2	6	407494	407499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556438
8508	NC_021490	GCT	2	6	407508	407513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556438
8509	NC_021490	ACA	2	6	407561	407566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556438
8510	NC_021490	AGG	3	9	407582	407590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556438
8511	NC_021490	GA	3	6	407602	407607	50 %	0 %	50 %	0 %	512556438
8512	NC_021490	TCA	2	6	407652	407657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556438
8513	NC_021490	GC	3	6	407786	407791	0 %	0 %	50 %	50 %	512556438
8514	NC_021490	GGC	2	6	407867	407872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556438
8515	NC_021490	TG	3	6	407887	407892	0 %	50 %	50 %	0 %	512556438
8516	NC_021490	CGT	2	6	407927	407932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556438
8517	NC_021490	ATC	2	6	408039	408044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556438
8518	NC_021490	GAGT	2	8	408088	408095	25 %	25 %	50 %	0 %	512556438
8519	NC_021490	TGC	2	6	408158	408163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556438
8520	NC_021490	GAT	2	6	408212	408217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556438
8521	NC_021490	GC	3	6	408294	408299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8522	NC_021490	CCA	2	6	408307	408312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8523	NC_021490	AGC	2	6	408376	408381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556439
8524	NC_021490	TTC	2	6	408401	408406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556439
8525	NC_021490	TTGGC	2	10	408411	408420	0 %	40 %	40 %	20 %	512556439
8526	NC_021490	GTAG	2	8	408428	408435	25 %	25 %	50 %	0 %	512556439
8527	NC_021490	CAG	2	6	408471	408476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556439
8528	NC_021490	A	7	7	408486	408492	100 %	0 %	0 %	0 %	512556439
8529	NC_021490	TGC	2	6	408579	408584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556439
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8531	NC_021490	CAG	2	6	408780	408785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556439
8532	NC_021490	CGG	2	6	408802	408807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556439
8533	NC_021490	TGA	2	6	408809	408814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556439
8534	NC_021490	CA	3	6	408899	408904	50 %	0 %	0 %	50 %	512556439
8535	NC_021490	A	7	7	408922	408928	100 %	0 %	0 %	0 %	512556439
8536	NC_021490	CG	4	8	408942	408949	0 %	0 %	50 %	50 %	512556439
8537	NC_021490	AGC	2	6	408967	408972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556439
8538	NC_021490	AGC	2	6	408991	408996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556439
8539	NC_021490	GAA	2	6	409013	409018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556439
8540	NC_021490	CGAC	2	8	409022	409029	25 %	0 %	25 %	50 %	512556439
8541	NC_021490	C	12	12	409105	409116	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8542	NC_021490	AAG	2	6	409196	409201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_021490	AGGG	2	8	409214	409221	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_021490	ATGT	2	8	409223	409230	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_021490	GGA	2	6	409292	409297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_021490	GGA	2	6	409332	409337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556440
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8548	NC_021490	CCTG	2	8	409457	409464	0 %	25 %	25 %	50 %	512556440
8549	NC_021490	TTC	2	6	409497	409502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556440
8550	NC_021490	TGC	2	6	409550	409555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556440
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8552	NC_021490	CG	3	6	409594	409599	0 %	0 %	50 %	50 %	512556440
8553	NC_021490	CCTT	2	8	409618	409625	0 %	50 %	0 %	50 %	512556440
8554	NC_021490	GCC	2	6	409636	409641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556440
8555	NC_021490	CG	4	8	409696	409703	0 %	0 %	50 %	50 %	512556440
8556	NC_021490	CA	3	6	409797	409802	50 %	0 %	0 %	50 %	512556441
8557	NC_021490	AGG	2	6	409807	409812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556441
8558	NC_021490	GTT	2	6	409892	409897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556441
8559	NC_021490	GA	3	6	409940	409945	50 %	0 %	50 %	0 %	512556441
8560	NC_021490	GGGGCG	2	12	409947	409958	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	512556441
8561	NC_021490	T	6	6	409959	409964	0 %	100 %	0 %	0 %	512556441
8562	NC_021490	AC	4	8	409991	409998	50 %	0 %	0 %	50 %	512556441
8563	NC_021490	GC	3	6	410076	410081	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
8564	NC_021490	GGT	2	6	410119	410124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556441
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8567	NC_021490	T	6	6	410258	410263	0 %	100 %	0 %	0 %	512556441
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8572	NC_021490	CG	3	6	410423	410428	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
8573	NC_021490	GC	3	6	410449	410454	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
8574	NC_021490	GC	4	8	410481	410488	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
8575	NC_021490	GC	3	6	410505	410510	0 %	0 %	50 %	50 %	512556441
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8585	NC_021490	TGC	2	6	410861	410866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556441
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8590	NC_021490	GTG	2	6	411093	411098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556442
8591	NC_021490	ACG	2	6	411106	411111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556442
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8596	NC_021490	GTG	2	6	411422	411427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556443
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8599	NC_021490	TTA	2	6	411626	411631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556443
8600	NC_021490	CG	3	6	411682	411687	0 %	0 %	50 %	50 %	512556443
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8607	NC_021490	GCA	2	6	411909	411914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556443
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8609	NC_021490	T	6	6	411941	411946	0 %	100 %	0 %	0 %	512556443
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8623	NC_021490	GAGT	2	8	412834	412841	25 %	25 %	50 %	0 %	512556444
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8877	NC_021490	GTA	2	6	424889	424894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556456
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8884	NC_021490	GTCG	2	8	425494	425501	0 %	25 %	50 %	25 %	512556456
8885	NC_021490	AAG	2	6	425504	425509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556456
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8888	NC_021490	GAAG	2	8	425635	425642	50 %	0 %	50 %	0 %	512556456
8889	NC_021490	CTG	2	6	425673	425678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556456
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8984	NC_021490	TCGA	2	8	429686	429693	25 %	25 %	25 %	25 %	512556460
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8989	NC_021490	ACGCGC	2	12	429871	429882	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	512556460
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8996	NC_021490	GC	3	6	430026	430031	0 %	0 %	50 %	50 %	512556461
8997	NC_021490	TGCG	2	8	430032	430039	0 %	25 %	50 %	25 %	512556461
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8999	NC_021490	AGTG	2	8	430435	430442	25 %	25 %	50 %	0 %	512556461
9000	NC_021490	CAG	2	6	430493	430498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556461

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