MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_021490	CAC	2	6	385074	385079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556422
8003	NC_021490	AGT	2	6	385118	385123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556422
8004	NC_021490	GC	4	8	385156	385163	0 %	0 %	50 %	50 %	512556422
8005	NC_021490	GCA	2	6	385171	385176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556422
8006	NC_021490	CGC	2	6	385213	385218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556422
8007	NC_021490	GCG	3	9	385224	385232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556422
8008	NC_021490	CGC	2	6	385274	385279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_021490	GA	4	8	385302	385309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021490	CGC	2	6	385338	385343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_021490	ACG	2	6	385354	385359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_021490	GTC	2	6	385380	385385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_021490	GAC	2	6	385465	385470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_021490	CG	3	6	385471	385476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_021490	ACC	2	6	385584	385589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_021490	GC	3	6	385622	385627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8018	NC_021490	AGC	2	6	385815	385820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556423
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8022	NC_021490	TGC	2	6	385912	385917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556423
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8029	NC_021490	GCG	2	6	386156	386161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556423
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8033	NC_021490	TGA	2	6	386364	386369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556423
8034	NC_021490	CGG	2	6	386377	386382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556423
8035	NC_021490	TGT	2	6	386476	386481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556423
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8044	NC_021490	CTTA	2	8	386967	386974	25 %	50 %	0 %	25 %	512556423
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8052	NC_021490	AGGAG	2	10	387256	387265	40 %	0 %	60 %	0 %	512556423
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8054	NC_021490	TC	3	6	387329	387334	0 %	50 %	0 %	50 %	512556423
8055	NC_021490	CG	4	8	387362	387369	0 %	0 %	50 %	50 %	512556423
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8057	NC_021490	GT	3	6	387501	387506	0 %	50 %	50 %	0 %	512556423
8058	NC_021490	TCGG	2	8	387577	387584	0 %	25 %	50 %	25 %	512556423
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8113	NC_021490	GT	3	6	390515	390520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8120	NC_021490	GTTCG	2	10	390710	390719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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8374	NC_021490	GTCT	2	8	401825	401832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8375	NC_021490	TGC	2	6	401962	401967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8377	NC_021490	CT	3	6	402019	402024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8484	NC_021490	CTC	2	6	406370	406375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8485	NC_021490	C	10	10	406375	406384	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8486	NC_021490	CA	5	10	406386	406395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8487	NC_021490	GGA	2	6	406397	406402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8488	NC_021490	TCT	2	6	406503	406508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556438
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8490	NC_021490	CCT	3	9	406588	406596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556438
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