MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021490	GC	3	6	338576	338581	0 %	0 %	50 %	50 %	512556384
7003	NC_021490	CG	3	6	338625	338630	0 %	0 %	50 %	50 %	512556384
7004	NC_021490	G	7	7	338688	338694	0 %	0 %	100 %	0 %	512556384
7005	NC_021490	CTC	2	6	338702	338707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556384
7006	NC_021490	GA	3	6	338769	338774	50 %	0 %	50 %	0 %	512556384
7007	NC_021490	A	6	6	338843	338848	100 %	0 %	0 %	0 %	512556384
7008	NC_021490	A	7	7	338861	338867	100 %	0 %	0 %	0 %	512556384
7009	NC_021490	GCT	2	6	338928	338933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556385
7010	NC_021490	GGT	2	6	338976	338981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556385
7011	NC_021490	GTG	2	6	339109	339114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556385
7012	NC_021490	GT	4	8	339223	339230	0 %	50 %	50 %	0 %	512556385
7013	NC_021490	CTTT	3	12	339253	339264	0 %	75 %	0 %	25 %	512556385
7014	NC_021490	GCG	2	6	339274	339279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556385
7015	NC_021490	GGA	2	6	339301	339306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556385
7016	NC_021490	GC	3	6	339333	339338	0 %	0 %	50 %	50 %	512556385
7017	NC_021490	GGT	3	9	339357	339365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556385
7018	NC_021490	TC	3	6	339486	339491	0 %	50 %	0 %	50 %	512556385
7019	NC_021490	AAC	2	6	339576	339581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556385
7020	NC_021490	GGC	2	6	339650	339655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556385
7021	NC_021490	GTAT	2	8	339683	339690	25 %	50 %	25 %	0 %	512556385
7022	NC_021490	GT	3	6	339704	339709	0 %	50 %	50 %	0 %	512556385
7023	NC_021490	CGGG	2	8	339735	339742	0 %	0 %	75 %	25 %	512556385
7024	NC_021490	TGG	2	6	339791	339796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556385
7025	NC_021490	GT	4	8	339816	339823	0 %	50 %	50 %	0 %	512556385
7026	NC_021490	CGG	2	6	339825	339830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556385
7027	NC_021490	GCT	2	6	339834	339839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556385
7028	NC_021490	GC	3	6	339849	339854	0 %	0 %	50 %	50 %	512556385
7029	NC_021490	AGG	2	6	339890	339895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556385
7030	NC_021490	ATT	2	6	339919	339924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556385
7031	NC_021490	TCTT	2	8	339926	339933	0 %	75 %	0 %	25 %	512556385
7032	NC_021490	TGG	2	6	340012	340017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556386
7033	NC_021490	G	7	7	340061	340067	0 %	0 %	100 %	0 %	512556386
7034	NC_021490	GAGCG	2	10	340077	340086	20 %	0 %	60 %	20 %	512556386
7035	NC_021490	TGA	2	6	340114	340119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556386
7036	NC_021490	GCT	2	6	340176	340181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556386
7037	NC_021490	TGGCA	2	10	340202	340211	20 %	20 %	40 %	20 %	512556386
7038	NC_021490	GTT	2	6	340229	340234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556386
7039	NC_021490	GATCA	2	10	340266	340275	40 %	20 %	20 %	20 %	512556386
7040	NC_021490	TG	3	6	340297	340302	0 %	50 %	50 %	0 %	512556386
7041	NC_021490	T	7	7	340318	340324	0 %	100 %	0 %	0 %	512556386
7042	NC_021490	GCA	2	6	340343	340348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556386
7043	NC_021490	GTTA	2	8	340373	340380	25 %	50 %	25 %	0 %	512556386
7044	NC_021490	T	6	6	340394	340399	0 %	100 %	0 %	0 %	512556386
7045	NC_021490	TAG	2	6	340471	340476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556386
7046	NC_021490	GTAC	2	8	340487	340494	25 %	25 %	25 %	25 %	512556386
7047	NC_021490	CGTG	2	8	340520	340527	0 %	25 %	50 %	25 %	512556386
7048	NC_021490	GT	3	6	340570	340575	0 %	50 %	50 %	0 %	512556386
7049	NC_021490	GCG	2	6	340590	340595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556386
7050	NC_021490	GGC	2	6	340626	340631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556386
7051	NC_021490	GTT	2	6	340805	340810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556386
7052	NC_021490	GC	3	6	340837	340842	0 %	0 %	50 %	50 %	512556386
7053	NC_021490	TGC	2	6	340867	340872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556386
7054	NC_021490	GGC	2	6	340881	340886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556386
7055	NC_021490	GAA	2	6	340950	340955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_021490	T	6	6	341024	341029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_021490	GCTGTG	2	12	341044	341055	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556387
7058	NC_021490	CTTC	2	8	341056	341063	0 %	50 %	0 %	50 %	512556387
7059	NC_021490	GTGCTC	2	12	341095	341106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7060	NC_021490	GCA	2	6	341145	341150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7061	NC_021490	TGGCT	2	10	341176	341185	0 %	40 %	40 %	20 %	512556387
7062	NC_021490	GAG	2	6	341191	341196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556387
7063	NC_021490	TC	4	8	341224	341231	0 %	50 %	0 %	50 %	512556387
7064	NC_021490	TGTTCG	2	12	341265	341276	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	512556387
7065	NC_021490	TTCATG	2	12	341381	341392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512556387
7066	NC_021490	ACCGTC	2	12	341417	341428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	512556387
7067	NC_021490	GAAA	2	8	341433	341440	75 %	0 %	25 %	0 %	512556387
7068	NC_021490	CG	3	6	341554	341559	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7069	NC_021490	AC	4	8	341672	341679	50 %	0 %	0 %	50 %	512556387
7070	NC_021490	CGT	2	6	341705	341710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
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7072	NC_021490	GTA	2	6	342158	342163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556387
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7075	NC_021490	GGA	2	6	342345	342350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556387
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7077	NC_021490	TGC	2	6	342531	342536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7078	NC_021490	CG	3	6	342572	342577	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7079	NC_021490	CAG	2	6	342599	342604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7080	NC_021490	CTG	2	6	342694	342699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7081	NC_021490	GCT	2	6	342744	342749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
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7083	NC_021490	GC	3	6	342930	342935	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7084	NC_021490	CT	4	8	342977	342984	0 %	50 %	0 %	50 %	512556387
7085	NC_021490	TCA	2	6	343050	343055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556387
7086	NC_021490	CGC	2	6	343080	343085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556387
7087	NC_021490	TGGCG	2	10	343125	343134	0 %	20 %	60 %	20 %	512556387
7088	NC_021490	T	6	6	343165	343170	0 %	100 %	0 %	0 %	512556387
7089	NC_021490	GCA	2	6	343230	343235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7090	NC_021490	GCAGG	2	10	343384	343393	20 %	0 %	60 %	20 %	512556387
7091	NC_021490	GGA	2	6	343513	343518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556387
7092	NC_021490	TGA	2	6	343527	343532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556387
7093	NC_021490	CCCA	2	8	343552	343559	25 %	0 %	0 %	75 %	512556387
7094	NC_021490	GCGT	2	8	343620	343627	0 %	25 %	50 %	25 %	512556387
7095	NC_021490	CAC	2	6	343635	343640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556387
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7098	NC_021490	GAT	2	6	343918	343923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556387
7099	NC_021490	T	6	6	343965	343970	0 %	100 %	0 %	0 %	512556387
7100	NC_021490	CAG	2	6	343993	343998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7101	NC_021490	TTG	2	6	344024	344029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556387
7102	NC_021490	GC	3	6	344035	344040	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7103	NC_021490	GC	3	6	344122	344127	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7104	NC_021490	AGG	2	6	344156	344161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556387
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7106	NC_021490	TAG	2	6	344219	344224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556387
7107	NC_021490	GCA	2	6	344231	344236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7108	NC_021490	GT	3	6	344292	344297	0 %	50 %	50 %	0 %	512556387
7109	NC_021490	GGT	2	6	344328	344333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556387
7110	NC_021490	CGC	2	6	344438	344443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556387
7111	NC_021490	GTT	2	6	344445	344450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556387
7112	NC_021490	GC	3	6	344467	344472	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7113	NC_021490	T	6	6	344487	344492	0 %	100 %	0 %	0 %	512556387
7114	NC_021490	GCT	2	6	344631	344636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7115	NC_021490	G	6	6	344715	344720	0 %	0 %	100 %	0 %	512556387
7116	NC_021490	T	7	7	344725	344731	0 %	100 %	0 %	0 %	512556387
7117	NC_021490	TTTCG	2	10	344807	344816	0 %	60 %	20 %	20 %	512556387
7118	NC_021490	CCG	2	6	344920	344925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556387
7119	NC_021490	GGT	2	6	344961	344966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556387
7120	NC_021490	GGA	2	6	345057	345062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556387
7121	NC_021490	TTTGGA	2	12	345078	345089	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512556387
7122	NC_021490	GCA	2	6	345155	345160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7123	NC_021490	CCTC	2	8	345194	345201	0 %	25 %	0 %	75 %	512556387
7124	NC_021490	CGT	2	6	345211	345216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
7125	NC_021490	GCT	2	6	345243	345248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556387
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7127	NC_021490	CCGG	2	8	345324	345331	0 %	0 %	50 %	50 %	512556387
7128	NC_021490	T	7	7	345358	345364	0 %	100 %	0 %	0 %	512556387
7129	NC_021490	A	6	6	345489	345494	100 %	0 %	0 %	0 %	512556388
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7132	NC_021490	T	6	6	345637	345642	0 %	100 %	0 %	0 %	512556388
7133	NC_021490	TCC	2	6	345865	345870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556388
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7136	NC_021490	GTG	2	6	345999	346004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556388
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7143	NC_021490	CG	3	6	346211	346216	0 %	0 %	50 %	50 %	512556388
7144	NC_021490	A	7	7	346245	346251	100 %	0 %	0 %	0 %	512556388
7145	NC_021490	TGG	2	6	346291	346296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556388
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7156	NC_021490	TCG	2	6	346698	346703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556388
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7231	NC_021490	CA	3	6	350695	350700	50 %	0 %	0 %	50 %	512556390
7232	NC_021490	GCA	2	6	350709	350714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556390
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7237	NC_021490	CG	3	6	351018	351023	0 %	0 %	50 %	50 %	512556390
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7241	NC_021490	GT	3	6	351157	351162	0 %	50 %	50 %	0 %	512556390
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7244	NC_021490	GCA	2	6	351293	351298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556390
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7247	NC_021490	GCG	2	6	351369	351374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7248	NC_021490	CG	3	6	351373	351378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7249	NC_021490	GAG	2	6	351433	351438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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