MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021490	ATA	2	6	293532	293537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556350
6002	NC_021490	GC	3	6	293550	293555	0 %	0 %	50 %	50 %	512556350
6003	NC_021490	ACA	2	6	293569	293574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556350
6004	NC_021490	TC	3	6	293590	293595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_021490	AGT	2	6	293621	293626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021490	GCG	2	6	293627	293632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_021490	GCAC	2	8	293637	293644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_021490	GACC	2	8	293673	293680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_021490	CTT	2	6	293760	293765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556351
6010	NC_021490	T	7	7	293764	293770	0 %	100 %	0 %	0 %	512556351
6011	NC_021490	CCA	2	6	293813	293818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556351
6012	NC_021490	TG	3	6	293833	293838	0 %	50 %	50 %	0 %	512556351
6013	NC_021490	TCA	2	6	293869	293874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556351
6014	NC_021490	CCA	2	6	293936	293941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556351
6015	NC_021490	TCTGC	2	10	294017	294026	0 %	40 %	20 %	40 %	512556351
6016	NC_021490	CTT	2	6	294071	294076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556351
6017	NC_021490	CGG	2	6	294114	294119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556351
6018	NC_021490	GTA	2	6	294156	294161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556351
6019	NC_021490	TGC	2	6	294211	294216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556351
6020	NC_021490	GC	3	6	294256	294261	0 %	0 %	50 %	50 %	512556351
6021	NC_021490	TGA	2	6	294317	294322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556351
6022	NC_021490	GAAT	2	8	294431	294438	50 %	25 %	25 %	0 %	512556351
6023	NC_021490	GCG	2	6	294457	294462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556351
6024	NC_021490	GCC	2	6	294471	294476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556351
6025	NC_021490	TTG	2	6	294481	294486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556351
6026	NC_021490	GGGTGA	2	12	294647	294658	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	512556351
6027	NC_021490	ACA	2	6	294688	294693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556351
6028	NC_021490	TCC	2	6	294804	294809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556351
6029	NC_021490	AGGA	2	8	294815	294822	50 %	0 %	50 %	0 %	512556351
6030	NC_021490	GGC	2	6	294834	294839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556351
6031	NC_021490	GCC	2	6	294906	294911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556351
6032	NC_021490	CGC	2	6	294944	294949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556351
6033	NC_021490	CGA	2	6	294965	294970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556351
6034	NC_021490	AG	3	6	294991	294996	50 %	0 %	50 %	0 %	512556351
6035	NC_021490	TCG	2	6	295045	295050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556351
6036	NC_021490	GTA	2	6	295053	295058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556351
6037	NC_021490	GGA	2	6	295064	295069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556351
6038	NC_021490	ACA	2	6	295173	295178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_021490	GAG	2	6	295182	295187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021490	GAT	2	6	295217	295222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021490	TTTCC	2	10	295264	295273	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6042	NC_021490	GGA	2	6	295286	295291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021490	GC	3	6	295312	295317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_021490	GAG	2	6	295334	295339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_021490	CTT	2	6	295380	295385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_021490	G	10	10	295406	295415	0 %	0 %	100 %	0 %	512556352
6047	NC_021490	AG	5	10	295416	295425	50 %	0 %	50 %	0 %	512556352
6048	NC_021490	CGTTG	2	10	295448	295457	0 %	40 %	40 %	20 %	512556352
6049	NC_021490	GTGC	2	8	295460	295467	0 %	25 %	50 %	25 %	512556352
6050	NC_021490	GCCG	2	8	295485	295492	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6051	NC_021490	ATC	2	6	295505	295510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556352
6052	NC_021490	AGC	2	6	295541	295546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556352
6053	NC_021490	GTC	2	6	295551	295556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556352
6054	NC_021490	GC	3	6	295575	295580	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6055	NC_021490	TTCT	2	8	295597	295604	0 %	75 %	0 %	25 %	512556352
6056	NC_021490	CGC	2	6	295621	295626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556352
6057	NC_021490	GCG	2	6	295685	295690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556352
6058	NC_021490	CAA	2	6	295716	295721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556352
6059	NC_021490	CAT	2	6	295731	295736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556352
6060	NC_021490	CTC	2	6	295740	295745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556352
6061	NC_021490	AGA	2	6	295755	295760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556352
6062	NC_021490	TGA	2	6	295774	295779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556352
6063	NC_021490	GC	3	6	295799	295804	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6064	NC_021490	CTG	2	6	295865	295870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556352
6065	NC_021490	ACG	2	6	295997	296002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556352
6066	NC_021490	CGT	2	6	296066	296071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556352
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6068	NC_021490	GC	4	8	296122	296129	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6069	NC_021490	GC	3	6	296147	296152	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6070	NC_021490	G	7	7	296158	296164	0 %	0 %	100 %	0 %	512556352
6071	NC_021490	CTT	2	6	296199	296204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556352
6072	NC_021490	GAG	2	6	296216	296221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
6073	NC_021490	CG	4	8	296236	296243	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6074	NC_021490	GAG	2	6	296268	296273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
6075	NC_021490	AGG	2	6	296292	296297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
6076	NC_021490	GGT	2	6	296383	296388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556352
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6078	NC_021490	AGTTA	2	10	296566	296575	40 %	40 %	20 %	0 %	512556352
6079	NC_021490	CGTC	2	8	296617	296624	0 %	25 %	25 %	50 %	512556352
6080	NC_021490	AGA	2	6	296634	296639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556352
6081	NC_021490	GAT	2	6	296668	296673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556352
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6083	NC_021490	GGA	2	6	296827	296832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
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6085	NC_021490	GAG	2	6	296852	296857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556352
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6087	NC_021490	CCT	2	6	296953	296958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556352
6088	NC_021490	CG	3	6	296997	297002	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6089	NC_021490	GAA	2	6	297010	297015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556352
6090	NC_021490	ATG	2	6	297135	297140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556352
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6092	NC_021490	GC	3	6	297398	297403	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6093	NC_021490	GAT	2	6	297485	297490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556352
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6095	NC_021490	GC	3	6	297581	297586	0 %	0 %	50 %	50 %	512556352
6096	NC_021490	CGTG	2	8	297706	297713	0 %	25 %	50 %	25 %	512556352
6097	NC_021490	AGC	2	6	297744	297749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556352
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6099	NC_021490	G	6	6	297930	297935	0 %	0 %	100 %	0 %	512556352
6100	NC_021490	TGA	2	6	297966	297971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556352
6101	NC_021490	AGTG	2	8	297987	297994	25 %	25 %	50 %	0 %	512556352
6102	NC_021490	GT	3	6	298000	298005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_021490	TGG	2	6	298056	298061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021490	CTC	3	9	298062	298070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_021490	GTT	2	6	298072	298077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021490	AGGT	2	8	298111	298118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021490	GT	3	6	298131	298136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_021490	GCT	2	6	298191	298196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_021490	GAG	2	6	298242	298247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021490	CATG	2	8	298253	298260	25 %	25 %	25 %	25 %	512556353
6111	NC_021490	AGC	2	6	298261	298266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556353
6112	NC_021490	CGG	2	6	298308	298313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556353
6113	NC_021490	TCG	2	6	298330	298335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556353
6114	NC_021490	G	6	6	298344	298349	0 %	0 %	100 %	0 %	512556353
6115	NC_021490	CG	4	8	298392	298399	0 %	0 %	50 %	50 %	512556353
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6120	NC_021490	CAG	2	6	298647	298652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556353
6121	NC_021490	TAT	2	6	298704	298709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556353
6122	NC_021490	GAG	2	6	298749	298754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556353
6123	NC_021490	CT	3	6	298813	298818	0 %	50 %	0 %	50 %	512556353
6124	NC_021490	GC	3	6	298850	298855	0 %	0 %	50 %	50 %	512556353
6125	NC_021490	GCT	3	9	298857	298865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556353
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6127	NC_021490	GCG	2	6	298914	298919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556353
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6240	NC_021490	T	7	7	304105	304111	0 %	100 %	0 %	0 %	512556357
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6376	NC_021490	TTG	2	6	309944	309949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556363
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6499	NC_021490	GTCG	2	8	315409	315416	0 %	25 %	50 %	25 %	512556368
6500	NC_021490	TGGC	2	8	315455	315462	0 %	25 %	50 %	25 %	512556368

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