MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021490	GTG	2	6	267737	267742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556329
5502	NC_021490	G	6	6	267817	267822	0 %	0 %	100 %	0 %	512556329
5503	NC_021490	CTT	2	6	267856	267861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556329
5504	NC_021490	GGA	2	6	267880	267885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556329
5505	NC_021490	AGG	2	6	267886	267891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556329
5506	NC_021490	GGAT	2	8	267936	267943	25 %	25 %	50 %	0 %	512556329
5507	NC_021490	GAG	2	6	267956	267961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556329
5508	NC_021490	TCG	2	6	267997	268002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556329
5509	NC_021490	GGA	2	6	268078	268083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556329
5510	NC_021490	AATC	2	8	268117	268124	50 %	25 %	0 %	25 %	512556329
5511	NC_021490	AAC	2	6	268181	268186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556329
5512	NC_021490	TCC	2	6	268223	268228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556329
5513	NC_021490	GT	3	6	268248	268253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021490	GCGCG	2	10	268312	268321	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5515	NC_021490	GAG	2	6	268377	268382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556330
5516	NC_021490	GGT	2	6	268388	268393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556330
5517	NC_021490	GT	3	6	268392	268397	0 %	50 %	50 %	0 %	512556330
5518	NC_021490	T	6	6	268473	268478	0 %	100 %	0 %	0 %	512556330
5519	NC_021490	CAG	2	6	268504	268509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556330
5520	NC_021490	CTTT	2	8	268647	268654	0 %	75 %	0 %	25 %	512556331
5521	NC_021490	GTT	2	6	268679	268684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556331
5522	NC_021490	CTG	2	6	268695	268700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556331
5523	NC_021490	GTG	2	6	268715	268720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556331
5524	NC_021490	TGC	2	6	268734	268739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556331
5525	NC_021490	TTTTC	2	10	268741	268750	0 %	80 %	0 %	20 %	512556331
5526	NC_021490	TTA	2	6	268777	268782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556331
5527	NC_021490	CG	3	6	268783	268788	0 %	0 %	50 %	50 %	512556331
5528	NC_021490	TTTTTC	2	12	268896	268907	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512556331
5529	NC_021490	ATG	2	6	268934	268939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556331
5530	NC_021490	T	6	6	269031	269036	0 %	100 %	0 %	0 %	512556331
5531	NC_021490	CTT	2	6	269039	269044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556331
5532	NC_021490	TGGC	2	8	269070	269077	0 %	25 %	50 %	25 %	512556331
5533	NC_021490	TGCG	2	8	269097	269104	0 %	25 %	50 %	25 %	512556331
5534	NC_021490	GCC	2	6	269109	269114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556331
5535	NC_021490	GTG	2	6	269123	269128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556331
5536	NC_021490	CTT	2	6	269148	269153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556331
5537	NC_021490	T	8	8	269152	269159	0 %	100 %	0 %	0 %	512556331
5538	NC_021490	T	6	6	269173	269178	0 %	100 %	0 %	0 %	512556331
5539	NC_021490	GT	3	6	269195	269200	0 %	50 %	50 %	0 %	512556331
5540	NC_021490	GCG	2	6	269283	269288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_021490	CTA	2	6	269291	269296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_021490	GAG	2	6	269331	269336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_021490	TG	3	6	269360	269365	0 %	50 %	50 %	0 %	512556332
5544	NC_021490	G	9	9	269373	269381	0 %	0 %	100 %	0 %	512556332
5545	NC_021490	GCA	2	6	269512	269517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556332
5546	NC_021490	ATA	2	6	269574	269579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556332
5547	NC_021490	TGAC	2	8	269580	269587	25 %	25 %	25 %	25 %	512556332
5548	NC_021490	AGA	2	6	269653	269658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556332
5549	NC_021490	CTC	2	6	269666	269671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556332
5550	NC_021490	CG	3	6	269694	269699	0 %	0 %	50 %	50 %	512556332
5551	NC_021490	TCA	3	9	269857	269865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556332
5552	NC_021490	GGAA	2	8	269866	269873	50 %	0 %	50 %	0 %	512556332
5553	NC_021490	A	6	6	269906	269911	100 %	0 %	0 %	0 %	512556332
5554	NC_021490	TACAAT	2	12	270092	270103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512556332
5555	NC_021490	GGT	2	6	270119	270124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556332
5556	NC_021490	GGA	2	6	270168	270173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556332
5557	NC_021490	GAAT	2	8	270184	270191	50 %	25 %	25 %	0 %	512556332
5558	NC_021490	GAAA	2	8	270277	270284	75 %	0 %	25 %	0 %	512556332
5559	NC_021490	CG	3	6	270298	270303	0 %	0 %	50 %	50 %	512556332
5560	NC_021490	GTG	2	6	270353	270358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556332
5561	NC_021490	CCCG	2	8	270401	270408	0 %	0 %	25 %	75 %	512556332
5562	NC_021490	GTTC	2	8	270473	270480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_021490	GCAC	2	8	270512	270519	25 %	0 %	25 %	50 %	512556333
5564	NC_021490	CG	3	6	270540	270545	0 %	0 %	50 %	50 %	512556333
5565	NC_021490	CG	4	8	270573	270580	0 %	0 %	50 %	50 %	512556333
5566	NC_021490	GC	3	6	270650	270655	0 %	0 %	50 %	50 %	512556333
5567	NC_021490	CGC	2	6	270667	270672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556333
5568	NC_021490	CGG	2	6	270711	270716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556333
5569	NC_021490	TTCTC	2	10	270734	270743	0 %	60 %	0 %	40 %	512556333
5570	NC_021490	CAT	2	6	270832	270837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556333
5571	NC_021490	T	7	7	270864	270870	0 %	100 %	0 %	0 %	512556333
5572	NC_021490	GC	3	6	270923	270928	0 %	0 %	50 %	50 %	512556333
5573	NC_021490	GT	3	6	270976	270981	0 %	50 %	50 %	0 %	512556333
5574	NC_021490	CGC	2	6	271038	271043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556333
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5578	NC_021490	TG	3	6	271127	271132	0 %	50 %	50 %	0 %	512556333
5579	NC_021490	AG	3	6	271183	271188	50 %	0 %	50 %	0 %	512556333
5580	NC_021490	GCT	2	6	271192	271197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_021490	GT	3	6	271220	271225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_021490	TG	3	6	271295	271300	0 %	50 %	50 %	0 %	512556334
5583	NC_021490	GGA	3	9	271341	271349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556334
5584	NC_021490	GAT	2	6	271353	271358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556334
5585	NC_021490	CGG	2	6	271433	271438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556334
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5588	NC_021490	GAA	2	6	271477	271482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556334
5589	NC_021490	GAG	2	6	271504	271509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556334
5590	NC_021490	ATT	2	6	271639	271644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556334
5591	NC_021490	TATC	2	8	271785	271792	25 %	50 %	0 %	25 %	512556334
5592	NC_021490	AGCT	2	8	271811	271818	25 %	25 %	25 %	25 %	512556334
5593	NC_021490	A	6	6	271841	271846	100 %	0 %	0 %	0 %	512556334
5594	NC_021490	GC	3	6	271890	271895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_021490	CA	3	6	271943	271948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_021490	GCTC	2	8	271951	271958	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_021490	TCC	2	6	271960	271965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5598	NC_021490	CTT	2	6	272008	272013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556335
5599	NC_021490	GGTG	2	8	272098	272105	0 %	25 %	75 %	0 %	512556335
5600	NC_021490	C	6	6	272129	272134	0 %	0 %	0 %	100 %	512556335
5601	NC_021490	GC	3	6	272170	272175	0 %	0 %	50 %	50 %	512556335
5602	NC_021490	CCCTGC	2	12	272261	272272	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512556335
5603	NC_021490	GC	5	10	272293	272302	0 %	0 %	50 %	50 %	512556335
5604	NC_021490	AT	3	6	272348	272353	50 %	50 %	0 %	0 %	512556335
5605	NC_021490	GCT	2	6	272413	272418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556335
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5607	NC_021490	TGCG	2	8	272626	272633	0 %	25 %	50 %	25 %	512556335
5608	NC_021490	T	6	6	272639	272644	0 %	100 %	0 %	0 %	512556335
5609	NC_021490	T	6	6	272677	272682	0 %	100 %	0 %	0 %	512556335
5610	NC_021490	GCG	2	6	272693	272698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556335
5611	NC_021490	GTA	2	6	272717	272722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556335
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5616	NC_021490	TCT	2	6	273136	273141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556335
5617	NC_021490	GGGA	2	8	273222	273229	25 %	0 %	75 %	0 %	512556335
5618	NC_021490	GGA	2	6	273235	273240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556335
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5621	NC_021490	TAG	2	6	273348	273353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556335
5622	NC_021490	CACC	2	8	273356	273363	25 %	0 %	0 %	75 %	512556335
5623	NC_021490	GC	3	6	273402	273407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_021490	CGTGA	2	10	273415	273424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5625	NC_021490	TGG	2	6	273735	273740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556336
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5757	NC_021490	TGC	2	6	280742	280747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5758	NC_021490	GTC	2	6	280754	280759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5759	NC_021490	GTG	2	6	280828	280833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5760	NC_021490	GGA	2	6	280868	280873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5761	NC_021490	TCA	2	6	280893	280898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5763	NC_021490	AC	3	6	281088	281093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5764	NC_021490	AGGG	2	8	281148	281155	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5765	NC_021490	AGG	2	6	281179	281184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5766	NC_021490	CCT	2	6	281231	281236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5769	NC_021490	CCCTT	2	10	281333	281342	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5770	NC_021490	TAT	2	6	281436	281441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5772	NC_021490	GGT	2	6	281481	281486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5773	NC_021490	GGGTG	2	10	281508	281517	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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5775	NC_021490	GAG	2	6	281626	281631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5777	NC_021490	AGGG	2	8	281711	281718	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5778	NC_021490	TGAAC	2	10	281734	281743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5779	NC_021490	AG	3	6	281772	281777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5780	NC_021490	AGT	2	6	281786	281791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5782	NC_021490	GGA	2	6	281805	281810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5784	NC_021490	GGTG	2	8	281861	281868	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5785	NC_021490	AAT	2	6	281870	281875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5786	NC_021490	AG	3	6	281912	281917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5809	NC_021490	GA	3	6	283261	283266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5879	NC_021490	A	7	7	287222	287228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5880	NC_021490	CTGT	2	8	287273	287280	0 %	50 %	25 %	25 %	512556344
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5883	NC_021490	TGT	2	6	287334	287339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556344
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