MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021179	CA	3	6	148012	148017	50 %	0 %	0 %	50 %	488657544
3002	NC_021179	CGC	2	6	148035	148040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657544
3003	NC_021179	GTC	2	6	148095	148100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657544
3004	NC_021179	CGC	2	6	148179	148184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657544
3005	NC_021179	AGT	2	6	148185	148190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657544
3006	NC_021179	CAC	2	6	148267	148272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657544
3007	NC_021179	TCG	2	6	148319	148324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021179	C	9	9	148343	148351	0 %	0 %	0 %	100 %	488657545
3009	NC_021179	GTTC	2	8	148381	148388	0 %	50 %	25 %	25 %	488657545
3010	NC_021179	CG	3	6	148390	148395	0 %	0 %	50 %	50 %	488657545
3011	NC_021179	GCA	2	6	148400	148405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657545
3012	NC_021179	CG	3	6	148406	148411	0 %	0 %	50 %	50 %	488657545
3013	NC_021179	CGGCTG	2	12	148591	148602	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488657545
3014	NC_021179	TTC	2	6	148862	148867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657545
3015	NC_021179	CTTGC	2	10	148897	148906	0 %	40 %	20 %	40 %	488657545
3016	NC_021179	AGC	2	6	149002	149007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021179	GAA	2	6	149047	149052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657546
3018	NC_021179	GGT	2	6	149090	149095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657546
3019	NC_021179	TTC	2	6	149096	149101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657546
3020	NC_021179	GCG	2	6	149110	149115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657546
3021	NC_021179	GC	3	6	149162	149167	0 %	0 %	50 %	50 %	488657546
3022	NC_021179	TCTT	2	8	149261	149268	0 %	75 %	0 %	25 %	488657546
3023	NC_021179	TGC	2	6	149295	149300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657546
3024	NC_021179	GGT	2	6	149344	149349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657546
3025	NC_021179	GCG	2	6	149504	149509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657547
3026	NC_021179	AGC	2	6	149555	149560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657547
3027	NC_021179	TG	3	6	149587	149592	0 %	50 %	50 %	0 %	488657547
3028	NC_021179	GC	3	6	149600	149605	0 %	0 %	50 %	50 %	488657547
3029	NC_021179	CTG	3	9	149615	149623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657547
3030	NC_021179	AGGC	2	8	149661	149668	25 %	0 %	50 %	25 %	488657547
3031	NC_021179	TCC	2	6	149693	149698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657547
3032	NC_021179	CCA	2	6	149718	149723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657547
3033	NC_021179	GTC	2	6	149750	149755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657547
3034	NC_021179	GTG	2	6	149769	149774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657547
3035	NC_021179	GCA	3	9	149820	149828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657547
3036	NC_021179	GTTT	2	8	149949	149956	0 %	75 %	25 %	0 %	488657548
3037	NC_021179	TAC	2	6	150058	150063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657548
3038	NC_021179	TGT	2	6	150119	150124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657548
3039	NC_021179	GT	3	6	150174	150179	0 %	50 %	50 %	0 %	488657548
3040	NC_021179	G	9	9	150206	150214	0 %	0 %	100 %	0 %	488657548
3041	NC_021179	ACT	2	6	150299	150304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657549
3042	NC_021179	CGGA	2	8	150497	150504	25 %	0 %	50 %	25 %	488657549
3043	NC_021179	GTT	2	6	150591	150596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021179	GGCTGG	2	12	150597	150608	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3045	NC_021179	TCGGGC	2	12	150612	150623	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_021179	GTAC	2	8	150648	150655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_021179	GCT	2	6	150691	150696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021179	TCC	2	6	150725	150730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657550
3049	NC_021179	T	6	6	150798	150803	0 %	100 %	0 %	0 %	488657550
3050	NC_021179	GC	3	6	150819	150824	0 %	0 %	50 %	50 %	488657550
3051	NC_021179	GAC	2	6	150873	150878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657550
3052	NC_021179	GCA	2	6	150889	150894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657550
3053	NC_021179	GCTT	2	8	150895	150902	0 %	50 %	25 %	25 %	488657550
3054	NC_021179	CCG	2	6	150910	150915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657550
3055	NC_021179	CTG	2	6	150935	150940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657550
3056	NC_021179	GTTTG	2	10	150951	150960	0 %	60 %	40 %	0 %	488657550
3057	NC_021179	G	6	6	150979	150984	0 %	0 %	100 %	0 %	488657550
3058	NC_021179	TCC	2	6	151009	151014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657550
3059	NC_021179	CCA	2	6	151034	151039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657550
3060	NC_021179	T	7	7	151040	151046	0 %	100 %	0 %	0 %	488657550
3061	NC_021179	GCGG	2	8	151143	151150	0 %	0 %	75 %	25 %	488657551
3062	NC_021179	GTC	2	6	151247	151252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657551
3063	NC_021179	CGGCTC	2	12	151270	151281	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488657551
3064	NC_021179	T	6	6	151303	151308	0 %	100 %	0 %	0 %	488657551
3065	NC_021179	GC	3	6	151324	151329	0 %	0 %	50 %	50 %	488657551
3066	NC_021179	GCA	3	9	151373	151381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657551
3067	NC_021179	T	6	6	151384	151389	0 %	100 %	0 %	0 %	488657551
3068	NC_021179	CCG	2	6	151397	151402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657551
3069	NC_021179	GAC	2	6	151429	151434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657551
3070	NC_021179	CCA	2	6	151485	151490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657551
3071	NC_021179	TCTT	2	8	151579	151586	0 %	75 %	0 %	25 %	488657552
3072	NC_021179	GTT	2	6	151781	151786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021179	CTGCGG	4	24	151789	151812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021179	CG	3	6	151865	151870	0 %	0 %	50 %	50 %	488657554
3075	NC_021179	AGC	2	6	151908	151913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657554
3076	NC_021179	AGC	2	6	151917	151922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657554
3077	NC_021179	CCG	2	6	151948	151953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657554
3078	NC_021179	CTG	2	6	151970	151975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657554
3079	NC_021179	TG	3	6	152040	152045	0 %	50 %	50 %	0 %	488657554
3080	NC_021179	CCT	2	6	152046	152051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657554
3081	NC_021179	CCA	2	6	152070	152075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657554
3082	NC_021179	CA	3	6	152131	152136	50 %	0 %	0 %	50 %	488657554
3083	NC_021179	GCGG	2	8	152261	152268	0 %	0 %	75 %	25 %	488657554
3084	NC_021179	CGGCTC	2	12	152294	152305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_021179	GCT	2	6	152319	152324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_021179	TGGTTG	2	12	152548	152559	0 %	50 %	50 %	0 %	488657555
3087	NC_021179	TTG	2	6	152567	152572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657555
3088	NC_021179	TG	4	8	152586	152593	0 %	50 %	50 %	0 %	488657555
3089	NC_021179	CAC	2	6	152635	152640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657555
3090	NC_021179	TGA	2	6	152663	152668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657555
3091	NC_021179	TTAT	2	8	152707	152714	25 %	75 %	0 %	0 %	488657555
3092	NC_021179	GGTG	2	8	152780	152787	0 %	25 %	75 %	0 %	488657555
3093	NC_021179	AGA	2	6	152910	152915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657555
3094	NC_021179	CG	3	6	153010	153015	0 %	0 %	50 %	50 %	488657555
3095	NC_021179	TTC	2	6	153022	153027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657555
3096	NC_021179	TGC	2	6	153028	153033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3097	NC_021179	ACC	2	6	153087	153092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657555
3098	NC_021179	CGA	2	6	153107	153112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3099	NC_021179	TGCGC	2	10	153116	153125	0 %	20 %	40 %	40 %	488657555
3100	NC_021179	AGA	2	6	153154	153159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657555
3101	NC_021179	ACA	2	6	153193	153198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657555
3102	NC_021179	TTG	2	6	153201	153206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657555
3103	NC_021179	CAG	2	6	153216	153221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3104	NC_021179	TGA	2	6	153239	153244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657555
3105	NC_021179	CCT	2	6	153367	153372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657555
3106	NC_021179	TGTTT	2	10	153390	153399	0 %	80 %	20 %	0 %	488657555
3107	NC_021179	TCGT	2	8	153400	153407	0 %	50 %	25 %	25 %	488657555
3108	NC_021179	TGC	2	6	153433	153438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3109	NC_021179	AGC	2	6	153472	153477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3110	NC_021179	GTG	2	6	153538	153543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657555
3111	NC_021179	AGGA	2	8	153571	153578	50 %	0 %	50 %	0 %	488657555
3112	NC_021179	CCGGAG	2	12	153646	153657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488657555
3113	NC_021179	CA	3	6	153735	153740	50 %	0 %	0 %	50 %	488657555
3114	NC_021179	GGAA	2	8	153794	153801	50 %	0 %	50 %	0 %	488657555
3115	NC_021179	AGA	2	6	153840	153845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657555
3116	NC_021179	CAGCTG	2	12	153870	153881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3117	NC_021179	CGG	2	6	153910	153915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657555
3118	NC_021179	GT	3	6	154000	154005	0 %	50 %	50 %	0 %	488657555
3119	NC_021179	TTC	2	6	154009	154014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657555
3120	NC_021179	GAGT	2	8	154061	154068	25 %	25 %	50 %	0 %	488657555
3121	NC_021179	AGC	2	6	154086	154091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657555
3122	NC_021179	CACT	2	8	154137	154144	25 %	25 %	0 %	50 %	488657555
3123	NC_021179	CTC	2	6	154149	154154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_021179	C	10	10	154169	154178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3241	NC_021179	GGGC	2	8	159227	159234	0 %	0 %	75 %	25 %	488657560
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3245	NC_021179	ACC	2	6	159349	159354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657560
3246	NC_021179	TCTT	2	8	159389	159396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3247	NC_021179	CTG	2	6	159435	159440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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