MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_021179	TCA	2	6	1090805	1090810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658435
23003	NC_021179	TTA	2	6	1090817	1090822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658435
23004	NC_021179	TAT	2	6	1090878	1090883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658435
23005	NC_021179	AGTC	2	8	1090945	1090952	25 %	25 %	25 %	25 %	488658435
23006	NC_021179	CGAG	2	8	1090986	1090993	25 %	0 %	50 %	25 %	488658435
23007	NC_021179	GC	3	6	1090999	1091004	0 %	0 %	50 %	50 %	488658435
23008	NC_021179	CG	3	6	1091020	1091025	0 %	0 %	50 %	50 %	488658435
23009	NC_021179	TGA	2	6	1091046	1091051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658435
23010	NC_021179	TGACGA	2	12	1091064	1091075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488658435
23011	NC_021179	GCAG	2	8	1091124	1091131	25 %	0 %	50 %	25 %	488658435
23012	NC_021179	CGCGC	2	10	1091203	1091212	0 %	0 %	40 %	60 %	488658435
23013	NC_021179	GAA	2	6	1091221	1091226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658435
23014	NC_021179	G	6	6	1091237	1091242	0 %	0 %	100 %	0 %	488658435
23015	NC_021179	GGTC	2	8	1091244	1091251	0 %	25 %	50 %	25 %	488658435
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23018	NC_021179	A	6	6	1091380	1091385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23019	NC_021179	GC	3	6	1091440	1091445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23020	NC_021179	CTT	2	6	1091446	1091451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23021	NC_021179	GGC	2	6	1091461	1091466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23022	NC_021179	AGG	2	6	1091524	1091529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658436
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23034	NC_021179	ATGG	2	8	1091902	1091909	25 %	25 %	50 %	0 %	488658436
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23041	NC_021179	CGTG	2	8	1092430	1092437	0 %	25 %	50 %	25 %	488658437
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23104	NC_021179	A	6	6	1095039	1095044	100 %	0 %	0 %	0 %	488658439
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23114	NC_021179	T	6	6	1095536	1095541	0 %	100 %	0 %	0 %	488658440
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23119	NC_021179	CTC	2	6	1095683	1095688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658440
23120	NC_021179	CAT	2	6	1095729	1095734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658440
23121	NC_021179	ATG	2	6	1095766	1095771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658440
23122	NC_021179	TCC	2	6	1095809	1095814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658440
23123	NC_021179	GCA	2	6	1095831	1095836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658440
23124	NC_021179	CA	4	8	1095835	1095842	50 %	0 %	0 %	50 %	488658440
23125	NC_021179	CG	3	6	1095875	1095880	0 %	0 %	50 %	50 %	488658440
23126	NC_021179	ACT	2	6	1095979	1095984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658440
23127	NC_021179	ATC	2	6	1096000	1096005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658440
23128	NC_021179	TCCCC	2	10	1096110	1096119	0 %	20 %	0 %	80 %	488658441
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23130	NC_021179	AC	3	6	1096146	1096151	50 %	0 %	0 %	50 %	488658441
23131	NC_021179	CAC	2	6	1096153	1096158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658441
23132	NC_021179	CA	3	6	1096168	1096173	50 %	0 %	0 %	50 %	488658441
23133	NC_021179	GCAG	2	8	1096196	1096203	25 %	0 %	50 %	25 %	488658441
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23135	NC_021179	AG	3	6	1096257	1096262	50 %	0 %	50 %	0 %	488658441
23136	NC_021179	AGC	2	6	1096379	1096384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658441
23137	NC_021179	TGCG	2	8	1096418	1096425	0 %	25 %	50 %	25 %	488658441
23138	NC_021179	CA	3	6	1096436	1096441	50 %	0 %	0 %	50 %	488658441
23139	NC_021179	GAA	2	6	1096469	1096474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658441
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23144	NC_021179	CTG	2	6	1096666	1096671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658441
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23150	NC_021179	GTC	2	6	1097056	1097061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658441
23151	NC_021179	T	8	8	1097077	1097084	0 %	100 %	0 %	0 %	488658441
23152	NC_021179	ATCTGC	2	12	1097210	1097221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488658441
23153	NC_021179	TTG	2	6	1097281	1097286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658441
23154	NC_021179	GTT	2	6	1097327	1097332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658441
23155	NC_021179	CGG	2	6	1097353	1097358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658441
23156	NC_021179	TCA	2	6	1097417	1097422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658441
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23158	NC_021179	ACGT	2	8	1097482	1097489	25 %	25 %	25 %	25 %	488658441
23159	NC_021179	TG	4	8	1097500	1097507	0 %	50 %	50 %	0 %	488658441
23160	NC_021179	TC	3	6	1097553	1097558	0 %	50 %	0 %	50 %	488658441
23161	NC_021179	CA	3	6	1097602	1097607	50 %	0 %	0 %	50 %	488658441
23162	NC_021179	CAC	2	6	1097820	1097825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23163	NC_021179	AT	3	6	1097873	1097878	50 %	50 %	0 %	0 %	488658442
23164	NC_021179	CAC	2	6	1097969	1097974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658442
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23166	NC_021179	CCAT	2	8	1098027	1098034	25 %	25 %	0 %	50 %	488658442
23167	NC_021179	T	7	7	1098073	1098079	0 %	100 %	0 %	0 %	488658442
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23197	NC_021179	C	7	7	1099466	1099472	0 %	0 %	0 %	100 %	488658442
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23202	NC_021179	TGC	2	6	1099844	1099849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23204	NC_021179	CTG	2	6	1099880	1099885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658443
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23218	NC_021179	CTG	3	9	1100288	1100296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658443
23219	NC_021179	GA	3	6	1100302	1100307	50 %	0 %	50 %	0 %	488658443
23220	NC_021179	CG	3	6	1100318	1100323	0 %	0 %	50 %	50 %	488658443
23221	NC_021179	AAG	2	6	1100390	1100395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658443
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23225	NC_021179	CTA	2	6	1100695	1100700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658443
23226	NC_021179	CA	3	6	1100736	1100741	50 %	0 %	0 %	50 %	488658443
23227	NC_021179	AAAG	2	8	1100795	1100802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23228	NC_021179	CA	3	6	1100854	1100859	50 %	0 %	0 %	50 %	488658444
23229	NC_021179	CGTA	2	8	1100883	1100890	25 %	25 %	25 %	25 %	488658444
23230	NC_021179	ACTG	2	8	1100979	1100986	25 %	25 %	25 %	25 %	488658444
23231	NC_021179	GCA	2	6	1101018	1101023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658444
23232	NC_021179	GCT	2	6	1101037	1101042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658444
23233	NC_021179	TCT	2	6	1101076	1101081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658444
23234	NC_021179	CTTT	2	8	1101118	1101125	0 %	75 %	0 %	25 %	488658444
23235	NC_021179	ATA	2	6	1101147	1101152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658444
23236	NC_021179	AAGT	2	8	1101212	1101219	50 %	25 %	25 %	0 %	488658444
23237	NC_021179	CG	4	8	1101352	1101359	0 %	0 %	50 %	50 %	488658444
23238	NC_021179	TCA	2	6	1101429	1101434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658444
23239	NC_021179	ATA	2	6	1101503	1101508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658444
23240	NC_021179	ATA	2	6	1101539	1101544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658444
23241	NC_021179	ATC	2	6	1101608	1101613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658444
23242	NC_021179	ACG	2	6	1101640	1101645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658444
23243	NC_021179	TACA	2	8	1101652	1101659	50 %	25 %	0 %	25 %	488658444
23244	NC_021179	CAC	2	6	1101686	1101691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658444
23245	NC_021179	AAT	2	6	1101785	1101790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658444
23246	NC_021179	CCA	2	6	1101859	1101864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658444
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23249	NC_021179	ACG	2	6	1102030	1102035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658444
23250	NC_021179	ATT	2	6	1102124	1102129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658444
23251	NC_021179	ACTGCA	2	12	1102218	1102229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488658444
23252	NC_021179	ACC	2	6	1102262	1102267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658444
23253	NC_021179	GCA	2	6	1102269	1102274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658444
23254	NC_021179	CGCA	2	8	1102304	1102311	25 %	0 %	25 %	50 %	488658444
23255	NC_021179	TCCC	2	8	1102333	1102340	0 %	25 %	0 %	75 %	488658444
23256	NC_021179	TGC	2	6	1102372	1102377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658444
23257	NC_021179	TGA	2	6	1102431	1102436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658444
23258	NC_021179	GC	3	6	1102445	1102450	0 %	0 %	50 %	50 %	488658444
23259	NC_021179	TCAT	2	8	1102539	1102546	25 %	50 %	0 %	25 %	488658444
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23262	NC_021179	GTGC	2	8	1102721	1102728	0 %	25 %	50 %	25 %	488658444
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23264	NC_021179	GC	3	6	1102847	1102852	0 %	0 %	50 %	50 %	488658444
23265	NC_021179	CAGT	2	8	1102885	1102892	25 %	25 %	25 %	25 %	488658444
23266	NC_021179	TAA	2	6	1102906	1102911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658444
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23269	NC_021179	TTG	2	6	1103009	1103014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658444
23270	NC_021179	TTTC	2	8	1103017	1103024	0 %	75 %	0 %	25 %	488658444
23271	NC_021179	T	6	6	1103085	1103090	0 %	100 %	0 %	0 %	488658444
23272	NC_021179	CTTCA	2	10	1103120	1103129	20 %	40 %	0 %	40 %	488658444
23273	NC_021179	TGA	2	6	1103251	1103256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658444
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23278	NC_021179	TCCG	2	8	1103382	1103389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23279	NC_021179	CG	3	6	1103477	1103482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23280	NC_021179	GAA	2	6	1103483	1103488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23294	NC_021179	TTTCG	2	10	1104436	1104445	0 %	60 %	20 %	20 %	488658445
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23299	NC_021179	TTC	2	6	1104602	1104607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23308	NC_021179	TTCT	2	8	1105168	1105175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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23315	NC_021179	TCC	2	6	1105510	1105515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658447
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23336	NC_021179	CATGCA	2	12	1106670	1106681	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488658448
23337	NC_021179	TTC	2	6	1106684	1106689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658448
23338	NC_021179	GTAC	2	8	1106800	1106807	25 %	25 %	25 %	25 %	488658448
23339	NC_021179	GC	3	6	1106912	1106917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23340	NC_021179	TTC	2	6	1106932	1106937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23341	NC_021179	CG	3	6	1106963	1106968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23342	NC_021179	GAG	2	6	1107014	1107019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23343	NC_021179	ATC	3	9	1107098	1107106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658449
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23345	NC_021179	CTG	2	6	1107251	1107256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658449
23346	NC_021179	AGT	2	6	1107288	1107293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658449
23347	NC_021179	GC	4	8	1107314	1107321	0 %	0 %	50 %	50 %	488658450
23348	NC_021179	CG	3	6	1107334	1107339	0 %	0 %	50 %	50 %	488658450
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23350	NC_021179	TC	3	6	1107391	1107396	0 %	50 %	0 %	50 %	488658450
23351	NC_021179	CGC	2	6	1107414	1107419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658450
23352	NC_021179	GC	3	6	1107423	1107428	0 %	0 %	50 %	50 %	488658450
23353	NC_021179	TTC	2	6	1107438	1107443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658450
23354	NC_021179	CCT	2	6	1107461	1107466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658450
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23356	NC_021179	CGCTG	2	10	1107579	1107588	0 %	20 %	40 %	40 %	488658450
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23423	NC_021179	GCA	2	6	1110770	1110775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23450	NC_021179	TAT	2	6	1112607	1112612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23451	NC_021179	CTG	2	6	1112623	1112628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23453	NC_021179	CA	3	6	1112710	1112715	50 %	0 %	0 %	50 %	488658454
23454	NC_021179	A	6	6	1112750	1112755	100 %	0 %	0 %	0 %	488658454
23455	NC_021179	CA	4	8	1112765	1112772	50 %	0 %	0 %	50 %	488658454
23456	NC_021179	TCC	2	6	1112893	1112898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658455
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23460	NC_021179	GAAA	2	8	1112970	1112977	75 %	0 %	25 %	0 %	488658455
23461	NC_021179	CAG	2	6	1112979	1112984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23462	NC_021179	GAC	2	6	1112991	1112996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23463	NC_021179	AGCTG	2	10	1113008	1113017	20 %	20 %	40 %	20 %	488658455
23464	NC_021179	CTT	2	6	1113036	1113041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658455
23465	NC_021179	CT	3	6	1113057	1113062	0 %	50 %	0 %	50 %	488658455
23466	NC_021179	CG	4	8	1113064	1113071	0 %	0 %	50 %	50 %	488658455
23467	NC_021179	AAG	2	6	1113127	1113132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658455
23468	NC_021179	CTCA	2	8	1113171	1113178	25 %	25 %	0 %	50 %	488658455
23469	NC_021179	TCA	3	9	1113196	1113204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658455
23470	NC_021179	ACG	2	6	1113229	1113234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23471	NC_021179	TCA	2	6	1113244	1113249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658455
23472	NC_021179	AGG	2	6	1113259	1113264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658455
23473	NC_021179	CG	5	10	1113288	1113297	0 %	0 %	50 %	50 %	488658455
23474	NC_021179	TAC	2	6	1113308	1113313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658455
23475	NC_021179	CTG	2	6	1113328	1113333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23476	NC_021179	GAA	2	6	1113378	1113383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658455
23477	NC_021179	CAT	2	6	1113395	1113400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658455
23478	NC_021179	CG	3	6	1113423	1113428	0 %	0 %	50 %	50 %	488658455
23479	NC_021179	AC	3	6	1113466	1113471	50 %	0 %	0 %	50 %	488658455
23480	NC_021179	GTC	2	6	1113480	1113485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23481	NC_021179	GC	3	6	1113519	1113524	0 %	0 %	50 %	50 %	488658455
23482	NC_021179	TC	3	6	1113526	1113531	0 %	50 %	0 %	50 %	488658455
23483	NC_021179	ATCC	2	8	1113558	1113565	25 %	25 %	0 %	50 %	488658455
23484	NC_021179	GC	3	6	1113567	1113572	0 %	0 %	50 %	50 %	488658455
23485	NC_021179	A	6	6	1113613	1113618	100 %	0 %	0 %	0 %	488658455
23486	NC_021179	AGG	2	6	1113745	1113750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658455
23487	NC_021179	TTGCCA	2	12	1113796	1113807	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488658455
23488	NC_021179	TGC	2	6	1113820	1113825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23489	NC_021179	ATGA	2	8	1113900	1113907	50 %	25 %	25 %	0 %	488658455
23490	NC_021179	CAC	2	6	1113939	1113944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658455
23491	NC_021179	GTGTT	2	10	1113959	1113968	0 %	60 %	40 %	0 %	488658455
23492	NC_021179	CTG	2	6	1114003	1114008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658455
23493	NC_021179	TGG	2	6	1114033	1114038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658455
23494	NC_021179	AAC	2	6	1114146	1114151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658455
23495	NC_021179	AG	3	6	1114208	1114213	50 %	0 %	50 %	0 %	488658455
23496	NC_021179	CG	3	6	1114261	1114266	0 %	0 %	50 %	50 %	488658455
23497	NC_021179	GA	3	6	1114302	1114307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23498	NC_021179	CAA	2	6	1114385	1114390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658456
23499	NC_021179	GCT	2	6	1114445	1114450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658456
23500	NC_021179	AGC	2	6	1114470	1114475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658456

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