MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_021179	CTT	2	6	1019035	1019040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658365
21503	NC_021179	CTG	2	6	1019061	1019066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658365
21504	NC_021179	CAT	2	6	1019067	1019072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658365
21505	NC_021179	TC	3	6	1019074	1019079	0 %	50 %	0 %	50 %	488658365
21506	NC_021179	AGG	2	6	1019104	1019109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658365
21507	NC_021179	CTG	2	6	1019184	1019189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658365
21508	NC_021179	T	6	6	1019192	1019197	0 %	100 %	0 %	0 %	488658365
21509	NC_021179	CG	3	6	1019285	1019290	0 %	0 %	50 %	50 %	488658365
21510	NC_021179	AC	3	6	1019399	1019404	50 %	0 %	0 %	50 %	488658366
21511	NC_021179	TG	3	6	1019502	1019507	0 %	50 %	50 %	0 %	488658366
21512	NC_021179	AAC	2	6	1019509	1019514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658366
21513	NC_021179	G	6	6	1019570	1019575	0 %	0 %	100 %	0 %	488658366
21514	NC_021179	CG	3	6	1019639	1019644	0 %	0 %	50 %	50 %	488658366
21515	NC_021179	TTCT	2	8	1019655	1019662	0 %	75 %	0 %	25 %	488658366
21516	NC_021179	CTCC	2	8	1019669	1019676	0 %	25 %	0 %	75 %	488658366
21517	NC_021179	GC	3	6	1019728	1019733	0 %	0 %	50 %	50 %	488658366
21518	NC_021179	AC	3	6	1019736	1019741	50 %	0 %	0 %	50 %	488658366
21519	NC_021179	ATA	2	6	1019812	1019817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658366
21520	NC_021179	TCT	2	6	1019834	1019839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658366
21521	NC_021179	CAT	2	6	1019861	1019866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658366
21522	NC_021179	GCA	2	6	1019881	1019886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658366
21523	NC_021179	A	6	6	1019997	1020002	100 %	0 %	0 %	0 %	488658366
21524	NC_021179	CCA	2	6	1020004	1020009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658366
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21526	NC_021179	A	7	7	1020125	1020131	100 %	0 %	0 %	0 %	488658366
21527	NC_021179	TCA	2	6	1020133	1020138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658366
21528	NC_021179	CGCA	2	8	1020144	1020151	25 %	0 %	25 %	50 %	488658366
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21534	NC_021179	G	6	6	1020474	1020479	0 %	0 %	100 %	0 %	488658367
21535	NC_021179	CCCT	2	8	1020508	1020515	0 %	25 %	0 %	75 %	488658367
21536	NC_021179	CGAT	2	8	1020572	1020579	25 %	25 %	25 %	25 %	488658367
21537	NC_021179	GT	3	6	1020698	1020703	0 %	50 %	50 %	0 %	488658367
21538	NC_021179	CGT	2	6	1020709	1020714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658367
21539	NC_021179	CATC	2	8	1020754	1020761	25 %	25 %	0 %	50 %	488658367
21540	NC_021179	AACGC	2	10	1020838	1020847	40 %	0 %	20 %	40 %	488658367
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21542	NC_021179	TTA	2	6	1020957	1020962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658367
21543	NC_021179	GCT	2	6	1020981	1020986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658367
21544	NC_021179	GCC	2	6	1021047	1021052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658367
21545	NC_021179	CA	4	8	1021200	1021207	50 %	0 %	0 %	50 %	488658367
21546	NC_021179	TGC	2	6	1021229	1021234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658367
21547	NC_021179	ATC	2	6	1021238	1021243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658367
21548	NC_021179	GC	4	8	1021265	1021272	0 %	0 %	50 %	50 %	488658367
21549	NC_021179	AC	3	6	1021330	1021335	50 %	0 %	0 %	50 %	488658367
21550	NC_021179	GCA	2	6	1021359	1021364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658367
21551	NC_021179	GCGCGT	2	12	1021370	1021381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	488658367
21552	NC_021179	A	6	6	1021413	1021418	100 %	0 %	0 %	0 %	488658367
21553	NC_021179	TAA	2	6	1021467	1021472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658367
21554	NC_021179	GC	3	6	1021532	1021537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21555	NC_021179	AGC	2	6	1021570	1021575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21556	NC_021179	CAAC	2	8	1021640	1021647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21557	NC_021179	CTAC	2	8	1021667	1021674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21558	NC_021179	GCC	2	6	1021722	1021727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658368
21559	NC_021179	CGTG	2	8	1021744	1021751	0 %	25 %	50 %	25 %	488658368
21560	NC_021179	TG	4	8	1021750	1021757	0 %	50 %	50 %	0 %	488658368
21561	NC_021179	TGCG	2	8	1021789	1021796	0 %	25 %	50 %	25 %	488658368
21562	NC_021179	GATT	2	8	1021827	1021834	25 %	50 %	25 %	0 %	488658368
21563	NC_021179	AC	3	6	1021853	1021858	50 %	0 %	0 %	50 %	488658368
21564	NC_021179	TAC	2	6	1021893	1021898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658368
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21572	NC_021179	CATAG	2	10	1022448	1022457	40 %	20 %	20 %	20 %	488658369
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21575	NC_021179	CG	3	6	1022548	1022553	0 %	0 %	50 %	50 %	488658369
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21585	NC_021179	GA	3	6	1023005	1023010	50 %	0 %	50 %	0 %	488658369
21586	NC_021179	GA	3	6	1023063	1023068	50 %	0 %	50 %	0 %	488658369
21587	NC_021179	AC	3	6	1023075	1023080	50 %	0 %	0 %	50 %	488658369
21588	NC_021179	CG	3	6	1023091	1023096	0 %	0 %	50 %	50 %	488658369
21589	NC_021179	TTCA	2	8	1023136	1023143	25 %	50 %	0 %	25 %	488658369
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21591	NC_021179	GC	3	6	1023192	1023197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21592	NC_021179	ACGG	2	8	1023210	1023217	25 %	0 %	50 %	25 %	488658370
21593	NC_021179	CTTCT	2	10	1023256	1023265	0 %	60 %	0 %	40 %	488658370
21594	NC_021179	GC	3	6	1023266	1023271	0 %	0 %	50 %	50 %	488658370
21595	NC_021179	AGC	2	6	1023275	1023280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658370
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21604	NC_021179	GGT	2	6	1023861	1023866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658370
21605	NC_021179	GA	3	6	1023871	1023876	50 %	0 %	50 %	0 %	488658370
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21613	NC_021179	GAA	2	6	1024193	1024198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658370
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21979	NC_021179	GCA	2	6	1041996	1042001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658390
21980	NC_021179	TGC	3	9	1042029	1042037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658390
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21982	NC_021179	T	7	7	1042131	1042137	0 %	100 %	0 %	0 %	488658390
21983	NC_021179	CTC	3	9	1042138	1042146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658390
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21987	NC_021179	GCTT	2	8	1042316	1042323	0 %	50 %	25 %	25 %	488658390
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