MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21109	NC_021179	TGC	2	6	1000250	1000255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658350
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21112	NC_021179	A	6	6	1000446	1000451	100 %	0 %	0 %	0 %	488658350
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21123	NC_021179	GCG	2	6	1000800	1000805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658350
21124	NC_021179	AGCA	2	8	1000834	1000841	50 %	0 %	25 %	25 %	488658350
21125	NC_021179	GCG	2	6	1000860	1000865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658350
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21129	NC_021179	GA	3	6	1001078	1001083	50 %	0 %	50 %	0 %	488658350
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21226	NC_021179	AACT	2	8	1005050	1005057	50 %	25 %	0 %	25 %	488658353
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21228	NC_021179	CAC	2	6	1005074	1005079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658353
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21230	NC_021179	CCG	2	6	1005160	1005165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658353
21231	NC_021179	CCA	2	6	1005241	1005246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658353
21232	NC_021179	CCT	2	6	1005424	1005429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658353
21233	NC_021179	AC	3	6	1005450	1005455	50 %	0 %	0 %	50 %	488658353
21234	NC_021179	GCA	2	6	1005464	1005469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658353
21235	NC_021179	GC	4	8	1005472	1005479	0 %	0 %	50 %	50 %	488658353
21236	NC_021179	ACA	2	6	1005512	1005517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21237	NC_021179	C	6	6	1005518	1005523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21238	NC_021179	CGC	2	6	1005547	1005552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21239	NC_021179	CAG	2	6	1005641	1005646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21360	NC_021179	TGC	2	6	1011708	1011713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658360
21361	NC_021179	CGC	2	6	1011720	1011725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658360
21362	NC_021179	CAAA	2	8	1011751	1011758	75 %	0 %	0 %	25 %	488658360
21363	NC_021179	GAG	2	6	1011781	1011786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658360
21364	NC_021179	ACGCTG	2	12	1011815	1011826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	488658360
21365	NC_021179	TACT	2	8	1011831	1011838	25 %	50 %	0 %	25 %	488658360
21366	NC_021179	CGC	2	6	1011839	1011844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658360
21367	NC_021179	ACC	2	6	1011929	1011934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658360
21368	NC_021179	GAA	2	6	1012008	1012013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658360
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21370	NC_021179	CTC	2	6	1012134	1012139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658360
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21372	NC_021179	GCACG	2	10	1012157	1012166	20 %	0 %	40 %	40 %	488658360
21373	NC_021179	CCA	2	6	1012217	1012222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658360
21374	NC_021179	CGG	2	6	1012322	1012327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658360
21375	NC_021179	GCA	2	6	1012417	1012422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658360
21376	NC_021179	CA	3	6	1012442	1012447	50 %	0 %	0 %	50 %	488658360
21377	NC_021179	GAG	2	6	1012486	1012491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658360
21378	NC_021179	CCG	3	9	1012535	1012543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658360
21379	NC_021179	C	6	6	1012638	1012643	0 %	0 %	0 %	100 %	488658360
21380	NC_021179	T	7	7	1012672	1012678	0 %	100 %	0 %	0 %	488658360
21381	NC_021179	GTA	2	6	1012738	1012743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658360
21382	NC_021179	CTA	2	6	1012790	1012795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658360
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21384	NC_021179	GCGT	2	8	1013017	1013024	0 %	25 %	50 %	25 %	488658361
21385	NC_021179	CGC	2	6	1013044	1013049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658361
21386	NC_021179	ACCT	2	8	1013094	1013101	25 %	25 %	0 %	50 %	488658361
21387	NC_021179	GC	3	6	1013135	1013140	0 %	0 %	50 %	50 %	488658361
21388	NC_021179	GC	3	6	1013145	1013150	0 %	0 %	50 %	50 %	488658361
21389	NC_021179	GC	3	6	1013185	1013190	0 %	0 %	50 %	50 %	488658361
21390	NC_021179	CTT	2	6	1013217	1013222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658361
21391	NC_021179	CCT	2	6	1013232	1013237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658361
21392	NC_021179	GCA	2	6	1013291	1013296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658361
21393	NC_021179	CA	4	8	1013345	1013352	50 %	0 %	0 %	50 %	488658361
21394	NC_021179	TGC	2	6	1013362	1013367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658361
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21397	NC_021179	AT	3	6	1013548	1013553	50 %	50 %	0 %	0 %	488658361
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21403	NC_021179	CGT	2	6	1013945	1013950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658361
21404	NC_021179	CGC	2	6	1013987	1013992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658361
21405	NC_021179	A	6	6	1014017	1014022	100 %	0 %	0 %	0 %	488658361
21406	NC_021179	AAG	2	6	1014286	1014291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658361
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21408	NC_021179	CGCA	2	8	1014322	1014329	25 %	0 %	25 %	50 %	488658361
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21411	NC_021179	CA	4	8	1014393	1014400	50 %	0 %	0 %	50 %	488658361
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21413	NC_021179	CAC	2	6	1014515	1014520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658361
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21415	NC_021179	GC	3	6	1014602	1014607	0 %	0 %	50 %	50 %	488658361
21416	NC_021179	TTTC	2	8	1014656	1014663	0 %	75 %	0 %	25 %	488658361
21417	NC_021179	CTC	2	6	1014669	1014674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658361
21418	NC_021179	TCT	2	6	1014687	1014692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658361
21419	NC_021179	GCA	2	6	1014749	1014754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21420	NC_021179	CGA	2	6	1014796	1014801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658362
21421	NC_021179	TCT	2	6	1014835	1014840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658362
21422	NC_021179	AG	3	6	1014923	1014928	50 %	0 %	50 %	0 %	488658362
21423	NC_021179	TAG	2	6	1015060	1015065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658362
21424	NC_021179	CTT	2	6	1015105	1015110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658362
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21428	NC_021179	AGGG	2	8	1015291	1015298	25 %	0 %	75 %	0 %	488658362
21429	NC_021179	TCA	2	6	1015329	1015334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658362
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21432	NC_021179	AGCTC	2	10	1015591	1015600	20 %	20 %	20 %	40 %	488658362
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21437	NC_021179	GAT	2	6	1015921	1015926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658362
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21441	NC_021179	GAA	2	6	1016015	1016020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658362
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21443	NC_021179	TAAT	2	8	1016053	1016060	50 %	50 %	0 %	0 %	488658362
21444	NC_021179	A	6	6	1016081	1016086	100 %	0 %	0 %	0 %	488658362
21445	NC_021179	CAA	2	6	1016164	1016169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658362
21446	NC_021179	CA	3	6	1016226	1016231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21447	NC_021179	TAA	2	6	1016363	1016368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658363
21448	NC_021179	TTC	2	6	1016384	1016389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658363
21449	NC_021179	ATAA	2	8	1016414	1016421	75 %	25 %	0 %	0 %	488658363
21450	NC_021179	CAG	3	9	1016444	1016452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658363
21451	NC_021179	AG	3	6	1016475	1016480	50 %	0 %	50 %	0 %	488658363
21452	NC_021179	AGC	2	6	1016495	1016500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658363
21453	NC_021179	TCCTC	2	10	1016586	1016595	0 %	40 %	0 %	60 %	488658363
21454	NC_021179	TTGCA	2	10	1016651	1016660	20 %	40 %	20 %	20 %	488658363
21455	NC_021179	GCCGA	2	10	1016685	1016694	20 %	0 %	40 %	40 %	488658363
21456	NC_021179	CG	4	8	1016718	1016725	0 %	0 %	50 %	50 %	488658363
21457	NC_021179	GAAG	2	8	1016759	1016766	50 %	0 %	50 %	0 %	488658363
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21462	NC_021179	CTG	2	6	1017097	1017102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658363
21463	NC_021179	CT	3	6	1017124	1017129	0 %	50 %	0 %	50 %	488658363
21464	NC_021179	A	6	6	1017135	1017140	100 %	0 %	0 %	0 %	488658363
21465	NC_021179	AAG	2	6	1017205	1017210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658363
21466	NC_021179	CCGT	2	8	1017218	1017225	0 %	25 %	25 %	50 %	488658363
21467	NC_021179	CATA	2	8	1017329	1017336	50 %	25 %	0 %	25 %	488658363
21468	NC_021179	GAC	2	6	1017393	1017398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658363
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21472	NC_021179	GCA	3	9	1017660	1017668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658363
21473	NC_021179	CGA	2	6	1017715	1017720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658363
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21475	NC_021179	GC	3	6	1017790	1017795	0 %	0 %	50 %	50 %	488658363
21476	NC_021179	ACGCA	2	10	1017812	1017821	40 %	0 %	20 %	40 %	488658363
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