MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021179	TCC	2	6	901100	901105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658258
19002	NC_021179	A	6	6	901113	901118	100 %	0 %	0 %	0 %	488658258
19003	NC_021179	CGC	2	6	901119	901124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658258
19004	NC_021179	TGTT	2	8	901216	901223	0 %	75 %	25 %	0 %	488658258
19005	NC_021179	GCAC	2	8	901265	901272	25 %	0 %	25 %	50 %	488658258
19006	NC_021179	CTT	2	6	901326	901331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658258
19007	NC_021179	CTG	2	6	901339	901344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658258
19008	NC_021179	TGA	2	6	901479	901484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658258
19009	NC_021179	CAC	2	6	901506	901511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658258
19010	NC_021179	AAT	2	6	901519	901524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658258
19011	NC_021179	AC	3	6	901691	901696	50 %	0 %	0 %	50 %	488658258
19012	NC_021179	GCG	2	6	901737	901742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658258
19013	NC_021179	CA	3	6	901752	901757	50 %	0 %	0 %	50 %	488658258
19014	NC_021179	TCT	2	6	901766	901771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658258
19015	NC_021179	CTG	2	6	901789	901794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658258
19016	NC_021179	CGG	2	6	901873	901878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658258
19017	NC_021179	TAAC	2	8	901887	901894	50 %	25 %	0 %	25 %	488658258
19018	NC_021179	GCC	2	6	901959	901964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658258
19019	NC_021179	CA	3	6	901971	901976	50 %	0 %	0 %	50 %	488658258
19020	NC_021179	CCTCA	2	10	901989	901998	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19021	NC_021179	GAAC	2	8	902012	902019	50 %	0 %	25 %	25 %	488658259
19022	NC_021179	TCAA	2	8	902082	902089	50 %	25 %	0 %	25 %	488658259
19023	NC_021179	ACC	2	6	902133	902138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658259
19024	NC_021179	CTC	2	6	902189	902194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658259
19025	NC_021179	CTT	2	6	902218	902223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658259
19026	NC_021179	GC	3	6	902313	902318	0 %	0 %	50 %	50 %	488658259
19027	NC_021179	CCT	2	6	902365	902370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658259
19028	NC_021179	AGCCG	2	10	902576	902585	20 %	0 %	40 %	40 %	488658259
19029	NC_021179	ACG	2	6	902594	902599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658259
19030	NC_021179	AC	3	6	902665	902670	50 %	0 %	0 %	50 %	488658259
19031	NC_021179	TCT	2	6	902681	902686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658259
19032	NC_021179	GAAA	2	8	902692	902699	75 %	0 %	25 %	0 %	488658259
19033	NC_021179	TGA	2	6	902747	902752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658259
19034	NC_021179	TGC	2	6	902815	902820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658259
19035	NC_021179	AC	3	6	902821	902826	50 %	0 %	0 %	50 %	488658259
19036	NC_021179	A	6	6	902847	902852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_021179	AGC	2	6	902873	902878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_021179	CG	3	6	902959	902964	0 %	0 %	50 %	50 %	488658260
19039	NC_021179	CTG	2	6	902966	902971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658260
19040	NC_021179	TATCAG	2	12	903046	903057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488658260
19041	NC_021179	CCT	2	6	903062	903067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658260
19042	NC_021179	TTC	2	6	903080	903085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658260
19043	NC_021179	TAC	2	6	903217	903222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658260
19044	NC_021179	GCG	2	6	903228	903233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658260
19045	NC_021179	CG	3	6	903236	903241	0 %	0 %	50 %	50 %	488658260
19046	NC_021179	AC	4	8	903314	903321	50 %	0 %	0 %	50 %	488658260
19047	NC_021179	GCG	2	6	903324	903329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658260
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19050	NC_021179	CGTG	2	8	903449	903456	0 %	25 %	50 %	25 %	488658260
19051	NC_021179	AAC	2	6	903474	903479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658260
19052	NC_021179	GC	3	6	903483	903488	0 %	0 %	50 %	50 %	488658260
19053	NC_021179	TCG	2	6	903542	903547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658260
19054	NC_021179	ACA	2	6	903577	903582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658260
19055	NC_021179	GACAC	2	10	903593	903602	40 %	0 %	20 %	40 %	488658260
19056	NC_021179	ACT	2	6	903669	903674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658261
19057	NC_021179	CAC	2	6	903697	903702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658261
19058	NC_021179	T	6	6	903706	903711	0 %	100 %	0 %	0 %	488658261
19059	NC_021179	CG	3	6	903715	903720	0 %	0 %	50 %	50 %	488658261
19060	NC_021179	CCGTC	2	10	903729	903738	0 %	20 %	20 %	60 %	488658261
19061	NC_021179	CTC	2	6	903804	903809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658261
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19064	NC_021179	CCG	2	6	903947	903952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658261
19065	NC_021179	CG	4	8	903958	903965	0 %	0 %	50 %	50 %	488658261
19066	NC_021179	AATT	2	8	904044	904051	50 %	50 %	0 %	0 %	488658261
19067	NC_021179	CGC	2	6	904112	904117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658261
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19070	NC_021179	CAA	2	6	904302	904307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658261
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19076	NC_021179	ATT	2	6	904534	904539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658261
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19078	NC_021179	CG	3	6	904673	904678	0 %	0 %	50 %	50 %	488658261
19079	NC_021179	CA	3	6	904719	904724	50 %	0 %	0 %	50 %	488658261
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19084	NC_021179	TGC	2	6	905151	905156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658262
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19087	NC_021179	T	6	6	905335	905340	0 %	100 %	0 %	0 %	488658262
19088	NC_021179	GCG	2	6	905546	905551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658262
19089	NC_021179	CG	3	6	905567	905572	0 %	0 %	50 %	50 %	488658262
19090	NC_021179	CCT	2	6	905584	905589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658262
19091	NC_021179	GC	3	6	905593	905598	0 %	0 %	50 %	50 %	488658262
19092	NC_021179	CGC	2	6	905601	905606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658262
19093	NC_021179	ACTG	2	8	905611	905618	25 %	25 %	25 %	25 %	488658262
19094	NC_021179	CATA	2	8	905657	905664	50 %	25 %	0 %	25 %	488658262
19095	NC_021179	CTG	2	6	905667	905672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658262
19096	NC_021179	CA	3	6	905943	905948	50 %	0 %	0 %	50 %	488658262
19097	NC_021179	CCTG	2	8	906004	906011	0 %	25 %	25 %	50 %	488658262
19098	NC_021179	GCA	2	6	906017	906022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
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19101	NC_021179	AATCC	2	10	906216	906225	40 %	20 %	0 %	40 %	488658262
19102	NC_021179	TCA	2	6	906308	906313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658262
19103	NC_021179	GCA	2	6	906356	906361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
19104	NC_021179	ATC	2	6	906388	906393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658262
19105	NC_021179	CAC	2	6	906474	906479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658262
19106	NC_021179	GAC	2	6	906507	906512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
19107	NC_021179	CG	3	6	906533	906538	0 %	0 %	50 %	50 %	488658262
19108	NC_021179	GCG	2	6	906554	906559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658262
19109	NC_021179	TCT	2	6	906574	906579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658262
19110	NC_021179	GAT	2	6	906626	906631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658262
19111	NC_021179	GCG	2	6	906653	906658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658262
19112	NC_021179	CTGCGC	2	12	906689	906700	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	488658262
19113	NC_021179	CTA	2	6	906701	906706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658262
19114	NC_021179	CCAA	2	8	906814	906821	50 %	0 %	0 %	50 %	488658262
19115	NC_021179	CACG	2	8	906878	906885	25 %	0 %	25 %	50 %	488658262
19116	NC_021179	GCA	3	9	906905	906913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
19117	NC_021179	GCA	2	6	906919	906924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
19118	NC_021179	CCTGC	2	10	906929	906938	0 %	20 %	20 %	60 %	488658262
19119	NC_021179	T	6	6	906976	906981	0 %	100 %	0 %	0 %	488658262
19120	NC_021179	GCG	2	6	907055	907060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658262
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19122	NC_021179	GCA	2	6	907165	907170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
19123	NC_021179	GCA	2	6	907177	907182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658262
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19233	NC_021179	ACCA	2	8	913450	913457	50 %	0 %	0 %	50 %	488658266
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19237	NC_021179	CGC	2	6	913577	913582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19239	NC_021179	TTCG	2	8	913679	913686	0 %	50 %	25 %	25 %	488658267
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19369	NC_021179	AAG	2	6	920309	920314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658272
19370	NC_021179	CGA	2	6	920353	920358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658272
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19491	NC_021179	CTT	2	6	925750	925755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658280
19492	NC_021179	TTC	2	6	925903	925908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658280
19493	NC_021179	C	6	6	925995	926000	0 %	0 %	0 %	100 %	488658280
19494	NC_021179	GC	3	6	926005	926010	0 %	0 %	50 %	50 %	488658280
19495	NC_021179	A	6	6	926080	926085	100 %	0 %	0 %	0 %	488658280
19496	NC_021179	TGG	2	6	926131	926136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658280
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19498	NC_021179	A	7	7	926180	926186	100 %	0 %	0 %	0 %	488658280
19499	NC_021179	GCTC	2	8	926212	926219	0 %	25 %	25 %	50 %	488658280
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