MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15005	NC_021179	GAA	2	6	706570	706575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658062
15006	NC_021179	GA	3	6	706605	706610	50 %	0 %	50 %	0 %	488658062
15007	NC_021179	CGC	2	6	706626	706631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658062
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15009	NC_021179	GATC	2	8	706683	706690	25 %	25 %	25 %	25 %	488658062
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15011	NC_021179	GC	3	6	706825	706830	0 %	0 %	50 %	50 %	488658062
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15013	NC_021179	CTTT	2	8	706906	706913	0 %	75 %	0 %	25 %	488658062
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15020	NC_021179	AAC	2	6	707168	707173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658063
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15040	NC_021179	AT	3	6	708172	708177	50 %	50 %	0 %	0 %	488658064
15041	NC_021179	CGG	2	6	708215	708220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658064
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15115	NC_021179	CAGGAT	2	12	712855	712866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	488658068
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15123	NC_021179	TCT	2	6	713241	713246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658068
15124	NC_021179	CG	3	6	713411	713416	0 %	0 %	50 %	50 %	488658068
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15243	NC_021179	CGCTG	2	10	720212	720221	0 %	20 %	40 %	40 %	488658074
15244	NC_021179	CTTC	2	8	720260	720267	0 %	50 %	0 %	50 %	488658074
15245	NC_021179	CAA	2	6	720308	720313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658074
15246	NC_021179	TGC	2	6	720398	720403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658074
15247	NC_021179	T	7	7	720437	720443	0 %	100 %	0 %	0 %	488658074
15248	NC_021179	GC	3	6	720468	720473	0 %	0 %	50 %	50 %	488658074
15249	NC_021179	CAT	2	6	720477	720482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658074
15250	NC_021179	CT	4	8	720553	720560	0 %	50 %	0 %	50 %	488658074
15251	NC_021179	GGC	2	6	720567	720572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658074
15252	NC_021179	CAT	2	6	720627	720632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658074
15253	NC_021179	TCA	2	6	720689	720694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658074
15254	NC_021179	CCA	2	6	720719	720724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658074
15255	NC_021179	TC	3	6	720764	720769	0 %	50 %	0 %	50 %	488658074
15256	NC_021179	ATC	2	6	720772	720777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658074
15257	NC_021179	ATG	2	6	720796	720801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658074
15258	NC_021179	CCT	2	6	720825	720830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658074
15259	NC_021179	ACT	2	6	720867	720872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658074
15260	NC_021179	TG	3	6	720915	720920	0 %	50 %	50 %	0 %	488658075
15261	NC_021179	TTCT	2	8	720934	720941	0 %	75 %	0 %	25 %	488658075
15262	NC_021179	TC	3	6	720950	720955	0 %	50 %	0 %	50 %	488658075
15263	NC_021179	CCTGTA	2	12	720995	721006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488658075
15264	NC_021179	TAC	2	6	721017	721022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658075
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15267	NC_021179	CAT	2	6	721172	721177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658075
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15269	NC_021179	AG	3	6	721241	721246	50 %	0 %	50 %	0 %	488658075
15270	NC_021179	TAT	2	6	721296	721301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658075
15271	NC_021179	GGCA	2	8	721310	721317	25 %	0 %	50 %	25 %	488658075
15272	NC_021179	A	6	6	721329	721334	100 %	0 %	0 %	0 %	488658075
15273	NC_021179	CG	3	6	721349	721354	0 %	0 %	50 %	50 %	488658075
15274	NC_021179	TCT	2	6	721366	721371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658075
15275	NC_021179	CGTAT	2	10	721387	721396	20 %	40 %	20 %	20 %	488658075
15276	NC_021179	ATG	2	6	721401	721406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658075
15277	NC_021179	TGC	2	6	721430	721435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658075
15278	NC_021179	A	6	6	721466	721471	100 %	0 %	0 %	0 %	488658075
15279	NC_021179	GCAG	2	8	721487	721494	25 %	0 %	50 %	25 %	488658075
15280	NC_021179	CGGA	2	8	721543	721550	25 %	0 %	50 %	25 %	488658075
15281	NC_021179	TGT	2	6	721580	721585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658075
15282	NC_021179	CTT	2	6	721607	721612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658075
15283	NC_021179	CTT	2	6	721649	721654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658075
15284	NC_021179	CTT	2	6	721748	721753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658075
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15289	NC_021179	GCA	2	6	721899	721904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658075
15290	NC_021179	TC	4	8	722063	722070	0 %	50 %	0 %	50 %	488658076
15291	NC_021179	CGC	2	6	722144	722149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658076
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15294	NC_021179	CGA	2	6	722257	722262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658077
15295	NC_021179	GGA	2	6	722376	722381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658077
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15297	NC_021179	CAA	2	6	722438	722443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488658077
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15299	NC_021179	GAT	2	6	722575	722580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658077
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15301	NC_021179	AAT	2	6	722698	722703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658078
15302	NC_021179	CTG	2	6	723043	723048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658078
15303	NC_021179	CGG	2	6	723059	723064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658078
15304	NC_021179	ATA	2	6	723225	723230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658078
15305	NC_021179	CTG	2	6	723293	723298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658078
15306	NC_021179	GC	4	8	723309	723316	0 %	0 %	50 %	50 %	488658078
15307	NC_021179	GAG	2	6	723324	723329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658078
15308	NC_021179	AGA	2	6	723330	723335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658078
15309	NC_021179	TGG	2	6	723372	723377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658078
15310	NC_021179	TGCATT	2	12	723551	723562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488658078
15311	NC_021179	T	8	8	723604	723611	0 %	100 %	0 %	0 %	488658078
15312	NC_021179	TAC	2	6	723671	723676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658078
15313	NC_021179	TC	3	6	723740	723745	0 %	50 %	0 %	50 %	488658078
15314	NC_021179	GAC	2	6	723768	723773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658078
15315	NC_021179	AGCG	2	8	723797	723804	25 %	0 %	50 %	25 %	488658078
15316	NC_021179	ATC	2	6	723806	723811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658078
15317	NC_021179	GCT	2	6	723817	723822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658078
15318	NC_021179	CTGT	2	8	723897	723904	0 %	50 %	25 %	25 %	488658078
15319	NC_021179	TG	3	6	723913	723918	0 %	50 %	50 %	0 %	488658078
15320	NC_021179	TCC	2	6	723940	723945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658078
15321	NC_021179	TGA	2	6	723991	723996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658079
15322	NC_021179	CCG	2	6	724018	724023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658079
15323	NC_021179	TAA	2	6	724063	724068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488658079
15324	NC_021179	TCA	2	6	724083	724088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658079
15325	NC_021179	TGT	2	6	724193	724198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658079
15326	NC_021179	A	6	6	724208	724213	100 %	0 %	0 %	0 %	488658079
15327	NC_021179	GT	3	6	724224	724229	0 %	50 %	50 %	0 %	488658079
15328	NC_021179	GCC	2	6	724278	724283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658079
15329	NC_021179	ACAGC	2	10	724351	724360	40 %	0 %	20 %	40 %	488658079
15330	NC_021179	TCCA	2	8	724371	724378	25 %	25 %	0 %	50 %	488658079
15331	NC_021179	CCTG	2	8	724419	724426	0 %	25 %	25 %	50 %	488658079
15332	NC_021179	CT	3	6	724450	724455	0 %	50 %	0 %	50 %	488658079
15333	NC_021179	TGC	2	6	724484	724489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658079
15334	NC_021179	TCC	2	6	724527	724532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658079
15335	NC_021179	TGAT	2	8	724638	724645	25 %	50 %	25 %	0 %	488658079
15336	NC_021179	CCA	2	6	724651	724656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658079
15337	NC_021179	CCA	2	6	724663	724668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658079
15338	NC_021179	GGC	2	6	724676	724681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658079
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15340	NC_021179	CCCATC	2	12	724805	724816	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	488658079
15341	NC_021179	TTG	2	6	724839	724844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658079
15342	NC_021179	A	7	7	724862	724868	100 %	0 %	0 %	0 %	488658079
15343	NC_021179	CAC	2	6	725051	725056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658079
15344	NC_021179	GTT	2	6	725076	725081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658079
15345	NC_021179	CTCATC	2	12	725156	725167	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	488658079
15346	NC_021179	CCA	2	6	725209	725214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658079
15347	NC_021179	TGA	3	9	725382	725390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658079
15348	NC_021179	ACAG	2	8	725457	725464	50 %	0 %	25 %	25 %	488658079
15349	NC_021179	GCCA	2	8	725470	725477	25 %	0 %	25 %	50 %	488658079
15350	NC_021179	TCC	2	6	725514	725519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658079
15351	NC_021179	GTCT	2	8	725585	725592	0 %	50 %	25 %	25 %	488658079
15352	NC_021179	GAG	2	6	725612	725617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658079
15353	NC_021179	CG	3	6	725631	725636	0 %	0 %	50 %	50 %	488658079
15354	NC_021179	CGAA	2	8	725713	725720	50 %	0 %	25 %	25 %	488658079
15355	NC_021179	GGC	2	6	725737	725742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658079
15356	NC_021179	GAA	2	6	725757	725762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658079
15357	NC_021179	GCA	2	6	725882	725887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15358	NC_021179	CCTC	2	8	725901	725908	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15359	NC_021179	CTC	2	6	725934	725939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15360	NC_021179	AAGAC	2	10	725973	725982	60 %	0 %	20 %	20 %	488658080
15361	NC_021179	CTG	2	6	726032	726037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658080
15362	NC_021179	CG	3	6	726078	726083	0 %	0 %	50 %	50 %	488658080
15363	NC_021179	T	6	6	726117	726122	0 %	100 %	0 %	0 %	488658080
15364	NC_021179	AG	3	6	726154	726159	50 %	0 %	50 %	0 %	488658080
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15487	NC_021179	CCA	2	6	732038	732043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658086
15488	NC_021179	CA	3	6	732079	732084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15489	NC_021179	AC	3	6	732134	732139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15490	NC_021179	AAT	2	6	732225	732230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15491	NC_021179	TTC	2	6	732231	732236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15492	NC_021179	CGA	2	6	732252	732257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15493	NC_021179	CAC	2	6	732354	732359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658087
15494	NC_021179	A	7	7	732369	732375	100 %	0 %	0 %	0 %	488658087
15495	NC_021179	CG	3	6	732388	732393	0 %	0 %	50 %	50 %	488658087
15496	NC_021179	AC	3	6	732409	732414	50 %	0 %	0 %	50 %	488658087
15497	NC_021179	CAT	2	6	732498	732503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658087
15498	NC_021179	A	6	6	732507	732512	100 %	0 %	0 %	0 %	488658087
15499	NC_021179	CAGCAT	2	12	732612	732623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	488658087
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