MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021179	CTT	2	6	660186	660191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658025
14002	NC_021179	CAAA	2	8	660200	660207	75 %	0 %	0 %	25 %	488658025
14003	NC_021179	ATG	2	6	660286	660291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658025
14004	NC_021179	CCTGA	2	10	660345	660354	20 %	20 %	20 %	40 %	488658025
14005	NC_021179	CAC	2	6	660396	660401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658025
14006	NC_021179	TCC	2	6	660413	660418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_021179	AG	3	6	660421	660426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_021179	TC	3	6	660445	660450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_021179	CAC	2	6	660454	660459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_021179	CA	3	6	660510	660515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14011	NC_021179	GCA	2	6	660586	660591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_021179	CCGC	2	8	660751	660758	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14013	NC_021179	CAG	2	6	660766	660771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_021179	GCC	2	6	660779	660784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658026
14015	NC_021179	CAC	2	6	660800	660805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658026
14016	NC_021179	GC	3	6	660811	660816	0 %	0 %	50 %	50 %	488658026
14017	NC_021179	GC	3	6	660819	660824	0 %	0 %	50 %	50 %	488658026
14018	NC_021179	CCA	2	6	660871	660876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658026
14019	NC_021179	GC	3	6	660879	660884	0 %	0 %	50 %	50 %	488658026
14020	NC_021179	GA	3	6	660938	660943	50 %	0 %	50 %	0 %	488658026
14021	NC_021179	CCG	2	6	661042	661047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658026
14022	NC_021179	CAC	2	6	661052	661057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658026
14023	NC_021179	CA	3	6	661075	661080	50 %	0 %	0 %	50 %	488658026
14024	NC_021179	CAG	2	6	661207	661212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658026
14025	NC_021179	CCT	2	6	661231	661236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658026
14026	NC_021179	TCA	2	6	661242	661247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658026
14027	NC_021179	CCT	2	6	661270	661275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658026
14028	NC_021179	CAC	2	6	661337	661342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658026
14029	NC_021179	TCA	2	6	661378	661383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658026
14030	NC_021179	CTG	2	6	661433	661438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658026
14031	NC_021179	CAAAAG	2	12	661456	661467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	488658026
14032	NC_021179	AAG	3	9	661482	661490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658026
14033	NC_021179	GCT	2	6	661492	661497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658026
14034	NC_021179	TCC	2	6	661510	661515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14035	NC_021179	GCACG	2	10	661559	661568	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14036	NC_021179	CG	3	6	661567	661572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14037	NC_021179	CAC	2	6	661596	661601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_021179	AC	3	6	661639	661644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_021179	CG	3	6	661711	661716	0 %	0 %	50 %	50 %	488658027
14040	NC_021179	AGA	2	6	661791	661796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658027
14041	NC_021179	CTC	2	6	661811	661816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658027
14042	NC_021179	AG	3	6	661821	661826	50 %	0 %	50 %	0 %	488658027
14043	NC_021179	ACG	2	6	661846	661851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_021179	GCG	2	6	661885	661890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_021179	GCT	2	6	661933	661938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_021179	GCGT	2	8	661979	661986	0 %	25 %	50 %	25 %	488658028
14047	NC_021179	C	6	6	662023	662028	0 %	0 %	0 %	100 %	488658028
14048	NC_021179	TCC	2	6	662216	662221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658028
14049	NC_021179	CGCT	2	8	662231	662238	0 %	25 %	25 %	50 %	488658028
14050	NC_021179	TAC	2	6	662256	662261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658028
14051	NC_021179	TCCCC	2	10	662294	662303	0 %	20 %	0 %	80 %	488658028
14052	NC_021179	GC	3	6	662328	662333	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14053	NC_021179	CTG	2	6	662363	662368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658028
14054	NC_021179	AGA	2	6	662384	662389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658028
14055	NC_021179	TGCG	2	8	662411	662418	0 %	25 %	50 %	25 %	488658028
14056	NC_021179	GC	5	10	662430	662439	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14057	NC_021179	CA	3	6	662530	662535	50 %	0 %	0 %	50 %	488658028
14058	NC_021179	ACT	2	6	662587	662592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658028
14059	NC_021179	GC	3	6	662611	662616	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14060	NC_021179	GGCA	2	8	662637	662644	25 %	0 %	50 %	25 %	488658028
14061	NC_021179	GAC	2	6	662668	662673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658028
14062	NC_021179	T	6	6	662674	662679	0 %	100 %	0 %	0 %	488658028
14063	NC_021179	GC	3	6	662689	662694	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14064	NC_021179	GCC	2	6	662795	662800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658028
14065	NC_021179	TGG	2	6	662819	662824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658028
14066	NC_021179	ACTG	2	8	662851	662858	25 %	25 %	25 %	25 %	488658028
14067	NC_021179	GCA	2	6	662899	662904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658028
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14069	NC_021179	CCTT	2	8	662930	662937	0 %	50 %	0 %	50 %	488658028
14070	NC_021179	GC	3	6	662943	662948	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14071	NC_021179	GCA	2	6	662952	662957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658028
14072	NC_021179	GC	3	6	662966	662971	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14073	NC_021179	AC	3	6	662978	662983	50 %	0 %	0 %	50 %	488658028
14074	NC_021179	CG	3	6	662991	662996	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14075	NC_021179	GC	3	6	663004	663009	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14076	NC_021179	CG	3	6	663064	663069	0 %	0 %	50 %	50 %	488658028
14077	NC_021179	ACT	2	6	663105	663110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658028
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14083	NC_021179	ACGC	2	8	663633	663640	25 %	0 %	25 %	50 %	488658029
14084	NC_021179	CGG	2	6	663653	663658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658029
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14089	NC_021179	GTC	2	6	663744	663749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658029
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14098	NC_021179	CA	3	6	664023	664028	50 %	0 %	0 %	50 %	488658029
14099	NC_021179	TG	3	6	664031	664036	0 %	50 %	50 %	0 %	488658029
14100	NC_021179	GTT	2	6	664047	664052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658029
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14102	NC_021179	AGA	2	6	664182	664187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658029
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14105	NC_021179	CTTT	2	8	664407	664414	0 %	75 %	0 %	25 %	488658029
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14107	NC_021179	GCG	2	6	664474	664479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658029
14108	NC_021179	GACGC	2	10	664516	664525	20 %	0 %	40 %	40 %	488658029
14109	NC_021179	CAGC	2	8	664571	664578	25 %	0 %	25 %	50 %	488658029
14110	NC_021179	GC	4	8	664661	664668	0 %	0 %	50 %	50 %	488658029
14111	NC_021179	CTC	2	6	664679	664684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658029
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14113	NC_021179	A	6	6	664781	664786	100 %	0 %	0 %	0 %	488658029
14114	NC_021179	AGTT	2	8	664956	664963	25 %	50 %	25 %	0 %	488658029
14115	NC_021179	CTTG	2	8	664971	664978	0 %	50 %	25 %	25 %	488658029
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14119	NC_021179	CGG	3	9	665145	665153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658029
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14124	NC_021179	GC	3	6	665356	665361	0 %	0 %	50 %	50 %	488658029
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14485	NC_021179	CGGTGT	2	12	682183	682194	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488658043
14486	NC_021179	ACG	2	6	682230	682235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658043
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14489	NC_021179	GCGCA	2	10	682403	682412	20 %	0 %	40 %	40 %	488658043
14490	NC_021179	TAC	2	6	682456	682461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658043
14491	NC_021179	ACGC	2	8	682502	682509	25 %	0 %	25 %	50 %	488658043
14492	NC_021179	TCG	2	6	682525	682530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658043
14493	NC_021179	AGGA	2	8	682659	682666	50 %	0 %	50 %	0 %	488658044
14494	NC_021179	CG	3	6	682684	682689	0 %	0 %	50 %	50 %	488658044
14495	NC_021179	CAC	2	6	682733	682738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658044
14496	NC_021179	GAA	2	6	682741	682746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658044
14497	NC_021179	TGC	2	6	682781	682786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658044
14498	NC_021179	ACG	2	6	682802	682807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658044
14499	NC_021179	TAC	2	6	682834	682839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658044
14500	NC_021179	TA	3	6	682957	682962	50 %	50 %	0 %	0 %	488658044

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