MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021179	CGA	2	6	519992	519997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11002	NC_021179	GAA	3	9	520045	520053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657904
11003	NC_021179	CCA	2	6	520115	520120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657904
11004	NC_021179	CG	3	6	520182	520187	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11005	NC_021179	TCA	2	6	520196	520201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657904
11006	NC_021179	CTG	2	6	520257	520262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11007	NC_021179	GCT	2	6	520268	520273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11008	NC_021179	GC	3	6	520281	520286	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11009	NC_021179	CG	3	6	520291	520296	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11010	NC_021179	GCC	2	6	520336	520341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657904
11011	NC_021179	CTG	2	6	520353	520358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11012	NC_021179	GCC	2	6	520426	520431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657904
11013	NC_021179	GC	3	6	520480	520485	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11014	NC_021179	CCG	2	6	520505	520510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657904
11015	NC_021179	CG	3	6	520509	520514	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11016	NC_021179	CTG	2	6	520524	520529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11017	NC_021179	CTG	2	6	520533	520538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11018	NC_021179	GTT	2	6	520544	520549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657904
11019	NC_021179	TTCC	2	8	520562	520569	0 %	50 %	0 %	50 %	488657904
11020	NC_021179	CCA	2	6	520646	520651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657904
11021	NC_021179	GC	3	6	520755	520760	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11022	NC_021179	GA	3	6	520780	520785	50 %	0 %	50 %	0 %	488657904
11023	NC_021179	ACC	2	6	520795	520800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657904
11024	NC_021179	GC	3	6	520809	520814	0 %	0 %	50 %	50 %	488657904
11025	NC_021179	CGTG	2	8	520875	520882	0 %	25 %	50 %	25 %	488657904
11026	NC_021179	GGC	2	6	520905	520910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657904
11027	NC_021179	GGC	2	6	520920	520925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657904
11028	NC_021179	TGT	2	6	520940	520945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657904
11029	NC_021179	ATG	2	6	520975	520980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657904
11030	NC_021179	CCG	2	6	521062	521067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657904
11031	NC_021179	GCG	3	9	521107	521115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657904
11032	NC_021179	CA	3	6	521231	521236	50 %	0 %	0 %	50 %	488657904
11033	NC_021179	GCA	2	6	521240	521245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657904
11034	NC_021179	TTC	2	6	521248	521253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657904
11035	NC_021179	TCA	2	6	521330	521335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_021179	GC	4	8	521464	521471	0 %	0 %	50 %	50 %	488657905
11037	NC_021179	GCGT	2	8	521515	521522	0 %	25 %	50 %	25 %	488657905
11038	NC_021179	AGT	2	6	521552	521557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657905
11039	NC_021179	TGC	2	6	521692	521697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11040	NC_021179	AAG	2	6	521758	521763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657905
11041	NC_021179	TCCT	2	8	521809	521816	0 %	50 %	0 %	50 %	488657905
11042	NC_021179	GCG	2	6	521871	521876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657905
11043	NC_021179	TG	3	6	521881	521886	0 %	50 %	50 %	0 %	488657905
11044	NC_021179	TGTC	2	8	521901	521908	0 %	50 %	25 %	25 %	488657905
11045	NC_021179	T	6	6	521918	521923	0 %	100 %	0 %	0 %	488657905
11046	NC_021179	GAAGA	2	10	521936	521945	60 %	0 %	40 %	0 %	488657905
11047	NC_021179	GGA	2	6	521953	521958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657905
11048	NC_021179	GCA	2	6	521993	521998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11049	NC_021179	GAA	2	6	522038	522043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657905
11050	NC_021179	TAC	2	6	522142	522147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657905
11051	NC_021179	GTG	2	6	522158	522163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657905
11052	NC_021179	GC	3	6	522210	522215	0 %	0 %	50 %	50 %	488657905
11053	NC_021179	CGT	2	6	522345	522350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11054	NC_021179	GCAC	2	8	522353	522360	25 %	0 %	25 %	50 %	488657905
11055	NC_021179	TG	3	6	522425	522430	0 %	50 %	50 %	0 %	488657905
11056	NC_021179	GCACCG	2	12	522438	522449	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	488657905
11057	NC_021179	TGC	2	6	522458	522463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11058	NC_021179	ACG	2	6	522548	522553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11059	NC_021179	GC	3	6	522596	522601	0 %	0 %	50 %	50 %	488657905
11060	NC_021179	T	8	8	522610	522617	0 %	100 %	0 %	0 %	488657905
11061	NC_021179	TGA	2	6	522660	522665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657905
11062	NC_021179	CG	3	6	522672	522677	0 %	0 %	50 %	50 %	488657905
11063	NC_021179	GGA	2	6	522692	522697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657905
11064	NC_021179	AGG	2	6	522698	522703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657905
11065	NC_021179	CTG	2	6	522746	522751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11066	NC_021179	CAG	2	6	522757	522762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11067	NC_021179	GGT	2	6	522772	522777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657905
11068	NC_021179	CAG	2	6	522781	522786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11069	NC_021179	CCGT	2	8	522787	522794	0 %	25 %	25 %	50 %	488657905
11070	NC_021179	C	6	6	522823	522828	0 %	0 %	0 %	100 %	488657905
11071	NC_021179	CGC	2	6	522832	522837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657905
11072	NC_021179	CG	3	6	522858	522863	0 %	0 %	50 %	50 %	488657905
11073	NC_021179	GCA	2	6	522866	522871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657905
11074	NC_021179	CTGG	2	8	522904	522911	0 %	25 %	50 %	25 %	488657905
11075	NC_021179	AGG	2	6	523128	523133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657905
11076	NC_021179	GCG	2	6	523154	523159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657905
11077	NC_021179	TGCG	2	8	523164	523171	0 %	25 %	50 %	25 %	488657905
11078	NC_021179	GAGG	2	8	523272	523279	25 %	0 %	75 %	0 %	488657905
11079	NC_021179	GT	3	6	523280	523285	0 %	50 %	50 %	0 %	488657905
11080	NC_021179	GCG	2	6	523357	523362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657905
11081	NC_021179	CAT	2	6	523506	523511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657906
11082	NC_021179	TCA	2	6	523543	523548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657906
11083	NC_021179	TCT	2	6	523561	523566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657906
11084	NC_021179	GGTT	2	8	523593	523600	0 %	50 %	50 %	0 %	488657906
11085	NC_021179	GCT	2	6	523638	523643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11086	NC_021179	GTCTG	2	10	523653	523662	0 %	40 %	40 %	20 %	488657906
11087	NC_021179	GC	3	6	523775	523780	0 %	0 %	50 %	50 %	488657906
11088	NC_021179	GAAG	2	8	523866	523873	50 %	0 %	50 %	0 %	488657906
11089	NC_021179	T	6	6	523876	523881	0 %	100 %	0 %	0 %	488657906
11090	NC_021179	GGT	2	6	523905	523910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657906
11091	NC_021179	GGA	2	6	523935	523940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657906
11092	NC_021179	CAG	2	6	523978	523983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11093	NC_021179	CGT	2	6	523996	524001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11094	NC_021179	TCGC	2	8	524019	524026	0 %	25 %	25 %	50 %	488657906
11095	NC_021179	TA	3	6	524066	524071	50 %	50 %	0 %	0 %	488657906
11096	NC_021179	CGG	2	6	524080	524085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657906
11097	NC_021179	ATT	2	6	524086	524091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657906
11098	NC_021179	TG	3	6	524126	524131	0 %	50 %	50 %	0 %	488657906
11099	NC_021179	GCA	2	6	524229	524234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11100	NC_021179	CGTC	2	8	524279	524286	0 %	25 %	25 %	50 %	488657906
11101	NC_021179	GAG	2	6	524299	524304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657906
11102	NC_021179	CGT	2	6	524400	524405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11103	NC_021179	GC	3	6	524518	524523	0 %	0 %	50 %	50 %	488657906
11104	NC_021179	AGA	2	6	524562	524567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657906
11105	NC_021179	TGACC	2	10	524586	524595	20 %	20 %	20 %	40 %	488657906
11106	NC_021179	GCT	2	6	524631	524636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11107	NC_021179	GCG	2	6	524712	524717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657906
11108	NC_021179	ATC	2	6	524857	524862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657906
11109	NC_021179	TCC	2	6	524923	524928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657906
11110	NC_021179	TGA	2	6	524985	524990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657906
11111	NC_021179	GCTT	2	8	525086	525093	0 %	50 %	25 %	25 %	488657906
11112	NC_021179	CGC	2	6	525150	525155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657906
11113	NC_021179	GGC	2	6	525162	525167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657906
11114	NC_021179	GGT	2	6	525198	525203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657906
11115	NC_021179	GAG	2	6	525322	525327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657906
11116	NC_021179	GCC	2	6	525451	525456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657906
11117	NC_021179	AGG	2	6	525470	525475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657906
11118	NC_021179	GAC	2	6	525532	525537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657906
11119	NC_021179	ATGA	2	8	525562	525569	50 %	25 %	25 %	0 %	488657906
11120	NC_021179	AGCA	2	8	525634	525641	50 %	0 %	25 %	25 %	488657906
11121	NC_021179	CAG	2	6	525648	525653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657906
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11124	NC_021179	GCT	2	6	526041	526046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11235	NC_021179	ATAA	2	8	531545	531552	75 %	25 %	0 %	0 %	488657911
11236	NC_021179	GTT	2	6	531574	531579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657911
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11240	NC_021179	TC	3	6	531681	531686	0 %	50 %	0 %	50 %	488657911
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11364	NC_021179	GGT	2	6	538278	538283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657918
11365	NC_021179	GAATGG	2	12	538312	538323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488657918
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11386	NC_021179	TTG	2	6	539476	539481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657919
11387	NC_021179	GTTTG	2	10	539495	539504	0 %	60 %	40 %	0 %	488657919
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11392	NC_021179	TGG	2	6	539678	539683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657919
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11429	NC_021179	ATC	2	6	541320	541325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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