MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_021179	GTG	2	6	243482	243487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657656
5003	NC_021179	GC	3	6	243494	243499	0 %	0 %	50 %	50 %	488657656
5004	NC_021179	TCT	3	9	243600	243608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657656
5005	NC_021179	CA	3	6	243644	243649	50 %	0 %	0 %	50 %	488657657
5006	NC_021179	AACG	2	8	243715	243722	50 %	0 %	25 %	25 %	488657657
5007	NC_021179	AAG	2	6	243776	243781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657657
5008	NC_021179	GGT	2	6	243784	243789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657657
5009	NC_021179	TTG	2	6	243815	243820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657657
5010	NC_021179	GGA	2	6	243849	243854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657657
5011	NC_021179	GT	3	6	243857	243862	0 %	50 %	50 %	0 %	488657657
5012	NC_021179	T	6	6	243895	243900	0 %	100 %	0 %	0 %	488657657
5013	NC_021179	TTC	2	6	243904	243909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657657
5014	NC_021179	CTC	2	6	243993	243998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657657
5015	NC_021179	T	6	6	244012	244017	0 %	100 %	0 %	0 %	488657657
5016	NC_021179	ACA	2	6	244024	244029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657657
5017	NC_021179	GGA	2	6	244075	244080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657657
5018	NC_021179	TGA	2	6	244083	244088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657657
5019	NC_021179	CAA	2	6	244096	244101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657657
5020	NC_021179	TCT	2	6	244181	244186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_021179	TGCC	2	8	244219	244226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_021179	TGT	2	6	244252	244257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021179	T	6	6	244257	244262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021179	GAA	3	9	244292	244300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657658
5025	NC_021179	CGC	2	6	244351	244356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657658
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5028	NC_021179	CGC	2	6	244507	244512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657658
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5030	NC_021179	CGA	2	6	244558	244563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657658
5031	NC_021179	GC	3	6	244584	244589	0 %	0 %	50 %	50 %	488657658
5032	NC_021179	TGC	2	6	244658	244663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657658
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5040	NC_021179	AGG	2	6	245023	245028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657659
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5043	NC_021179	GCT	2	6	245159	245164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657659
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5045	NC_021179	ACG	2	6	245240	245245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657659
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5054	NC_021179	TGG	2	6	245638	245643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657660
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5057	NC_021179	GTG	2	6	245733	245738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657660
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5060	NC_021179	GTG	2	6	245919	245924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657660
5061	NC_021179	GTT	2	6	245949	245954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021179	ATA	2	6	246049	246054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657661
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5074	NC_021179	GGC	2	6	246386	246391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657661
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5079	NC_021179	TCGGT	2	10	246676	246685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5080	NC_021179	G	6	6	246695	246700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5082	NC_021179	AG	3	6	246871	246876	50 %	0 %	50 %	0 %	488657663
5083	NC_021179	TGA	2	6	246966	246971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
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5089	NC_021179	ATT	2	6	247243	247248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657663
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5091	NC_021179	TGCG	2	8	247349	247356	0 %	25 %	50 %	25 %	488657663
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5094	NC_021179	GA	3	6	247523	247528	50 %	0 %	50 %	0 %	488657663
5095	NC_021179	ATCC	2	8	247531	247538	25 %	25 %	0 %	50 %	488657663
5096	NC_021179	GAT	2	6	247549	247554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
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5099	NC_021179	TGTAT	2	10	247708	247717	20 %	60 %	20 %	0 %	488657663
5100	NC_021179	CGG	2	6	247757	247762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657663
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5104	NC_021179	GAT	2	6	247945	247950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
5105	NC_021179	CGT	2	6	247969	247974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657663
5106	NC_021179	TTCG	2	8	247976	247983	0 %	50 %	25 %	25 %	488657663
5107	NC_021179	GGAAAC	2	12	248064	248075	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488657663
5108	NC_021179	AC	3	6	248191	248196	50 %	0 %	0 %	50 %	488657663
5109	NC_021179	GCG	2	6	248199	248204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657663
5110	NC_021179	TGG	2	6	248223	248228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657663
5111	NC_021179	ACGC	2	8	248351	248358	25 %	0 %	25 %	50 %	488657663
5112	NC_021179	GTT	2	6	248410	248415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657663
5113	NC_021179	CTA	2	6	248457	248462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657663
5114	NC_021179	CGG	2	6	248480	248485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657663
5115	NC_021179	G	6	6	248534	248539	0 %	0 %	100 %	0 %	488657663
5116	NC_021179	TTTCTG	2	12	248600	248611	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	488657663
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5118	NC_021179	ATG	3	9	248636	248644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
5119	NC_021179	CG	3	6	248711	248716	0 %	0 %	50 %	50 %	488657663
5120	NC_021179	AGA	2	6	248807	248812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657663
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5122	NC_021179	AGG	2	6	248849	248854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657663
5123	NC_021179	ACC	2	6	248903	248908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657663
5124	NC_021179	AGG	2	6	249080	249085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657663
5125	NC_021179	GAA	2	6	249186	249191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657663
5126	NC_021179	GTGC	2	8	249238	249245	0 %	25 %	50 %	25 %	488657663
5127	NC_021179	GAC	2	6	249291	249296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657663
5128	NC_021179	GCT	2	6	249309	249314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657663
5129	NC_021179	GAAG	2	8	249339	249346	50 %	0 %	50 %	0 %	488657663
5130	NC_021179	TTC	2	6	249354	249359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657663
5131	NC_021179	GGAG	2	8	249420	249427	25 %	0 %	75 %	0 %	488657663
5132	NC_021179	GGT	2	6	249453	249458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657663
5133	NC_021179	GC	3	6	249538	249543	0 %	0 %	50 %	50 %	488657663
5134	NC_021179	TCCT	2	8	249545	249552	0 %	50 %	0 %	50 %	488657663
5135	NC_021179	GAA	2	6	249553	249558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657663
5136	NC_021179	GAT	2	6	249574	249579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
5137	NC_021179	GCAG	2	8	249747	249754	25 %	0 %	50 %	25 %	488657663
5138	NC_021179	TGC	2	6	249779	249784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657663
5139	NC_021179	GACG	2	8	249787	249794	25 %	0 %	50 %	25 %	488657663
5140	NC_021179	ATT	2	6	249803	249808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657663
5141	NC_021179	GCA	2	6	249912	249917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657663
5142	NC_021179	CGGCG	2	10	249990	249999	0 %	0 %	60 %	40 %	488657663
5143	NC_021179	GAT	2	6	250033	250038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657663
5144	NC_021179	GAA	2	6	250207	250212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657663
5145	NC_021179	AATT	2	8	250353	250360	50 %	50 %	0 %	0 %	488657664
5146	NC_021179	T	6	6	250391	250396	0 %	100 %	0 %	0 %	488657664
5147	NC_021179	TAC	2	6	250413	250418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657664
5148	NC_021179	GGAATG	2	12	250422	250433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	488657664
5149	NC_021179	TAC	2	6	250570	250575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657664
5150	NC_021179	A	6	6	250686	250691	100 %	0 %	0 %	0 %	488657664
5151	NC_021179	GGC	2	6	250744	250749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
5152	NC_021179	CGG	2	6	250754	250759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
5153	NC_021179	ACCTTG	2	12	250796	250807	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	488657664
5154	NC_021179	TTG	2	6	250814	250819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657664
5155	NC_021179	GAT	2	6	250836	250841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
5156	NC_021179	TGC	2	6	250871	250876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657664
5157	NC_021179	GAT	2	6	250929	250934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
5158	NC_021179	ATC	2	6	251089	251094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657664
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5160	NC_021179	GAAA	2	8	251382	251389	75 %	0 %	25 %	0 %	488657664
5161	NC_021179	TGG	2	6	251543	251548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657664
5162	NC_021179	TG	3	6	251577	251582	0 %	50 %	50 %	0 %	488657664
5163	NC_021179	GGC	2	6	251643	251648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
5164	NC_021179	TGT	2	6	251672	251677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657664
5165	NC_021179	TAT	2	6	251752	251757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657664
5166	NC_021179	CT	3	6	251772	251777	0 %	50 %	0 %	50 %	488657664
5167	NC_021179	GGA	2	6	251814	251819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657664
5168	NC_021179	ATG	2	6	251824	251829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
5169	NC_021179	TGA	2	6	251976	251981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
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5175	NC_021179	CGT	2	6	252231	252236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657664
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5178	NC_021179	GGAT	2	8	252303	252310	25 %	25 %	50 %	0 %	488657664
5179	NC_021179	ATG	2	6	252325	252330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
5180	NC_021179	GC	3	6	252343	252348	0 %	0 %	50 %	50 %	488657664
5181	NC_021179	ATC	2	6	252415	252420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657664
5182	NC_021179	T	6	6	252469	252474	0 %	100 %	0 %	0 %	488657664
5183	NC_021179	CGT	2	6	252547	252552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657664
5184	NC_021179	TGG	2	6	252575	252580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657664
5185	NC_021179	GAG	2	6	252586	252591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657664
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5187	NC_021179	ATT	2	6	252646	252651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657664
5188	NC_021179	CTG	2	6	252721	252726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657664
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5192	NC_021179	TG	5	10	252836	252845	0 %	50 %	50 %	0 %	488657664
5193	NC_021179	CAA	2	6	252870	252875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657664
5194	NC_021179	TAC	2	6	252984	252989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657664
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5196	NC_021179	T	6	6	253099	253104	0 %	100 %	0 %	0 %	488657664
5197	NC_021179	CG	4	8	253162	253169	0 %	0 %	50 %	50 %	488657664
5198	NC_021179	ACCAC	2	10	253193	253202	40 %	0 %	0 %	60 %	488657664
5199	NC_021179	ATCG	2	8	253249	253256	25 %	25 %	25 %	25 %	488657664
5200	NC_021179	GTA	2	6	253312	253317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
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5203	NC_021179	TGG	2	6	253472	253477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657664
5204	NC_021179	ACG	2	6	253489	253494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657664
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5209	NC_021179	GC	3	6	253604	253609	0 %	0 %	50 %	50 %	488657664
5210	NC_021179	G	7	7	253674	253680	0 %	0 %	100 %	0 %	488657664
5211	NC_021179	ATT	2	6	253698	253703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657664
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5215	NC_021179	AGGC	2	8	253880	253887	25 %	0 %	50 %	25 %	488657664
5216	NC_021179	TG	3	6	253895	253900	0 %	50 %	50 %	0 %	488657664
5217	NC_021179	TGA	2	6	253964	253969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657664
5218	NC_021179	TCAA	2	8	254005	254012	50 %	25 %	0 %	25 %	488657664
5219	NC_021179	GTG	2	6	254032	254037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657664
5220	NC_021179	G	6	6	254152	254157	0 %	0 %	100 %	0 %	488657664
5221	NC_021179	GC	3	6	254170	254175	0 %	0 %	50 %	50 %	488657664
5222	NC_021179	GGC	2	6	254199	254204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
5223	NC_021179	GCG	2	6	254269	254274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
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5226	NC_021179	GCG	2	6	254355	254360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657664
5227	NC_021179	GGA	2	6	254415	254420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657664
5228	NC_021179	AGG	2	6	254447	254452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657664
5229	NC_021179	TG	3	6	254552	254557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_021179	T	7	7	254582	254588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_021179	T	6	6	254651	254656	0 %	100 %	0 %	0 %	488657665
5232	NC_021179	GT	3	6	254704	254709	0 %	50 %	50 %	0 %	488657665
5233	NC_021179	TGA	2	6	254717	254722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657665
5234	NC_021179	A	6	6	254733	254738	100 %	0 %	0 %	0 %	488657665
5235	NC_021179	TCTGC	2	10	254746	254755	0 %	40 %	20 %	40 %	488657665
5236	NC_021179	G	6	6	254903	254908	0 %	0 %	100 %	0 %	488657665
5237	NC_021179	GTG	2	6	254926	254931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657665
5238	NC_021179	GAG	2	6	254993	254998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_021179	CCG	2	6	255037	255042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657666
5240	NC_021179	CG	3	6	255048	255053	0 %	0 %	50 %	50 %	488657666
5241	NC_021179	GTG	2	6	255064	255069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657666
5242	NC_021179	ATG	2	6	255091	255096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657666
5243	NC_021179	AAG	2	6	255106	255111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657666
5244	NC_021179	TAT	2	6	255126	255131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657666
5245	NC_021179	GAG	2	6	255169	255174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657666
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5247	NC_021179	TGG	2	6	255243	255248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657666
5248	NC_021179	GCA	2	6	255322	255327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657666
5249	NC_021179	GCA	2	6	255364	255369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657666
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5294	NC_021179	GAGG	2	8	257808	257815	25 %	0 %	75 %	0 %	488657667
5295	NC_021179	CG	3	6	257821	257826	0 %	0 %	50 %	50 %	488657667
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5314	NC_021179	CT	3	6	258669	258674	0 %	50 %	0 %	50 %	488657667
5315	NC_021179	ACA	2	6	258771	258776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657667
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5317	NC_021179	TCG	2	6	258922	258927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657667
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5326	NC_021179	TATG	2	8	259269	259276	25 %	50 %	25 %	0 %	488657668
5327	NC_021179	T	6	6	259283	259288	0 %	100 %	0 %	0 %	488657668
5328	NC_021179	GA	3	6	259299	259304	50 %	0 %	50 %	0 %	488657668
5329	NC_021179	CA	3	6	259342	259347	50 %	0 %	0 %	50 %	488657668
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5332	NC_021179	GCT	2	6	259443	259448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657668
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5334	NC_021179	GCAT	2	8	259576	259583	25 %	25 %	25 %	25 %	488657668
5335	NC_021179	GTA	2	6	259597	259602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657668
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5343	NC_021179	GTGC	2	8	260197	260204	0 %	25 %	50 %	25 %	488657668
5344	NC_021179	GTT	2	6	260242	260247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657668
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5352	NC_021179	CTC	2	6	260625	260630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657668
5353	NC_021179	CGA	2	6	260647	260652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657668
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5355	NC_021179	TGA	2	6	260708	260713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657668
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5357	NC_021179	ATG	2	6	260738	260743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657668
5358	NC_021179	GAG	2	6	260758	260763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657668
5359	NC_021179	GA	3	6	260863	260868	50 %	0 %	50 %	0 %	488657668
5360	NC_021179	GTG	2	6	260894	260899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5361	NC_021179	CGAG	2	8	260970	260977	25 %	0 %	50 %	25 %	488657669
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5366	NC_021179	CGA	2	6	261147	261152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657669
5367	NC_021179	TGA	2	6	261205	261210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657669
5368	NC_021179	CCG	2	6	261216	261221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657669
5369	NC_021179	GGT	2	6	261236	261241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657669
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5371	NC_021179	GGTGC	2	10	261318	261327	0 %	20 %	60 %	20 %	488657669
5372	NC_021179	GGA	2	6	261345	261350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657669
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5491	NC_021179	TGAT	2	8	266932	266939	25 %	50 %	25 %	0 %	488657676
5492	NC_021179	ATGC	2	8	266958	266965	25 %	25 %	25 %	25 %	488657676
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5496	NC_021179	TGG	2	6	267068	267073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657676
5497	NC_021179	T	6	6	267122	267127	0 %	100 %	0 %	0 %	488657676
5498	NC_021179	TC	3	6	267175	267180	0 %	50 %	0 %	50 %	488657676
5499	NC_021179	AGG	2	6	267247	267252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657676
5500	NC_021179	GAA	2	6	267297	267302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657676

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