MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020892	GAT	2	6	162833	162838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933781
3502	NC_020892	CTT	2	6	162854	162859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933781
3503	NC_020892	GTT	2	6	162869	162874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933781
3504	NC_020892	GCC	2	6	162900	162905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933781
3505	NC_020892	TACA	2	8	162980	162987	50 %	25 %	0 %	25 %	474933781
3506	NC_020892	TTC	2	6	163002	163007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933781
3507	NC_020892	GAT	2	6	163052	163057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933781
3508	NC_020892	CGA	2	6	163096	163101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933781
3509	NC_020892	TTG	2	6	163104	163109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933781
3510	NC_020892	CGGC	2	8	163137	163144	0 %	0 %	50 %	50 %	474933781
3511	NC_020892	TGC	2	6	163240	163245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933781
3512	NC_020892	TGG	2	6	163363	163368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933781
3513	NC_020892	CAT	2	6	163436	163441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933781
3514	NC_020892	CGG	2	6	163456	163461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933781
3515	NC_020892	CGG	2	6	163504	163509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933781
3516	NC_020892	ATC	2	6	163512	163517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933781
3517	NC_020892	TGG	2	6	163597	163602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933781
3518	NC_020892	CGA	2	6	163666	163671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933781
3519	NC_020892	TTTCAT	2	12	163697	163708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	474933781
3520	NC_020892	TG	3	6	163731	163736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020892	TGA	2	6	163758	163763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020892	CGGC	2	8	163787	163794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_020892	AT	3	6	163843	163848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020892	GC	3	6	163861	163866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_020892	ACA	2	6	163892	163897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_020892	CGC	3	9	164110	164118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3527	NC_020892	TGA	2	6	164244	164249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933782
3528	NC_020892	CGG	2	6	164332	164337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933782
3529	NC_020892	GAC	2	6	164387	164392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933782
3530	NC_020892	CGC	2	6	164419	164424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3531	NC_020892	CAT	3	9	164488	164496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933782
3532	NC_020892	TCG	2	6	164505	164510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933782
3533	NC_020892	CTC	2	6	164579	164584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933782
3534	NC_020892	TCA	2	6	164586	164591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933782
3535	NC_020892	GAG	3	9	164636	164644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933782
3536	NC_020892	AAG	2	6	164645	164650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3537	NC_020892	AGA	2	6	164656	164661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3538	NC_020892	GCC	2	6	164666	164671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3539	NC_020892	GGC	2	6	164674	164679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933782
3540	NC_020892	AAG	2	6	164702	164707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3541	NC_020892	AGGC	2	8	164717	164724	25 %	0 %	50 %	25 %	474933782
3542	NC_020892	GAA	2	6	164749	164754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3543	NC_020892	GCC	2	6	164756	164761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3544	NC_020892	AAG	2	6	164792	164797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3545	NC_020892	GCA	2	6	164813	164818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933782
3546	NC_020892	GAA	2	6	164824	164829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3547	NC_020892	GGC	2	6	164938	164943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933782
3548	NC_020892	AAG	2	6	164951	164956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3549	NC_020892	GAG	2	6	164957	164962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933782
3550	NC_020892	GCA	2	6	164981	164986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933782
3551	NC_020892	GCC	2	6	164987	164992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3552	NC_020892	GCC	2	6	165002	165007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3553	NC_020892	GAC	3	9	165035	165043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933782
3554	NC_020892	GAG	2	6	165068	165073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933782
3555	NC_020892	GCC	2	6	165126	165131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3556	NC_020892	GAA	2	6	165145	165150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3557	NC_020892	AAGGG	2	10	165170	165179	40 %	0 %	60 %	0 %	474933782
3558	NC_020892	GCC	2	6	165224	165229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3559	NC_020892	TCC	2	6	165252	165257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933782
3560	NC_020892	AGG	2	6	165264	165269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933782
3561	NC_020892	AAG	3	9	165365	165373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3562	NC_020892	GCC	3	9	165374	165382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933782
3563	NC_020892	AAG	2	6	165389	165394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933782
3564	NC_020892	CTT	2	6	165463	165468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_020892	CT	3	6	165471	165476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_020892	TAT	2	6	165489	165494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020892	GAA	2	6	165657	165662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933783
3568	NC_020892	GAA	2	6	165682	165687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933783
3569	NC_020892	TAC	2	6	165748	165753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933783
3570	NC_020892	CAT	2	6	165792	165797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933783
3571	NC_020892	GCT	2	6	165803	165808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933783
3572	NC_020892	CAA	2	6	165816	165821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933783
3573	NC_020892	CGT	2	6	165962	165967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933784
3574	NC_020892	CTCGAC	2	12	166065	166076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474933784
3575	NC_020892	GTCC	2	8	166085	166092	0 %	25 %	25 %	50 %	474933784
3576	NC_020892	CAT	3	9	166118	166126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933784
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3578	NC_020892	CCT	2	6	166201	166206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933784
3579	NC_020892	CAT	2	6	166250	166255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933784
3580	NC_020892	AGC	2	6	166267	166272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933784
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3582	NC_020892	ACT	2	6	166450	166455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933784
3583	NC_020892	CGT	2	6	166490	166495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933784
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3585	NC_020892	CGT	2	6	166662	166667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933785
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3587	NC_020892	CCT	2	6	166725	166730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933785
3588	NC_020892	CAT	2	6	166749	166754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933785
3589	NC_020892	AGG	2	6	166781	166786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933785
3590	NC_020892	CGC	2	6	166836	166841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933785
3591	NC_020892	AG	3	6	166848	166853	50 %	0 %	50 %	0 %	474933785
3592	NC_020892	GGA	2	6	166869	166874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933785
3593	NC_020892	ACC	2	6	166951	166956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933785
3594	NC_020892	GGCC	2	8	167001	167008	0 %	0 %	50 %	50 %	474933785
3595	NC_020892	CTG	2	6	167041	167046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933785
3596	NC_020892	AGG	2	6	167063	167068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933785
3597	NC_020892	CCA	2	6	167097	167102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933785
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3599	NC_020892	CGTCAT	2	12	167223	167234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474933785
3600	NC_020892	ATC	2	6	167257	167262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933785
3601	NC_020892	GGC	2	6	167277	167282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933785
3602	NC_020892	AAG	2	6	167290	167295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933785
3603	NC_020892	ATC	2	6	167308	167313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933785
3604	NC_020892	GAG	2	6	167389	167394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933785
3605	NC_020892	GA	3	6	167440	167445	50 %	0 %	50 %	0 %	474933786
3606	NC_020892	CTA	2	6	167462	167467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933786
3607	NC_020892	CGT	3	9	167507	167515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933786
3608	NC_020892	CCA	2	6	167539	167544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933786
3609	NC_020892	CGC	2	6	167621	167626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933786
3610	NC_020892	GCT	2	6	167689	167694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933786
3611	NC_020892	TCG	2	6	167743	167748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933786
3612	NC_020892	CCAC	2	8	167749	167756	25 %	0 %	0 %	75 %	474933786
3613	NC_020892	CCA	2	6	167789	167794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933786
3614	NC_020892	GGA	2	6	167801	167806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933786
3615	NC_020892	ACG	2	6	167899	167904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933786
3616	NC_020892	AGG	3	9	167950	167958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933786
3617	NC_020892	AGGG	2	8	167994	168001	25 %	0 %	75 %	0 %	474933786
3618	NC_020892	CGC	2	6	168053	168058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933786
3619	NC_020892	AGC	2	6	168061	168066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933786
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3621	NC_020892	GAA	2	6	168149	168154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933786
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3863	NC_020892	CGA	2	6	179414	179419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933797
3864	NC_020892	CAA	2	6	179534	179539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933797
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3867	NC_020892	GAAGGA	2	12	179579	179590	50 %	0 %	50 %	0 %	474933797
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3870	NC_020892	CAT	2	6	179804	179809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933797
3871	NC_020892	CGC	2	6	179819	179824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933797
3872	NC_020892	AGTG	2	8	179878	179885	25 %	25 %	50 %	0 %	474933797
3873	NC_020892	CAT	2	6	179909	179914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933798
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3884	NC_020892	GAT	2	6	180212	180217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933798
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3891	NC_020892	CGA	2	6	180443	180448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933798
3892	NC_020892	CGA	2	6	180452	180457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933798
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3958	NC_020892	ATC	2	6	183186	183191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933800
3959	NC_020892	TA	3	6	183364	183369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3960	NC_020892	T	6	6	183384	183389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3961	NC_020892	TTA	2	6	183396	183401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3962	NC_020892	TA	3	6	183400	183405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3963	NC_020892	A	6	6	183408	183413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3964	NC_020892	GCA	2	6	183440	183445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3966	NC_020892	GAG	2	6	183548	183553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933801
3967	NC_020892	CGGTT	2	10	183565	183574	0 %	40 %	40 %	20 %	474933801
3968	NC_020892	TCG	2	6	183633	183638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933801
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3970	NC_020892	CTC	2	6	183719	183724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933801
3971	NC_020892	GAA	2	6	183763	183768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933801
3972	NC_020892	GGA	2	6	183769	183774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933801
3973	NC_020892	CCG	2	6	183818	183823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933802
3974	NC_020892	CCG	2	6	183879	183884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933802
3975	NC_020892	GAA	2	6	183927	183932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933802
3976	NC_020892	GGAT	2	8	184072	184079	25 %	25 %	50 %	0 %	474933802
3977	NC_020892	AAG	2	6	184084	184089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933802
3978	NC_020892	AGG	2	6	184105	184110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933802
3979	NC_020892	GAG	2	6	184117	184122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933802
3980	NC_020892	GGA	2	6	184171	184176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933802
3981	NC_020892	ACA	2	6	184193	184198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933802
3982	NC_020892	CGATG	2	10	184263	184272	20 %	20 %	40 %	20 %	474933802
3983	NC_020892	AGA	3	9	184295	184303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933802
3984	NC_020892	AG	3	6	184319	184324	50 %	0 %	50 %	0 %	474933802
3985	NC_020892	TCC	2	6	184517	184522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933803
3986	NC_020892	ACG	2	6	184523	184528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933803
3987	NC_020892	TGG	2	6	184571	184576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933803
3988	NC_020892	GTC	2	6	184588	184593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933803
3989	NC_020892	ACG	2	6	184658	184663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933803
3990	NC_020892	GGA	2	6	184696	184701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933803
3991	NC_020892	TTC	2	6	184798	184803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933803
3992	NC_020892	AGA	2	6	184858	184863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933804
3993	NC_020892	GC	3	6	184886	184891	0 %	0 %	50 %	50 %	474933804
3994	NC_020892	CGA	2	6	184898	184903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933804
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3996	NC_020892	TGC	2	6	185009	185014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933804
3997	NC_020892	AGA	2	6	185023	185028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933804
3998	NC_020892	GCA	2	6	185063	185068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933804
3999	NC_020892	GA	3	6	185113	185118	50 %	0 %	50 %	0 %	474933804
4000	NC_020892	ATC	2	6	185199	185204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933804

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