MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020892	CAG	3	9	141326	141334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933756
3002	NC_020892	CAC	2	6	141335	141340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933756
3003	NC_020892	CCA	2	6	141346	141351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933756
3004	NC_020892	GAT	2	6	141434	141439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933756
3005	NC_020892	ACG	3	9	141453	141461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933756
3006	NC_020892	ATG	2	6	141480	141485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933756
3007	NC_020892	CAG	2	6	141491	141496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933756
3008	NC_020892	GC	3	6	141527	141532	0 %	0 %	50 %	50 %	474933756
3009	NC_020892	AGA	3	9	141577	141585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933756
3010	NC_020892	AG	3	6	141677	141682	50 %	0 %	50 %	0 %	474933756
3011	NC_020892	GCT	2	6	141879	141884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933756
3012	NC_020892	GAT	2	6	141896	141901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933756
3013	NC_020892	ATG	2	6	141918	141923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933756
3014	NC_020892	GGA	2	6	141991	141996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933756
3015	NC_020892	GGC	2	6	142028	142033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933756
3016	NC_020892	GGC	2	6	142046	142051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933756
3017	NC_020892	ATC	2	6	142056	142061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933756
3018	NC_020892	CAC	2	6	142079	142084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933756
3019	NC_020892	GTC	2	6	142100	142105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933756
3020	NC_020892	TGA	2	6	142123	142128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933756
3021	NC_020892	CTG	2	6	142264	142269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_020892	TCT	2	6	142270	142275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_020892	ATC	2	6	142284	142289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_020892	AAC	2	6	142292	142297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_020892	GAA	2	6	142400	142405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933757
3026	NC_020892	CTT	2	6	142427	142432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933757
3027	NC_020892	TGT	2	6	142465	142470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933757
3028	NC_020892	TCT	2	6	142474	142479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933757
3029	NC_020892	GTA	2	6	142526	142531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933757
3030	NC_020892	GAA	2	6	142616	142621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933757
3031	NC_020892	CGATCA	2	12	142678	142689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474933757
3032	NC_020892	TGC	2	6	142747	142752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933757
3033	NC_020892	TGG	2	6	142753	142758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933757
3034	NC_020892	GGT	2	6	142817	142822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933757
3035	NC_020892	GT	3	6	142887	142892	0 %	50 %	50 %	0 %	474933757
3036	NC_020892	ATG	2	6	142908	142913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933757
3037	NC_020892	TGA	2	6	142927	142932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933757
3038	NC_020892	GGA	2	6	142946	142951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933757
3039	NC_020892	CGA	2	6	142969	142974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933757
3040	NC_020892	TGT	2	6	142981	142986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933757
3041	NC_020892	TTG	3	9	143007	143015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933757
3042	NC_020892	TGG	2	6	143026	143031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933757
3043	NC_020892	TGT	2	6	143110	143115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933757
3044	NC_020892	TCT	2	6	143152	143157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933757
3045	NC_020892	TTG	2	6	143178	143183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933757
3046	NC_020892	AGG	2	6	143194	143199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933757
3047	NC_020892	CGG	2	6	143287	143292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933757
3048	NC_020892	CGA	2	6	143338	143343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933757
3049	NC_020892	CGA	2	6	143368	143373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933757
3050	NC_020892	TGC	2	6	143413	143418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933757
3051	NC_020892	GTC	3	9	143423	143431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933757
3052	NC_020892	GCG	2	6	143466	143471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933757
3053	NC_020892	TGT	2	6	143585	143590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_020892	GCA	2	6	143696	143701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933758
3055	NC_020892	GCA	2	6	143708	143713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933758
3056	NC_020892	CG	4	8	143740	143747	0 %	0 %	50 %	50 %	474933758
3057	NC_020892	GAG	2	6	143750	143755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933758
3058	NC_020892	GCA	2	6	143832	143837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933758
3059	NC_020892	GGC	2	6	143860	143865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933758
3060	NC_020892	TTC	2	6	143873	143878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933758
3061	NC_020892	AAG	2	6	143894	143899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933758
3062	NC_020892	TGG	2	6	143907	143912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933758
3063	NC_020892	GAG	2	6	143939	143944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933758
3064	NC_020892	AAG	2	6	144041	144046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933758
3065	NC_020892	CTG	2	6	144052	144057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933758
3066	NC_020892	ACT	2	6	144129	144134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933758
3067	NC_020892	CGA	2	6	144284	144289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933759
3068	NC_020892	CCA	2	6	144326	144331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933759
3069	NC_020892	ATC	2	6	144354	144359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933759
3070	NC_020892	TTTGGG	2	12	144363	144374	0 %	50 %	50 %	0 %	474933759
3071	NC_020892	G	6	6	144372	144377	0 %	0 %	100 %	0 %	474933759
3072	NC_020892	CGT	2	6	144494	144499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933759
3073	NC_020892	AGG	2	6	144535	144540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933759
3074	NC_020892	CCG	2	6	144542	144547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933759
3075	NC_020892	CCT	2	6	144548	144553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933759
3076	NC_020892	CATC	2	8	144561	144568	25 %	25 %	0 %	50 %	474933759
3077	NC_020892	GAC	2	6	144609	144614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933759
3078	NC_020892	CG	3	6	144627	144632	0 %	0 %	50 %	50 %	474933759
3079	NC_020892	GAA	2	6	144633	144638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933759
3080	NC_020892	TCCC	2	8	144673	144680	0 %	25 %	0 %	75 %	474933759
3081	NC_020892	TGC	2	6	144688	144693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_020892	TAT	2	6	144695	144700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_020892	CG	3	6	144707	144712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_020892	CG	5	10	144721	144730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_020892	AAAAT	2	10	144751	144760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_020892	ATC	2	6	144861	144866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933760
3087	NC_020892	CGT	2	6	144986	144991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933760
3088	NC_020892	ATG	3	9	145024	145032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933761
3089	NC_020892	CAGG	2	8	145145	145152	25 %	0 %	50 %	25 %	474933761
3090	NC_020892	AAG	2	6	145176	145181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933761
3091	NC_020892	CGA	2	6	145184	145189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933761
3092	NC_020892	GCC	2	6	145203	145208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933761
3093	NC_020892	TCG	2	6	145243	145248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933761
3094	NC_020892	GC	3	6	145303	145308	0 %	0 %	50 %	50 %	474933761
3095	NC_020892	GTTC	2	8	145325	145332	0 %	50 %	25 %	25 %	474933761
3096	NC_020892	TCG	2	6	145384	145389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933761
3097	NC_020892	TC	4	8	145416	145423	0 %	50 %	0 %	50 %	474933761
3098	NC_020892	TCG	2	6	145450	145455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933761
3099	NC_020892	CAA	2	6	145469	145474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933761
3100	NC_020892	CAA	3	9	145508	145516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933761
3101	NC_020892	GCAT	2	8	145533	145540	25 %	25 %	25 %	25 %	474933761
3102	NC_020892	GCT	2	6	145547	145552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933761
3103	NC_020892	AACT	2	8	145641	145648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_020892	CTT	2	6	145669	145674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_020892	T	7	7	145673	145679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_020892	AATT	2	8	145684	145691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_020892	AGG	2	6	145758	145763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933762
3108	NC_020892	CAA	2	6	145828	145833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933762
3109	NC_020892	CGG	2	6	145845	145850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933762
3110	NC_020892	CGT	2	6	145942	145947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933762
3111	NC_020892	ACT	2	6	146001	146006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933762
3112	NC_020892	GCATC	2	10	146040	146049	20 %	20 %	20 %	40 %	474933762
3113	NC_020892	CGA	2	6	146071	146076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933762
3114	NC_020892	CG	4	8	146079	146086	0 %	0 %	50 %	50 %	474933762
3115	NC_020892	CAT	3	9	146161	146169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933762
3116	NC_020892	CCG	2	6	146190	146195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933762
3117	NC_020892	CCA	2	6	146223	146228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933762
3118	NC_020892	TCA	3	9	146241	146249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933762
3119	NC_020892	CCG	2	6	146298	146303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933762
3120	NC_020892	CAA	2	6	146368	146373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933762
3121	NC_020892	GGA	2	6	146430	146435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933762
3122	NC_020892	TTCG	2	8	146458	146465	0 %	50 %	25 %	25 %	474933762
3123	NC_020892	CGT	2	6	146491	146496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933762
3124	NC_020892	ACA	2	6	146569	146574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_020892	CTC	2	6	146678	146683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933763
3126	NC_020892	CCT	2	6	146704	146709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933763
3127	NC_020892	TCC	2	6	146790	146795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933763
3128	NC_020892	TCG	2	6	146799	146804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933763
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3135	NC_020892	TCT	2	6	147178	147183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933763
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3154	NC_020892	TGA	2	6	147921	147926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933764
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3162	NC_020892	GGCC	2	8	148500	148507	0 %	0 %	50 %	50 %	474933764
3163	NC_020892	TGG	2	6	148542	148547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933764
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3179	NC_020892	TGA	2	6	149091	149096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933765
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3182	NC_020892	GA	3	6	149315	149320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3183	NC_020892	T	6	6	149347	149352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3184	NC_020892	GCG	2	6	149358	149363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3212	NC_020892	TAT	2	6	150609	150614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3214	NC_020892	TCA	2	6	150630	150635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3215	NC_020892	AAGG	2	8	150636	150643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3216	NC_020892	CAG	2	6	150677	150682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933767
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3227	NC_020892	GGCA	2	8	151286	151293	25 %	0 %	50 %	25 %	474933767
3228	NC_020892	CATC	2	8	151305	151312	25 %	25 %	0 %	50 %	474933767
3229	NC_020892	GAT	2	6	151318	151323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933767
3230	NC_020892	TC	3	6	151348	151353	0 %	50 %	0 %	50 %	474933767
3231	NC_020892	CAA	2	6	151423	151428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933767
3232	NC_020892	CTG	2	6	151450	151455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933767
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3235	NC_020892	AAG	2	6	151535	151540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933767
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3240	NC_020892	CGA	2	6	151756	151761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933767
3241	NC_020892	AAG	2	6	151790	151795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933767
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3243	NC_020892	TCGC	2	8	151895	151902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3364	NC_020892	TCA	2	6	156717	156722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933771
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3368	NC_020892	CGA	2	6	156981	156986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933772
3369	NC_020892	GAA	2	6	156993	156998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933772
3370	NC_020892	TCA	2	6	157001	157006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933772
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3456	NC_020892	CAT	2	6	160965	160970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3470	NC_020892	GCCT	2	8	161460	161467	0 %	25 %	25 %	50 %	474933779
3471	NC_020892	GCG	2	6	161516	161521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933779
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3473	NC_020892	CGA	2	6	161633	161638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3474	NC_020892	GATA	2	8	161642	161649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_020892	CATC	2	8	161663	161670	25 %	25 %	0 %	50 %	474933780
3476	NC_020892	GTGG	2	8	161676	161683	0 %	25 %	75 %	0 %	474933780
3477	NC_020892	CGG	3	9	161741	161749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933780
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3479	NC_020892	CGG	2	6	161831	161836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933780
3480	NC_020892	GCC	2	6	161878	161883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933780
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3483	NC_020892	CTT	2	6	162060	162065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933780
3484	NC_020892	GGT	2	6	162087	162092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933780
3485	NC_020892	CGG	2	6	162260	162265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933780
3486	NC_020892	TCG	2	6	162334	162339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933780
3487	NC_020892	TCC	2	6	162358	162363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933780
3488	NC_020892	TGA	2	6	162371	162376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933780
3489	NC_020892	GGA	2	6	162398	162403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933780
3490	NC_020892	ACGTC	2	10	162413	162422	20 %	20 %	20 %	40 %	474933780
3491	NC_020892	TCC	2	6	162436	162441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933780
3492	NC_020892	ACGG	2	8	162449	162456	25 %	0 %	50 %	25 %	474933780
3493	NC_020892	TTG	2	6	162492	162497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933781
3494	NC_020892	ATG	3	9	162564	162572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933781
3495	NC_020892	CGA	2	6	162742	162747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933781
3496	NC_020892	GGA	2	6	162748	162753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933781
3497	NC_020892	TCC	2	6	162768	162773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933781
3498	NC_020892	CCG	2	6	162804	162809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933781
3499	NC_020892	CCG	2	6	162819	162824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933781
3500	NC_020892	GTG	2	6	162825	162830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933781

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