MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_020892	GTCCTC	2	12	1439009	1439020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	474935096
32004	NC_020892	CCA	2	6	1439041	1439046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935096
32005	NC_020892	TCA	2	6	1439089	1439094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935096
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32007	NC_020892	TAC	2	6	1439172	1439177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935096
32008	NC_020892	AAGAC	2	10	1439221	1439230	60 %	0 %	20 %	20 %	474935096
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32011	NC_020892	GTC	2	6	1439355	1439360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935096
32012	NC_020892	CGC	2	6	1439403	1439408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935096
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32014	NC_020892	ACG	2	6	1439512	1439517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935097
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32023	NC_020892	TGG	2	6	1439771	1439776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935097
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32117	NC_020892	TGC	2	6	1443558	1443563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935101
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32122	NC_020892	TCC	2	6	1443696	1443701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935101
32123	NC_020892	GCT	2	6	1443724	1443729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935101
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32142	NC_020892	GTC	2	6	1444471	1444476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935102
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32222	NC_020892	ATA	2	6	1448280	1448285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32223	NC_020892	A	6	6	1448299	1448304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32224	NC_020892	ATG	2	6	1448332	1448337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935108
32225	NC_020892	TCT	2	6	1448405	1448410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935108
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32228	NC_020892	TCG	2	6	1448486	1448491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935108
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32230	NC_020892	GA	3	6	1448632	1448637	50 %	0 %	50 %	0 %	474935108
32231	NC_020892	GCAT	2	8	1448654	1448661	25 %	25 %	25 %	25 %	474935108
32232	NC_020892	CCCG	2	8	1448686	1448693	0 %	0 %	25 %	75 %	474935108
32233	NC_020892	AGG	2	6	1448716	1448721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935108
32234	NC_020892	CAT	2	6	1448802	1448807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935108
32235	NC_020892	CCG	2	6	1448822	1448827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935108
32236	NC_020892	GCT	2	6	1448835	1448840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935108
32237	NC_020892	GAT	2	6	1448847	1448852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935108
32238	NC_020892	TAC	2	6	1448881	1448886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935108
32239	NC_020892	AAG	2	6	1448926	1448931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935108
32240	NC_020892	CGACTA	2	12	1448988	1448999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474935108
32241	NC_020892	CA	3	6	1449006	1449011	50 %	0 %	0 %	50 %	474935108
32242	NC_020892	CCCT	2	8	1449032	1449039	0 %	25 %	0 %	75 %	474935108
32243	NC_020892	GGA	2	6	1449042	1449047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935108
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32246	NC_020892	CTGG	2	8	1449102	1449109	0 %	25 %	50 %	25 %	474935108
32247	NC_020892	CCG	2	6	1449188	1449193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32248	NC_020892	GAT	3	9	1449195	1449203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32249	NC_020892	TGA	2	6	1449223	1449228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32250	NC_020892	ATG	2	6	1449326	1449331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935109
32251	NC_020892	GCA	2	6	1449342	1449347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935109
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32253	NC_020892	TCA	2	6	1449408	1449413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935109
32254	NC_020892	CCGT	2	8	1449432	1449439	0 %	25 %	25 %	50 %	474935109
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32259	NC_020892	ATC	2	6	1449692	1449697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935109
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32273	NC_020892	CGG	2	6	1450387	1450392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935109
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32278	NC_020892	ATT	2	6	1450624	1450629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32279	NC_020892	TCC	2	6	1450789	1450794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935110
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32297	NC_020892	CTT	2	6	1451828	1451833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935111
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32299	NC_020892	TGA	3	9	1451881	1451889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935111
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32301	NC_020892	CCTG	2	8	1452010	1452017	0 %	25 %	25 %	50 %	474935111
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32305	NC_020892	ATC	2	6	1452194	1452199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935111
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32310	NC_020892	CG	4	8	1452408	1452415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32311	NC_020892	GGT	2	6	1452421	1452426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935112
32312	NC_020892	ATG	2	6	1452459	1452464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935112
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32316	NC_020892	ATG	2	6	1452531	1452536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935112
32317	NC_020892	TCG	2	6	1452555	1452560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935112
32318	NC_020892	CGGT	2	8	1452585	1452592	0 %	25 %	50 %	25 %	474935112
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32321	NC_020892	GT	3	6	1452653	1452658	0 %	50 %	50 %	0 %	474935112
32322	NC_020892	CTC	3	9	1452659	1452667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935112
32323	NC_020892	GAGG	2	8	1452680	1452687	25 %	0 %	75 %	0 %	474935112
32324	NC_020892	AGGG	2	8	1452702	1452709	25 %	0 %	75 %	0 %	474935112
32325	NC_020892	CCCG	2	8	1452717	1452724	0 %	0 %	25 %	75 %	474935112
32326	NC_020892	GAT	2	6	1452776	1452781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935112
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32328	NC_020892	AGC	2	6	1452822	1452827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935112
32329	NC_020892	TCG	2	6	1452852	1452857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935112
32330	NC_020892	CCTTC	2	10	1452901	1452910	0 %	40 %	0 %	60 %	474935112
32331	NC_020892	ATC	2	6	1452945	1452950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935112
32332	NC_020892	CCT	2	6	1452961	1452966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935112
32333	NC_020892	CTC	2	6	1452977	1452982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935112
32334	NC_020892	GCGA	2	8	1452984	1452991	25 %	0 %	50 %	25 %	474935112
32335	NC_020892	TCCTGA	2	12	1453108	1453119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474935112
32336	NC_020892	TCC	2	6	1453195	1453200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935112
32337	NC_020892	GTC	2	6	1453223	1453228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935112
32338	NC_020892	CGA	2	6	1453260	1453265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32339	NC_020892	TAA	2	6	1453272	1453277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32340	NC_020892	CAGAAG	2	12	1453323	1453334	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	474935113
32341	NC_020892	AGG	2	6	1453389	1453394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935113
32342	NC_020892	TAC	2	6	1453395	1453400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935113
32343	NC_020892	GAA	2	6	1453436	1453441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935113
32344	NC_020892	ATG	2	6	1453521	1453526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935113
32345	NC_020892	GCCC	2	8	1453535	1453542	0 %	0 %	25 %	75 %	474935113
32346	NC_020892	CTA	2	6	1453547	1453552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935113
32347	NC_020892	TAC	2	6	1453563	1453568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935113
32348	NC_020892	TCCC	2	8	1453574	1453581	0 %	25 %	0 %	75 %	474935113
32349	NC_020892	ACC	2	6	1453642	1453647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935113
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32351	NC_020892	GAT	2	6	1453703	1453708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935113
32352	NC_020892	CGA	2	6	1453718	1453723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935113
32353	NC_020892	GGA	2	6	1453751	1453756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935113
32354	NC_020892	CGG	2	6	1453778	1453783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935113
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32360	NC_020892	CGA	2	6	1453988	1453993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935113
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32372	NC_020892	TCG	2	6	1454509	1454514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935113
32373	NC_020892	GGA	2	6	1454515	1454520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935113
32374	NC_020892	GGGTT	2	10	1454659	1454668	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32375	NC_020892	AGC	2	6	1454728	1454733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935114
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32414	NC_020892	GAA	2	6	1456187	1456192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935116
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32442	NC_020892	TGAT	2	8	1457715	1457722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32443	NC_020892	CGG	2	6	1457741	1457746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32444	NC_020892	GAC	2	6	1457788	1457793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32445	NC_020892	AAAT	2	8	1457873	1457880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32446	NC_020892	ATC	2	6	1457931	1457936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935118
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32448	NC_020892	GGT	2	6	1458014	1458019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935118
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32451	NC_020892	TCG	2	6	1458090	1458095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935118
32452	NC_020892	TCT	2	6	1458109	1458114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935118
32453	NC_020892	GTC	2	6	1458167	1458172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935118
32454	NC_020892	CTT	2	6	1458188	1458193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935118
32455	NC_020892	GGA	2	6	1458241	1458246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935118
32456	NC_020892	CT	3	6	1458252	1458257	0 %	50 %	0 %	50 %	474935118
32457	NC_020892	CGA	2	6	1458265	1458270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935118
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