MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_020892	CTG	2	6	1416307	1416312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935081
31502	NC_020892	GAT	2	6	1416378	1416383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935081
31503	NC_020892	CCT	2	6	1416523	1416528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31504	NC_020892	ATG	2	6	1416606	1416611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935082
31505	NC_020892	CAT	2	6	1416644	1416649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935082
31506	NC_020892	GCA	2	6	1416677	1416682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935082
31507	NC_020892	ACCG	2	8	1416756	1416763	25 %	0 %	25 %	50 %	474935082
31508	NC_020892	AAT	2	6	1416850	1416855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474935082
31509	NC_020892	TAT	2	6	1416871	1416876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31510	NC_020892	CAAG	2	8	1416883	1416890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31511	NC_020892	GTAG	2	8	1416904	1416911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31512	NC_020892	TCT	2	6	1416975	1416980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31513	NC_020892	TATT	2	8	1417054	1417061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31514	NC_020892	ACC	2	6	1417075	1417080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31515	NC_020892	CTTAG	2	10	1417093	1417102	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31516	NC_020892	TAT	2	6	1417253	1417258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31517	NC_020892	TCTA	2	8	1417279	1417286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31518	NC_020892	AGGC	2	8	1417307	1417314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31519	NC_020892	GAG	2	6	1417387	1417392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935083
31520	NC_020892	C	6	6	1417472	1417477	0 %	0 %	0 %	100 %	474935083
31521	NC_020892	CTA	2	6	1417488	1417493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935083
31522	NC_020892	CGC	2	6	1417509	1417514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935083
31523	NC_020892	TCG	2	6	1417565	1417570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935083
31524	NC_020892	TCG	2	6	1417634	1417639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935083
31525	NC_020892	GAG	2	6	1417648	1417653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935083
31526	NC_020892	ACGGAC	2	12	1417676	1417687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935083
31527	NC_020892	CGG	2	6	1417743	1417748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935083
31528	NC_020892	CGC	2	6	1417755	1417760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935083
31529	NC_020892	TGG	2	6	1417771	1417776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935083
31530	NC_020892	TCT	2	6	1417814	1417819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935083
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31532	NC_020892	CGG	2	6	1417887	1417892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935083
31533	NC_020892	CGA	2	6	1417917	1417922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935083
31534	NC_020892	GTG	2	6	1417923	1417928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935083
31535	NC_020892	CTC	2	6	1417942	1417947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935083
31536	NC_020892	TCG	2	6	1417991	1417996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935083
31537	NC_020892	CAG	2	6	1418095	1418100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935083
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31539	NC_020892	GAA	2	6	1418145	1418150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935083
31540	NC_020892	ACC	2	6	1418162	1418167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935083
31541	NC_020892	TGC	2	6	1418308	1418313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935083
31542	NC_020892	AGG	3	9	1418319	1418327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935083
31543	NC_020892	CAA	2	6	1418343	1418348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474935083
31544	NC_020892	CGAGGC	2	12	1418382	1418393	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	474935083
31545	NC_020892	GAG	3	9	1418527	1418535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935083
31546	NC_020892	CCG	2	6	1418540	1418545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935083
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31548	NC_020892	CCGG	2	8	1418574	1418581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31549	NC_020892	GCGCT	2	10	1418649	1418658	0 %	20 %	40 %	40 %	474935084
31550	NC_020892	TGC	2	6	1418773	1418778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935084
31551	NC_020892	CGA	2	6	1418786	1418791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935084
31552	NC_020892	CG	3	6	1418847	1418852	0 %	0 %	50 %	50 %	474935084
31553	NC_020892	GGA	2	6	1418879	1418884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935084
31554	NC_020892	TCC	2	6	1418966	1418971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935084
31555	NC_020892	TCA	2	6	1418980	1418985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935084
31556	NC_020892	GAA	2	6	1419020	1419025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935084
31557	NC_020892	GAA	2	6	1419041	1419046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935084
31558	NC_020892	GTG	2	6	1419057	1419062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935084
31559	NC_020892	CGA	2	6	1419065	1419070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935084
31560	NC_020892	GA	3	6	1419093	1419098	50 %	0 %	50 %	0 %	474935084
31561	NC_020892	GA	3	6	1419123	1419128	50 %	0 %	50 %	0 %	474935084
31562	NC_020892	GAGGG	2	10	1419216	1419225	20 %	0 %	80 %	0 %	474935084
31563	NC_020892	TGA	2	6	1419349	1419354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935084
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31567	NC_020892	CCA	2	6	1419476	1419481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935084
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31573	NC_020892	GTC	2	6	1419735	1419740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935084
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31582	NC_020892	GTC	2	6	1420158	1420163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935084
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31585	NC_020892	AGG	2	6	1420281	1420286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935084
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31588	NC_020892	ACA	2	6	1420384	1420389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474935084
31589	NC_020892	CTG	2	6	1420430	1420435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935084
31590	NC_020892	AC	3	6	1420456	1420461	50 %	0 %	0 %	50 %	474935084
31591	NC_020892	CTC	2	6	1420482	1420487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935084
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31593	NC_020892	ACC	2	6	1420518	1420523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935084
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31601	NC_020892	CGT	2	6	1421062	1421067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935084
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31607	NC_020892	GCC	2	6	1421256	1421261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935084
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31611	NC_020892	ATC	2	6	1421407	1421412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31612	NC_020892	AAG	3	9	1421501	1421509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31613	NC_020892	AGGG	2	8	1421549	1421556	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31614	NC_020892	CGG	2	6	1421566	1421571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31615	NC_020892	GCC	2	6	1421587	1421592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935085
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