MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31003	NC_020892	TGG	2	6	1395509	1395514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935063
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31115	NC_020892	GTA	2	6	1400190	1400195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935068
31116	NC_020892	TCC	2	6	1400218	1400223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935068
31117	NC_020892	GC	3	6	1400233	1400238	0 %	0 %	50 %	50 %	474935068
31118	NC_020892	TCG	2	6	1400314	1400319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935068
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31121	NC_020892	CGA	2	6	1400393	1400398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935068
31122	NC_020892	GTC	2	6	1400400	1400405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935068
31123	NC_020892	TCG	2	6	1400422	1400427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935068
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31127	NC_020892	CGA	2	6	1400612	1400617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935068
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31217	NC_020892	TGT	2	6	1404067	1404072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474935069
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31219	NC_020892	AGC	2	6	1404134	1404139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935070
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31221	NC_020892	CTG	2	6	1404262	1404267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935070
31222	NC_020892	GAG	2	6	1404286	1404291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935070
31223	NC_020892	TGA	2	6	1404300	1404305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935070
31224	NC_020892	TC	3	6	1404345	1404350	0 %	50 %	0 %	50 %	474935070
31225	NC_020892	AGA	2	6	1404468	1404473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935070
31226	NC_020892	GTGC	2	8	1404620	1404627	0 %	25 %	50 %	25 %	474935070
31227	NC_020892	ATC	2	6	1404653	1404658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935070
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31332	NC_020892	CGA	2	6	1408640	1408645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31333	NC_020892	TCGT	2	8	1408647	1408654	0 %	50 %	25 %	25 %	474935072
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31344	NC_020892	CAT	2	6	1409150	1409155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935072
31345	NC_020892	TTC	2	6	1409157	1409162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935072
31346	NC_020892	CGA	2	6	1409204	1409209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31347	NC_020892	CGTCAT	2	12	1409273	1409284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474935072
31348	NC_020892	CCA	2	6	1409290	1409295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935072
31349	NC_020892	GAGATC	2	12	1409349	1409360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474935072
31350	NC_020892	GA	4	8	1409384	1409391	50 %	0 %	50 %	0 %	474935072
31351	NC_020892	GAC	2	6	1409433	1409438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31352	NC_020892	TCG	2	6	1409476	1409481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31353	NC_020892	GCC	2	6	1409511	1409516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935072
31354	NC_020892	GAC	2	6	1409610	1409615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31355	NC_020892	CGG	2	6	1409666	1409671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935072
31356	NC_020892	TCCG	2	8	1409712	1409719	0 %	25 %	25 %	50 %	474935072
31357	NC_020892	GGA	2	6	1409732	1409737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935072
31358	NC_020892	CCT	2	6	1409738	1409743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935072
31359	NC_020892	GCA	2	6	1409749	1409754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31360	NC_020892	CAGGG	2	10	1409787	1409796	20 %	0 %	60 %	20 %	474935072
31361	NC_020892	GAG	2	6	1409925	1409930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935072
31362	NC_020892	CAT	2	6	1409975	1409980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935072
31363	NC_020892	TTC	2	6	1409982	1409987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935072
31364	NC_020892	CGG	2	6	1410026	1410031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935072
31365	NC_020892	CCTG	2	8	1410067	1410074	0 %	25 %	25 %	50 %	474935072
31366	NC_020892	GGC	2	6	1410110	1410115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935072
31367	NC_020892	GAT	2	6	1410173	1410178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935072
31368	NC_020892	CGA	2	6	1410194	1410199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935072
31369	NC_020892	GCC	2	6	1410309	1410314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935072
31370	NC_020892	AGG	2	6	1410370	1410375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935072
31371	NC_020892	AGA	2	6	1410418	1410423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935072
31372	NC_020892	GA	3	6	1410451	1410456	50 %	0 %	50 %	0 %	474935072
31373	NC_020892	CAA	2	6	1410482	1410487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474935072
31374	NC_020892	CCGA	2	8	1410544	1410551	25 %	0 %	25 %	50 %	474935073
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31376	NC_020892	CTT	2	6	1410642	1410647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935073
31377	NC_020892	TGC	2	6	1410661	1410666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935073
31378	NC_020892	GCT	2	6	1410676	1410681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935073
31379	NC_020892	TCG	2	6	1410742	1410747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935073
31380	NC_020892	ACGT	2	8	1410756	1410763	25 %	25 %	25 %	25 %	474935073
31381	NC_020892	CCA	2	6	1410767	1410772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935073
31382	NC_020892	CTCGTA	2	12	1410780	1410791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474935073
31383	NC_020892	TCC	2	6	1410859	1410864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935073
31384	NC_020892	TG	3	6	1410876	1410881	0 %	50 %	50 %	0 %	474935073
31385	NC_020892	TGCACC	2	12	1410902	1410913	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474935073
31386	NC_020892	GGTG	2	8	1411121	1411128	0 %	25 %	75 %	0 %	474935073
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31391	NC_020892	GGCA	2	8	1411280	1411287	25 %	0 %	50 %	25 %	474935073
31392	NC_020892	CCT	2	6	1411304	1411309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935073
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31394	NC_020892	CAT	2	6	1411395	1411400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935073
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31398	NC_020892	ATG	3	9	1411597	1411605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935073
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31404	NC_020892	G	6	6	1411733	1411738	0 %	0 %	100 %	0 %	474935073
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31412	NC_020892	TTG	2	6	1412236	1412241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474935074
31413	NC_020892	TGG	2	6	1412264	1412269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474935074
31414	NC_020892	CTC	2	6	1412289	1412294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474935074
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31418	NC_020892	CGG	2	6	1412378	1412383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935074
31419	NC_020892	GTC	2	6	1412451	1412456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935074
31420	NC_020892	ATT	2	6	1412546	1412551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31421	NC_020892	GTC	2	6	1412594	1412599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935075
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31429	NC_020892	AGG	2	6	1412827	1412832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935075
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31431	NC_020892	GAT	2	6	1412876	1412881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935075
31432	NC_020892	TGA	2	6	1412893	1412898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935075
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31440	NC_020892	CGG	2	6	1413285	1413290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935076
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31443	NC_020892	GAG	2	6	1413359	1413364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935076
31444	NC_020892	CGG	2	6	1413417	1413422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935076
31445	NC_020892	CGG	2	6	1413507	1413512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935076
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31447	NC_020892	CTCGGA	2	12	1413523	1413534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474935076
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31449	NC_020892	CTCCC	2	10	1413597	1413606	0 %	20 %	0 %	80 %	474935076
31450	NC_020892	GCT	2	6	1413796	1413801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935076
31451	NC_020892	AGT	2	6	1413840	1413845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935076
31452	NC_020892	GAC	2	6	1413895	1413900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935076
31453	NC_020892	CTT	2	6	1413907	1413912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935076
31454	NC_020892	CGT	2	6	1414018	1414023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935077
31455	NC_020892	CGG	2	6	1414024	1414029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935077
31456	NC_020892	CTG	2	6	1414052	1414057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935077
31457	NC_020892	AGA	2	6	1414077	1414082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935077
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