MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_020892	CTCA	2	8	1372444	1372451	25 %	25 %	0 %	50 %	474935041
30502	NC_020892	GCC	2	6	1372468	1372473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935041
30503	NC_020892	CCG	2	6	1372478	1372483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935041
30504	NC_020892	CAT	3	9	1372554	1372562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30505	NC_020892	TAC	2	6	1372611	1372616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30506	NC_020892	GTA	2	6	1372624	1372629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30507	NC_020892	CGATA	2	10	1372642	1372651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30508	NC_020892	TA	3	6	1372662	1372667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30509	NC_020892	AGG	2	6	1372691	1372696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30510	NC_020892	AACCG	2	10	1372806	1372815	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30511	NC_020892	GC	3	6	1372843	1372848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30512	NC_020892	TTA	2	6	1372873	1372878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30513	NC_020892	AAG	2	6	1372908	1372913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935042
30514	NC_020892	AAG	2	6	1372950	1372955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935042
30515	NC_020892	CAC	2	6	1372976	1372981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935042
30516	NC_020892	CAT	2	6	1372982	1372987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935042
30517	NC_020892	CGAGG	2	10	1373072	1373081	20 %	0 %	60 %	20 %	474935042
30518	NC_020892	CAT	2	6	1373111	1373116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935042
30519	NC_020892	GAA	2	6	1373141	1373146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935042
30520	NC_020892	GTC	2	6	1373247	1373252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935042
30521	NC_020892	TCG	2	6	1373254	1373259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935042
30522	NC_020892	CGG	2	6	1373276	1373281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935042
30523	NC_020892	ACC	2	6	1373283	1373288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474935042
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30525	NC_020892	CGG	2	6	1373318	1373323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935042
30526	NC_020892	CAA	2	6	1373375	1373380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474935042
30527	NC_020892	ACG	2	6	1373395	1373400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935042
30528	NC_020892	CATT	2	8	1373435	1373442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30529	NC_020892	GGCC	2	8	1373455	1373462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30530	NC_020892	T	6	6	1373464	1373469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30531	NC_020892	AGG	2	6	1373480	1373485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30532	NC_020892	GGT	2	6	1373507	1373512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30533	NC_020892	ATCA	2	8	1373562	1373569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30534	NC_020892	ACG	2	6	1373656	1373661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935043
30535	NC_020892	CCG	2	6	1373728	1373733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935043
30536	NC_020892	CGA	2	6	1373753	1373758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935043
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30538	NC_020892	GTC	2	6	1373778	1373783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935043
30539	NC_020892	AC	3	6	1373798	1373803	50 %	0 %	0 %	50 %	474935043
30540	NC_020892	TTC	2	6	1373817	1373822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474935043
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30542	NC_020892	GAG	2	6	1373922	1373927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935043
30543	NC_020892	TCA	2	6	1374052	1374057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935043
30544	NC_020892	CAG	2	6	1374134	1374139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935043
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30547	NC_020892	GAT	2	6	1374284	1374289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474935043
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30550	NC_020892	CGT	2	6	1374503	1374508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935043
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30552	NC_020892	CGC	2	6	1374566	1374571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474935043
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30554	NC_020892	CGT	2	6	1374605	1374610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935043
30555	NC_020892	GGC	2	6	1374627	1374632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474935043
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30558	NC_020892	CCTT	2	8	1374751	1374758	0 %	50 %	0 %	50 %	474935044
30559	NC_020892	TCA	2	6	1374832	1374837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474935044
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30584	NC_020892	CTTC	2	8	1375758	1375765	0 %	50 %	0 %	50 %	474935044
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30587	NC_020892	AAG	2	6	1375872	1375877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935044
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30590	NC_020892	T	6	6	1375963	1375968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30591	NC_020892	GAA	2	6	1376193	1376198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474935045
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30600	NC_020892	AG	3	6	1376652	1376657	50 %	0 %	50 %	0 %	474935045
30601	NC_020892	GAG	3	9	1376680	1376688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935045
30602	NC_020892	GGA	2	6	1376755	1376760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474935045
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30604	NC_020892	CCCT	2	8	1376804	1376811	0 %	25 %	0 %	75 %	474935045
30605	NC_020892	TCG	2	6	1376867	1376872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474935045
30606	NC_020892	ACG	2	6	1376957	1376962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474935045
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30615	NC_020892	GC	3	6	1377242	1377247	0 %	0 %	50 %	50 %	474935045
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30719	NC_020892	A	7	7	1381962	1381968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30720	NC_020892	CAA	2	6	1381979	1381984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30847	NC_020892	GA	3	6	1387840	1387845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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