MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_020892	ATA	2	6	1242849	1242854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_020892	GAT	2	6	1242961	1242966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934910
27504	NC_020892	TCG	3	9	1242986	1242994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27505	NC_020892	TTG	2	6	1243073	1243078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934910
27506	NC_020892	TCC	2	6	1243117	1243122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934910
27507	NC_020892	GCG	2	6	1243128	1243133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934910
27508	NC_020892	CGA	2	6	1243152	1243157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27509	NC_020892	AGT	2	6	1243158	1243163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934910
27510	NC_020892	CCTGG	2	10	1243168	1243177	0 %	20 %	40 %	40 %	474934910
27511	NC_020892	TCG	2	6	1243184	1243189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27512	NC_020892	CGT	2	6	1243230	1243235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27513	NC_020892	CCG	2	6	1243295	1243300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934910
27514	NC_020892	GTG	2	6	1243342	1243347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934910
27515	NC_020892	TCCA	2	8	1243400	1243407	25 %	25 %	0 %	50 %	474934910
27516	NC_020892	GAA	2	6	1243408	1243413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934910
27517	NC_020892	TCC	2	6	1243458	1243463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934910
27518	NC_020892	CTC	2	6	1243528	1243533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934910
27519	NC_020892	GGT	2	6	1243543	1243548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934910
27520	NC_020892	CTT	2	6	1243648	1243653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934910
27521	NC_020892	TTCC	2	8	1243682	1243689	0 %	50 %	0 %	50 %	474934910
27522	NC_020892	CTT	2	6	1243705	1243710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934910
27523	NC_020892	CGA	2	6	1243725	1243730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27524	NC_020892	ATG	2	6	1243745	1243750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934910
27525	NC_020892	GAC	2	6	1243780	1243785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934910
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27527	NC_020892	TAG	2	6	1244051	1244056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934910
27528	NC_020892	CCG	2	6	1244066	1244071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934910
27529	NC_020892	CTG	2	6	1244092	1244097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27530	NC_020892	G	6	6	1244097	1244102	0 %	0 %	100 %	0 %	474934910
27531	NC_020892	GAT	2	6	1244146	1244151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934910
27532	NC_020892	TCC	2	6	1244286	1244291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934910
27533	NC_020892	TCG	2	6	1244327	1244332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27534	NC_020892	GGA	2	6	1244334	1244339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934910
27535	NC_020892	CTTC	2	8	1244343	1244350	0 %	50 %	0 %	50 %	474934910
27536	NC_020892	G	6	6	1244369	1244374	0 %	0 %	100 %	0 %	474934910
27537	NC_020892	CTTGGA	2	12	1244377	1244388	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	474934910
27538	NC_020892	TGA	2	6	1244406	1244411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934910
27539	NC_020892	CGG	2	6	1244445	1244450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934910
27540	NC_020892	GGAGG	2	10	1244548	1244557	20 %	0 %	80 %	0 %	474934910
27541	NC_020892	GAC	2	6	1244572	1244577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934910
27542	NC_020892	CTC	2	6	1244619	1244624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934910
27543	NC_020892	CAGA	2	8	1244656	1244663	50 %	0 %	25 %	25 %	474934910
27544	NC_020892	GTTC	2	8	1244704	1244711	0 %	50 %	25 %	25 %	474934910
27545	NC_020892	CT	3	6	1244813	1244818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27546	NC_020892	ATC	2	6	1244854	1244859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934911
27547	NC_020892	TCA	2	6	1244875	1244880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934911
27548	NC_020892	GGGA	2	8	1244882	1244889	25 %	0 %	75 %	0 %	474934911
27549	NC_020892	GGA	2	6	1244900	1244905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934911
27550	NC_020892	TTG	2	6	1244940	1244945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934911
27551	NC_020892	GAC	2	6	1244972	1244977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934911
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27553	NC_020892	CGT	2	6	1245040	1245045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934911
27554	NC_020892	CGA	2	6	1245052	1245057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934911
27555	NC_020892	TGT	2	6	1245097	1245102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934911
27556	NC_020892	TGA	2	6	1245175	1245180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934911
27557	NC_020892	GTG	2	6	1245219	1245224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934911
27558	NC_020892	GCT	2	6	1245238	1245243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934911
27559	NC_020892	CTGG	2	8	1245266	1245273	0 %	25 %	50 %	25 %	474934911
27560	NC_020892	GAT	2	6	1245290	1245295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934911
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27563	NC_020892	ATG	2	6	1245677	1245682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934912
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27566	NC_020892	CTCC	2	8	1245712	1245719	0 %	25 %	0 %	75 %	474934912
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27584	NC_020892	CAAGGC	2	12	1246522	1246533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934912
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27587	NC_020892	ATA	2	6	1246608	1246613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27588	NC_020892	GGT	2	6	1246615	1246620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27589	NC_020892	CAG	2	6	1246715	1246720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934913
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27599	NC_020892	TA	3	6	1247309	1247314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27600	NC_020892	GTG	2	6	1247328	1247333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27601	NC_020892	CAG	2	6	1247346	1247351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27602	NC_020892	ATCA	2	8	1247520	1247527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27603	NC_020892	T	6	6	1247529	1247534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27604	NC_020892	CATTC	2	10	1247537	1247546	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27605	NC_020892	TTA	2	6	1247554	1247559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27606	NC_020892	ATC	2	6	1247561	1247566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27607	NC_020892	TCC	2	6	1247646	1247651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934915
27608	NC_020892	TTCTAC	2	12	1247660	1247671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	474934915
27609	NC_020892	GGAA	2	8	1247708	1247715	50 %	0 %	50 %	0 %	474934915
27610	NC_020892	GGC	2	6	1247731	1247736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934915
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27617	NC_020892	TCT	2	6	1247997	1248002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934915
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27619	NC_020892	ATC	2	6	1248104	1248109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934915
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