MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23008	NC_020892	GGGAA	2	10	1037914	1037923	40 %	0 %	60 %	0 %	474934705
23009	NC_020892	GAA	2	6	1038001	1038006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934705
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23231	NC_020892	TCC	2	6	1048808	1048813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934712
23232	NC_020892	AGA	2	6	1048814	1048819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934712
23233	NC_020892	CG	3	6	1048852	1048857	0 %	0 %	50 %	50 %	474934712
23234	NC_020892	CCA	2	6	1048910	1048915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934712
23235	NC_020892	ATC	2	6	1048993	1048998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934712
23236	NC_020892	CAT	2	6	1049028	1049033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934712
23237	NC_020892	GGCCA	2	10	1049083	1049092	20 %	0 %	40 %	40 %	474934712
23238	NC_020892	CGG	2	6	1049094	1049099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934712
23239	NC_020892	CAGAAG	2	12	1049101	1049112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	474934712
23240	NC_020892	CGA	2	6	1049130	1049135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934712
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23242	NC_020892	G	6	6	1049144	1049149	0 %	0 %	100 %	0 %	474934712
23243	NC_020892	CGT	2	6	1049157	1049162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934712
23244	NC_020892	GAG	2	6	1049182	1049187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934712
23245	NC_020892	TCT	2	6	1049219	1049224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934712
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23250	NC_020892	AGC	2	6	1049528	1049533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934713
23251	NC_020892	TTC	2	6	1049564	1049569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934713
23252	NC_020892	ATC	2	6	1049600	1049605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934713
23253	NC_020892	AGA	3	9	1049775	1049783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934713
23254	NC_020892	CAGGA	2	10	1049873	1049882	40 %	0 %	40 %	20 %	474934713
23255	NC_020892	CGAGG	2	10	1049926	1049935	20 %	0 %	60 %	20 %	474934713
23256	NC_020892	CAA	2	6	1050019	1050024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934713
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23258	NC_020892	TGG	2	6	1050078	1050083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934713
23259	NC_020892	GCTCC	2	10	1050172	1050181	0 %	20 %	20 %	60 %	474934713
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23262	NC_020892	GGA	2	6	1050307	1050312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934713
23263	NC_020892	ATC	2	6	1050377	1050382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934713
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23265	NC_020892	GGA	2	6	1050481	1050486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934713
23266	NC_020892	CCT	2	6	1050514	1050519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934713
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23277	NC_020892	GCT	2	6	1050877	1050882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934713
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23282	NC_020892	CCG	2	6	1051074	1051079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934713
23283	NC_020892	CATCAG	2	12	1051084	1051095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474934713
23284	NC_020892	CCG	2	6	1051107	1051112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934713
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23288	NC_020892	CGA	2	6	1051267	1051272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934713
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23290	NC_020892	TGA	2	6	1051295	1051300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934713
23291	NC_020892	TGTCC	2	10	1051310	1051319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23292	NC_020892	TATAA	2	10	1051356	1051365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23293	NC_020892	A	6	6	1051401	1051406	100 %	0 %	0 %	0 %	474934714
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23305	NC_020892	TA	3	6	1051994	1051999	50 %	50 %	0 %	0 %	474934715
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23315	NC_020892	CGA	2	6	1052432	1052437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934715
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23323	NC_020892	GT	3	6	1052812	1052817	0 %	50 %	50 %	0 %	474934715
23324	NC_020892	TCC	2	6	1052854	1052859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934715
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23326	NC_020892	TGCG	2	8	1052973	1052980	0 %	25 %	50 %	25 %	474934716
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23331	NC_020892	TTC	2	6	1053197	1053202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934716
23332	NC_020892	GCC	2	6	1053305	1053310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934716
23333	NC_020892	GCG	2	6	1053385	1053390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934716
23334	NC_020892	ATG	2	6	1053392	1053397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934716
23335	NC_020892	CCG	2	6	1053417	1053422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934716
23336	NC_020892	CCT	3	9	1053429	1053437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934716
23337	NC_020892	GGA	2	6	1053570	1053575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934716
23338	NC_020892	TCCT	2	8	1053608	1053615	0 %	50 %	0 %	50 %	474934716
23339	NC_020892	GAGG	2	8	1053670	1053677	25 %	0 %	75 %	0 %	474934716
23340	NC_020892	CGT	2	6	1053699	1053704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934716
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23343	NC_020892	CGG	2	6	1053795	1053800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934716
23344	NC_020892	CATC	2	8	1053810	1053817	25 %	25 %	0 %	50 %	474934716
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23346	NC_020892	GGA	2	6	1053955	1053960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934716
23347	NC_020892	CGG	2	6	1054019	1054024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934716
23348	NC_020892	TCC	2	6	1054092	1054097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934716
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23440	NC_020892	A	6	6	1058015	1058020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23450	NC_020892	CGA	2	6	1058472	1058477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934718
23451	NC_020892	TCG	2	6	1058483	1058488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934718
23452	NC_020892	GAGG	2	8	1058532	1058539	25 %	0 %	75 %	0 %	474934718
23453	NC_020892	GTCGAG	2	12	1058641	1058652	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	474934718
23454	NC_020892	GAG	3	9	1058656	1058664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934718
23455	NC_020892	TCA	2	6	1058684	1058689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934718
23456	NC_020892	GGA	2	6	1058690	1058695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934718
23457	NC_020892	AG	3	6	1058782	1058787	50 %	0 %	50 %	0 %	474934718
23458	NC_020892	CGAT	2	8	1058804	1058811	25 %	25 %	25 %	25 %	474934718
23459	NC_020892	CGC	2	6	1058892	1058897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934718
23460	NC_020892	CGC	2	6	1058907	1058912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934718
23461	NC_020892	CGA	2	6	1059015	1059020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934718
23462	NC_020892	TGG	2	6	1059118	1059123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934719
23463	NC_020892	CGG	2	6	1059124	1059129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934719
23464	NC_020892	CAT	2	6	1059200	1059205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934719
23465	NC_020892	GAA	2	6	1059221	1059226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934719
23466	NC_020892	CGA	2	6	1059254	1059259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934719
23467	NC_020892	CTC	2	6	1059330	1059335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934719
23468	NC_020892	GAC	2	6	1059363	1059368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934719
23469	NC_020892	CCT	2	6	1059389	1059394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934719
23470	NC_020892	GAC	2	6	1059408	1059413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934719
23471	NC_020892	CAC	2	6	1059473	1059478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934719
23472	NC_020892	GAC	2	6	1059573	1059578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934719
23473	NC_020892	GAG	2	6	1059579	1059584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934719
23474	NC_020892	AGG	2	6	1059612	1059617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934719
23475	NC_020892	GGA	2	6	1059629	1059634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934719
23476	NC_020892	GCT	2	6	1059707	1059712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934719
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23478	NC_020892	G	6	6	1059790	1059795	0 %	0 %	100 %	0 %	474934719
23479	NC_020892	GGAA	2	8	1059840	1059847	50 %	0 %	50 %	0 %	474934719
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23481	NC_020892	ACC	2	6	1059895	1059900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934719
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23483	NC_020892	AGA	2	6	1059937	1059942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934719
23484	NC_020892	GGA	2	6	1059965	1059970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934719
23485	NC_020892	AAG	2	6	1060020	1060025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934719
23486	NC_020892	CCAG	2	8	1060043	1060050	25 %	0 %	25 %	50 %	474934719
23487	NC_020892	TCA	2	6	1060126	1060131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934719
23488	NC_020892	GGC	2	6	1060136	1060141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934719
23489	NC_020892	CAT	2	6	1060163	1060168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934719
23490	NC_020892	CCA	2	6	1060306	1060311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934719
23491	NC_020892	CGC	3	9	1060316	1060324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934719
23492	NC_020892	AGC	2	6	1060345	1060350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934719
23493	NC_020892	GGA	2	6	1060355	1060360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934719
23494	NC_020892	TTCCTG	2	12	1060425	1060436	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	474934719
23495	NC_020892	ATC	2	6	1060458	1060463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934719
23496	NC_020892	GCC	2	6	1060488	1060493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934719
23497	NC_020892	TGA	2	6	1060543	1060548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934719
23498	NC_020892	GAG	2	6	1060557	1060562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934719
23499	NC_020892	TCA	2	6	1060573	1060578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934719
23500	NC_020892	AGC	2	6	1060600	1060605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934719

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