MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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22352	NC_020892	CTC	2	6	1008135	1008140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934676
22353	NC_020892	ATC	2	6	1008160	1008165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934676
22354	NC_020892	CCT	2	6	1008168	1008173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934676
22355	NC_020892	GCA	2	6	1008225	1008230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934676
22356	NC_020892	CCG	2	6	1008254	1008259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934676
22357	NC_020892	TCCT	2	8	1008319	1008326	0 %	50 %	0 %	50 %	474934676
22358	NC_020892	CTGT	2	8	1008370	1008377	0 %	50 %	25 %	25 %	474934676
22359	NC_020892	TCC	2	6	1008413	1008418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934676
22360	NC_020892	ATCCT	2	10	1008475	1008484	20 %	40 %	0 %	40 %	474934676
22361	NC_020892	CAT	2	6	1008630	1008635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934676
22362	NC_020892	TGA	2	6	1008653	1008658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934676
22363	NC_020892	TTC	2	6	1008676	1008681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934676
22364	NC_020892	ACG	2	6	1008703	1008708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934676
22365	NC_020892	CG	3	6	1008744	1008749	0 %	0 %	50 %	50 %	474934676
22366	NC_020892	GTCC	2	8	1008789	1008796	0 %	25 %	25 %	50 %	474934676
22367	NC_020892	CTG	2	6	1008799	1008804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934676
22368	NC_020892	TGC	2	6	1008818	1008823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934676
22369	NC_020892	TCG	2	6	1008829	1008834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22370	NC_020892	GGA	2	6	1008984	1008989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934677
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22372	NC_020892	AGG	2	6	1009048	1009053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934677
22373	NC_020892	GCC	2	6	1009186	1009191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934677
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22375	NC_020892	AGC	2	6	1009301	1009306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934677
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22377	NC_020892	CGA	2	6	1009376	1009381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934678
22378	NC_020892	CAG	2	6	1009400	1009405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934678
22379	NC_020892	CCT	2	6	1009448	1009453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934678
22380	NC_020892	GGA	2	6	1009489	1009494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934678
22381	NC_020892	CGT	2	6	1009532	1009537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934678
22382	NC_020892	GAG	2	6	1009617	1009622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934678
22383	NC_020892	GGAA	2	8	1009720	1009727	50 %	0 %	50 %	0 %	474934678
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22385	NC_020892	CTA	2	6	1009832	1009837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934678
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22387	NC_020892	CTG	2	6	1009908	1009913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934678
22388	NC_020892	TCCC	2	8	1009924	1009931	0 %	25 %	0 %	75 %	474934678
22389	NC_020892	AGA	2	6	1009954	1009959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934678
22390	NC_020892	ACCCT	2	10	1010155	1010164	20 %	20 %	0 %	60 %	474934679
22391	NC_020892	GAT	2	6	1010184	1010189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934679
22392	NC_020892	CAT	2	6	1010196	1010201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934679
22393	NC_020892	GAT	2	6	1010220	1010225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934679
22394	NC_020892	TCCTTC	2	12	1010269	1010280	0 %	50 %	0 %	50 %	474934679
22395	NC_020892	CCT	2	6	1010315	1010320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934679
22396	NC_020892	GAT	2	6	1010376	1010381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934679
22397	NC_020892	CGC	2	6	1010420	1010425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934679
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22399	NC_020892	GCC	2	6	1010481	1010486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934679
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22403	NC_020892	TCC	2	6	1010754	1010759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934680
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22406	NC_020892	CGT	2	6	1010806	1010811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934680
22407	NC_020892	ATG	2	6	1010838	1010843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934680
22408	NC_020892	CGT	2	6	1010977	1010982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934680
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22411	NC_020892	GGT	2	6	1011257	1011262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934680
22412	NC_020892	CGA	2	6	1011277	1011282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934680
22413	NC_020892	CTT	2	6	1011290	1011295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934680
22414	NC_020892	TGG	3	9	1011391	1011399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934680
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22416	NC_020892	GGT	2	6	1011479	1011484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934680
22417	NC_020892	TGG	2	6	1011510	1011515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934680
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22421	NC_020892	CTC	3	9	1011679	1011687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934680
22422	NC_020892	GCC	2	6	1011742	1011747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934681
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22427	NC_020892	GT	4	8	1012304	1012311	0 %	50 %	50 %	0 %	474934682
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22431	NC_020892	TCG	2	6	1012428	1012433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934682
22432	NC_020892	GCA	2	6	1012445	1012450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934682
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22434	NC_020892	TGG	2	6	1012543	1012548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934682
22435	NC_020892	GTC	2	6	1012589	1012594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934682
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22437	NC_020892	CCT	2	6	1012758	1012763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934683
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22442	NC_020892	AT	3	6	1013040	1013045	50 %	50 %	0 %	0 %	474934683
22443	NC_020892	GAT	2	6	1013092	1013097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934683
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22445	NC_020892	GAC	2	6	1013131	1013136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934683
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22450	NC_020892	TCT	2	6	1013451	1013456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934683
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22452	NC_020892	GCC	2	6	1013548	1013553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934683
22453	NC_020892	CGA	2	6	1013565	1013570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934683
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22457	NC_020892	TCGCC	2	10	1013718	1013727	0 %	20 %	20 %	60 %	474934683
22458	NC_020892	TG	3	6	1013760	1013765	0 %	50 %	50 %	0 %	474934683
22459	NC_020892	GGAA	2	8	1013868	1013875	50 %	0 %	50 %	0 %	474934683
22460	NC_020892	TCC	2	6	1013892	1013897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934683
22461	NC_020892	CTT	2	6	1014145	1014150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934684
22462	NC_020892	GAATCC	2	12	1014166	1014177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474934684
22463	NC_020892	CGG	2	6	1014186	1014191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934684
22464	NC_020892	CTT	2	6	1014205	1014210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934684
22465	NC_020892	CATCGG	2	12	1014216	1014227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474934684
22466	NC_020892	ATCG	2	8	1014241	1014248	25 %	25 %	25 %	25 %	474934684
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22468	NC_020892	CTG	2	6	1014359	1014364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934684
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22470	NC_020892	GCT	2	6	1014390	1014395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934684
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22500	NC_020892	TA	3	6	1015994	1015999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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