MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_020892	AGGA	2	8	943196	943203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21002	NC_020892	CTT	2	6	943216	943221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21003	NC_020892	GTA	3	9	943259	943267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21004	NC_020892	GTC	2	6	943330	943335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21005	NC_020892	GTT	2	6	943498	943503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_020892	GCC	2	6	943565	943570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934617
21007	NC_020892	TTC	2	6	943782	943787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934618
21008	NC_020892	CTC	2	6	943793	943798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934618
21009	NC_020892	TCGCCG	2	12	943806	943817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	474934618
21010	NC_020892	TCC	2	6	943845	943850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934618
21011	NC_020892	CTC	2	6	943907	943912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934618
21012	NC_020892	TGA	3	9	943963	943971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934618
21013	NC_020892	TCC	2	6	943995	944000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934618
21014	NC_020892	GGC	2	6	944027	944032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934618
21015	NC_020892	TCA	2	6	944089	944094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934618
21016	NC_020892	CGG	2	6	944134	944139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934618
21017	NC_020892	GAACCC	2	12	944142	944153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	474934618
21018	NC_020892	CGT	2	6	944167	944172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934618
21019	NC_020892	GCC	2	6	944202	944207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934618
21020	NC_020892	TCGCG	2	10	944218	944227	0 %	20 %	40 %	40 %	474934618
21021	NC_020892	GAC	2	6	944276	944281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934618
21022	NC_020892	GAG	2	6	944309	944314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934618
21023	NC_020892	CTT	2	6	944447	944452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934618
21024	NC_020892	CTT	2	6	944456	944461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934618
21025	NC_020892	GGT	2	6	944492	944497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934618
21026	NC_020892	AGG	2	6	944512	944517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934618
21027	NC_020892	TCG	2	6	944633	944638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934619
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21029	NC_020892	TCC	2	6	944759	944764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934619
21030	NC_020892	CTTC	2	8	944788	944795	0 %	50 %	0 %	50 %	474934619
21031	NC_020892	CCG	2	6	944873	944878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934619
21032	NC_020892	ATC	2	6	944885	944890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934619
21033	NC_020892	CTT	2	6	944914	944919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934619
21034	NC_020892	GAA	2	6	944947	944952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934619
21035	NC_020892	GGA	2	6	945006	945011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934619
21036	NC_020892	CAT	2	6	945019	945024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934619
21037	NC_020892	TCC	2	6	945031	945036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934619
21038	NC_020892	CATC	2	8	945103	945110	25 %	25 %	0 %	50 %	474934619
21039	NC_020892	GTC	2	6	945115	945120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934619
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21043	NC_020892	TCG	2	6	945389	945394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934619
21044	NC_020892	CGC	2	6	945420	945425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934619
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21050	NC_020892	GTA	2	6	945712	945717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934619
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21052	NC_020892	TGCCTG	2	12	945835	945846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934619
21053	NC_020892	CGGA	2	8	945878	945885	25 %	0 %	50 %	25 %	474934619
21054	NC_020892	CTT	2	6	946042	946047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934619
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21056	NC_020892	TCT	2	6	946110	946115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934619
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21058	NC_020892	ACAG	2	8	946152	946159	50 %	0 %	25 %	25 %	474934619
21059	NC_020892	TCG	2	6	946160	946165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934619
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21061	NC_020892	GTCCTC	2	12	946216	946227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	474934619
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21063	NC_020892	TTC	2	6	946355	946360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934619
21064	NC_020892	ATGG	2	8	946377	946384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_020892	CAAC	2	8	946391	946398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21066	NC_020892	TCC	2	6	946472	946477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21067	NC_020892	CGA	2	6	946524	946529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934620
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21070	NC_020892	AGC	2	6	946691	946696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934620
21071	NC_020892	CGA	2	6	946926	946931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934620
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21077	NC_020892	A	6	6	947203	947208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21079	NC_020892	GAAC	2	8	947260	947267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21080	NC_020892	TGC	2	6	947291	947296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21083	NC_020892	AGGC	2	8	947403	947410	25 %	0 %	50 %	25 %	474934621
21084	NC_020892	TCGGCA	2	12	947607	947618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474934621
21085	NC_020892	TGA	2	6	947619	947624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934621
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21087	NC_020892	GCT	2	6	947791	947796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934621
21088	NC_020892	CGA	2	6	947833	947838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934621
21089	NC_020892	GGAA	2	8	947879	947886	50 %	0 %	50 %	0 %	474934621
21090	NC_020892	TCA	2	6	947952	947957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934621
21091	NC_020892	GA	3	6	948028	948033	50 %	0 %	50 %	0 %	474934621
21092	NC_020892	AAC	2	6	948068	948073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934621
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21101	NC_020892	GAAG	2	8	948282	948289	50 %	0 %	50 %	0 %	474934622
21102	NC_020892	CAA	2	6	948330	948335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934622
21103	NC_020892	AGG	2	6	948341	948346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934622
21104	NC_020892	TCA	3	9	948350	948358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934622
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21107	NC_020892	ATG	2	6	948529	948534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934622
21108	NC_020892	GAA	2	6	948540	948545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934622
21109	NC_020892	ATCC	2	8	948549	948556	25 %	25 %	0 %	50 %	474934622
21110	NC_020892	CAT	3	9	948570	948578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934622
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21120	NC_020892	CGG	2	6	948975	948980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934622
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21227	NC_020892	CTC	2	6	953577	953582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934627
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21232	NC_020892	GTT	2	6	953887	953892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934628
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21235	NC_020892	GAC	2	6	954016	954021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934628
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21499	NC_020892	AGG	2	6	969714	969719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934637
21500	NC_020892	CTG	2	6	969760	969765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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