MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_020892	CAA	2	6	853403	853408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934527
19003	NC_020892	CCA	2	6	853444	853449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934527
19004	NC_020892	GAAG	2	8	853499	853506	50 %	0 %	50 %	0 %	474934527
19005	NC_020892	GAT	2	6	853532	853537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934527
19006	NC_020892	TCGA	2	8	853565	853572	25 %	25 %	25 %	25 %	474934528
19007	NC_020892	CGAGG	2	10	853633	853642	20 %	0 %	60 %	20 %	474934528
19008	NC_020892	GGC	2	6	853714	853719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934528
19009	NC_020892	GAC	2	6	853730	853735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
19010	NC_020892	CAC	2	6	853784	853789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19011	NC_020892	CGA	2	6	853849	853854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
19012	NC_020892	CGA	2	6	853888	853893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
19013	NC_020892	CATCGA	2	12	853912	853923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474934528
19014	NC_020892	CAC	3	9	853934	853942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19015	NC_020892	CACCAT	2	12	853946	853957	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	474934528
19016	NC_020892	GAG	2	6	853961	853966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934528
19017	NC_020892	CCA	3	9	853978	853986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19018	NC_020892	CAC	2	6	854030	854035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19019	NC_020892	CAT	2	6	854069	854074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934528
19020	NC_020892	ACC	2	6	854076	854081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19021	NC_020892	CATGAG	2	12	854102	854113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934528
19022	NC_020892	CAC	2	6	854126	854131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19023	NC_020892	CGG	2	6	854137	854142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934528
19024	NC_020892	CAC	2	6	854150	854155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934528
19025	NC_020892	ACG	2	6	854160	854165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934528
19026	NC_020892	G	6	6	854178	854183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_020892	C	6	6	854189	854194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19028	NC_020892	TCT	2	6	854224	854229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934529
19029	NC_020892	CTT	2	6	854230	854235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934529
19030	NC_020892	TCCGCA	2	12	854297	854308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934529
19031	NC_020892	CTC	2	6	854356	854361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934529
19032	NC_020892	TCC	2	6	854420	854425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934529
19033	NC_020892	TCCTCG	2	12	854456	854467	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	474934529
19034	NC_020892	CTG	2	6	854501	854506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934529
19035	NC_020892	GGA	2	6	854529	854534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934529
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19039	NC_020892	GAT	2	6	854725	854730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934529
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19044	NC_020892	AT	3	6	855049	855054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_020892	TCT	2	6	855116	855121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934530
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19048	NC_020892	GAT	2	6	855207	855212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934530
19049	NC_020892	CGG	2	6	855266	855271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934530
19050	NC_020892	TGG	2	6	855332	855337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934530
19051	NC_020892	GGA	2	6	855518	855523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934530
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19053	NC_020892	ATC	2	6	855565	855570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934530
19054	NC_020892	CTT	2	6	855579	855584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934530
19055	NC_020892	AGG	2	6	855637	855642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934530
19056	NC_020892	TCC	2	6	855661	855666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934530
19057	NC_020892	CGG	2	6	855686	855691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934530
19058	NC_020892	TCC	2	6	855697	855702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934530
19059	NC_020892	GAT	2	6	855717	855722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934530
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19062	NC_020892	CT	3	6	855876	855881	0 %	50 %	0 %	50 %	474934530
19063	NC_020892	CA	3	6	855891	855896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19064	NC_020892	GGGGA	2	10	855954	855963	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_020892	CTA	2	6	856134	856139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934531
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19072	NC_020892	TCC	2	6	856347	856352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934531
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19102	NC_020892	CTT	2	6	857432	857437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934531
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19104	NC_020892	C	6	6	857450	857455	0 %	0 %	0 %	100 %	474934531
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19107	NC_020892	ACA	2	6	857506	857511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934531
19108	NC_020892	ACC	2	6	857514	857519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934531
19109	NC_020892	CCA	2	6	857531	857536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934531
19110	NC_020892	CGG	2	6	857564	857569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934531
19111	NC_020892	TCG	2	6	857626	857631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934531
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19119	NC_020892	AAG	2	6	857919	857924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934531
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19186	NC_020892	TCC	2	6	861215	861220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19187	NC_020892	TTA	2	6	861238	861243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19188	NC_020892	GC	3	6	861257	861262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19189	NC_020892	TACACC	2	12	861440	861451	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	474934537
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19236	NC_020892	CTG	2	6	863117	863122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934537
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19479	NC_020892	CG	3	6	873161	873166	0 %	0 %	50 %	50 %	474934545
19480	NC_020892	CCT	2	6	873199	873204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934545
19481	NC_020892	GAT	2	6	873224	873229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934545
19482	NC_020892	GTC	2	6	873302	873307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934545
19483	NC_020892	CAT	2	6	873413	873418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934545
19484	NC_020892	GAG	2	6	873425	873430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934545
19485	NC_020892	ACG	2	6	873618	873623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934545
19486	NC_020892	CCA	2	6	873739	873744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934545
19487	NC_020892	TGT	2	6	873930	873935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934545
19488	NC_020892	CGTTGC	2	12	873949	873960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934545
19489	NC_020892	TGT	2	6	873973	873978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934545
19490	NC_020892	CCT	2	6	873997	874002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934545
19491	NC_020892	C	6	6	874037	874042	0 %	0 %	0 %	100 %	474934545
19492	NC_020892	TCC	2	6	874152	874157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934545
19493	NC_020892	CAC	2	6	874169	874174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934545
19494	NC_020892	TCT	2	6	874204	874209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934545
19495	NC_020892	CAG	2	6	874236	874241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934545
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19497	NC_020892	TCC	2	6	874293	874298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934545
19498	NC_020892	GTT	2	6	874340	874345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934545
19499	NC_020892	CTC	2	6	874367	874372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934545
19500	NC_020892	ATC	2	6	874434	874439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934545

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