MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_020892	TTC	2	6	739753	739758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934387
16503	NC_020892	AGA	2	6	739787	739792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934387
16504	NC_020892	GAA	2	6	739824	739829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934387
16505	NC_020892	GAA	2	6	739932	739937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934387
16506	NC_020892	GGA	2	6	739953	739958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934387
16507	NC_020892	CAT	2	6	739962	739967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934387
16508	NC_020892	CTC	2	6	739993	739998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934387
16509	NC_020892	ACA	2	6	740015	740020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934387
16510	NC_020892	GAC	2	6	740104	740109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934387
16511	NC_020892	GAG	2	6	740194	740199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934387
16512	NC_020892	CCT	2	6	740241	740246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934387
16513	NC_020892	ATG	2	6	740332	740337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934387
16514	NC_020892	CTG	2	6	740362	740367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934387
16515	NC_020892	GTTC	2	8	740381	740388	0 %	50 %	25 %	25 %	474934387
16516	NC_020892	GATG	2	8	740445	740452	25 %	25 %	50 %	0 %	474934387
16517	NC_020892	GTG	2	6	740455	740460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934387
16518	NC_020892	TGA	2	6	740504	740509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934387
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16520	NC_020892	TGC	2	6	740569	740574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934388
16521	NC_020892	GAT	2	6	740580	740585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934388
16522	NC_020892	TCC	2	6	740626	740631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934388
16523	NC_020892	TCA	2	6	740691	740696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934388
16524	NC_020892	CCG	2	6	740698	740703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934388
16525	NC_020892	GAG	2	6	740717	740722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934388
16526	NC_020892	TTC	2	6	740819	740824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934389
16527	NC_020892	GTTC	2	8	740874	740881	0 %	50 %	25 %	25 %	474934389
16528	NC_020892	AGGG	2	8	740891	740898	25 %	0 %	75 %	0 %	474934389
16529	NC_020892	GAC	2	6	740924	740929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934389
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16533	NC_020892	ACG	2	6	741109	741114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934390
16534	NC_020892	GAT	2	6	741149	741154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934390
16535	NC_020892	GGA	2	6	741211	741216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934390
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16542	NC_020892	CGGATT	2	12	741451	741462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	474934390
16543	NC_020892	GCT	2	6	741491	741496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934390
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16545	NC_020892	GT	3	6	741556	741561	0 %	50 %	50 %	0 %	474934390
16546	NC_020892	GGA	2	6	741569	741574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934390
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16549	NC_020892	CAT	2	6	741830	741835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934391
16550	NC_020892	TTG	2	6	741841	741846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934391
16551	NC_020892	TCT	2	6	741908	741913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934391
16552	NC_020892	TAA	2	6	741988	741993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_020892	GCAC	2	8	742066	742073	25 %	0 %	25 %	50 %	474934392
16554	NC_020892	TGA	2	6	742089	742094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934392
16555	NC_020892	AGA	2	6	742206	742211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934392
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16557	NC_020892	TTGG	2	8	742311	742318	0 %	50 %	50 %	0 %	474934392
16558	NC_020892	TAA	2	6	742320	742325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474934392
16559	NC_020892	GAT	2	6	742327	742332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934392
16560	NC_020892	GTT	2	6	742401	742406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934392
16561	NC_020892	GA	3	6	742428	742433	50 %	0 %	50 %	0 %	474934392
16562	NC_020892	CAA	2	6	742473	742478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934392
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16565	NC_020892	ATG	2	6	742535	742540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934392
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16567	NC_020892	TTG	2	6	742649	742654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934392
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16570	NC_020892	TGGTTC	2	12	742704	742715	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	474934392
16571	NC_020892	TCT	2	6	742716	742721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934392
16572	NC_020892	ATC	2	6	742740	742745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934392
16573	NC_020892	ATTG	2	8	742753	742760	25 %	50 %	25 %	0 %	474934392
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16577	NC_020892	GTA	2	6	742936	742941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934392
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16585	NC_020892	CAG	2	6	743137	743142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934392
16586	NC_020892	TCAA	2	8	743153	743160	50 %	25 %	0 %	25 %	474934392
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16589	NC_020892	ACA	2	6	743198	743203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934392
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16591	NC_020892	A	6	6	743233	743238	100 %	0 %	0 %	0 %	474934392
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16593	NC_020892	GC	3	6	743313	743318	0 %	0 %	50 %	50 %	474934392
16594	NC_020892	TC	3	6	743375	743380	0 %	50 %	0 %	50 %	474934392
16595	NC_020892	GTATC	2	10	743381	743390	20 %	40 %	20 %	20 %	474934392
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16600	NC_020892	AATT	2	8	743792	743799	50 %	50 %	0 %	0 %	474934392
16601	NC_020892	ACT	2	6	743848	743853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934392
16602	NC_020892	A	6	6	743918	743923	100 %	0 %	0 %	0 %	474934392
16603	NC_020892	GAA	2	6	744010	744015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934392
16604	NC_020892	A	6	6	744019	744024	100 %	0 %	0 %	0 %	474934392
16605	NC_020892	GAA	2	6	744082	744087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934392
16606	NC_020892	TGA	2	6	744090	744095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934392
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16608	NC_020892	A	6	6	744163	744168	100 %	0 %	0 %	0 %	474934392
16609	NC_020892	A	6	6	744184	744189	100 %	0 %	0 %	0 %	474934392
16610	NC_020892	GGA	3	9	744198	744206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934392
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16613	NC_020892	AAAC	2	8	744268	744275	75 %	0 %	0 %	25 %	474934392
16614	NC_020892	AAGA	2	8	744283	744290	75 %	0 %	25 %	0 %	474934392
16615	NC_020892	GAGAAA	2	12	744337	744348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934392
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16983	NC_020892	TTC	2	6	761279	761284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934408
16984	NC_020892	GAT	2	6	761329	761334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934408
16985	NC_020892	AGA	2	6	761401	761406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934408
16986	NC_020892	GTTC	2	8	761430	761437	0 %	50 %	25 %	25 %	474934408
16987	NC_020892	CTTC	2	8	761562	761569	0 %	50 %	0 %	50 %	474934408
16988	NC_020892	ATC	2	6	761600	761605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934408
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16990	NC_020892	TTC	2	6	761623	761628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16991	NC_020892	CGT	2	6	761706	761711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934409
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16993	NC_020892	ATT	2	6	761896	761901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16994	NC_020892	GCAC	2	8	761943	761950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16995	NC_020892	CGCA	2	8	761972	761979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16996	NC_020892	GCC	2	6	762162	762167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934410
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16999	NC_020892	ATCCC	2	10	762342	762351	20 %	20 %	0 %	60 %	474934410
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