MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_020892	CAT	2	6	693119	693124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934332
15503	NC_020892	GTGG	2	8	693128	693135	0 %	25 %	75 %	0 %	474934332
15504	NC_020892	CTC	2	6	693194	693199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934332
15505	NC_020892	GA	4	8	693252	693259	50 %	0 %	50 %	0 %	474934332
15506	NC_020892	TCT	2	6	693265	693270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934332
15507	NC_020892	CTTCTC	2	12	693365	693376	0 %	50 %	0 %	50 %	474934332
15508	NC_020892	CTT	2	6	693413	693418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934332
15509	NC_020892	ATG	2	6	693488	693493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020892	ATG	2	6	693502	693507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_020892	CAA	2	6	693514	693519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_020892	GTTT	2	8	693535	693542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_020892	TGT	2	6	693680	693685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934333
15514	NC_020892	AAC	2	6	693688	693693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934333
15515	NC_020892	TCT	2	6	693696	693701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934333
15516	NC_020892	CTG	2	6	693774	693779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934333
15517	NC_020892	AACG	2	8	693841	693848	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15518	NC_020892	GAC	2	6	693859	693864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_020892	CAG	2	6	693901	693906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_020892	AT	3	6	693936	693941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020892	GGA	2	6	694018	694023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934334
15522	NC_020892	CACC	2	8	694180	694187	25 %	0 %	0 %	75 %	474934334
15523	NC_020892	GTG	2	6	694208	694213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934334
15524	NC_020892	ATAGGG	2	12	694274	694285	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	474934334
15525	NC_020892	CCT	2	6	694417	694422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934334
15526	NC_020892	AAC	2	6	694456	694461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934334
15527	NC_020892	TGA	2	6	694465	694470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934334
15528	NC_020892	TCCG	2	8	694511	694518	0 %	25 %	25 %	50 %	474934334
15529	NC_020892	ATC	2	6	694587	694592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934334
15530	NC_020892	TGG	2	6	694653	694658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934334
15531	NC_020892	GGC	2	6	694729	694734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934334
15532	NC_020892	ATC	2	6	694789	694794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15533	NC_020892	ACGG	2	8	694857	694864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15534	NC_020892	ATC	2	6	695028	695033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934335
15535	NC_020892	ACC	2	6	695049	695054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934335
15536	NC_020892	AGG	2	6	695068	695073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934335
15537	NC_020892	CAA	2	6	695081	695086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934335
15538	NC_020892	CGC	2	6	695093	695098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934335
15539	NC_020892	CGT	2	6	695177	695182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15540	NC_020892	ACG	2	6	695191	695196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15541	NC_020892	CGC	2	6	695234	695239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934335
15542	NC_020892	GTC	2	6	695247	695252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15543	NC_020892	ACC	3	9	695292	695300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934335
15544	NC_020892	CGT	2	6	695303	695308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15545	NC_020892	GCT	2	6	695321	695326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15546	NC_020892	GAG	2	6	695337	695342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934335
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15548	NC_020892	CCACC	2	10	695360	695369	20 %	0 %	0 %	80 %	474934335
15549	NC_020892	TCA	2	6	695371	695376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934335
15550	NC_020892	GGC	2	6	695393	695398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934335
15551	NC_020892	CAA	2	6	695441	695446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934335
15552	NC_020892	CCTC	2	8	695476	695483	0 %	25 %	0 %	75 %	474934335
15553	NC_020892	GAG	2	6	695502	695507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934335
15554	NC_020892	AAG	3	9	695514	695522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934335
15555	NC_020892	TCG	2	6	695533	695538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15556	NC_020892	TCG	2	6	695554	695559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15557	NC_020892	CGA	2	6	695561	695566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934335
15558	NC_020892	AAG	2	6	695604	695609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934335
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15560	NC_020892	GTC	3	9	695649	695657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
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15569	NC_020892	AGGC	2	8	695914	695921	25 %	0 %	50 %	25 %	474934335
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15578	NC_020892	GTC	2	6	696213	696218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934335
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15591	NC_020892	GAA	2	6	696765	696770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_020892	TCA	2	6	696812	696817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934336
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15602	NC_020892	GCG	2	6	697351	697356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934336
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15613	NC_020892	CTTCGT	2	12	697732	697743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	474934337
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15620	NC_020892	GAT	2	6	697945	697950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934337
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15981	NC_020892	CCT	2	6	714009	714014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934356
15982	NC_020892	CAG	2	6	714045	714050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934356
15983	NC_020892	CGT	2	6	714173	714178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934356
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