MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020892	AGG	3	9	649358	649366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934294
14502	NC_020892	CAT	2	6	649398	649403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934294
14503	NC_020892	GCT	2	6	649409	649414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14504	NC_020892	ACC	2	6	649441	649446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934294
14505	NC_020892	CTG	2	6	649487	649492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14506	NC_020892	AGC	2	6	649556	649561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14507	NC_020892	TGG	2	6	649571	649576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934294
14508	NC_020892	GAC	2	6	649611	649616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14509	NC_020892	GGT	2	6	649626	649631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934294
14510	NC_020892	GGA	3	9	649635	649643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934294
14511	NC_020892	CTC	2	6	649662	649667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934294
14512	NC_020892	TCC	2	6	649741	649746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14513	NC_020892	TGG	2	6	649814	649819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_020892	ATA	2	6	649901	649906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_020892	GAC	2	6	649984	649989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_020892	GAG	2	6	650067	650072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934296
14517	NC_020892	CTT	2	6	650073	650078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934296
14518	NC_020892	CCT	2	6	650081	650086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934296
14519	NC_020892	CTT	2	6	650118	650123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934296
14520	NC_020892	CGG	3	9	650207	650215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934296
14521	NC_020892	TTC	2	6	650245	650250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934296
14522	NC_020892	TCG	2	6	650374	650379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934296
14523	NC_020892	TCG	2	6	650560	650565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934296
14524	NC_020892	CG	3	6	650664	650669	0 %	0 %	50 %	50 %	474934296
14525	NC_020892	GTA	2	6	650700	650705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934296
14526	NC_020892	GGA	2	6	650742	650747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934296
14527	NC_020892	CTT	2	6	650792	650797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14528	NC_020892	TCG	2	6	650829	650834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934297
14529	NC_020892	TCT	2	6	650863	650868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14530	NC_020892	TTC	2	6	650883	650888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14531	NC_020892	CGG	2	6	650953	650958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934297
14532	NC_020892	CGC	2	6	650977	650982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934297
14533	NC_020892	GAA	2	6	651029	651034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934297
14534	NC_020892	CGG	2	6	651061	651066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934297
14535	NC_020892	CCT	2	6	651067	651072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934297
14536	NC_020892	GGC	3	9	651080	651088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934297
14537	NC_020892	CTT	2	6	651089	651094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14538	NC_020892	CCCCT	2	10	651111	651120	0 %	20 %	0 %	80 %	474934297
14539	NC_020892	GCC	2	6	651171	651176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934297
14540	NC_020892	GTA	3	9	651215	651223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934297
14541	NC_020892	GCC	2	6	651279	651284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934297
14542	NC_020892	ATC	2	6	651360	651365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934297
14543	NC_020892	CTG	2	6	651368	651373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934297
14544	NC_020892	GAG	2	6	651395	651400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934297
14545	NC_020892	CTT	2	6	651413	651418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14546	NC_020892	TC	3	6	651423	651428	0 %	50 %	0 %	50 %	474934297
14547	NC_020892	GTT	2	6	651434	651439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934297
14548	NC_020892	GCC	2	6	651488	651493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934297
14549	NC_020892	CGG	2	6	651496	651501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934297
14550	NC_020892	TGA	2	6	651505	651510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934297
14551	NC_020892	ATG	2	6	651561	651566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934297
14552	NC_020892	CGT	2	6	651667	651672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934297
14553	NC_020892	GGC	2	6	651692	651697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934297
14554	NC_020892	GAG	2	6	651728	651733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934297
14555	NC_020892	TTC	2	6	651753	651758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14556	NC_020892	CGT	2	6	651817	651822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934297
14557	NC_020892	TTC	2	6	651861	651866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14558	NC_020892	TTC	2	6	651894	651899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934297
14559	NC_020892	GCT	2	6	651946	651951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934297
14560	NC_020892	CGG	3	9	652045	652053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934297
14561	NC_020892	TCCT	2	8	652077	652084	0 %	50 %	0 %	50 %	474934297
14562	NC_020892	CGC	2	6	652217	652222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934297
14563	NC_020892	CAT	2	6	652247	652252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934297
14564	NC_020892	GCT	2	6	652265	652270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934297
14565	NC_020892	AT	4	8	652298	652305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_020892	AGG	2	6	652388	652393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934298
14567	NC_020892	GGA	2	6	652453	652458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934298
14568	NC_020892	ATCG	2	8	652537	652544	25 %	25 %	25 %	25 %	474934298
14569	NC_020892	CTT	2	6	652591	652596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934298
14570	NC_020892	AGA	2	6	652608	652613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934298
14571	NC_020892	TGG	2	6	652724	652729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934298
14572	NC_020892	AAT	2	6	652763	652768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474934298
14573	NC_020892	TCC	2	6	652778	652783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934298
14574	NC_020892	CAGCGG	2	12	652786	652797	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	474934298
14575	NC_020892	CTTT	2	8	652809	652816	0 %	75 %	0 %	25 %	474934298
14576	NC_020892	ACC	2	6	652829	652834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934298
14577	NC_020892	T	6	6	652899	652904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_020892	TAT	2	6	652909	652914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_020892	ATT	3	9	652949	652957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_020892	CGGA	2	8	652991	652998	25 %	0 %	50 %	25 %	474934299
14581	NC_020892	TCA	2	6	653030	653035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934299
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14583	NC_020892	TCCTC	2	10	653075	653084	0 %	40 %	0 %	60 %	474934299
14584	NC_020892	AG	3	6	653189	653194	50 %	0 %	50 %	0 %	474934299
14585	NC_020892	CTT	2	6	653344	653349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934299
14586	NC_020892	GCA	2	6	653410	653415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934299
14587	NC_020892	GAGG	2	8	653416	653423	25 %	0 %	75 %	0 %	474934299
14588	NC_020892	TCC	2	6	653512	653517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934299
14589	NC_020892	GCG	2	6	653518	653523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934299
14590	NC_020892	CTG	2	6	653551	653556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934299
14591	NC_020892	AGG	2	6	653588	653593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934299
14592	NC_020892	CGA	2	6	653598	653603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934299
14593	NC_020892	GGCC	2	8	653604	653611	0 %	0 %	50 %	50 %	474934299
14594	NC_020892	GAT	2	6	653651	653656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934300
14595	NC_020892	CTT	2	6	653657	653662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934300
14596	NC_020892	GA	3	6	653706	653711	50 %	0 %	50 %	0 %	474934300
14597	NC_020892	ATG	2	6	653724	653729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934300
14598	NC_020892	GAC	2	6	653744	653749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934300
14599	NC_020892	TCCCGC	2	12	653753	653764	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	474934300
14600	NC_020892	GAG	2	6	653768	653773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934300
14601	NC_020892	TCT	2	6	653971	653976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934300
14602	NC_020892	TGGA	2	8	653979	653986	25 %	25 %	50 %	0 %	474934300
14603	NC_020892	TCG	2	6	653991	653996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934300
14604	NC_020892	TGG	2	6	654022	654027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934300
14605	NC_020892	CGA	2	6	654040	654045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934300
14606	NC_020892	TCCC	2	8	654073	654080	0 %	25 %	0 %	75 %	474934300
14607	NC_020892	GGT	2	6	654263	654268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934300
14608	NC_020892	CAT	2	6	654305	654310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934300
14609	NC_020892	ACGG	2	8	654317	654324	25 %	0 %	50 %	25 %	474934300
14610	NC_020892	CGA	2	6	654328	654333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934300
14611	NC_020892	GGCG	2	8	654364	654371	0 %	0 %	75 %	25 %	474934300
14612	NC_020892	CGG	2	6	654403	654408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934300
14613	NC_020892	C	6	6	654414	654419	0 %	0 %	0 %	100 %	474934300
14614	NC_020892	GGC	2	6	654449	654454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934300
14615	NC_020892	TGG	2	6	654457	654462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934300
14616	NC_020892	GTT	2	6	654473	654478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934300
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14618	NC_020892	CAT	2	6	654578	654583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934300
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14853	NC_020892	GTCACC	2	12	664410	664421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934307
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14974	NC_020892	TCA	2	6	669149	669154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934311
14975	NC_020892	CTTC	2	8	669181	669188	0 %	50 %	0 %	50 %	474934311
14976	NC_020892	CCCTC	2	10	669201	669210	0 %	20 %	0 %	80 %	474934311
14977	NC_020892	ATC	2	6	669215	669220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934311
14978	NC_020892	GCC	2	6	669227	669232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934311
14979	NC_020892	GCCT	2	8	669247	669254	0 %	25 %	25 %	50 %	474934311
14980	NC_020892	TTG	2	6	669266	669271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934311
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14982	NC_020892	TTG	2	6	669323	669328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14983	NC_020892	ATC	2	6	669353	669358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934312
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14999	NC_020892	TTC	2	6	670334	670339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934312
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