MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020892	GAT	2	6	627997	628002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934272
14002	NC_020892	TCC	2	6	628010	628015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934272
14003	NC_020892	GCG	2	6	628166	628171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934272
14004	NC_020892	GGC	2	6	628216	628221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934272
14005	NC_020892	GGT	2	6	628233	628238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934272
14006	NC_020892	GAG	2	6	628241	628246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934272
14007	NC_020892	TGC	2	6	628268	628273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934272
14008	NC_020892	TCT	2	6	628275	628280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934272
14009	NC_020892	CTC	2	6	628288	628293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934272
14010	NC_020892	GTT	2	6	628300	628305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934272
14011	NC_020892	TCC	2	6	628399	628404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934272
14012	NC_020892	GC	3	6	628425	628430	0 %	0 %	50 %	50 %	474934272
14013	NC_020892	TCC	2	6	628433	628438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934272
14014	NC_020892	TCC	2	6	628469	628474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934272
14015	NC_020892	CGG	2	6	628486	628491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934272
14016	NC_020892	G	6	6	628490	628495	0 %	0 %	100 %	0 %	474934272
14017	NC_020892	TGA	2	6	628545	628550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934272
14018	NC_020892	TCC	2	6	628590	628595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934272
14019	NC_020892	GGAC	2	8	628719	628726	25 %	0 %	50 %	25 %	474934272
14020	NC_020892	CTT	2	6	628783	628788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934272
14021	NC_020892	GTA	2	6	628840	628845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934272
14022	NC_020892	TTG	2	6	628964	628969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934272
14023	NC_020892	TC	3	6	628983	628988	0 %	50 %	0 %	50 %	474934272
14024	NC_020892	TGA	2	6	628989	628994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934272
14025	NC_020892	CGG	2	6	629084	629089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_020892	CGG	2	6	629130	629135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934273
14027	NC_020892	AGG	2	6	629159	629164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934273
14028	NC_020892	ATG	2	6	629198	629203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934273
14029	NC_020892	CAG	2	6	629272	629277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934273
14030	NC_020892	GAACAC	2	12	629287	629298	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	474934273
14031	NC_020892	TGG	2	6	629307	629312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934273
14032	NC_020892	ATG	2	6	629429	629434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934273
14033	NC_020892	CGA	2	6	629463	629468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934273
14034	NC_020892	CCG	2	6	629477	629482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934273
14035	NC_020892	GGC	2	6	629491	629496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934273
14036	NC_020892	AGTCC	2	10	629548	629557	20 %	20 %	20 %	40 %	474934273
14037	NC_020892	GCAC	2	8	629649	629656	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_020892	AT	3	6	629724	629729	50 %	50 %	0 %	0 %	474934274
14039	NC_020892	GTC	2	6	629808	629813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934274
14040	NC_020892	ACT	2	6	629819	629824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934274
14041	NC_020892	CGT	2	6	629948	629953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934274
14042	NC_020892	CT	3	6	629972	629977	0 %	50 %	0 %	50 %	474934274
14043	NC_020892	CT	4	8	630002	630009	0 %	50 %	0 %	50 %	474934274
14044	NC_020892	GAA	2	6	630036	630041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934274
14045	NC_020892	GA	3	6	630130	630135	50 %	0 %	50 %	0 %	474934275
14046	NC_020892	GAA	2	6	630151	630156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934275
14047	NC_020892	CTG	2	6	630160	630165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934275
14048	NC_020892	GAA	2	6	630253	630258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934275
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14050	NC_020892	CTT	2	6	630334	630339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934275
14051	NC_020892	CGG	2	6	630340	630345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934275
14052	NC_020892	GAT	2	6	630370	630375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934275
14053	NC_020892	CGA	2	6	630382	630387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934275
14054	NC_020892	AAAC	2	8	630449	630456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14055	NC_020892	TA	3	6	630482	630487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020892	CGA	2	6	630590	630595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934276
14057	NC_020892	CCG	2	6	630619	630624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934276
14058	NC_020892	AGGA	2	8	630663	630670	50 %	0 %	50 %	0 %	474934276
14059	NC_020892	CAC	3	9	630689	630697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934276
14060	NC_020892	TCT	2	6	630745	630750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934276
14061	NC_020892	CACC	2	8	630790	630797	25 %	0 %	0 %	75 %	474934276
14062	NC_020892	ACA	2	6	630811	630816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934276
14063	NC_020892	GTC	2	6	630821	630826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934276
14064	NC_020892	ACC	2	6	630844	630849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934276
14065	NC_020892	CCG	2	6	630931	630936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934276
14066	NC_020892	CCT	2	6	630989	630994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934276
14067	NC_020892	ATG	2	6	631053	631058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934276
14068	NC_020892	GAT	2	6	631097	631102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934276
14069	NC_020892	CGA	2	6	631106	631111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934276
14070	NC_020892	AGGA	2	8	631125	631132	50 %	0 %	50 %	0 %	474934276
14071	NC_020892	GAA	2	6	631154	631159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934276
14072	NC_020892	CGA	2	6	631181	631186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934276
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14077	NC_020892	CGA	2	6	631327	631332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934277
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14086	NC_020892	TCG	2	6	631638	631643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934277
14087	NC_020892	GGT	2	6	631661	631666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934277
14088	NC_020892	ACC	2	6	631696	631701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934278
14089	NC_020892	GGC	2	6	631725	631730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934278
14090	NC_020892	GCACCG	2	12	631748	631759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	474934278
14091	NC_020892	TCA	2	6	631769	631774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934278
14092	NC_020892	AAG	2	6	631816	631821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934278
14093	NC_020892	GAG	2	6	631828	631833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934278
14094	NC_020892	GC	3	6	631895	631900	0 %	0 %	50 %	50 %	474934278
14095	NC_020892	CAT	2	6	631950	631955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934278
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14097	NC_020892	GAC	2	6	631987	631992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934278
14098	NC_020892	TGGC	2	8	632005	632012	0 %	25 %	50 %	25 %	474934278
14099	NC_020892	AGGG	2	8	632101	632108	25 %	0 %	75 %	0 %	474934278
14100	NC_020892	GGA	2	6	632145	632150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934279
14101	NC_020892	ATG	2	6	632217	632222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934279
14102	NC_020892	AGGCCG	2	12	632233	632244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	474934279
14103	NC_020892	CTC	2	6	632319	632324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934279
14104	NC_020892	TCA	2	6	632347	632352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934279
14105	NC_020892	TCA	2	6	632365	632370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934279
14106	NC_020892	CCA	2	6	632377	632382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934279
14107	NC_020892	ACG	2	6	632386	632391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934279
14108	NC_020892	TCA	2	6	632395	632400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934279
14109	NC_020892	GACGC	2	10	632518	632527	20 %	0 %	40 %	40 %	474934279
14110	NC_020892	CGT	2	6	632537	632542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934279
14111	NC_020892	CTC	2	6	632547	632552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934279
14112	NC_020892	GCCCC	2	10	632587	632596	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14113	NC_020892	CCT	2	6	632662	632667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934280
14114	NC_020892	TTCTC	2	10	632757	632766	0 %	60 %	0 %	40 %	474934280
14115	NC_020892	C	6	6	632839	632844	0 %	0 %	0 %	100 %	474934280
14116	NC_020892	TCG	2	6	632862	632867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934280
14117	NC_020892	TCG	2	6	632886	632891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934280
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14119	NC_020892	CTT	2	6	632977	632982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934280
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14121	NC_020892	TAC	2	6	633038	633043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934280
14122	NC_020892	GCT	2	6	633166	633171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934280
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14225	NC_020892	GTT	2	6	638449	638454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14226	NC_020892	CCGA	2	8	638465	638472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14227	NC_020892	TTA	2	6	638480	638485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14228	NC_020892	TAA	2	6	638512	638517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14229	NC_020892	TTCG	2	8	638621	638628	0 %	50 %	25 %	25 %	474934285
14230	NC_020892	AAGC	2	8	638679	638686	50 %	0 %	25 %	25 %	474934285
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14232	NC_020892	TA	3	6	638854	638859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_020892	CAA	2	6	638865	638870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14234	NC_020892	CAA	2	6	638898	638903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14235	NC_020892	ATA	2	6	638910	638915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14236	NC_020892	GAAC	2	8	638927	638934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14237	NC_020892	ATC	2	6	638986	638991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934286
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14240	NC_020892	GGT	2	6	639128	639133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934286
14241	NC_020892	GAG	2	6	639137	639142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934286
14242	NC_020892	TTC	2	6	639165	639170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934286
14243	NC_020892	GC	3	6	639208	639213	0 %	0 %	50 %	50 %	474934286
14244	NC_020892	TTG	2	6	639222	639227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934286
14245	NC_020892	CGA	2	6	639301	639306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934286
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14247	NC_020892	CG	3	6	639374	639379	0 %	0 %	50 %	50 %	474934286
14248	NC_020892	TCA	2	6	639388	639393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934286
14249	NC_020892	AGTAGC	2	12	639436	639447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934286
14250	NC_020892	GTC	2	6	639509	639514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
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14252	NC_020892	TCG	2	6	639570	639575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
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14255	NC_020892	TGA	2	6	639667	639672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934286
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14260	NC_020892	TCG	2	6	639831	639836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
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14262	NC_020892	TTC	2	6	639927	639932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934286
14263	NC_020892	GCCT	2	8	640014	640021	0 %	25 %	25 %	50 %	474934286
14264	NC_020892	TTG	2	6	640062	640067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934286
14265	NC_020892	CG	3	6	640104	640109	0 %	0 %	50 %	50 %	474934286
14266	NC_020892	GCT	2	6	640113	640118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934286
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14269	NC_020892	CTT	2	6	640204	640209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14270	NC_020892	CCAA	2	8	640269	640276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14271	NC_020892	CAT	2	6	640291	640296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934287
14272	NC_020892	ACC	2	6	640320	640325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934287
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14310	NC_020892	ACG	2	6	641937	641942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934287
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14312	NC_020892	GGA	2	6	642127	642132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934287
14313	NC_020892	CGA	2	6	642154	642159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934287
14314	NC_020892	TTCCCG	2	12	642254	642265	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14315	NC_020892	TAA	2	6	642288	642293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14316	NC_020892	TAC	2	6	642320	642325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934288
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14345	NC_020892	GATACG	2	12	643383	643394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934289
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14347	NC_020892	CGA	2	6	643468	643473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934289
14348	NC_020892	TGGACC	2	12	643494	643505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474934289
14349	NC_020892	AGG	2	6	643512	643517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934289
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14351	NC_020892	TCC	2	6	643704	643709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934289
14352	NC_020892	CACC	2	8	643729	643736	25 %	0 %	0 %	75 %	474934289
14353	NC_020892	ACT	2	6	643743	643748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934289
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14355	NC_020892	CTT	2	6	643822	643827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934289
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14476	NC_020892	GAG	2	6	648297	648302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934293
14477	NC_020892	TGA	2	6	648316	648321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934293
14478	NC_020892	CCG	2	6	648322	648327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934293
14479	NC_020892	TCA	2	6	648406	648411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934293
14480	NC_020892	ATC	2	6	648501	648506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934293
14481	NC_020892	CGG	2	6	648563	648568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934293
14482	NC_020892	CTG	2	6	648652	648657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14483	NC_020892	TCT	3	9	648659	648667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934294
14484	NC_020892	GGTC	2	8	648711	648718	0 %	25 %	50 %	25 %	474934294
14485	NC_020892	CCT	2	6	648749	648754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934294
14486	NC_020892	GAA	2	6	648792	648797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934294
14487	NC_020892	CCTTC	2	10	648812	648821	0 %	40 %	0 %	60 %	474934294
14488	NC_020892	CGA	2	6	648849	648854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14489	NC_020892	CCT	2	6	648878	648883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934294
14490	NC_020892	TGA	2	6	648944	648949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934294
14491	NC_020892	TGA	2	6	649025	649030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934294
14492	NC_020892	CTTC	2	8	649040	649047	0 %	50 %	0 %	50 %	474934294
14493	NC_020892	TGA	2	6	649058	649063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934294
14494	NC_020892	TTC	2	6	649093	649098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934294
14495	NC_020892	GTC	2	6	649134	649139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14496	NC_020892	TCG	2	6	649237	649242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934294
14497	NC_020892	C	6	6	649265	649270	0 %	0 %	0 %	100 %	474934294
14498	NC_020892	TC	3	6	649272	649277	0 %	50 %	0 %	50 %	474934294
14499	NC_020892	GAT	2	6	649284	649289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934294
14500	NC_020892	GAG	3	9	649344	649352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934294

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