MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020892	CTG	2	6	584149	584154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934227
13002	NC_020892	GCCGG	2	10	584167	584176	0 %	0 %	60 %	40 %	474934227
13003	NC_020892	TA	3	6	584239	584244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_020892	GC	3	6	584291	584296	0 %	0 %	50 %	50 %	474934228
13005	NC_020892	GCC	2	6	584324	584329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934228
13006	NC_020892	TTC	2	6	584357	584362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934228
13007	NC_020892	CCG	2	6	584472	584477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934228
13008	NC_020892	TCC	2	6	584519	584524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934228
13009	NC_020892	GAT	2	6	584539	584544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934228
13010	NC_020892	CTG	2	6	584558	584563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934228
13011	NC_020892	ATC	2	6	584564	584569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934228
13012	NC_020892	GGA	2	6	584599	584604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934228
13013	NC_020892	CATCGT	2	12	584626	584637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474934228
13014	NC_020892	GAA	2	6	584692	584697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934228
13015	NC_020892	CTC	2	6	584752	584757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934228
13016	NC_020892	ATC	3	9	584765	584773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934228
13017	NC_020892	TCG	2	6	584862	584867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934228
13018	NC_020892	CAT	2	6	584905	584910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934228
13019	NC_020892	ATC	2	6	584927	584932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934228
13020	NC_020892	ATC	2	6	584978	584983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934228
13021	NC_020892	GTC	2	6	585002	585007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934228
13022	NC_020892	CCG	2	6	585018	585023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934228
13023	NC_020892	TGG	2	6	585042	585047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934228
13024	NC_020892	CAT	2	6	585106	585111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934228
13025	NC_020892	GAT	2	6	585115	585120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934228
13026	NC_020892	GAG	2	6	585161	585166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934228
13027	NC_020892	GGA	2	6	585211	585216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934228
13028	NC_020892	GAG	3	9	585242	585250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934228
13029	NC_020892	CGG	2	6	585367	585372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934229
13030	NC_020892	AAG	2	6	585396	585401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934229
13031	NC_020892	GAACCA	2	12	585433	585444	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	474934229
13032	NC_020892	TCAAGC	2	12	585447	585458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	474934229
13033	NC_020892	GCC	2	6	585491	585496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934229
13034	NC_020892	TCTG	2	8	585506	585513	0 %	50 %	25 %	25 %	474934229
13035	NC_020892	CGA	2	6	585526	585531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934229
13036	NC_020892	ACG	2	6	585603	585608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934229
13037	NC_020892	GCC	2	6	585617	585622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934229
13038	NC_020892	ACG	2	6	585651	585656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934229
13039	NC_020892	GAG	2	6	585746	585751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934229
13040	NC_020892	AGA	2	6	585795	585800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934229
13041	NC_020892	GAA	2	6	585877	585882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934229
13042	NC_020892	TCT	2	6	585924	585929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934229
13043	NC_020892	CGG	2	6	585990	585995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934230
13044	NC_020892	GAT	2	6	586021	586026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934230
13045	NC_020892	TCG	2	6	586079	586084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934230
13046	NC_020892	CTCC	2	8	586125	586132	0 %	25 %	0 %	75 %	474934230
13047	NC_020892	TCC	2	6	586137	586142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934230
13048	NC_020892	ATG	2	6	586160	586165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934230
13049	NC_020892	CTG	2	6	586175	586180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934230
13050	NC_020892	GTC	2	6	586292	586297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934231
13051	NC_020892	CTC	2	6	586301	586306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934231
13052	NC_020892	ATC	2	6	586308	586313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934231
13053	NC_020892	CGAT	2	8	586335	586342	25 %	25 %	25 %	25 %	474934231
13054	NC_020892	TGG	2	6	586393	586398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934231
13055	NC_020892	C	6	6	586551	586556	0 %	0 %	0 %	100 %	474934231
13056	NC_020892	ACC	2	6	586560	586565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934231
13057	NC_020892	GCCT	2	8	586638	586645	0 %	25 %	25 %	50 %	474934231
13058	NC_020892	CTC	2	6	586649	586654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934231
13059	NC_020892	GGT	2	6	586658	586663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934231
13060	NC_020892	GGC	2	6	586727	586732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934231
13061	NC_020892	GCC	2	6	586796	586801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934232
13062	NC_020892	TCT	2	6	586840	586845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934232
13063	NC_020892	GCC	2	6	586895	586900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934232
13064	NC_020892	GAT	2	6	586910	586915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934232
13065	NC_020892	CAG	2	6	586937	586942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934232
13066	NC_020892	TGGT	2	8	586986	586993	0 %	50 %	50 %	0 %	474934232
13067	NC_020892	TCG	2	6	587001	587006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934232
13068	NC_020892	CGA	3	9	587008	587016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934232
13069	NC_020892	GTC	2	6	587024	587029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934232
13070	NC_020892	CGT	2	6	587119	587124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934232
13071	NC_020892	GGA	2	6	587164	587169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934232
13072	NC_020892	CGTG	2	8	587206	587213	0 %	25 %	50 %	25 %	474934232
13073	NC_020892	CATCC	2	10	587228	587237	20 %	20 %	0 %	60 %	474934232
13074	NC_020892	TCG	2	6	587328	587333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13075	NC_020892	GTA	3	9	587336	587344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934233
13076	NC_020892	TCC	2	6	587382	587387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13077	NC_020892	TTG	2	6	587388	587393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934233
13078	NC_020892	GGTG	2	8	587404	587411	0 %	25 %	75 %	0 %	474934233
13079	NC_020892	CCT	2	6	587420	587425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13080	NC_020892	CCCT	2	8	587463	587470	0 %	25 %	0 %	75 %	474934233
13081	NC_020892	GTG	2	6	587498	587503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934233
13082	NC_020892	CGA	2	6	587569	587574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13083	NC_020892	TCT	2	6	587593	587598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934233
13084	NC_020892	CAT	2	6	587600	587605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934233
13085	NC_020892	GGC	2	6	587621	587626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934233
13086	NC_020892	TCG	2	6	587664	587669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13087	NC_020892	TCC	2	6	587688	587693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13088	NC_020892	CTC	2	6	587728	587733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13089	NC_020892	TTC	2	6	587742	587747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934233
13090	NC_020892	TGA	2	6	587785	587790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934233
13091	NC_020892	GGT	2	6	587963	587968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934233
13092	NC_020892	CGA	2	6	587989	587994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13093	NC_020892	GGA	2	6	588026	588031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934233
13094	NC_020892	TCC	2	6	588159	588164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13095	NC_020892	AC	3	6	588223	588228	50 %	0 %	0 %	50 %	474934233
13096	NC_020892	GAC	3	9	588305	588313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13097	NC_020892	GTC	2	6	588320	588325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13098	NC_020892	TGA	2	6	588340	588345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934233
13099	NC_020892	AGG	2	6	588382	588387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934233
13100	NC_020892	TCG	2	6	588393	588398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934233
13101	NC_020892	AAG	2	6	588399	588404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934233
13102	NC_020892	GCC	2	6	588432	588437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934233
13103	NC_020892	CCG	2	6	588459	588464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934233
13104	NC_020892	CGG	2	6	588514	588519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934233
13105	NC_020892	CCT	2	6	588520	588525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13106	NC_020892	ACC	2	6	588567	588572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934233
13107	NC_020892	CGG	2	6	588616	588621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934233
13108	NC_020892	CCT	3	9	588691	588699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13109	NC_020892	G	6	6	588705	588710	0 %	0 %	100 %	0 %	474934233
13110	NC_020892	GGT	2	6	588764	588769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934233
13111	NC_020892	CTT	2	6	588812	588817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934233
13112	NC_020892	TGG	2	6	588861	588866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934233
13113	NC_020892	TCC	2	6	588873	588878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934233
13114	NC_020892	TCG	2	6	588885	588890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934233
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13116	NC_020892	TTG	2	6	589047	589052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934233
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13118	NC_020892	CCG	2	6	589084	589089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934233
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13240	NC_020892	CAT	2	6	594792	594797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13322	NC_020892	TA	3	6	599009	599014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13354	NC_020892	TCA	2	6	600539	600544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934248
13355	NC_020892	AGGG	2	8	600583	600590	25 %	0 %	75 %	0 %	474934248
13356	NC_020892	ACA	2	6	600605	600610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934248
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13360	NC_020892	CGG	2	6	600842	600847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934248
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13374	NC_020892	CTG	2	6	601382	601387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934249
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13476	NC_020892	CGACGG	2	12	605064	605075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	474934252
13477	NC_020892	CGA	2	6	605124	605129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934252
13478	NC_020892	TGA	2	6	605130	605135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934252
13479	NC_020892	TTC	2	6	605147	605152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934252
13480	NC_020892	CGG	2	6	605163	605168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934252
13481	NC_020892	GGT	2	6	605188	605193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934252
13482	NC_020892	CGA	2	6	605262	605267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934252
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13484	NC_020892	GC	3	6	605288	605293	0 %	0 %	50 %	50 %	474934252
13485	NC_020892	CGA	2	6	605295	605300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934252
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13487	NC_020892	CT	4	8	605305	605312	0 %	50 %	0 %	50 %	474934252
13488	NC_020892	GCG	3	9	605390	605398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934252
13489	NC_020892	GAGG	2	8	605422	605429	25 %	0 %	75 %	0 %	474934252
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13491	NC_020892	TCCC	2	8	605457	605464	0 %	25 %	0 %	75 %	474934252
13492	NC_020892	GACCTC	2	12	605473	605484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474934252
13493	NC_020892	TCC	2	6	605487	605492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934252
13494	NC_020892	GAG	2	6	605539	605544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934252
13495	NC_020892	CGA	2	6	605571	605576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934252
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13497	NC_020892	GTT	2	6	605653	605658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13499	NC_020892	TCC	2	6	605729	605734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13500	NC_020892	TCG	2	6	605820	605825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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