MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020892	T	6	6	561725	561730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020892	AGG	2	6	561764	561769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020892	GCCC	2	8	562027	562034	0 %	0 %	25 %	75 %	474934206
12504	NC_020892	CCG	2	6	562092	562097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934206
12505	NC_020892	TGG	2	6	562203	562208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934206
12506	NC_020892	TCG	2	6	562290	562295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934206
12507	NC_020892	CAC	2	6	562346	562351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934206
12508	NC_020892	GCG	2	6	562359	562364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934206
12509	NC_020892	GCCACC	2	12	562392	562403	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	474934206
12510	NC_020892	ATC	2	6	562493	562498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934206
12511	NC_020892	AAG	2	6	562520	562525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934206
12512	NC_020892	AGG	3	9	562536	562544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934206
12513	NC_020892	GCAA	2	8	562625	562632	50 %	0 %	25 %	25 %	474934206
12514	NC_020892	CCG	2	6	562764	562769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934206
12515	NC_020892	CGG	2	6	562820	562825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934207
12516	NC_020892	AGC	2	6	562850	562855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934207
12517	NC_020892	TGT	2	6	562900	562905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934207
12518	NC_020892	CAA	2	6	562946	562951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934207
12519	NC_020892	TGA	2	6	562975	562980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934207
12520	NC_020892	GTC	3	9	563010	563018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934207
12521	NC_020892	CAACGC	2	12	563027	563038	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	474934207
12522	NC_020892	CGGA	2	8	563045	563052	25 %	0 %	50 %	25 %	474934207
12523	NC_020892	GGC	2	6	563090	563095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934207
12524	NC_020892	CCG	2	6	563109	563114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934207
12525	NC_020892	ACC	2	6	563253	563258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934207
12526	NC_020892	AAG	2	6	563268	563273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934207
12527	NC_020892	GTCCGC	2	12	563283	563294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	474934207
12528	NC_020892	GAT	2	6	563345	563350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934207
12529	NC_020892	C	6	6	563353	563358	0 %	0 %	0 %	100 %	474934207
12530	NC_020892	ACC	2	6	563379	563384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934207
12531	NC_020892	GAT	2	6	563390	563395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934207
12532	NC_020892	CAC	2	6	563396	563401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934207
12533	NC_020892	ACA	2	6	563452	563457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934207
12534	NC_020892	CCTG	2	8	563503	563510	0 %	25 %	25 %	50 %	474934207
12535	NC_020892	CGA	2	6	563546	563551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934207
12536	NC_020892	CGCA	2	8	563597	563604	25 %	0 %	25 %	50 %	474934207
12537	NC_020892	TCA	2	6	563638	563643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934207
12538	NC_020892	GAG	3	9	563670	563678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934207
12539	NC_020892	CAT	2	6	563699	563704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934207
12540	NC_020892	TGA	2	6	563761	563766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934207
12541	NC_020892	GGAGT	2	10	563784	563793	20 %	20 %	60 %	0 %	474934207
12542	NC_020892	GAG	2	6	563802	563807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934207
12543	NC_020892	AGG	2	6	563875	563880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934207
12544	NC_020892	GTC	2	6	563895	563900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934207
12545	NC_020892	ACA	2	6	563914	563919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934207
12546	NC_020892	AGG	2	6	563920	563925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934207
12547	NC_020892	TCC	2	6	563929	563934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934207
12548	NC_020892	GACCT	2	10	563982	563991	20 %	20 %	20 %	40 %	474934207
12549	NC_020892	CGT	2	6	564022	564027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934207
12550	NC_020892	TCA	2	6	564051	564056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934208
12551	NC_020892	G	6	6	564062	564067	0 %	0 %	100 %	0 %	474934208
12552	NC_020892	TCG	2	6	564147	564152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934208
12553	NC_020892	CGG	3	9	564157	564165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934208
12554	NC_020892	GAG	2	6	564179	564184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934208
12555	NC_020892	AGG	2	6	564191	564196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934208
12556	NC_020892	CGA	2	6	564235	564240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934208
12557	NC_020892	CGT	2	6	564322	564327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934208
12558	NC_020892	GAA	2	6	564361	564366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934208
12559	NC_020892	GCC	2	6	564367	564372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934208
12560	NC_020892	TGG	2	6	564384	564389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934208
12561	NC_020892	AGG	3	9	564396	564404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934208
12562	NC_020892	TCG	2	6	564405	564410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934208
12563	NC_020892	GTG	2	6	564431	564436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934208
12564	NC_020892	CCT	2	6	564463	564468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934208
12565	NC_020892	CGT	2	6	564487	564492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934208
12566	NC_020892	CAC	2	6	564518	564523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934208
12567	NC_020892	GGA	2	6	564577	564582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934208
12568	NC_020892	GAT	2	6	564583	564588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934208
12569	NC_020892	TCC	2	6	564635	564640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934208
12570	NC_020892	CGG	2	6	564700	564705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934208
12571	NC_020892	GAT	2	6	564706	564711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934208
12572	NC_020892	GCA	2	6	564729	564734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934208
12573	NC_020892	TGG	2	6	564768	564773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934208
12574	NC_020892	GGAAT	2	10	564858	564867	40 %	20 %	40 %	0 %	474934209
12575	NC_020892	GCG	2	6	564940	564945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934209
12576	NC_020892	GCT	2	6	564949	564954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934209
12577	NC_020892	CAA	2	6	564974	564979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934209
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12579	NC_020892	CCG	2	6	565210	565215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934209
12580	NC_020892	GGC	2	6	565244	565249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934209
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12582	NC_020892	TAC	2	6	565350	565355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934209
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12584	NC_020892	CCG	2	6	565402	565407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934209
12585	NC_020892	GAGG	2	8	565434	565441	25 %	0 %	75 %	0 %	474934209
12586	NC_020892	CGT	2	6	565442	565447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934209
12587	NC_020892	GTG	3	9	565553	565561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934209
12588	NC_020892	CAT	2	6	565589	565594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934209
12589	NC_020892	CAC	2	6	565595	565600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934209
12590	NC_020892	ACC	2	6	565644	565649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934209
12591	NC_020892	ACC	2	6	565689	565694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934209
12592	NC_020892	CGG	2	6	565697	565702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934209
12593	NC_020892	CAT	2	6	565742	565747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934209
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12599	NC_020892	CGA	2	6	565880	565885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934209
12600	NC_020892	CGC	3	9	565889	565897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934209
12601	NC_020892	AAG	2	6	565902	565907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934209
12602	NC_020892	CAT	2	6	565925	565930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934209
12603	NC_020892	CGT	2	6	565952	565957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934209
12604	NC_020892	CAT	2	6	565961	565966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934209
12605	NC_020892	C	6	6	565967	565972	0 %	0 %	0 %	100 %	474934209
12606	NC_020892	GCC	2	6	566086	566091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12607	NC_020892	CG	3	6	566108	566113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12608	NC_020892	GTCC	2	8	566129	566136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_020892	TGCGGT	2	12	566137	566148	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12610	NC_020892	GCG	2	6	566149	566154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_020892	CTG	2	6	566174	566179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_020892	ACA	2	6	566306	566311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934210
12613	NC_020892	AT	3	6	566327	566332	50 %	50 %	0 %	0 %	474934210
12614	NC_020892	GCA	2	6	566335	566340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934210
12615	NC_020892	TCA	2	6	566450	566455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934210
12616	NC_020892	ACT	2	6	566456	566461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934210
12617	NC_020892	CCTC	2	8	566462	566469	0 %	25 %	0 %	75 %	474934210
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12619	NC_020892	TCA	2	6	566477	566482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934210
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12841	NC_020892	TA	3	6	576340	576345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12842	NC_020892	CAAAT	2	10	576346	576355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12963	NC_020892	GGA	2	6	582577	582582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12975	NC_020892	ACC	2	6	582848	582853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934227
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12977	NC_020892	CCA	2	6	582882	582887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934227
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12980	NC_020892	ATA	2	6	583076	583081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	474934227
12981	NC_020892	TCC	2	6	583113	583118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934227
12982	NC_020892	TTCC	2	8	583180	583187	0 %	50 %	0 %	50 %	474934227
12983	NC_020892	CCA	2	6	583257	583262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934227
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12999	NC_020892	ATG	2	6	584000	584005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934227
13000	NC_020892	TCTG	2	8	584118	584125	0 %	50 %	25 %	25 %	474934227

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