MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_020892	GAGTAC	2	12	539032	539043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	474934180
12003	NC_020892	GAG	2	6	539047	539052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934180
12004	NC_020892	GAG	2	6	539077	539082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934180
12005	NC_020892	GGA	2	6	539112	539117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934180
12006	NC_020892	GAT	2	6	539196	539201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_020892	GAC	2	6	539209	539214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934181
12008	NC_020892	GCG	2	6	539294	539299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934181
12009	NC_020892	CCA	2	6	539344	539349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934181
12010	NC_020892	CCG	2	6	539367	539372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934181
12011	NC_020892	GGGA	2	8	539409	539416	25 %	0 %	75 %	0 %	474934181
12012	NC_020892	ACT	2	6	539424	539429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934181
12013	NC_020892	C	6	6	539494	539499	0 %	0 %	0 %	100 %	474934181
12014	NC_020892	CAA	2	6	539518	539523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934181
12015	NC_020892	AGG	3	9	539615	539623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934181
12016	NC_020892	TGG	2	6	539625	539630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934181
12017	NC_020892	GTC	2	6	539742	539747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934182
12018	NC_020892	TCC	2	6	539863	539868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934182
12019	NC_020892	AGG	2	6	539912	539917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934182
12020	NC_020892	TTC	2	6	540012	540017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934182
12021	NC_020892	GA	3	6	540118	540123	50 %	0 %	50 %	0 %	474934182
12022	NC_020892	CGA	2	6	540153	540158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934182
12023	NC_020892	GGA	2	6	540177	540182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934182
12024	NC_020892	TCC	2	6	540211	540216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934182
12025	NC_020892	TA	3	6	540238	540243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_020892	AGA	2	6	540270	540275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934183
12027	NC_020892	CGA	3	9	540310	540318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934183
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12030	NC_020892	AAGG	2	8	540440	540447	50 %	0 %	50 %	0 %	474934183
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12052	NC_020892	TGG	2	6	540947	540952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934183
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12054	NC_020892	TCG	2	6	540981	540986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934183
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12068	NC_020892	GAAT	2	8	541815	541822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12100	NC_020892	GCG	2	6	543215	543220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934186
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12102	NC_020892	CGA	2	6	543255	543260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934186
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12118	NC_020892	ACG	3	9	544194	544202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934188
12119	NC_020892	TCC	2	6	544254	544259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934188
12120	NC_020892	TCC	2	6	544323	544328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934188
12121	NC_020892	CGT	2	6	544333	544338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934188
12122	NC_020892	CGA	2	6	544465	544470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934188
12123	NC_020892	TTC	2	6	544524	544529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934188
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12135	NC_020892	CTG	2	6	545553	545558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934190
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12234	NC_020892	CCT	3	9	550087	550095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934194
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12353	NC_020892	GAC	2	6	555218	555223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934200
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12356	NC_020892	TCA	2	6	555459	555464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12357	NC_020892	ATG	2	6	555533	555538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934201
12358	NC_020892	CTT	2	6	555607	555612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934201
12359	NC_020892	CCAGC	2	10	555690	555699	20 %	0 %	20 %	60 %	474934201
12360	NC_020892	C	6	6	555827	555832	0 %	0 %	0 %	100 %	474934201
12361	NC_020892	TTC	2	6	555833	555838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934201
12362	NC_020892	TCC	2	6	555884	555889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934201
12363	NC_020892	TTC	2	6	555902	555907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934201
12364	NC_020892	CTT	2	6	556024	556029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934201
12365	NC_020892	ATC	2	6	556103	556108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934201
12366	NC_020892	TGA	2	6	556164	556169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934201
12367	NC_020892	GAC	2	6	556267	556272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934201
12368	NC_020892	CCCT	2	8	556288	556295	0 %	25 %	0 %	75 %	474934201
12369	NC_020892	AGA	2	6	556298	556303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934201
12370	NC_020892	CCT	2	6	556314	556319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934201
12371	NC_020892	CGT	2	6	556347	556352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934201
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12375	NC_020892	TGT	2	6	556518	556523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934201
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12380	NC_020892	TGA	2	6	556698	556703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934201
12381	NC_020892	ATT	2	6	556830	556835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12382	NC_020892	CTAA	2	8	556840	556847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12383	NC_020892	GC	4	8	556850	556857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12384	NC_020892	T	6	6	556867	556872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12385	NC_020892	ATA	2	6	556873	556878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12386	NC_020892	AGATGG	2	12	556879	556890	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12387	NC_020892	TCA	2	6	556988	556993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934202
12388	NC_020892	AGG	2	6	557015	557020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934202
12389	NC_020892	AGC	2	6	557036	557041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934202
12390	NC_020892	CGA	2	6	557049	557054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934202
12391	NC_020892	AGGA	2	8	557125	557132	50 %	0 %	50 %	0 %	474934202
12392	NC_020892	ACA	3	9	557150	557158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934202
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12400	NC_020892	GGC	2	6	557536	557541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934203
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12427	NC_020892	CAC	2	6	558613	558618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934203
12428	NC_020892	CGGAG	2	10	558634	558643	20 %	0 %	60 %	20 %	474934203
12429	NC_020892	GAC	2	6	558650	558655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934203
12430	NC_020892	GCT	2	6	558732	558737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12431	NC_020892	A	7	7	558761	558767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12432	NC_020892	GCT	3	9	558827	558835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934204
12433	NC_020892	CCTG	2	8	558851	558858	0 %	25 %	25 %	50 %	474934204
12434	NC_020892	AGGGTC	2	12	558874	558885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	474934204
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12437	NC_020892	TTG	2	6	559036	559041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934204
12438	NC_020892	CGA	2	6	559067	559072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934204
12439	NC_020892	GGTC	2	8	559124	559131	0 %	25 %	50 %	25 %	474934204
12440	NC_020892	TGA	2	6	559136	559141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934204
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12442	NC_020892	CGA	2	6	559193	559198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934204
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12457	NC_020892	CAG	2	6	559722	559727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934204
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12459	NC_020892	GGA	2	6	559778	559783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934204
12460	NC_020892	C	6	6	559930	559935	0 %	0 %	0 %	100 %	474934204
12461	NC_020892	ATC	2	6	559945	559950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934204
12462	NC_020892	TCT	2	6	560036	560041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934204
12463	NC_020892	GAT	2	6	560079	560084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934204
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12465	NC_020892	GAGG	2	8	560160	560167	25 %	0 %	75 %	0 %	474934204
12466	NC_020892	GTC	2	6	560187	560192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934204
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12470	NC_020892	TCG	2	6	560494	560499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934205
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12472	NC_020892	CGT	2	6	560543	560548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934205
12473	NC_020892	TCT	2	6	560567	560572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934205
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12499	NC_020892	GAA	2	6	561581	561586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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