MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_020892	GTA	2	6	496738	496743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934137
11003	NC_020892	GCC	2	6	496790	496795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934137
11004	NC_020892	TCC	2	6	496805	496810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934137
11005	NC_020892	GGA	2	6	496851	496856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934137
11006	NC_020892	CGG	2	6	496878	496883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934137
11007	NC_020892	GTA	2	6	496885	496890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934137
11008	NC_020892	GTT	2	6	497017	497022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474934137
11009	NC_020892	ATGTT	2	10	497039	497048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_020892	AAT	2	6	497105	497110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_020892	ATGT	2	8	497122	497129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_020892	TGA	2	6	497133	497138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_020892	TA	3	6	497146	497151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_020892	GTATGT	2	12	497152	497163	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_020892	AGG	2	6	497206	497211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_020892	GC	3	6	497315	497320	0 %	0 %	50 %	50 %	474934138
11017	NC_020892	TCA	2	6	497323	497328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934138
11018	NC_020892	CGG	2	6	497408	497413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934138
11019	NC_020892	TCA	2	6	497425	497430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934138
11020	NC_020892	TCA	2	6	497443	497448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934138
11021	NC_020892	TCC	2	6	497488	497493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934138
11022	NC_020892	TCG	2	6	497542	497547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934138
11023	NC_020892	TCCA	2	8	497589	497596	25 %	25 %	0 %	50 %	474934138
11024	NC_020892	GGC	2	6	497636	497641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934138
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11029	NC_020892	GGC	2	6	498032	498037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934138
11030	NC_020892	AAG	2	6	498070	498075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934139
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11037	NC_020892	GCAT	2	8	498256	498263	25 %	25 %	25 %	25 %	474934139
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11042	NC_020892	CGGA	2	8	498484	498491	25 %	0 %	50 %	25 %	474934139
11043	NC_020892	CCT	2	6	498522	498527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934139
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11050	NC_020892	AGGG	2	8	498829	498836	25 %	0 %	75 %	0 %	474934139
11051	NC_020892	GTCC	2	8	498877	498884	0 %	25 %	25 %	50 %	474934139
11052	NC_020892	TCG	2	6	498893	498898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934139
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11056	NC_020892	GTC	2	6	498958	498963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934139
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11058	NC_020892	GAA	2	6	498996	499001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934139
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11065	NC_020892	GAT	2	6	499346	499351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934140
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11114	NC_020892	C	6	6	501317	501322	0 %	0 %	0 %	100 %	474934142
11115	NC_020892	CCA	2	6	501344	501349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934142
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11119	NC_020892	TGA	2	6	501476	501481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934142
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11124	NC_020892	TCG	2	6	501673	501678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934142
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11127	NC_020892	CAT	2	6	501786	501791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934142
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11230	NC_020892	GGCG	2	8	506391	506398	0 %	0 %	75 %	25 %	474934149
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11234	NC_020892	CCT	2	6	506601	506606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934149
11235	NC_020892	CCT	2	6	506673	506678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934149
11236	NC_020892	TCAC	2	8	506753	506760	25 %	25 %	0 %	50 %	474934150
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11238	NC_020892	TCT	2	6	506809	506814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934150
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11240	NC_020892	CTT	2	6	506885	506890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934150
11241	NC_020892	TGA	2	6	507085	507090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934150
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11253	NC_020892	TCA	2	6	507586	507591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934150
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11321	NC_020892	T	6	6	509958	509963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11323	NC_020892	TTA	2	6	509993	509998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11338	NC_020892	CCG	2	6	510751	510756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11339	NC_020892	GAC	2	6	510945	510950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934153
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11345	NC_020892	GAGACC	2	12	511107	511118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934153
11346	NC_020892	CAT	2	6	511145	511150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934153
11347	NC_020892	GA	3	6	511173	511178	50 %	0 %	50 %	0 %	474934153
11348	NC_020892	CGA	2	6	511220	511225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934153
11349	NC_020892	GAG	2	6	511262	511267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934153
11350	NC_020892	ATC	2	6	511290	511295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934153
11351	NC_020892	GAC	2	6	511374	511379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934153
11352	NC_020892	CGA	2	6	511427	511432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934153
11353	NC_020892	CGCC	2	8	511544	511551	0 %	0 %	25 %	75 %	474934154
11354	NC_020892	TTC	2	6	511552	511557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934154
11355	NC_020892	GAC	2	6	511635	511640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934154
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11357	NC_020892	ACG	3	9	511687	511695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934154
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11479	NC_020892	CGG	2	6	515721	515726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11480	NC_020892	CGG	2	6	515729	515734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11481	NC_020892	CAT	2	6	515759	515764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11482	NC_020892	TAA	3	9	515771	515779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11483	NC_020892	CG	3	6	515785	515790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11484	NC_020892	GTC	2	6	515842	515847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934160
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11498	NC_020892	CGA	2	6	516766	516771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11499	NC_020892	TAAA	2	8	516789	516796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_020892	ATC	2	6	516846	516851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934161

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