MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_020892	CGGG	2	8	362609	362616	0 %	0 %	75 %	25 %	474933999
8003	NC_020892	GGA	2	6	362621	362626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933999
8004	NC_020892	CCT	2	6	362627	362632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933999
8005	NC_020892	GGA	2	6	362633	362638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933999
8006	NC_020892	CTT	2	6	362664	362669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933999
8007	NC_020892	AGT	2	6	362672	362677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933999
8008	NC_020892	GAA	2	6	362706	362711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933999
8009	NC_020892	TCG	2	6	362737	362742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933999
8010	NC_020892	CGG	2	6	362789	362794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933999
8011	NC_020892	GGT	2	6	362841	362846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933999
8012	NC_020892	GAA	2	6	362916	362921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933999
8013	NC_020892	ATG	2	6	362960	362965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_020892	TCCC	2	8	362988	362995	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8015	NC_020892	TAAA	2	8	362996	363003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020892	AGG	2	6	363016	363021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_020892	CTT	3	9	363086	363094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934000
8018	NC_020892	ATG	2	6	363144	363149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934000
8019	NC_020892	GTC	2	6	363155	363160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934000
8020	NC_020892	GAG	2	6	363161	363166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934000
8021	NC_020892	GGA	2	6	363209	363214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934000
8022	NC_020892	AGA	2	6	363317	363322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474934000
8023	NC_020892	GGA	2	6	363443	363448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934000
8024	NC_020892	AGG	2	6	363462	363467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934000
8025	NC_020892	CG	3	6	363479	363484	0 %	0 %	50 %	50 %	474934000
8026	NC_020892	TCA	2	6	363502	363507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934000
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8028	NC_020892	CTT	2	6	363644	363649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474934000
8029	NC_020892	ATC	2	6	363687	363692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934000
8030	NC_020892	CCT	2	6	363791	363796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934000
8031	NC_020892	TCG	2	6	363840	363845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934000
8032	NC_020892	TGG	2	6	363925	363930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934000
8033	NC_020892	CCG	2	6	364075	364080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_020892	TGC	2	6	364129	364134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934001
8035	NC_020892	AGT	2	6	364153	364158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474934001
8036	NC_020892	GC	3	6	364199	364204	0 %	0 %	50 %	50 %	474934001
8037	NC_020892	AAGG	2	8	364287	364294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_020892	TAT	2	6	364336	364341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_020892	AAGAA	2	10	364348	364357	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_020892	GAC	2	6	364389	364394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_020892	CCG	2	6	364448	364453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474934002
8042	NC_020892	AGGG	2	8	364527	364534	25 %	0 %	75 %	0 %	474934002
8043	NC_020892	TCG	2	6	364597	364602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934002
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8045	NC_020892	AGCGC	2	10	364621	364630	20 %	0 %	40 %	40 %	474934002
8046	NC_020892	GGA	2	6	364645	364650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934002
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8049	NC_020892	TA	4	8	364936	364943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_020892	GCG	2	6	364974	364979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_020892	GA	3	6	365012	365017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_020892	AG	4	8	365057	365064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020892	TGA	2	6	365077	365082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8055	NC_020892	TGA	2	6	365170	365175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_020892	AAG	2	6	365213	365218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_020892	CGA	2	6	365228	365233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8059	NC_020892	AGA	2	6	365488	365493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_020892	GTA	3	9	365602	365610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8062	NC_020892	GCT	2	6	365894	365899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_020892	GGA	2	6	365922	365927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020892	TCGA	2	8	366037	366044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8065	NC_020892	AGGG	2	8	366080	366087	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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8070	NC_020892	GAGT	2	8	366459	366466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_020892	AGC	2	6	366467	366472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_020892	CGC	2	6	366495	366500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_020892	GAA	2	6	366684	366689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_020892	ATG	2	6	366717	366722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_020892	TC	3	6	367311	367316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_020892	AGGT	2	8	367448	367455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_020892	TGG	2	6	367673	367678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8088	NC_020892	TGT	2	6	367844	367849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_020892	AGGC	2	8	367856	367863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8090	NC_020892	T	7	7	368084	368090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_020892	CTTT	2	8	368138	368145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8098	NC_020892	CAA	2	6	368690	368695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474934003
8099	NC_020892	CGG	2	6	368744	368749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934003
8100	NC_020892	TGG	2	6	368776	368781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474934003
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8108	NC_020892	ACC	2	6	369165	369170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934004
8109	NC_020892	GC	3	6	369193	369198	0 %	0 %	50 %	50 %	474934004
8110	NC_020892	CCA	2	6	369333	369338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934004
8111	NC_020892	ATC	2	6	369368	369373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474934004
8112	NC_020892	GAG	2	6	369392	369397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934004
8113	NC_020892	GAG	2	6	369404	369409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474934004
8114	NC_020892	TCC	2	6	369411	369416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474934004
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8121	NC_020892	AGGG	2	8	369853	369860	25 %	0 %	75 %	0 %	474934005
8122	NC_020892	CCA	2	6	369888	369893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474934005
8123	NC_020892	TCCC	2	8	369929	369936	0 %	25 %	0 %	75 %	474934005
8124	NC_020892	GCG	2	6	369944	369949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934005
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8126	NC_020892	ACG	2	6	370064	370069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474934005
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8489	NC_020892	CGG	2	6	388020	388025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474934018
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8491	NC_020892	TCG	2	6	388172	388177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474934018
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