MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01

Total Repeats: 3156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019956	T	7	7	8	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019956	TAAAA	2	10	16	25	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019956	GAG	2	6	26	31	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019956	TAT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653607
5	NC_019956	GAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
6	NC_019956	AAT	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653607
7	NC_019956	AAG	2	6	162	167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
8	NC_019956	A	7	7	183	189	100 %	0 %	0 %	0 %	433653607
9	NC_019956	AT	3	6	235	240	50 %	50 %	0 %	0 %	433653607
10	NC_019956	A	7	7	340	346	100 %	0 %	0 %	0 %	433653607
11	NC_019956	TGC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653607
12	NC_019956	CATA	2	8	423	430	50 %	25 %	0 %	25 %	433653607
13	NC_019956	GAAA	2	8	556	563	75 %	0 %	25 %	0 %	433653607
14	NC_019956	A	6	6	613	618	100 %	0 %	0 %	0 %	433653607
15	NC_019956	GGCGT	2	10	642	651	0 %	20 %	60 %	20 %	433653607
16	NC_019956	AGA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
17	NC_019956	TAA	2	6	709	714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653607
18	NC_019956	ATAA	2	8	743	750	75 %	25 %	0 %	0 %	433653607
19	NC_019956	TA	3	6	785	790	50 %	50 %	0 %	0 %	433653607
20	NC_019956	ATT	2	6	796	801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653607
21	NC_019956	TTA	2	6	845	850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653607
22	NC_019956	GGTA	2	8	859	866	25 %	25 %	50 %	0 %	433653607
23	NC_019956	CTG	2	6	897	902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653607
24	NC_019956	AGT	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653607
25	NC_019956	TAC	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653607
26	NC_019956	GAAT	2	8	955	962	50 %	25 %	25 %	0 %	433653607
27	NC_019956	GAA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
28	NC_019956	AGA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
29	NC_019956	CTA	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653607
30	NC_019956	ATA	3	9	1109	1117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653607
31	NC_019956	AGA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
32	NC_019956	A	6	6	1180	1185	100 %	0 %	0 %	0 %	433653607
33	NC_019956	AAG	2	6	1218	1223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653607
34	NC_019956	CTTTAA	2	12	1276	1287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433653607
35	NC_019956	ATTT	2	8	1304	1311	25 %	75 %	0 %	0 %	433653607
36	NC_019956	ATA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653607
37	NC_019956	AG	3	6	1414	1419	50 %	0 %	50 %	0 %	433653607
38	NC_019956	A	6	6	1475	1480	100 %	0 %	0 %	0 %	433653607
39	NC_019956	TAAT	2	8	1494	1501	50 %	50 %	0 %	0 %	433653607
40	NC_019956	TGAT	2	8	1509	1516	25 %	50 %	25 %	0 %	433653607
41	NC_019956	TTA	2	6	1521	1526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653607
42	NC_019956	A	6	6	1557	1562	100 %	0 %	0 %	0 %	433653607
43	NC_019956	ATA	2	6	1565	1570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653607
44	NC_019956	TA	3	6	1604	1609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019956	TTA	2	6	1637	1642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653608
46	NC_019956	AAT	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653608
47	NC_019956	ATA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653608
48	NC_019956	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653608
49	NC_019956	TAT	2	6	1710	1715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653608
50	NC_019956	AAT	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653608
51	NC_019956	TAA	3	9	1755	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653608
52	NC_019956	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	433653608
53	NC_019956	TA	3	6	1801	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	433653608
54	NC_019956	T	7	7	1833	1839	0 %	100 %	0 %	0 %	433653608
55	NC_019956	TGA	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653608
56	NC_019956	TAA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653608
57	NC_019956	A	6	6	1891	1896	100 %	0 %	0 %	0 %	433653608
58	NC_019956	A	6	6	1916	1921	100 %	0 %	0 %	0 %	433653608
59	NC_019956	A	6	6	1928	1933	100 %	0 %	0 %	0 %	433653608
60	NC_019956	CTTT	2	8	1967	1974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019956	ATTT	2	8	1975	1982	25 %	75 %	0 %	0 %	433653609
62	NC_019956	TTAT	2	8	1993	2000	25 %	75 %	0 %	0 %	433653609
63	NC_019956	AT	3	6	2014	2019	50 %	50 %	0 %	0 %	433653609
64	NC_019956	AAC	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653609
65	NC_019956	TTA	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653609
66	NC_019956	ATA	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653609
67	NC_019956	TCT	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653609
68	NC_019956	CTTTT	2	10	2178	2187	0 %	80 %	0 %	20 %	433653609
69	NC_019956	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	433653609
70	NC_019956	ATC	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019956	CTAT	2	8	2256	2263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019956	AATA	2	8	2272	2279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019956	TAA	3	9	2287	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019956	ATA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019956	A	7	7	2301	2307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019956	ACT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
77	NC_019956	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653610
78	NC_019956	ATG	3	9	2568	2576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
79	NC_019956	GTA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
80	NC_019956	CTG	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653610
81	NC_019956	CGT	2	6	2811	2816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653610
82	NC_019956	ATC	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
83	NC_019956	TA	4	8	2869	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
84	NC_019956	TGT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653610
85	NC_019956	GCTGT	2	10	2925	2934	0 %	40 %	40 %	20 %	433653610
86	NC_019956	TCAT	2	8	2948	2955	25 %	50 %	0 %	25 %	433653610
87	NC_019956	TTG	2	6	3063	3068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653610
88	NC_019956	TTG	2	6	3108	3113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653610
89	NC_019956	TCC	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433653610
90	NC_019956	ATAG	2	8	3176	3183	50 %	25 %	25 %	0 %	433653610
91	NC_019956	CAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
92	NC_019956	ATG	2	6	3231	3236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
93	NC_019956	TGGT	2	8	3240	3247	0 %	50 %	50 %	0 %	433653610
94	NC_019956	TGTC	2	8	3255	3262	0 %	50 %	25 %	25 %	433653610
95	NC_019956	TAA	2	6	3341	3346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653610
96	NC_019956	AAGT	2	8	3385	3392	50 %	25 %	25 %	0 %	433653610
97	NC_019956	TCA	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
98	NC_019956	TCC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433653610
99	NC_019956	ACC	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433653610
100	NC_019956	ATT	2	6	3454	3459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
101	NC_019956	ACT	2	6	3460	3465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
102	NC_019956	TAC	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
103	NC_019956	TGA	2	6	3496	3501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
104	NC_019956	ATG	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
105	NC_019956	GTTA	2	8	3616	3623	25 %	50 %	25 %	0 %	433653610
106	NC_019956	AAGTTA	2	12	3633	3644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	433653610
107	NC_019956	AC	3	6	3732	3737	50 %	0 %	0 %	50 %	433653610
108	NC_019956	CTG	2	6	3746	3751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653610
109	NC_019956	AT	4	8	3760	3767	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
110	NC_019956	TAA	2	6	3803	3808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653610
111	NC_019956	ATA	2	6	3823	3828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653610
112	NC_019956	CCGT	2	8	3881	3888	0 %	25 %	25 %	50 %	433653610
113	NC_019956	CTT	2	6	3890	3895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653610
114	NC_019956	ATT	3	9	3946	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
115	NC_019956	ATT	2	6	3958	3963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
116	NC_019956	TA	3	6	3977	3982	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
117	NC_019956	TA	4	8	3993	4000	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
118	NC_019956	GTA	2	6	4085	4090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
119	NC_019956	TAAA	2	8	4102	4109	75 %	25 %	0 %	0 %	433653610
120	NC_019956	GTA	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
121	NC_019956	AAC	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653610
122	NC_019956	CAC	2	6	4233	4238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433653610
123	NC_019956	TTG	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653610
124	NC_019956	CAT	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
125	NC_019956	ATT	2	6	4291	4296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
126	NC_019956	ATT	2	6	4315	4320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
127	NC_019956	TAA	2	6	4344	4349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653610
128	NC_019956	GTA	2	6	4355	4360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
129	NC_019956	TTA	2	6	4361	4366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
130	NC_019956	ATTA	2	8	4402	4409	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
131	NC_019956	GAT	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
132	NC_019956	AT	3	6	4435	4440	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
133	NC_019956	ATT	2	6	4510	4515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
134	NC_019956	GAC	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433653610
135	NC_019956	GTA	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653610
136	NC_019956	TAT	2	6	4587	4592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
137	NC_019956	CTA	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653610
138	NC_019956	ATT	3	9	4684	4692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653610
139	NC_019956	AATTA	2	10	4699	4708	60 %	40 %	0 %	0 %	433653610
140	NC_019956	AT	3	6	4724	4729	50 %	50 %	0 %	0 %	433653610
141	NC_019956	ATCCA	2	10	4756	4765	40 %	20 %	0 %	40 %	433653610
142	NC_019956	CTT	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653610
143	NC_019956	ACC	3	9	4831	4839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433653610
144	NC_019956	CAG	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433653610
145	NC_019956	ATA	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653610
146	NC_019956	AAC	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653611
147	NC_019956	TAT	2	6	4940	4945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653611
148	NC_019956	TTCT	2	8	4946	4953	0 %	75 %	0 %	25 %	433653611
149	NC_019956	ATC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653611
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151	NC_019956	CTA	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653611
152	NC_019956	A	6	6	5030	5035	100 %	0 %	0 %	0 %	433653611
153	NC_019956	ACC	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433653611
154	NC_019956	A	6	6	5129	5134	100 %	0 %	0 %	0 %	433653611
155	NC_019956	CTTTT	2	10	5163	5172	0 %	80 %	0 %	20 %	433653611
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157	NC_019956	CT	3	6	5255	5260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_019956	AAC	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019956	TATT	2	8	5337	5344	25 %	75 %	0 %	0 %	433653612
160	NC_019956	T	7	7	5367	5373	0 %	100 %	0 %	0 %	433653612
161	NC_019956	ATC	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653612
162	NC_019956	TTA	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653612
163	NC_019956	ATT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653612
164	NC_019956	TAC	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653612
165	NC_019956	TA	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	433653612
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169	NC_019956	GATC	2	8	5721	5728	25 %	25 %	25 %	25 %	433653612
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171	NC_019956	TAC	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_019956	TAA	2	6	5906	5911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653613
173	NC_019956	ACATC	2	10	5913	5922	40 %	20 %	0 %	40 %	433653613
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175	NC_019956	CTTTT	2	10	6031	6040	0 %	80 %	0 %	20 %	433653613
176	NC_019956	T	6	6	6037	6042	0 %	100 %	0 %	0 %	433653613
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179	NC_019956	CTT	2	6	6103	6108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653613
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183	NC_019956	TCCT	2	8	6266	6273	0 %	50 %	0 %	50 %	433653614
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185	NC_019956	T	7	7	6303	6309	0 %	100 %	0 %	0 %	433653614
186	NC_019956	ATA	2	6	6355	6360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653614
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189	NC_019956	ATT	2	6	6484	6489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653614
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195	NC_019956	AT	3	6	6779	6784	50 %	50 %	0 %	0 %	433653614
196	NC_019956	A	6	6	6827	6832	100 %	0 %	0 %	0 %	433653615
197	NC_019956	CAT	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653615
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199	NC_019956	AGA	2	6	6930	6935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433653615
200	NC_019956	ACC	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433653615
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232	NC_019956	TA	3	6	8544	8549	50 %	50 %	0 %	0 %	433653616
233	NC_019956	A	6	6	8573	8578	100 %	0 %	0 %	0 %	433653616
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236	NC_019956	CTC	2	6	8675	8680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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238	NC_019956	AT	3	6	8698	8703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_019956	A	6	6	8704	8709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_019956	T	6	6	8711	8716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_019956	CAG	2	6	8962	8967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_019956	A	6	6	9078	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_019956	AAT	2	6	9091	9096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_019956	T	6	6	9221	9226	0 %	100 %	0 %	0 %	433653617
246	NC_019956	GTA	2	6	9246	9251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653617
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254	NC_019956	ATT	2	6	9453	9458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653617
255	NC_019956	TAT	2	6	9475	9480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653617
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259	NC_019956	TGA	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653617
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261	NC_019956	AAT	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653617
262	NC_019956	ATT	2	6	9752	9757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653617
263	NC_019956	AATT	2	8	9820	9827	50 %	50 %	0 %	0 %	433653617
264	NC_019956	TGATT	2	10	9829	9838	20 %	60 %	20 %	0 %	433653617
265	NC_019956	ATT	2	6	9873	9878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653617
266	NC_019956	ATAAA	2	10	9886	9895	80 %	20 %	0 %	0 %	433653617
267	NC_019956	AT	3	6	9912	9917	50 %	50 %	0 %	0 %	433653617
268	NC_019956	T	6	6	9917	9922	0 %	100 %	0 %	0 %	433653617
269	NC_019956	TTTTC	2	10	9925	9934	0 %	80 %	0 %	20 %	433653617
270	NC_019956	TAT	2	6	9949	9954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019956	TC	3	6	9960	9965	0 %	50 %	0 %	50 %	433653618
272	NC_019956	T	6	6	10007	10012	0 %	100 %	0 %	0 %	433653618
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274	NC_019956	AAT	2	6	10124	10129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653618
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401	NC_019956	TTAT	2	8	14609	14616	25 %	75 %	0 %	0 %	433653627
402	NC_019956	AT	3	6	14615	14620	50 %	50 %	0 %	0 %	433653627
403	NC_019956	TA	5	10	14682	14691	50 %	50 %	0 %	0 %	433653627
404	NC_019956	CTATTG	2	12	14714	14725	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433653627
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