MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 61487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_019954	CGG	2	6	516104	516109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	555077253
11003	NC_019954	CACG	2	8	516194	516201	25 %	0 %	25 %	50 %	555077253
11004	NC_019954	TA	3	6	516210	516215	50 %	50 %	0 %	0 %	555077253
11005	NC_019954	CCTA	2	8	516303	516310	25 %	25 %	0 %	50 %	555077253
11006	NC_019954	CCG	2	6	516361	516366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	555077253
11007	NC_019954	ATT	2	6	516409	516414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077253
11008	NC_019954	T	6	6	516413	516418	0 %	100 %	0 %	0 %	555077253
11009	NC_019954	ATT	2	6	516525	516530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077253
11010	NC_019954	TGC	2	6	516558	516563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077253
11011	NC_019954	TAATT	2	10	516567	516576	40 %	60 %	0 %	0 %	555077253
11012	NC_019954	CTT	2	6	516590	516595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077253
11013	NC_019954	CCT	2	6	516637	516642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	555077253
11014	NC_019954	T	8	8	516661	516668	0 %	100 %	0 %	0 %	555077253
11015	NC_019954	ATA	2	6	516690	516695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_019954	TAAA	2	8	516700	516707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_019954	T	6	6	516720	516725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_019954	TCA	2	6	516777	516782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_019954	TCCCT	2	10	516821	516830	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11020	NC_019954	CTT	2	6	516831	516836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_019954	AT	3	6	516858	516863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_019954	ATATTT	2	12	516900	516911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_019954	TAAA	2	8	517014	517021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_019954	TTG	3	9	517032	517040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_019954	CTT	2	6	517045	517050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_019954	GAG	2	6	517090	517095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_019954	T	6	6	517123	517128	0 %	100 %	0 %	0 %	438001444
11028	NC_019954	TTGTT	2	10	517164	517173	0 %	80 %	20 %	0 %	438001444
11029	NC_019954	TGG	2	6	517191	517196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	438001444
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11031	NC_019954	TGG	2	6	517249	517254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	438001444
11032	NC_019954	G	6	6	517312	517317	0 %	0 %	100 %	0 %	438001444
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11034	NC_019954	GCA	2	6	517481	517486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438001444
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11036	NC_019954	TAT	2	6	517528	517533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438001444
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11038	NC_019954	TTTC	2	8	517565	517572	0 %	75 %	0 %	25 %	438001444
11039	NC_019954	T	6	6	517583	517588	0 %	100 %	0 %	0 %	438001444
11040	NC_019954	TAAAA	2	10	517734	517743	80 %	20 %	0 %	0 %	438001444
11041	NC_019954	A	6	6	517740	517745	100 %	0 %	0 %	0 %	438001444
11042	NC_019954	T	6	6	517746	517751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_019954	ATT	2	6	517765	517770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_019954	A	7	7	517776	517782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_019954	ATGAT	2	10	517792	517801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_019954	T	7	7	517811	517817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_019954	TTC	2	6	518013	518018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438001445
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11049	NC_019954	A	7	7	518175	518181	100 %	0 %	0 %	0 %	438001445
11050	NC_019954	ATC	2	6	518190	518195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	438001445
11051	NC_019954	A	6	6	518214	518219	100 %	0 %	0 %	0 %	438001445
11052	NC_019954	CGC	2	6	518239	518244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	438001445
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11054	NC_019954	TCC	2	6	518281	518286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_019954	TTTAAA	2	12	518353	518364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_019954	A	7	7	518362	518368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_019954	TA	5	10	518398	518407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_019954	ATT	2	6	518432	518437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_019954	ATT	2	6	518502	518507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077254
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11061	NC_019954	A	7	7	518522	518528	100 %	0 %	0 %	0 %	555077254
11062	NC_019954	AAGG	2	8	518537	518544	50 %	0 %	50 %	0 %	555077254
11063	NC_019954	ATT	2	6	518602	518607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077254
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11073	NC_019954	GCT	2	6	519073	519078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077255
11074	NC_019954	TAT	2	6	519117	519122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077255
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11077	NC_019954	GCT	2	6	519442	519447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077255
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11081	NC_019954	AGC	2	6	519669	519674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077255
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11092	NC_019954	GTT	2	6	520185	520190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	555077255
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11096	NC_019954	GCA	3	9	520297	520305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077255
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11104	NC_019954	GAAA	2	8	520800	520807	75 %	0 %	25 %	0 %	555077256
11105	NC_019954	A	6	6	520805	520810	100 %	0 %	0 %	0 %	555077256
11106	NC_019954	TCT	2	6	520871	520876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	555077256
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11109	NC_019954	TGG	2	6	521242	521247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	555077256
11110	NC_019954	AT	3	6	521251	521256	50 %	50 %	0 %	0 %	555077256
11111	NC_019954	ATT	2	6	521273	521278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077256
11112	NC_019954	GA	3	6	521471	521476	50 %	0 %	50 %	0 %	555077256
11113	NC_019954	TA	3	6	521559	521564	50 %	50 %	0 %	0 %	555077256
11114	NC_019954	T	6	6	521596	521601	0 %	100 %	0 %	0 %	555077256
11115	NC_019954	AT	4	8	521648	521655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_019954	TTG	2	6	521724	521729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	438001449
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11119	NC_019954	TA	3	6	521823	521828	50 %	50 %	0 %	0 %	438001449
11120	NC_019954	GATAAG	2	12	521845	521856	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	438001449
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11123	NC_019954	TCGGA	2	10	522031	522040	20 %	20 %	40 %	20 %	555077257
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11125	NC_019954	AAAT	2	8	522086	522093	75 %	25 %	0 %	0 %	555077257
11126	NC_019954	TTA	2	6	522106	522111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077257
11127	NC_019954	TGC	2	6	522113	522118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077257
11128	NC_019954	CA	3	6	522152	522157	50 %	0 %	0 %	50 %	555077257
11129	NC_019954	AAAAG	2	10	522245	522254	80 %	0 %	20 %	0 %	555077257
11130	NC_019954	A	6	6	522282	522287	100 %	0 %	0 %	0 %	555077257
11131	NC_019954	AAG	2	6	522340	522345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_019954	TTA	2	6	522380	522385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_019954	TTAAA	2	10	522456	522465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_019954	A	7	7	522478	522484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11135	NC_019954	GGA	2	6	522485	522490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11136	NC_019954	ATT	2	6	522500	522505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11137	NC_019954	AT	3	6	522510	522515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11138	NC_019954	AAAGAC	2	12	522561	522572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	555077258
11139	NC_019954	T	6	6	522583	522588	0 %	100 %	0 %	0 %	555077258
11140	NC_019954	ATG	2	6	522598	522603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077258
11141	NC_019954	ATG	2	6	522616	522621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077258
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11157	NC_019954	A	6	6	523704	523709	100 %	0 %	0 %	0 %	555077258
11158	NC_019954	CGA	2	6	523748	523753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077258
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11160	NC_019954	TGC	2	6	523797	523802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001453
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11162	NC_019954	CTG	2	6	524055	524060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001453
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11165	NC_019954	CA	3	6	524227	524232	50 %	0 %	0 %	50 %	438001453
11166	NC_019954	TGAAAT	2	12	524233	524244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	438001453
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11174	NC_019954	TGC	2	6	524488	524493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001453
11175	NC_019954	GGA	3	9	524526	524534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11176	NC_019954	AT	4	8	524546	524553	50 %	50 %	0 %	0 %	438001454
11177	NC_019954	AAAT	2	8	524598	524605	75 %	25 %	0 %	0 %	438001454
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11190	NC_019954	CTG	3	9	525081	525089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001454
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11194	NC_019954	AGG	2	6	525364	525369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11200	NC_019954	TAT	3	9	525753	525761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	438001455
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11212	NC_019954	TAT	2	6	526568	526573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11213	NC_019954	ATA	2	6	526584	526589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11214	NC_019954	AAT	2	6	526598	526603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11215	NC_019954	A	6	6	526653	526658	100 %	0 %	0 %	0 %	438001456
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11231	NC_019954	A	6	6	527197	527202	100 %	0 %	0 %	0 %	555077259
11232	NC_019954	GCT	2	6	527525	527530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077259
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11235	NC_019954	TCA	2	6	527673	527678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077259
11236	NC_019954	AGC	4	12	527681	527692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077259
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11238	NC_019954	TA	3	6	527748	527753	50 %	50 %	0 %	0 %	555077259
11239	NC_019954	GAG	2	6	527769	527774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077259
11240	NC_019954	GAG	2	6	527781	527786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	555077259
11241	NC_019954	CAT	2	6	527787	527792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077259
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11243	NC_019954	GAT	2	6	527848	527853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077260
11244	NC_019954	GTA	2	6	527947	527952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077260
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11246	NC_019954	GCT	2	6	528063	528068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	555077260
11247	NC_019954	GCA	2	6	528085	528090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077260
11248	NC_019954	TA	3	6	528142	528147	50 %	50 %	0 %	0 %	555077260
11249	NC_019954	CGA	2	6	528193	528198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	555077260
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11251	NC_019954	TCC	2	6	528271	528276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	555077261
11252	NC_019954	ATA	2	6	528344	528349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	555077261
11253	NC_019954	AAC	2	6	528400	528405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	555077261
11254	NC_019954	TAT	2	6	528474	528479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	555077261
11255	NC_019954	T	6	6	528542	528547	0 %	100 %	0 %	0 %	555077261
11256	NC_019954	GGAA	2	8	528590	528597	50 %	0 %	50 %	0 %	555077261
11257	NC_019954	AATT	2	8	528681	528688	50 %	50 %	0 %	0 %	555077261
11258	NC_019954	TCTAC	2	10	528707	528716	20 %	40 %	0 %	40 %	555077261
11259	NC_019954	TTA	2	6	528736	528741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11260	NC_019954	AAAT	2	8	528746	528753	75 %	25 %	0 %	0 %	438001460
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11267	NC_019954	GCTG	2	8	529025	529032	0 %	25 %	50 %	25 %	438001460
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11290	NC_019954	T	7	7	530061	530067	0 %	100 %	0 %	0 %	555077262
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11294	NC_019954	AT	3	6	530229	530234	50 %	50 %	0 %	0 %	555077262
11295	NC_019954	GAT	2	6	530238	530243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077262
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11300	NC_019954	CAT	3	9	530349	530357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	555077262
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11312	NC_019954	AGT	2	6	530922	530927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	555077262
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11328	NC_019954	ACC	2	6	531718	531723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11329	NC_019954	TAT	2	6	531872	531877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11330	NC_019954	A	6	6	531912	531917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11331	NC_019954	AT	4	8	531940	531947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11332	NC_019954	A	6	6	531962	531967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11333	NC_019954	AAG	2	6	531970	531975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11351	NC_019954	A	7	7	532679	532685	100 %	0 %	0 %	0 %	438001463
11352	NC_019954	AAAT	3	12	532759	532770	75 %	25 %	0 %	0 %	438001463
11353	NC_019954	CCGG	2	8	532782	532789	0 %	0 %	50 %	50 %	438001463
11354	NC_019954	CA	3	6	532838	532843	50 %	0 %	0 %	50 %	438001463
11355	NC_019954	GCA	2	6	532884	532889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	438001463
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11357	NC_019954	GAG	2	6	532917	532922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11358	NC_019954	A	6	6	532935	532940	100 %	0 %	0 %	0 %	438001464
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11361	NC_019954	TA	3	6	533110	533115	50 %	50 %	0 %	0 %	438001464
11362	NC_019954	CCAGCA	2	12	533126	533137	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	438001464
11363	NC_019954	TTG	2	6	533207	533212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	438001464
11364	NC_019954	TAAT	2	8	533262	533269	50 %	50 %	0 %	0 %	438001464
11365	NC_019954	A	6	6	533342	533347	100 %	0 %	0 %	0 %	438001464
11366	NC_019954	CATA	2	8	533386	533393	50 %	25 %	0 %	25 %	438001464
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11493	NC_019954	TTC	2	6	539545	539550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	438001470
11494	NC_019954	CTG	2	6	539633	539638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	438001470
11495	NC_019954	TGTACA	2	12	539682	539693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	438001470
11496	NC_019954	ATAG	2	8	539827	539834	50 %	25 %	25 %	0 %	438001470
11497	NC_019954	T	7	7	539847	539853	0 %	100 %	0 %	0 %	438001470
11498	NC_019954	ACTAAA	2	12	539939	539950	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	438001470
11499	NC_019954	ATA	2	6	539952	539957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	438001470
11500	NC_019954	T	6	6	539959	539964	0 %	100 %	0 %	0 %	438001470

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