MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_019902	TGC	2	6	91834	91839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
2004	NC_019902	CTC	2	6	91841	91846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759444
2005	NC_019902	GCG	2	6	91915	91920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759444
2006	NC_019902	ATG	2	6	91995	92000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759444
2007	NC_019902	CGAGC	2	10	92060	92069	20 %	0 %	40 %	40 %	430759444
2008	NC_019902	CG	3	6	92152	92157	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
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2011	NC_019902	TGC	2	6	92200	92205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759444
2012	NC_019902	GC	3	6	92252	92257	0 %	0 %	50 %	50 %	430759444
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2022	NC_019902	GC	3	6	92691	92696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2036	NC_019902	CGGG	2	8	93253	93260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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2061	NC_019902	GCAA	2	8	94404	94411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2128	NC_019902	TGCG	2	8	97950	97957	0 %	25 %	50 %	25 %	430759448
2129	NC_019902	GGA	2	6	98010	98015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759449
2130	NC_019902	CGTC	2	8	98017	98024	0 %	25 %	25 %	50 %	430759449
2131	NC_019902	GCC	2	6	98067	98072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759449
2132	NC_019902	GTG	2	6	98093	98098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759449
2133	NC_019902	CTG	2	6	98106	98111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759449
2134	NC_019902	GGT	2	6	98172	98177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759449
2135	NC_019902	G	6	6	98302	98307	0 %	0 %	100 %	0 %	430759449
2136	NC_019902	GTGCG	2	10	98345	98354	0 %	20 %	60 %	20 %	430759449
2137	NC_019902	GC	3	6	98364	98369	0 %	0 %	50 %	50 %	430759449
2138	NC_019902	AG	3	6	98413	98418	50 %	0 %	50 %	0 %	430759449
2139	NC_019902	ACG	2	6	98440	98445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759449
2140	NC_019902	CAA	2	6	98454	98459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759449
2141	NC_019902	CAGCT	2	10	98473	98482	20 %	20 %	20 %	40 %	430759449
2142	NC_019902	AAG	2	6	98524	98529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759449
2143	NC_019902	GCC	2	6	98618	98623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2144	NC_019902	GCC	2	6	98625	98630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2145	NC_019902	GTC	2	6	98854	98859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2146	NC_019902	CGA	2	6	98895	98900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2147	NC_019902	GAC	2	6	98926	98931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2148	NC_019902	CCCG	2	8	98967	98974	0 %	0 %	25 %	75 %	430759451
2149	NC_019902	CGA	2	6	98979	98984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2150	NC_019902	TGC	2	6	99021	99026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2151	NC_019902	CCTGGC	2	12	99079	99090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430759451
2152	NC_019902	AGC	2	6	99109	99114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2153	NC_019902	CG	3	6	99128	99133	0 %	0 %	50 %	50 %	430759451
2154	NC_019902	TCC	2	6	99147	99152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759451
2155	NC_019902	GC	3	6	99179	99184	0 %	0 %	50 %	50 %	430759451
2156	NC_019902	GGTG	2	8	99201	99208	0 %	25 %	75 %	0 %	430759451
2157	NC_019902	CTG	2	6	99220	99225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2158	NC_019902	GAC	2	6	99226	99231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2159	NC_019902	ACCGAC	2	12	99280	99291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2160	NC_019902	ACCGAT	2	12	99346	99357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2161	NC_019902	ACCGAT	2	12	99364	99375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2162	NC_019902	GACACG	2	12	99397	99408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2163	NC_019902	GATACC	7	42	99421	99462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2164	NC_019902	GATACC	3	18	99529	99546	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2165	NC_019902	GATACC	6	36	99548	99583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2166	NC_019902	GATACC	7	42	99674	99715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2167	NC_019902	ACCGAT	3	18	99725	99742	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2168	NC_019902	GACACC	2	12	99926	99937	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2169	NC_019902	GATACC	2	12	99944	99955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2170	NC_019902	GATACC	2	12	100040	100051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2171	NC_019902	GGACAC	2	12	100052	100063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2172	NC_019902	ACCGAT	2	12	100074	100085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2173	NC_019902	ACCGAC	2	12	100104	100115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2174	NC_019902	GCCC	2	8	100222	100229	0 %	0 %	25 %	75 %	430759451
2175	NC_019902	GATACC	2	12	100239	100250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2176	NC_019902	GACACG	3	18	100377	100394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2177	NC_019902	GACACC	3	18	100395	100412	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2178	NC_019902	ACCGAT	9	54	100422	100475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2179	NC_019902	ACCGAT	2	12	100488	100499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2180	NC_019902	ACGGAT	5	30	100674	100703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430759451
2181	NC_019902	ACCGAT	2	12	100704	100715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2182	NC_019902	GACACC	2	12	100851	100862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2183	NC_019902	GATACC	2	12	100869	100880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2184	NC_019902	ACGGAC	2	12	100986	100997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2185	NC_019902	ACCGAT	2	12	100998	101009	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2186	NC_019902	ACCGAC	2	12	101028	101039	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2187	NC_019902	GACACG	2	12	101181	101192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2188	NC_019902	GATACC	2	12	101193	101204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2189	NC_019902	GACACG	2	12	101241	101252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2190	NC_019902	GATACC	2	12	101253	101264	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759451
2191	NC_019902	GACACG	2	12	101361	101372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759451
2192	NC_019902	GACACC	2	12	101553	101564	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2193	NC_019902	ACCGAC	2	12	101586	101597	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759451
2194	NC_019902	GAC	2	6	101673	101678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759450
2195	NC_019902	ATC	3	9	101793	101801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759450
2196	NC_019902	GGC	2	6	101805	101810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759450
2197	NC_019902	TGA	2	6	101882	101887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759450
2198	NC_019902	AGT	2	6	101939	101944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759450
2199	NC_019902	GTC	2	6	101963	101968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2200	NC_019902	GACACC	2	12	101979	101990	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430759452
2201	NC_019902	ACCGAT	2	12	102000	102011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
2202	NC_019902	ACCGAT	2	12	102018	102029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
2203	NC_019902	ACCGAT	4	24	102036	102059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
2204	NC_019902	ACCGAT	7	42	102084	102125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430759452
2205	NC_019902	GACACG	15	90	102131	102220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2206	NC_019902	ACACGG	7	42	102223	102264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2207	NC_019902	CAG	2	6	102341	102346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2208	NC_019902	CGA	3	9	102362	102370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2209	NC_019902	CGG	2	6	102404	102409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759452
2210	NC_019902	GAC	2	6	102411	102416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2211	NC_019902	GAA	2	6	102435	102440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759452
2212	NC_019902	TTC	2	6	102444	102449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759452
2213	NC_019902	GAC	2	6	102450	102455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2214	NC_019902	AGC	2	6	102493	102498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759452
2215	NC_019902	CGT	2	6	102506	102511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2216	NC_019902	CAA	2	6	102581	102586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2217	NC_019902	GGA	2	6	102604	102609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2218	NC_019902	GACGT	2	10	102667	102676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2219	NC_019902	TCGC	2	8	102727	102734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2220	NC_019902	GGAT	2	8	102742	102749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2221	NC_019902	CGT	2	6	102819	102824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2222	NC_019902	ACG	2	6	102973	102978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759453
2223	NC_019902	TGC	2	6	103063	103068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759453
2224	NC_019902	GCC	2	6	103202	103207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759453
2225	NC_019902	GTT	2	6	103216	103221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759453
2226	NC_019902	CGA	2	6	103267	103272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759453
2227	NC_019902	ATC	2	6	103283	103288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759453
2228	NC_019902	GGC	2	6	103361	103366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2229	NC_019902	CAC	2	6	103402	103407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2230	NC_019902	CTC	2	6	103433	103438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2231	NC_019902	TGA	2	6	103487	103492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_019902	AGG	2	6	103525	103530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_019902	ACC	2	6	103623	103628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2234	NC_019902	CGG	2	6	103669	103674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2235	NC_019902	GC	3	6	103711	103716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2236	NC_019902	CCTCTT	2	12	103778	103789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2237	NC_019902	GC	3	6	103811	103816	0 %	0 %	50 %	50 %	430759454
2238	NC_019902	GAA	2	6	103875	103880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759454
2239	NC_019902	CTT	2	6	103916	103921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759454
2240	NC_019902	GC	3	6	103943	103948	0 %	0 %	50 %	50 %	430759454
2241	NC_019902	CGT	2	6	103952	103957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759454
2242	NC_019902	CTGG	2	8	104090	104097	0 %	25 %	50 %	25 %	430759454
2243	NC_019902	CCAAGA	2	12	104116	104127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430759454
2244	NC_019902	ATT	2	6	104131	104136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430759454
2245	NC_019902	G	6	6	104143	104148	0 %	0 %	100 %	0 %	430759454
2246	NC_019902	TC	3	6	104208	104213	0 %	50 %	0 %	50 %	430759454
2247	NC_019902	TGGC	2	8	104294	104301	0 %	25 %	50 %	25 %	430759454
2248	NC_019902	CTA	2	6	104921	104926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759454
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2343	NC_019902	GAAG	2	8	109633	109640	50 %	0 %	50 %	0 %	430759455
2344	NC_019902	GAT	2	6	109738	109743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759455
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2349	NC_019902	G	7	7	110036	110042	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2350	NC_019902	ACT	2	6	110126	110131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2352	NC_019902	CCA	2	6	110171	110176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2353	NC_019902	G	6	6	110229	110234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2354	NC_019902	GA	3	6	110304	110309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2355	NC_019902	GTC	2	6	110368	110373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759456
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2364	NC_019902	CCGG	2	8	110610	110617	0 %	0 %	50 %	50 %	430759456
2365	NC_019902	GCTGCA	2	12	110658	110669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430759456
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2369	NC_019902	AGC	2	6	110717	110722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759456
2370	NC_019902	GGT	2	6	110790	110795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759456
2371	NC_019902	CTGC	2	8	110799	110806	0 %	25 %	25 %	50 %	430759456
2372	NC_019902	GGC	2	6	110825	110830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759456
2373	NC_019902	GCT	2	6	110893	110898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759456
2374	NC_019902	G	6	6	110942	110947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_019902	GGC	2	6	111086	111091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2376	NC_019902	GGC	2	6	111101	111106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2377	NC_019902	TCA	2	6	111218	111223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2380	NC_019902	GTG	3	9	111288	111296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2381	NC_019902	CGG	2	6	111328	111333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2382	NC_019902	TG	3	6	111343	111348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2383	NC_019902	GGT	2	6	111391	111396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2384	NC_019902	GCC	2	6	111452	111457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759457
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2393	NC_019902	CCG	2	6	111656	111661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2451	NC_019902	AACG	2	8	114286	114293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2452	NC_019902	GCA	2	6	114343	114348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2453	NC_019902	TGTGC	2	10	114349	114358	0 %	40 %	40 %	20 %	430759461
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2459	NC_019902	GGTG	2	8	114544	114551	0 %	25 %	75 %	0 %	430759461
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2466	NC_019902	GCTG	2	8	114648	114655	0 %	25 %	50 %	25 %	430759461
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2472	NC_019902	GCT	2	6	114799	114804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759462
2473	NC_019902	CACCCG	2	12	114823	114834	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	430759462
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2475	NC_019902	TGC	2	6	114855	114860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759462
2476	NC_019902	TCA	2	6	115016	115021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759463
2477	NC_019902	ACC	2	6	115034	115039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759463
2478	NC_019902	CGA	3	9	115050	115058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759463
2479	NC_019902	GCG	2	6	115091	115096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759463
2480	NC_019902	CAA	2	6	115110	115115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759463
2481	NC_019902	TCA	2	6	115118	115123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759463
2482	NC_019902	TGG	2	6	115153	115158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759463
2483	NC_019902	GTG	2	6	115159	115164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759463
2484	NC_019902	ACGGCA	2	12	115169	115180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759463
2485	NC_019902	TGC	2	6	115181	115186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759463
2486	NC_019902	CTGCG	2	10	115189	115198	0 %	20 %	40 %	40 %	430759463
2487	NC_019902	AGA	2	6	115247	115252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759463
2488	NC_019902	TCC	2	6	115279	115284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2489	NC_019902	CGG	2	6	115375	115380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2490	NC_019902	GC	3	6	115397	115402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2491	NC_019902	TCG	2	6	115459	115464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_019902	TCGG	2	8	115495	115502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2493	NC_019902	AGG	2	6	115530	115535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_019902	TG	3	6	115613	115618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2495	NC_019902	TAGCCA	2	12	115679	115690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2496	NC_019902	GT	3	6	115719	115724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_019902	GT	3	6	115757	115762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_019902	GGAG	2	8	115770	115777	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2499	NC_019902	GGT	2	6	115782	115787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2500	NC_019902	GAA	2	6	115847	115852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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