MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019902	GAT	2	6	48595	48600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759400
1002	NC_019902	TCG	2	6	48638	48643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1003	NC_019902	GC	3	6	48655	48660	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1004	NC_019902	GGTC	2	8	48669	48676	0 %	25 %	50 %	25 %	430759400
1005	NC_019902	ACG	2	6	48677	48682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1006	NC_019902	GCG	2	6	48709	48714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1007	NC_019902	GCG	2	6	48737	48742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1008	NC_019902	CGT	2	6	48747	48752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1009	NC_019902	GAG	2	6	48775	48780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759400
1010	NC_019902	CGG	2	6	48813	48818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1011	NC_019902	GCG	2	6	48896	48901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1012	NC_019902	GCT	2	6	48909	48914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1013	NC_019902	ATCGC	2	10	48926	48935	20 %	20 %	20 %	40 %	430759400
1014	NC_019902	CG	3	6	48936	48941	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1015	NC_019902	GCC	2	6	48948	48953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759400
1016	NC_019902	GCC	2	6	48960	48965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759400
1017	NC_019902	ACG	2	6	48983	48988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1018	NC_019902	CTG	2	6	49012	49017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1019	NC_019902	CGG	2	6	49031	49036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1020	NC_019902	GGC	2	6	49075	49080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1021	NC_019902	CCGGT	2	10	49082	49091	0 %	20 %	40 %	40 %	430759400
1022	NC_019902	CGC	2	6	49118	49123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759400
1023	NC_019902	GCT	2	6	49185	49190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1024	NC_019902	GCG	2	6	49197	49202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1025	NC_019902	CG	3	6	49201	49206	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1026	NC_019902	CCA	2	6	49208	49213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759400
1027	NC_019902	TGG	2	6	49322	49327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759400
1028	NC_019902	TGC	2	6	49346	49351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1029	NC_019902	GCC	2	6	49420	49425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759400
1030	NC_019902	GGC	2	6	49426	49431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1031	NC_019902	GC	3	6	49514	49519	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1032	NC_019902	GCT	2	6	49569	49574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1033	NC_019902	CG	3	6	49626	49631	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1034	NC_019902	GGC	2	6	49635	49640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1035	NC_019902	CGG	2	6	49676	49681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759400
1036	NC_019902	GCTC	2	8	49704	49711	0 %	25 %	25 %	50 %	430759400
1037	NC_019902	GC	3	6	49788	49793	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1038	NC_019902	GCT	2	6	49809	49814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759400
1039	NC_019902	CG	3	6	49832	49837	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1040	NC_019902	CG	3	6	49854	49859	0 %	0 %	50 %	50 %	430759400
1041	NC_019902	CGG	2	6	49929	49934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019902	AAGG	2	8	49956	49963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019902	CGG	2	6	49966	49971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_019902	CGGG	2	8	49990	49997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_019902	CGG	2	6	50000	50005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_019902	CGG	2	6	50085	50090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019902	GAA	2	6	50161	50166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019902	CTGG	2	8	50189	50196	0 %	25 %	50 %	25 %	430759401
1049	NC_019902	CGC	2	6	50228	50233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759401
1050	NC_019902	GCT	2	6	50275	50280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1051	NC_019902	CG	3	6	50353	50358	0 %	0 %	50 %	50 %	430759401
1052	NC_019902	GCT	2	6	50395	50400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1053	NC_019902	CGGGG	2	10	50459	50468	0 %	0 %	80 %	20 %	430759401
1054	NC_019902	CGG	2	6	50493	50498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759401
1055	NC_019902	CGAT	2	8	50547	50554	25 %	25 %	25 %	25 %	430759401
1056	NC_019902	GCC	2	6	50555	50560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759401
1057	NC_019902	GCTACG	2	12	50613	50624	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1058	NC_019902	GC	3	6	50644	50649	0 %	0 %	50 %	50 %	430759401
1059	NC_019902	CCG	2	6	50694	50699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759401
1060	NC_019902	TGG	2	6	50726	50731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759401
1061	NC_019902	GC	3	6	50752	50757	0 %	0 %	50 %	50 %	430759401
1062	NC_019902	CGA	2	6	50760	50765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1063	NC_019902	CGA	2	6	50770	50775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1064	NC_019902	TCGATC	2	12	50897	50908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430759401
1065	NC_019902	CGAT	2	8	51051	51058	25 %	25 %	25 %	25 %	430759401
1066	NC_019902	ACA	2	6	51063	51068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759401
1067	NC_019902	GTG	2	6	51125	51130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759401
1068	NC_019902	CCG	2	6	51135	51140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759401
1069	NC_019902	TGG	2	6	51150	51155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759401
1070	NC_019902	GCC	2	6	51215	51220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759401
1071	NC_019902	GGA	2	6	51274	51279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759401
1072	NC_019902	GAG	2	6	51404	51409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759401
1073	NC_019902	ATC	2	6	51497	51502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759401
1074	NC_019902	GGA	2	6	51526	51531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759401
1075	NC_019902	GAC	2	6	51533	51538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1076	NC_019902	CGA	2	6	51550	51555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759401
1077	NC_019902	G	6	6	51712	51717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019902	ACC	2	6	51899	51904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759402
1079	NC_019902	CCA	2	6	52017	52022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759402
1080	NC_019902	CGT	2	6	52038	52043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759402
1081	NC_019902	CGA	2	6	52119	52124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759402
1082	NC_019902	CGA	2	6	52164	52169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759402
1083	NC_019902	TCA	2	6	52170	52175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759402
1084	NC_019902	GCC	2	6	52184	52189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759402
1085	NC_019902	CAT	2	6	52204	52209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759402
1086	NC_019902	GCC	2	6	52231	52236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759402
1087	NC_019902	T	6	6	52255	52260	0 %	100 %	0 %	0 %	430759402
1088	NC_019902	TCA	2	6	52360	52365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_019902	CGGTG	2	10	52377	52386	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_019902	ACC	2	6	52441	52446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_019902	GTG	2	6	52449	52454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019902	GTG	2	6	52507	52512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019902	CA	3	6	52520	52525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_019902	T	6	6	52550	52555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019902	TCG	2	6	52574	52579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_019902	GCT	2	6	52600	52605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_019902	CCGC	2	8	52780	52787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1098	NC_019902	CCA	2	6	52823	52828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_019902	CTG	2	6	52834	52839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_019902	CGG	2	6	52843	52848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_019902	GCGGCC	2	12	52875	52886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_019902	GCT	2	6	52952	52957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_019902	GGAT	2	8	53001	53008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019902	CGGG	2	8	53070	53077	0 %	0 %	75 %	25 %	430759403
1105	NC_019902	TTC	2	6	53108	53113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759403
1106	NC_019902	CGG	2	6	53149	53154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759403
1107	NC_019902	CGC	2	6	53256	53261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759403
1108	NC_019902	GCT	2	6	53287	53292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759403
1109	NC_019902	TGG	2	6	53313	53318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759403
1110	NC_019902	CGT	2	6	53319	53324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759403
1111	NC_019902	ATG	2	6	53402	53407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759403
1112	NC_019902	TTC	2	6	53426	53431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759403
1113	NC_019902	ATC	2	6	53576	53581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759403
1114	NC_019902	ATC	2	6	53609	53614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759403
1115	NC_019902	GAT	2	6	53617	53622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759403
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1117	NC_019902	GC	3	6	53778	53783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_019902	TGG	2	6	53829	53834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019902	CCT	2	6	53840	53845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_019902	GCA	2	6	53915	53920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019902	ACG	2	6	53950	53955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019902	CGG	2	6	53970	53975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_019902	GAT	2	6	53981	53986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019902	GTTGT	2	10	54047	54056	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019902	GAT	2	6	54083	54088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759404
1126	NC_019902	GCG	2	6	54113	54118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759404
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1128	NC_019902	GCGG	2	8	54273	54280	0 %	0 %	75 %	25 %	430759404
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1252	NC_019902	GAC	2	6	59503	59508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1253	NC_019902	ACC	2	6	59555	59560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1254	NC_019902	TCC	2	6	59632	59637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_019902	CGC	2	6	59641	59646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1256	NC_019902	ATT	2	6	59651	59656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_019902	GTT	2	6	59687	59692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_019902	GC	3	6	59702	59707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1259	NC_019902	GAC	2	6	59733	59738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1260	NC_019902	CGC	2	6	59761	59766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1261	NC_019902	AGGA	2	8	59785	59792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_019902	CGG	2	6	59859	59864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_019902	GCC	2	6	59939	59944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1264	NC_019902	GC	3	6	59947	59952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_019902	GAT	2	6	59962	59967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_019902	GAG	2	6	60199	60204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_019902	AGC	2	6	60290	60295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_019902	TGG	2	6	60330	60335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_019902	CGG	2	6	60349	60354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_019902	GTG	2	6	60394	60399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_019902	GGT	2	6	60468	60473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_019902	GACC	2	8	60510	60517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1273	NC_019902	TGGC	2	8	60532	60539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1274	NC_019902	CTG	2	6	60559	60564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1275	NC_019902	TCC	2	6	60579	60584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1276	NC_019902	GAA	2	6	60654	60659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_019902	GCCG	2	8	60792	60799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1278	NC_019902	GAA	2	6	60816	60821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_019902	GGA	2	6	60842	60847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_019902	CTG	2	6	60975	60980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1281	NC_019902	GCC	2	6	61011	61016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1282	NC_019902	TGC	2	6	61018	61023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1283	NC_019902	TCG	2	6	61024	61029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1285	NC_019902	CTG	2	6	61168	61173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1286	NC_019902	GCC	2	6	61189	61194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1287	NC_019902	TCG	2	6	61358	61363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1288	NC_019902	CGCGC	2	10	61374	61383	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1289	NC_019902	GCC	2	6	61429	61434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1295	NC_019902	AG	3	6	61902	61907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1330	NC_019902	TCG	2	6	63633	63638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1382	NC_019902	GGCC	2	8	65849	65856	0 %	0 %	50 %	50 %	430759417
1383	NC_019902	GCC	2	6	65908	65913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759417
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