MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13053	NC_019902	CCAG	2	8	569248	569255	25 %	0 %	25 %	50 %	430759920
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13107	NC_019902	GCTT	2	8	571825	571832	0 %	50 %	25 %	25 %	430759922
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13120	NC_019902	GGC	2	6	572311	572316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759922
13121	NC_019902	CG	3	6	572355	572360	0 %	0 %	50 %	50 %	430759922
13122	NC_019902	CGAG	2	8	572421	572428	25 %	0 %	50 %	25 %	430759922
13123	NC_019902	CG	3	6	572456	572461	0 %	0 %	50 %	50 %	430759922
13124	NC_019902	GCA	2	6	572547	572552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759922
13125	NC_019902	GGT	2	6	572554	572559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759922
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13141	NC_019902	CGAC	2	8	573005	573012	25 %	0 %	25 %	50 %	430759923
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13152	NC_019902	GC	3	6	573488	573493	0 %	0 %	50 %	50 %	430759923
13153	NC_019902	CAG	2	6	573510	573515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759923
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13211	NC_019902	GCC	2	6	576486	576491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759926
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13216	NC_019902	TCG	2	6	576640	576645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759926
13217	NC_019902	GTC	2	6	576651	576656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759926
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13220	NC_019902	CGTC	2	8	576854	576861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13221	NC_019902	GGT	2	6	576865	576870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13222	NC_019902	CGC	2	6	576902	576907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13224	NC_019902	CGG	2	6	576941	576946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13225	NC_019902	GCCG	2	8	577091	577098	0 %	0 %	50 %	50 %	430759927
13226	NC_019902	CGG	2	6	577246	577251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759927
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13229	NC_019902	GCCC	2	8	577729	577736	0 %	0 %	25 %	75 %	430759927
13230	NC_019902	GAA	2	6	577841	577846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759927
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13232	NC_019902	CCT	2	6	577867	577872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759927
13233	NC_019902	GC	3	6	577883	577888	0 %	0 %	50 %	50 %	430759927
13234	NC_019902	CCCA	2	8	577926	577933	25 %	0 %	0 %	75 %	430759927
13235	NC_019902	ACG	2	6	578116	578121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759927
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13239	NC_019902	GACACG	2	12	578235	578246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759927
13240	NC_019902	TCC	2	6	578259	578264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759927
13241	NC_019902	GCGCG	2	10	578297	578306	0 %	0 %	60 %	40 %	430759927
13242	NC_019902	CGA	2	6	578324	578329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759927
13243	NC_019902	CGT	2	6	578392	578397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759927
13244	NC_019902	CGC	3	9	578437	578445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759927
13245	NC_019902	CGTCGC	2	12	578482	578493	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430759927
13246	NC_019902	GCG	2	6	578549	578554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759927
13247	NC_019902	CAC	2	6	578572	578577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759927
13248	NC_019902	CACG	2	8	578614	578621	25 %	0 %	25 %	50 %	430759927
13249	NC_019902	GATCAG	2	12	578705	578716	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430759927
13250	NC_019902	GCGCA	2	10	578801	578810	20 %	0 %	40 %	40 %	430759927
13251	NC_019902	GAA	2	6	578926	578931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759927
13252	NC_019902	GGCAT	2	10	579042	579051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13253	NC_019902	GAT	2	6	579285	579290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13254	NC_019902	TCC	2	6	579406	579411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759928
13255	NC_019902	GCGT	2	8	579429	579436	0 %	25 %	50 %	25 %	430759928
13256	NC_019902	GGA	2	6	579486	579491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759928
13257	NC_019902	CCT	2	6	579525	579530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759928
13258	NC_019902	GCT	2	6	579642	579647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759928
13259	NC_019902	TCC	2	6	579659	579664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759928
13260	NC_019902	GGAA	2	8	579771	579778	50 %	0 %	50 %	0 %	430759928
13261	NC_019902	CGG	2	6	579786	579791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759928
13262	NC_019902	CGG	2	6	579930	579935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759928
13263	NC_019902	AGCGCG	2	12	580088	580099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759928
13264	NC_019902	CAT	2	6	580147	580152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759928
13265	NC_019902	TCC	2	6	580158	580163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13266	NC_019902	CGT	2	6	580209	580214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13267	NC_019902	GTC	2	6	580261	580266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13268	NC_019902	GTCGG	2	10	580492	580501	0 %	20 %	60 %	20 %	430759929
13269	NC_019902	GGC	2	6	580506	580511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759929
13270	NC_019902	TCG	2	6	580516	580521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759929
13271	NC_019902	CGG	2	6	580531	580536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759929
13272	NC_019902	GTCGGG	2	12	580539	580550	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	430759929
13273	NC_019902	GACG	2	8	580553	580560	25 %	0 %	50 %	25 %	430759929
13274	NC_019902	GCG	2	6	580564	580569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759929
13275	NC_019902	CCG	3	9	580706	580714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759929
13276	NC_019902	CGC	2	6	580721	580726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759929
13277	NC_019902	CG	3	6	580736	580741	0 %	0 %	50 %	50 %	430759929
13278	NC_019902	GATCGA	2	12	580756	580767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430759929
13279	NC_019902	GC	3	6	580807	580812	0 %	0 %	50 %	50 %	430759929
13280	NC_019902	CCG	2	6	580814	580819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759929
13281	NC_019902	CTG	2	6	580889	580894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759929
13282	NC_019902	TCG	2	6	580896	580901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759929
13283	NC_019902	CAT	2	6	580979	580984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759929
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13285	NC_019902	GGA	2	6	581094	581099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13286	NC_019902	CGT	2	6	581115	581120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13287	NC_019902	GCA	2	6	581122	581127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13288	NC_019902	CTC	2	6	581136	581141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13289	NC_019902	GCTG	2	8	581197	581204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13290	NC_019902	CCG	2	6	581285	581290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13291	NC_019902	TTC	2	6	581297	581302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13292	NC_019902	GCG	2	6	581306	581311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13293	NC_019902	GC	3	6	581378	581383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13294	NC_019902	CAGC	3	12	581399	581410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13295	NC_019902	AGCC	2	8	581444	581451	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13296	NC_019902	CG	3	6	581531	581536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13297	NC_019902	GGT	2	6	581539	581544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13298	NC_019902	CGA	2	6	581558	581563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13299	NC_019902	CAT	2	6	581641	581646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759930
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13310	NC_019902	CGG	3	9	582028	582036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13311	NC_019902	GCG	2	6	582064	582069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13312	NC_019902	CCG	3	9	582162	582170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13313	NC_019902	GCT	2	6	582216	582221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13314	NC_019902	GCG	2	6	582237	582242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13315	NC_019902	GCG	2	6	582309	582314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13316	NC_019902	GCC	2	6	582408	582413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759931
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13320	NC_019902	TGA	2	6	582524	582529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759931
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13332	NC_019902	CGG	2	6	582804	582809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759932
13333	NC_019902	CGG	2	6	582855	582860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759932
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13335	NC_019902	GCC	2	6	582992	582997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759933
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13340	NC_019902	CAC	3	9	583090	583098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759933
13341	NC_019902	TCA	2	6	583129	583134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759933
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13343	NC_019902	GCC	2	6	583158	583163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759933
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13348	NC_019902	GCCGAG	2	12	583272	583283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759933
13349	NC_019902	CGA	2	6	583336	583341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759934
13350	NC_019902	TCG	2	6	583444	583449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759934
13351	NC_019902	CGC	2	6	583454	583459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759934
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13353	NC_019902	GCT	2	6	583484	583489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759934
13354	NC_019902	GCC	2	6	583517	583522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759934
13355	NC_019902	GCCG	2	8	583536	583543	0 %	0 %	50 %	50 %	430759934
13356	NC_019902	GCA	2	6	583548	583553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759934
13357	NC_019902	GGC	3	9	583565	583573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759934
13358	NC_019902	GCC	2	6	583578	583583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759934
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13360	NC_019902	GC	3	6	583655	583660	0 %	0 %	50 %	50 %	430759934
13361	NC_019902	CGGGC	2	10	583728	583737	0 %	0 %	60 %	40 %	430759934
13362	NC_019902	CGG	2	6	583753	583758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759934
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13364	NC_019902	GGC	2	6	583793	583798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759934
13365	NC_019902	GCT	2	6	583817	583822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759934
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13369	NC_019902	GTG	2	6	584012	584017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759935
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13374	NC_019902	GCCGA	2	10	584105	584114	20 %	0 %	40 %	40 %	430759935
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13392	NC_019902	CCGA	2	8	584775	584782	25 %	0 %	25 %	50 %	430759935
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13467	NC_019902	CTCG	2	8	588253	588260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13481	NC_019902	ACG	2	6	588915	588920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13482	NC_019902	CGG	2	6	589025	589030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759938
13483	NC_019902	CCA	2	6	589061	589066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759938
13484	NC_019902	GCA	2	6	589094	589099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13485	NC_019902	GGC	2	6	589100	589105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759938
13486	NC_019902	CAG	2	6	589155	589160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13487	NC_019902	G	6	6	589160	589165	0 %	0 %	100 %	0 %	430759938
13488	NC_019902	GCT	2	6	589169	589174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13489	NC_019902	CTG	2	6	589188	589193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13490	NC_019902	CGA	2	6	589205	589210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13491	NC_019902	GC	3	6	589216	589221	0 %	0 %	50 %	50 %	430759938
13492	NC_019902	CGA	2	6	589229	589234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13493	NC_019902	GTCGA	2	10	589245	589254	20 %	20 %	40 %	20 %	430759938
13494	NC_019902	CGG	2	6	589343	589348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759938
13495	NC_019902	G	6	6	589367	589372	0 %	0 %	100 %	0 %	430759938
13496	NC_019902	GGCCCG	2	12	589460	589471	0 %	0 %	50 %	50 %	430759938
13497	NC_019902	G	6	6	589514	589519	0 %	0 %	100 %	0 %	430759938
13498	NC_019902	CGG	2	6	589529	589534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759938
13499	NC_019902	CGA	2	6	589541	589546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759938
13500	NC_019902	CGC	2	6	589594	589599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759938

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