MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_019902	GCCC	2	8	475421	475428	0 %	0 %	25 %	75 %	430759822
11003	NC_019902	CCG	2	6	475463	475468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759822
11004	NC_019902	CCG	2	6	475500	475505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759822
11005	NC_019902	GTC	2	6	475561	475566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759822
11006	NC_019902	GCCC	2	8	475650	475657	0 %	0 %	25 %	75 %	430759822
11007	NC_019902	GGGC	2	8	475659	475666	0 %	0 %	75 %	25 %	430759822
11008	NC_019902	CGC	2	6	475728	475733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759822
11009	NC_019902	CGC	2	6	475842	475847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759822
11010	NC_019902	CGA	2	6	475875	475880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759822
11011	NC_019902	GGC	2	6	475926	475931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759822
11012	NC_019902	CCG	2	6	476043	476048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759822
11013	NC_019902	CGG	2	6	476103	476108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759822
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11015	NC_019902	TCC	2	6	476147	476152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759822
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11017	NC_019902	CCGCAG	2	12	476206	476217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430759822
11018	NC_019902	CGG	2	6	476271	476276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759822
11019	NC_019902	TCG	2	6	476366	476371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759822
11020	NC_019902	CAG	2	6	476440	476445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759822
11021	NC_019902	GCA	2	6	476478	476483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759822
11022	NC_019902	CG	3	6	476508	476513	0 %	0 %	50 %	50 %	430759822
11023	NC_019902	GGC	2	6	476517	476522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759822
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11025	NC_019902	CCCG	2	8	476640	476647	0 %	0 %	25 %	75 %	430759822
11026	NC_019902	CG	3	6	476646	476651	0 %	0 %	50 %	50 %	430759822
11027	NC_019902	CTG	2	6	476672	476677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759822
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11033	NC_019902	CCG	2	6	477093	477098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759822
11034	NC_019902	CCAG	2	8	477114	477121	25 %	0 %	25 %	50 %	430759822
11035	NC_019902	CGAT	2	8	477200	477207	25 %	25 %	25 %	25 %	430759822
11036	NC_019902	CAG	2	6	477211	477216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759822
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11040	NC_019902	GCA	2	6	477402	477407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759822
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11052	NC_019902	ATG	2	6	477928	477933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759823
11053	NC_019902	CGC	2	6	477992	477997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759823
11054	NC_019902	AAG	2	6	478003	478008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759823
11055	NC_019902	TCG	2	6	478036	478041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759823
11056	NC_019902	ATC	2	6	478072	478077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759823
11057	NC_019902	GCCC	2	8	478080	478087	0 %	0 %	25 %	75 %	430759823
11058	NC_019902	GAGGC	2	10	478141	478150	20 %	0 %	60 %	20 %	430759823
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11060	NC_019902	CAG	2	6	478170	478175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759823
11061	NC_019902	GTC	2	6	478209	478214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759823
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11063	NC_019902	CGT	2	6	478257	478262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759823
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11072	NC_019902	CGA	2	6	478781	478786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759823
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11083	NC_019902	CAG	2	6	479419	479424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_019902	CGATT	2	10	479434	479443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11085	NC_019902	CTG	2	6	479465	479470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_019902	GGTG	2	8	479472	479479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_019902	GCGG	2	8	479523	479530	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_019902	CCA	2	6	479587	479592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11089	NC_019902	CGGCC	2	10	479651	479660	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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11091	NC_019902	GCA	2	6	479695	479700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11093	NC_019902	ACC	2	6	479752	479757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_019902	GCG	2	6	479841	479846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_019902	GCG	2	6	479857	479862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_019902	TCACG	2	10	479899	479908	20 %	20 %	20 %	40 %	430759824
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11101	NC_019902	CCA	2	6	480087	480092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759825
11102	NC_019902	CACG	2	8	480114	480121	25 %	0 %	25 %	50 %	430759825
11103	NC_019902	CCGCG	2	10	480207	480216	0 %	0 %	40 %	60 %	430759825
11104	NC_019902	GTC	2	6	480274	480279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759825
11105	NC_019902	GAT	2	6	480391	480396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759825
11106	NC_019902	CGA	2	6	480408	480413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759825
11107	NC_019902	CGGC	2	8	480432	480439	0 %	0 %	50 %	50 %	430759825
11108	NC_019902	GGT	2	6	480450	480455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759825
11109	NC_019902	GCCG	2	8	480477	480484	0 %	0 %	50 %	50 %	430759825
11110	NC_019902	GGT	2	6	480553	480558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759825
11111	NC_019902	GC	3	6	480566	480571	0 %	0 %	50 %	50 %	430759825
11112	NC_019902	CG	3	6	480577	480582	0 %	0 %	50 %	50 %	430759825
11113	NC_019902	CG	4	8	480588	480595	0 %	0 %	50 %	50 %	430759825
11114	NC_019902	TCG	2	6	480635	480640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759825
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11116	NC_019902	GCGCG	2	10	480658	480667	0 %	0 %	60 %	40 %	430759825
11117	NC_019902	GCT	3	9	480690	480698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759825
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11119	NC_019902	GTGC	2	8	480711	480718	0 %	25 %	50 %	25 %	430759825
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11240	NC_019902	GCAGC	2	10	486045	486054	20 %	0 %	40 %	40 %	430759828
11241	NC_019902	AGC	2	6	486083	486088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11242	NC_019902	GCT	2	6	486102	486107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11243	NC_019902	GCC	2	6	486200	486205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759828
11244	NC_019902	GCT	3	9	486228	486236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11245	NC_019902	GACC	2	8	486256	486263	25 %	0 %	25 %	50 %	430759828
11246	NC_019902	TCC	2	6	486272	486277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759828
11247	NC_019902	CG	3	6	486278	486283	0 %	0 %	50 %	50 %	430759828
11248	NC_019902	GTCG	2	8	486311	486318	0 %	25 %	50 %	25 %	430759828
11249	NC_019902	GCT	2	6	486330	486335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11250	NC_019902	CGA	2	6	486429	486434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11251	NC_019902	C	8	8	486461	486468	0 %	0 %	0 %	100 %	430759828
11252	NC_019902	CGA	2	6	486495	486500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11253	NC_019902	GGA	2	6	486522	486527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759828
11254	NC_019902	CGC	3	9	486585	486593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759828
11255	NC_019902	CAT	2	6	486597	486602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759828
11256	NC_019902	ACCTG	2	10	486635	486644	20 %	20 %	20 %	40 %	430759828
11257	NC_019902	CTG	2	6	486658	486663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11258	NC_019902	CGT	2	6	486742	486747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11259	NC_019902	ATC	2	6	486760	486765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759828
11260	NC_019902	G	7	7	486780	486786	0 %	0 %	100 %	0 %	430759828
11261	NC_019902	CCG	2	6	486857	486862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759828
11262	NC_019902	ACA	2	6	486878	486883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759828
11263	NC_019902	TTC	2	6	486889	486894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759828
11264	NC_019902	CTG	2	6	486922	486927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11265	NC_019902	CCGG	2	8	486940	486947	0 %	0 %	50 %	50 %	430759828
11266	NC_019902	CTG	2	6	486997	487002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759828
11267	NC_019902	CAG	2	6	487005	487010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759828
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11270	NC_019902	CGG	2	6	487132	487137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759828
11271	NC_019902	CG	3	6	487151	487156	0 %	0 %	50 %	50 %	430759828
11272	NC_019902	GGT	2	6	487179	487184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759828
11273	NC_019902	CG	3	6	487220	487225	0 %	0 %	50 %	50 %	430759828
11274	NC_019902	CGG	2	6	487257	487262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759828
11275	NC_019902	GGCCGG	2	12	487458	487469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759828
11276	NC_019902	GGT	2	6	487476	487481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759828
11277	NC_019902	CGG	2	6	487490	487495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759828
11278	NC_019902	GC	4	8	487500	487507	0 %	0 %	50 %	50 %	430759828
11279	NC_019902	ACTG	2	8	487582	487589	25 %	25 %	25 %	25 %	430759828
11280	NC_019902	GA	3	6	487592	487597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11281	NC_019902	CGA	2	6	487599	487604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759829
11282	NC_019902	GT	3	6	487710	487715	0 %	50 %	50 %	0 %	430759829
11283	NC_019902	GC	3	6	487726	487731	0 %	0 %	50 %	50 %	430759829
11284	NC_019902	GCC	2	6	487739	487744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759829
11285	NC_019902	GGA	2	6	487768	487773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759829
11286	NC_019902	CG	3	6	487798	487803	0 %	0 %	50 %	50 %	430759829
11287	NC_019902	GCC	2	6	487847	487852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759829
11288	NC_019902	TCCG	2	8	487862	487869	0 %	25 %	25 %	50 %	430759829
11289	NC_019902	TTC	2	6	487910	487915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759829
11290	NC_019902	GC	3	6	487936	487941	0 %	0 %	50 %	50 %	430759829
11291	NC_019902	TGG	2	6	487965	487970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759829
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11293	NC_019902	GCATCC	2	12	488019	488030	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430759829
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11296	NC_019902	CAAGGC	2	12	488074	488085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759829
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11302	NC_019902	CGG	2	6	488267	488272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759829
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11309	NC_019902	ACGT	2	8	488513	488520	25 %	25 %	25 %	25 %	430759829
11310	NC_019902	CCG	2	6	488537	488542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11311	NC_019902	CCG	2	6	488589	488594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759830
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11314	NC_019902	CGA	2	6	488725	488730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759830
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11317	NC_019902	ACC	2	6	488805	488810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11318	NC_019902	GCG	2	6	488814	488819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11319	NC_019902	GCG	2	6	488950	488955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11320	NC_019902	CCGC	2	8	489015	489022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11321	NC_019902	GCTT	2	8	489035	489042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11322	NC_019902	GCC	2	6	489059	489064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11324	NC_019902	GGCA	2	8	489109	489116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11325	NC_019902	AGCC	2	8	489122	489129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11326	NC_019902	CAC	2	6	489133	489138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11327	NC_019902	AGA	2	6	489209	489214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759831
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11331	NC_019902	CGA	2	6	489290	489295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759831
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11334	NC_019902	GCGCT	2	10	489499	489508	0 %	20 %	40 %	40 %	430759831
11335	NC_019902	CCCGG	2	10	489525	489534	0 %	0 %	40 %	60 %	430759831
11336	NC_019902	GGC	2	6	489593	489598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759832
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11344	NC_019902	GATG	2	8	490067	490074	25 %	25 %	50 %	0 %	430759834
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11347	NC_019902	TGA	2	6	490243	490248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759834
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11349	NC_019902	CTG	2	6	490389	490394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759834
11350	NC_019902	CGC	2	6	490406	490411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759834
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11353	NC_019902	GCT	2	6	490487	490492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759834
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11357	NC_019902	TGA	3	9	490729	490737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759834
11358	NC_019902	TCG	2	6	490801	490806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759834
11359	NC_019902	GCAT	2	8	490819	490826	25 %	25 %	25 %	25 %	430759834
11360	NC_019902	TGC	2	6	490831	490836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759834
11361	NC_019902	CGG	2	6	490862	490867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759834
11362	NC_019902	CGA	2	6	490868	490873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759834
11363	NC_019902	TGC	2	6	490882	490887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759834
11364	NC_019902	CG	4	8	490910	490917	0 %	0 %	50 %	50 %	430759834
11365	NC_019902	GGC	2	6	490919	490924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759834
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11486	NC_019902	GAC	2	6	497955	497960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_019902	GGCGT	2	10	497971	497980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11488	NC_019902	CGT	2	6	498009	498014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11489	NC_019902	TGGC	2	8	498065	498072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11490	NC_019902	GAC	2	6	498184	498189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11491	NC_019902	CG	4	8	498199	498206	0 %	0 %	50 %	50 %	430759848
11492	NC_019902	GGC	2	6	498229	498234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759848
11493	NC_019902	CCG	2	6	498333	498338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759848
11494	NC_019902	CGC	2	6	498342	498347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759848
11495	NC_019902	TCAT	2	8	498365	498372	25 %	50 %	0 %	25 %	430759848
11496	NC_019902	GC	3	6	498393	498398	0 %	0 %	50 %	50 %	430759848
11497	NC_019902	CTC	2	6	498439	498444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759848
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11499	NC_019902	GGAT	2	8	498461	498468	25 %	25 %	50 %	0 %	430759848
11500	NC_019902	TGCTG	2	10	498588	498597	0 %	40 %	40 %	20 %	430759849

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