MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobacillus composti KWC4 plasmid pTHECO01

Total Repeats: 2970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019898	GCT	2	6	51624	51629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748255
1002	NC_019898	TG	3	6	51657	51662	0 %	50 %	50 %	0 %	430748255
1003	NC_019898	CTT	2	6	51663	51668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748255
1004	NC_019898	CAT	2	6	51696	51701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748255
1005	NC_019898	ATC	2	6	51761	51766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748255
1006	NC_019898	CG	3	6	51846	51851	0 %	0 %	50 %	50 %	430748255
1007	NC_019898	CTT	2	6	51904	51909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748255
1008	NC_019898	CTT	2	6	51919	51924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748255
1009	NC_019898	GAT	2	6	51949	51954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748255
1010	NC_019898	GC	3	6	51967	51972	0 %	0 %	50 %	50 %	430748255
1011	NC_019898	AGC	2	6	52007	52012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748255
1012	NC_019898	TTC	2	6	52015	52020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748255
1013	NC_019898	CCACAA	2	12	52041	52052	50 %	0 %	0 %	50 %	430748255
1014	NC_019898	GAA	2	6	52086	52091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748255
1015	NC_019898	GGC	2	6	52130	52135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748255
1016	NC_019898	TCA	2	6	52215	52220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748255
1017	NC_019898	CGAG	2	8	52227	52234	25 %	0 %	50 %	25 %	430748255
1018	NC_019898	AAC	2	6	52238	52243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748255
1019	NC_019898	CGAAA	2	10	52349	52358	60 %	0 %	20 %	20 %	430748255
1020	NC_019898	CCA	2	6	52365	52370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748255
1021	NC_019898	TGG	2	6	52427	52432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748256
1022	NC_019898	TCT	2	6	52450	52455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748256
1023	NC_019898	CTT	2	6	52517	52522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748256
1024	NC_019898	TCG	2	6	52537	52542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748256
1025	NC_019898	CGG	2	6	52552	52557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748256
1026	NC_019898	CGC	2	6	52567	52572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748256
1027	NC_019898	AGG	2	6	52705	52710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748256
1028	NC_019898	TTC	2	6	52743	52748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748256
1029	NC_019898	GCGA	2	8	52774	52781	25 %	0 %	50 %	25 %	430748256
1030	NC_019898	CGGC	2	8	52791	52798	0 %	0 %	50 %	50 %	430748256
1031	NC_019898	TTTC	2	8	52829	52836	0 %	75 %	0 %	25 %	430748256
1032	NC_019898	TGG	2	6	52855	52860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748256
1033	NC_019898	CGT	2	6	52889	52894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748256
1034	NC_019898	CTC	2	6	52899	52904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748256
1035	NC_019898	CGT	2	6	52908	52913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748256
1036	NC_019898	GC	3	6	52932	52937	0 %	0 %	50 %	50 %	430748256
1037	NC_019898	GGAA	2	8	52948	52955	50 %	0 %	50 %	0 %	430748256
1038	NC_019898	CTC	2	6	52978	52983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748256
1039	NC_019898	CGC	2	6	53079	53084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748256
1040	NC_019898	CGC	2	6	53114	53119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748256
1041	NC_019898	TTC	2	6	53134	53139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748256
1042	NC_019898	TCG	2	6	53167	53172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748256
1043	NC_019898	TCG	2	6	53209	53214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748256
1044	NC_019898	TTC	2	6	53245	53250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748256
1045	NC_019898	CAGG	2	8	53264	53271	25 %	0 %	50 %	25 %	430748256
1046	NC_019898	ACCAGA	2	12	53299	53310	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430748256
1047	NC_019898	TCC	2	6	53314	53319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748256
1048	NC_019898	GCG	2	6	53328	53333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748256
1049	NC_019898	TTTC	2	8	53351	53358	0 %	75 %	0 %	25 %	430748256
1050	NC_019898	GCG	2	6	53367	53372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748256
1051	NC_019898	GC	3	6	53397	53402	0 %	0 %	50 %	50 %	430748256
1052	NC_019898	CGG	2	6	53427	53432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748256
1053	NC_019898	GAT	2	6	53460	53465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748256
1054	NC_019898	CG	3	6	53561	53566	0 %	0 %	50 %	50 %	430748256
1055	NC_019898	GCC	2	6	53583	53588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748256
1056	NC_019898	CCG	2	6	53647	53652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748256
1057	NC_019898	CCT	2	6	53678	53683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748256
1058	NC_019898	GCA	2	6	53684	53689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748256
1059	NC_019898	GCG	2	6	53761	53766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748256
1060	NC_019898	CTC	2	6	53797	53802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_019898	CGC	2	6	53841	53846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_019898	ATC	2	6	53883	53888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_019898	GCA	2	6	53937	53942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019898	CCT	2	6	53949	53954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_019898	CAG	2	6	53978	53983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_019898	AAG	2	6	54046	54051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019898	GCG	2	6	54097	54102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_019898	CAC	2	6	54104	54109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_019898	CCG	2	6	54137	54142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_019898	GGC	2	6	54148	54153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_019898	TGC	2	6	54158	54163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_019898	TC	3	6	54192	54197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_019898	GAC	2	6	54202	54207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019898	CCG	2	6	54225	54230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_019898	TGC	2	6	54233	54238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_019898	TCG	2	6	54267	54272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019898	AACGAA	2	12	54291	54302	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1078	NC_019898	AC	4	8	54394	54401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_019898	TCC	2	6	54569	54574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_019898	TGA	2	6	54575	54580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019898	GTC	2	6	54583	54588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_019898	CAAC	2	8	54610	54617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_019898	TCC	2	6	54626	54631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_019898	ACAT	2	8	54636	54643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_019898	A	6	6	54647	54652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_019898	ATTGAG	2	12	54726	54737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019898	A	7	7	54762	54768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019898	AT	3	6	54806	54811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019898	ATC	2	6	54867	54872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_019898	ATC	2	6	54936	54941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_019898	AAG	2	6	55071	55076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019898	CGAAA	2	10	55081	55090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_019898	TCG	2	6	55123	55128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019898	AAG	2	6	55135	55140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019898	GGA	2	6	55154	55159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019898	CTG	2	6	55161	55166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_019898	AGA	2	6	55204	55209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019898	GCAA	2	8	55211	55218	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_019898	TTA	2	6	55268	55273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748257
1100	NC_019898	AT	3	6	55294	55299	50 %	50 %	0 %	0 %	430748257
1101	NC_019898	TGGT	2	8	55307	55314	0 %	50 %	50 %	0 %	430748257
1102	NC_019898	GAAA	2	8	55374	55381	75 %	0 %	25 %	0 %	430748257
1103	NC_019898	AAG	2	6	55418	55423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748257
1104	NC_019898	A	8	8	55456	55463	100 %	0 %	0 %	0 %	430748257
1105	NC_019898	AGA	2	6	55575	55580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748257
1106	NC_019898	CGA	2	6	55647	55652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748257
1107	NC_019898	A	6	6	55717	55722	100 %	0 %	0 %	0 %	430748257
1108	NC_019898	A	8	8	55783	55790	100 %	0 %	0 %	0 %	430748257
1109	NC_019898	TCA	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748257
1110	NC_019898	GAAGC	2	10	56074	56083	40 %	0 %	40 %	20 %	430748257
1111	NC_019898	A	6	6	56084	56089	100 %	0 %	0 %	0 %	430748257
1112	NC_019898	GGC	2	6	56103	56108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748257
1113	NC_019898	CAG	2	6	56137	56142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748257
1114	NC_019898	AATGA	2	10	56152	56161	60 %	20 %	20 %	0 %	430748257
1115	NC_019898	AAAC	2	8	56229	56236	75 %	0 %	0 %	25 %	430748257
1116	NC_019898	ACG	2	6	56248	56253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748257
1117	NC_019898	AAG	2	6	56305	56310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748257
1118	NC_019898	A	6	6	56451	56456	100 %	0 %	0 %	0 %	430748258
1119	NC_019898	CAAT	2	8	56501	56508	50 %	25 %	0 %	25 %	430748258
1120	NC_019898	A	6	6	56522	56527	100 %	0 %	0 %	0 %	430748258
1121	NC_019898	GAA	2	6	56562	56567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748258
1122	NC_019898	TGA	2	6	56580	56585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748258
1123	NC_019898	ACA	2	6	56594	56599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748258
1124	NC_019898	TGT	2	6	56694	56699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748258
1125	NC_019898	TCTTG	2	10	56716	56725	0 %	60 %	20 %	20 %	430748258
1126	NC_019898	TCGA	2	8	56821	56828	25 %	25 %	25 %	25 %	430748258
1127	NC_019898	GA	3	6	57063	57068	50 %	0 %	50 %	0 %	430748258
1128	NC_019898	GCA	2	6	57126	57131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748259
1129	NC_019898	ACA	2	6	57167	57172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748259
1130	NC_019898	T	6	6	57223	57228	0 %	100 %	0 %	0 %	430748259
1131	NC_019898	A	6	6	57234	57239	100 %	0 %	0 %	0 %	430748259
1132	NC_019898	TCA	2	6	57258	57263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748259
1133	NC_019898	TTG	2	6	57374	57379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748259
1134	NC_019898	A	6	6	57391	57396	100 %	0 %	0 %	0 %	430748259
1135	NC_019898	GAA	2	6	57398	57403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748259
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1137	NC_019898	ATG	2	6	57462	57467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748259
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1139	NC_019898	CGA	2	6	57601	57606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748259
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1141	NC_019898	GCA	2	6	57663	57668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748259
1142	NC_019898	CA	3	6	57747	57752	50 %	0 %	0 %	50 %	430748259
1143	NC_019898	TCGCAA	2	12	57781	57792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430748259
1144	NC_019898	GAC	2	6	57806	57811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748259
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1151	NC_019898	A	8	8	58034	58041	100 %	0 %	0 %	0 %	430748260
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1155	NC_019898	ATA	2	6	58205	58210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748260
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1157	NC_019898	TGA	2	6	58296	58301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748260
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1160	NC_019898	GAT	2	6	58474	58479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748260
1161	NC_019898	GAAA	2	8	58488	58495	75 %	0 %	25 %	0 %	430748260
1162	NC_019898	ATC	2	6	58528	58533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748260
1163	NC_019898	GTT	2	6	58570	58575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748260
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1165	NC_019898	T	6	6	58724	58729	0 %	100 %	0 %	0 %	430748260
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1171	NC_019898	CGT	2	6	58952	58957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748260
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1181	NC_019898	CAT	2	6	59667	59672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748260
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1198	NC_019898	CAT	2	6	60629	60634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748261
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1217	NC_019898	A	6	6	61538	61543	100 %	0 %	0 %	0 %	430748261
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1220	NC_019898	GATG	2	8	61595	61602	25 %	25 %	50 %	0 %	430748261
1221	NC_019898	GAT	2	6	61680	61685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748261
1222	NC_019898	TAT	2	6	61704	61709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748261
1223	NC_019898	AGG	2	6	61711	61716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748261
1224	NC_019898	AGA	2	6	61724	61729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748261
1225	NC_019898	TCTA	2	8	61807	61814	25 %	50 %	0 %	25 %	430748261
1226	NC_019898	AGG	2	6	61892	61897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1227	NC_019898	CTA	2	6	61909	61914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748262
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1230	NC_019898	TTG	2	6	62068	62073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748262
1231	NC_019898	GTT	2	6	62088	62093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748262
1232	NC_019898	GTA	2	6	62106	62111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748262
1233	NC_019898	CTG	2	6	62182	62187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748262
1234	NC_019898	TATGG	2	10	62188	62197	20 %	40 %	40 %	0 %	430748262
1235	NC_019898	AAC	2	6	62352	62357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748262
1236	NC_019898	AAT	2	6	62386	62391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748262
1237	NC_019898	T	7	7	62483	62489	0 %	100 %	0 %	0 %	430748263
1238	NC_019898	ATT	2	6	62495	62500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748263
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1240	NC_019898	TGC	2	6	62649	62654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748263
1241	NC_019898	GAT	2	6	62672	62677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748263
1242	NC_019898	CAA	2	6	62732	62737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748263
1243	NC_019898	G	6	6	62840	62845	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1244	NC_019898	ATG	2	6	62851	62856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748264
1245	NC_019898	GCG	2	6	62881	62886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748264
1246	NC_019898	GAT	2	6	62944	62949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748264
1247	NC_019898	TA	3	6	63013	63018	50 %	50 %	0 %	0 %	430748264
1248	NC_019898	AATCA	2	10	63187	63196	60 %	20 %	0 %	20 %	430748264
1249	NC_019898	CCTGT	2	10	63199	63208	0 %	40 %	20 %	40 %	430748264
1250	NC_019898	ACT	2	6	63269	63274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748264
1251	NC_019898	CAAA	2	8	63301	63308	75 %	0 %	0 %	25 %	430748264
1252	NC_019898	TAT	2	6	63315	63320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748264
1253	NC_019898	GGA	2	6	63337	63342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748264
1254	NC_019898	GAT	2	6	63381	63386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748264
1255	NC_019898	TGAA	2	8	63389	63396	50 %	25 %	25 %	0 %	430748264
1256	NC_019898	ATT	2	6	63398	63403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748264
1257	NC_019898	ATT	2	6	63405	63410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748264
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1277	NC_019898	GATT	2	8	64444	64451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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