MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermobacillus composti KWC4 chromosome

Total Repeats: 102345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019897	GCCG	2	8	39842	39849	0 %	0 %	50 %	50 %	430748376
1003	NC_019897	GAC	2	6	39870	39875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1004	NC_019897	TCC	2	6	39904	39909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748376
1005	NC_019897	CGG	2	6	39914	39919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748376
1006	NC_019897	ATC	2	6	39945	39950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748376
1007	NC_019897	GCT	2	6	40007	40012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1008	NC_019897	GCA	2	6	40055	40060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1009	NC_019897	CGA	2	6	40066	40071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1010	NC_019897	TCT	2	6	40081	40086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748376
1011	NC_019897	CG	3	6	40141	40146	0 %	0 %	50 %	50 %	430748376
1012	NC_019897	GAT	2	6	40217	40222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748376
1013	NC_019897	CCG	2	6	40223	40228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748376
1014	NC_019897	CGT	2	6	40277	40282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1015	NC_019897	TCA	2	6	40297	40302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748376
1016	NC_019897	TGC	2	6	40312	40317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1017	NC_019897	TGC	2	6	40336	40341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1018	NC_019897	TGC	2	6	40387	40392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748376
1019	NC_019897	CGG	2	6	40434	40439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748376
1020	NC_019897	CGG	2	6	40441	40446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748376
1021	NC_019897	GCG	2	6	40450	40455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748376
1022	NC_019897	CGC	2	6	40487	40492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748376
1023	NC_019897	GCC	2	6	40497	40502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748376
1024	NC_019897	AGC	2	6	40519	40524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019897	ATCAG	2	10	40562	40571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_019897	ATT	2	6	40579	40584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019897	T	6	6	40663	40668	0 %	100 %	0 %	0 %	430748377
1028	NC_019897	GTA	2	6	40684	40689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748377
1029	NC_019897	TTG	2	6	40711	40716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748377
1030	NC_019897	ATG	2	6	40718	40723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748377
1031	NC_019897	AAGAG	2	10	40770	40779	60 %	0 %	40 %	0 %	430748377
1032	NC_019897	CTT	2	6	40794	40799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748377
1033	NC_019897	A	6	6	40855	40860	100 %	0 %	0 %	0 %	430748377
1034	NC_019897	ATG	2	6	40940	40945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748377
1035	NC_019897	ACAAT	3	15	40985	40999	60 %	20 %	0 %	20 %	430748377
1036	NC_019897	TAT	2	6	41043	41048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748377
1037	NC_019897	ACA	2	6	41066	41071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748377
1038	NC_019897	A	6	6	41071	41076	100 %	0 %	0 %	0 %	430748377
1039	NC_019897	AGA	2	6	41169	41174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748377
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1041	NC_019897	TA	3	6	41266	41271	50 %	50 %	0 %	0 %	430748377
1042	NC_019897	ATT	2	6	41291	41296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748377
1043	NC_019897	AGA	2	6	41299	41304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748377
1044	NC_019897	CTA	2	6	41407	41412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_019897	TTG	2	6	41485	41490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019897	CCA	2	6	41492	41497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_019897	TAT	2	6	41510	41515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019897	TA	3	6	41526	41531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019897	ATG	2	6	41545	41550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019897	GGC	2	6	41606	41611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748378
1051	NC_019897	GCT	2	6	41621	41626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748378
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1053	NC_019897	GCCCG	2	10	41680	41689	0 %	0 %	40 %	60 %	430748378
1054	NC_019897	CTG	2	6	41727	41732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748378
1055	NC_019897	GC	4	8	41742	41749	0 %	0 %	50 %	50 %	430748378
1056	NC_019897	TGC	2	6	41788	41793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748378
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1059	NC_019897	GCG	2	6	41851	41856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748378
1060	NC_019897	CGG	2	6	41932	41937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748378
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1062	NC_019897	GCT	2	6	42017	42022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748378
1063	NC_019897	CT	3	6	42090	42095	0 %	50 %	0 %	50 %	430748378
1064	NC_019897	GAG	2	6	42108	42113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748378
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1072	NC_019897	TGC	2	6	42316	42321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748378
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1075	NC_019897	CGCTG	2	10	42383	42392	0 %	20 %	40 %	40 %	430748378
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1078	NC_019897	GAG	2	6	42561	42566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019897	GTC	2	6	42670	42675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748379
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1082	NC_019897	GAA	2	6	42772	42777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748379
1083	NC_019897	TCG	2	6	42791	42796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748379
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1088	NC_019897	GAC	2	6	42936	42941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748379
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1094	NC_019897	GAA	2	6	43074	43079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748379
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1098	NC_019897	GCAA	2	8	43207	43214	50 %	0 %	25 %	25 %	430748379
1099	NC_019897	GAC	2	6	43273	43278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748379
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1101	NC_019897	GCG	2	6	43440	43445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019897	CCT	2	6	43456	43461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_019897	TGC	2	6	43516	43521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748380
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1107	NC_019897	CGC	2	6	43612	43617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748380
1108	NC_019897	AGC	3	9	43697	43705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748380
1109	NC_019897	GCG	2	6	43737	43742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748380
1110	NC_019897	GCC	2	6	43797	43802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748380
1111	NC_019897	AAC	2	6	43862	43867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748380
1112	NC_019897	CG	3	6	43887	43892	0 %	0 %	50 %	50 %	430748380
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1114	NC_019897	TCCCC	2	10	44022	44031	0 %	20 %	0 %	80 %	430748380
1115	NC_019897	CG	3	6	44038	44043	0 %	0 %	50 %	50 %	430748380
1116	NC_019897	AGC	2	6	44045	44050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748380
1117	NC_019897	CCG	2	6	44072	44077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748380
1118	NC_019897	CGA	2	6	44101	44106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748380
1119	NC_019897	GCC	2	6	44142	44147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748380
1120	NC_019897	GTC	2	6	44171	44176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748380
1121	NC_019897	CGA	2	6	44196	44201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748380
1122	NC_019897	TCCC	2	8	44223	44230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_019897	CGC	2	6	44252	44257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_019897	CCG	2	6	44281	44286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1126	NC_019897	TTC	2	6	44341	44346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1376	NC_019897	GCT	2	6	52973	52978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748389
1377	NC_019897	ACA	2	6	52981	52986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748389
1378	NC_019897	CAA	2	6	53195	53200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748389
1379	NC_019897	CTG	2	6	53235	53240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748389
1380	NC_019897	TCC	2	6	53256	53261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748389
1381	NC_019897	A	6	6	53266	53271	100 %	0 %	0 %	0 %	430748389
1382	NC_019897	A	6	6	53299	53304	100 %	0 %	0 %	0 %	430748389
1383	NC_019897	CGA	2	6	53315	53320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748389
1384	NC_019897	CTA	3	9	53339	53347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748389
1385	NC_019897	GAT	2	6	53360	53365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748389
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1387	NC_019897	GACA	2	8	53427	53434	50 %	0 %	25 %	25 %	430748389
1388	NC_019897	GGC	2	6	53439	53444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1389	NC_019897	TCAA	2	8	53474	53481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1390	NC_019897	TCC	2	6	53501	53506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1391	NC_019897	CGGG	2	8	53507	53514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1392	NC_019897	TA	4	8	53590	53597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1393	NC_019897	TA	4	8	53603	53610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1394	NC_019897	GTG	2	6	53634	53639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1396	NC_019897	A	7	7	53782	53788	100 %	0 %	0 %	0 %	430748390
1397	NC_019897	CTA	2	6	53798	53803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748390
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1403	NC_019897	CGA	2	6	54169	54174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748390
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1405	NC_019897	GATT	2	8	54211	54218	25 %	50 %	25 %	0 %	430748390
1406	NC_019897	CAC	2	6	54221	54226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748390
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1409	NC_019897	TGC	2	6	54325	54330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748390
1410	NC_019897	GTC	2	6	54333	54338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748390
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1423	NC_019897	TCG	2	6	54935	54940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748391
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1425	NC_019897	GATC	2	8	54957	54964	25 %	25 %	25 %	25 %	430748391
1426	NC_019897	CGT	2	6	54975	54980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748391
1427	NC_019897	CGG	2	6	54984	54989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748391
1428	NC_019897	CAT	2	6	54990	54995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748391
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1430	NC_019897	GTG	2	6	55072	55077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748391
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1432	NC_019897	TGG	2	6	55088	55093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748391
1433	NC_019897	ACC	2	6	55111	55116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748391
1434	NC_019897	ATC	2	6	55117	55122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748391
1435	NC_019897	ATT	2	6	55282	55287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748391
1436	NC_019897	AGG	2	6	55539	55544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_019897	TCCGGC	2	12	55682	55693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430748392
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1454	NC_019897	CCG	2	6	56520	56525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748392
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1479	NC_019897	CCG	2	6	57406	57411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748393
1480	NC_019897	GCGCT	2	10	57453	57462	0 %	20 %	40 %	40 %	430748393
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1482	NC_019897	GGC	2	6	57504	57509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748393
1483	NC_019897	CGA	2	6	57530	57535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1484	NC_019897	TGC	2	6	57647	57652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748394
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1486	NC_019897	CGCC	2	8	57686	57693	0 %	0 %	25 %	75 %	430748394
1487	NC_019897	GC	3	6	57725	57730	0 %	0 %	50 %	50 %	430748394
1488	NC_019897	GC	3	6	57749	57754	0 %	0 %	50 %	50 %	430748394
1489	NC_019897	CCG	3	9	57758	57766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748394
1490	NC_019897	CCGC	2	8	57770	57777	0 %	0 %	25 %	75 %	430748394
1491	NC_019897	CG	3	6	57781	57786	0 %	0 %	50 %	50 %	430748394
1492	NC_019897	CGT	2	6	57800	57805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748394
1493	NC_019897	GCG	2	6	57857	57862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748394
1494	NC_019897	GAC	2	6	57900	57905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748394
1495	NC_019897	CGA	2	6	57915	57920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748394
1496	NC_019897	GCCGG	2	10	57972	57981	0 %	0 %	60 %	40 %	430748394
1497	NC_019897	CG	4	8	57990	57997	0 %	0 %	50 %	50 %	430748394
1498	NC_019897	CGG	2	6	58024	58029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748394
1499	NC_019897	GCT	2	6	58115	58120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748394
1500	NC_019897	GCC	2	6	58135	58140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748394

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